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Some edits.
authorWolfgang Bangerth <bangerth@colostate.edu>
Wed, 25 Apr 2018 19:29:54 +0000 (13:29 -0600)
committerWolfgang Bangerth <bangerth@colostate.edu>
Wed, 25 Apr 2018 19:29:54 +0000 (13:29 -0600)
9.0/paper.tex

index e203d979791e13a52c3564b7fd9bc8d8f640c79f..c1fe583e0e3f0c22dbff180df0560ad7ea82d0f0 100644 (file)
@@ -217,7 +217,7 @@ are mainly used in Boundary Element Methods.
   updates to step-37. In addition, the separate code
   gallery of \dealii has gained a number of new entries.
 
-\item Improved support for user parameters: a new \texttt{ParameterAcceptor}
+\item Improved support for user-defined run-time parameters: a new \texttt{ParameterAcceptor}
   class has been added to the library. The class is intended to be used as a
   base for any class that wants to handle parameters using the
   \texttt{ParameterHandler} class. If you derive all your classes from
@@ -272,33 +272,47 @@ the release announcement.)
 
 \marginpar{All: please edit as appropriate}
 
-Every function in the GridGenerator namespace now attaches a default manifold to
-the curved parts of the domain, and sets reasonable defaults for manifold
-indicators both in the domain and on the boundary, where appropriate. Manifold
-classes are no longer sensible to settings made on boundary indicators, and are
-only affected by manifold indicators, decoupling completely the concept of
-boundary indicators and manifold indicator, leaving the former for boundary
-conditions, and the latter for the geometrical description of the domain.
-
-All functions that allowed to query for \texttt{Boundary} objects (deprecated
+\dealii{} has had the ability to attach \textit{manifold descriptions}
+to all parts of a geometry for several releases already. These
+descriptions are used when considering where to place new vertices
+upon mesh refinement, in determining the mapping from reference cell
+to real cell, and in a number of other contexts. However, for historical
+reasons, manifold descripts have used some of the same code paths also
+used for boundary indicators typically used to identify which parts of
+the boundary correspond to what boundary conditions.
+
+This connection has been severed in the current release: Boundary
+indicators and manifold descriptions are now entirely separated. Furthermore,
+all functions that allowed to query for old-style \texttt{Boundary} objects (deprecated
 since version 8.5 of the \dealii library) have been removed, and have been
 replaced by the equivalent methods that query \texttt{Manifold} classes.
 
-The manifold smoothing algorithms applied in the Triangulation class and
-MappingQGeneric have been changed from the old Laplace-style smoothing to a
+There are also numerous improvements to the available manifold descriptions.
+First, the manifold smoothing algorithms applied in the \texttt{Triangulation} class and
+\texttt{MappingQGeneric} have been changed from the old Laplace-style smoothing to a
 transfinite interpolation that linearly blends between the descriptions on the
 faces around a cell. The old transformation introduced boundary layers inside
 cells that prevented convergence rates from exceeding \(3.5\) in the global
-\(L^2\) errors on typical settings. This change also considerably improves mesh
-quality on settings where curved descriptions are only applied to the boundary
+\(L^2\) errors for typical settings. This change also considerably improves mesh
+quality in situations where curved descriptions are only applied to the boundary
 rather than the whole volume.
 
-A new manifold class \texttt{TransfiniteInterpolationManifold} implementing an
-interpolation from a curved boundary description to the interior has been added.
-This class enables high-order convergence rates of more than three in the power
-of the mesh size for situations where a curved manifold can only be prescribed
+\marginpar{This paragraph seems to duplicate the previous. Can we
+  merge the information?}
+Secondly, a new manifold class
+\texttt{TransfiniteInterpolationManifold} has been added that implements an
+interpolation from a curved boundary description to the interior.
+This class enables high-order convergence rates of better than ${\cal O}(h^3)$
+for situations where a curved manifold can only be prescribed
 to the boundary but not in a whole volume.
 
+Finally,
+every function in the \texttt{GridGenerator} namespace now attaches a default manifold to
+the curved parts of the domain described by the generated mesh, and sets reasonable defaults for manifold
+indicators both in the domain and on the boundary.
+
+
+
 %%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
 \subsection{Support for particle-in-cell methods}
 
@@ -343,16 +357,17 @@ the functionality was not available pervasively throughout
 deal.II. 
 This has changed with release 9.0 where support is given for differentiation 
 using a selection of ``white-listed'' libraries (namely ADOL-C \citep{Griewank1996a} 
-and Sacado) and a subset of their supported number types. Currently, we offer support for
+and Sacado) and a subset of their supported number types. Currently,
+we offer support for the following cases:
 \begin{itemize}
 \item ADOL-C taped (n-differentiable),
 \item ADOL-C tapeless (once differentiable),
 \item Sacado dynamic forward (once differentiable),
 \item Sacado reverse (once differentiable),
 \item Sacado nested dynamic forward (twice differentiable), and
-\item Sacado nested reverse and dynamic forward (twice differentiable)
+\item Sacado nested reverse and dynamic forward (twice differentiable).
 \end{itemize}
-numbers. In practice, this support means that these ADOL-C and Sacado data
+In practice, this support means that these ADOL-C and Sacado data
 types can be used in the \texttt{FEValues}, \texttt{FEValuesViews},
 \texttt{Tensor}, \texttt{SymmetricTensor},
 and related classes that are generally used to assemble linear systems
@@ -489,7 +504,7 @@ thereby clarifying object ownership responsibilities and avoiding memory leaks.
 The matrix-free infrastructure in \dealii{} was significantly overhauled for
 the current release. The major new contribution is the support of face
 integrals through a new class \texttt{FEFaceEvaluation}. The new class has a
-similar interface as the previous \texttt{FEEvaluation}, and applies SIMD
+similar interface as the existing \texttt{FEEvaluation} class, and applies SIMD
 vectorization over several faces in analogy to the intra-cell vectorization in
 FEEvaluation. Discontinuous Galerkin operators are implemented defining two
 face functions, one for interior and one for boundary faces, in addition to
@@ -502,7 +517,7 @@ the performance boundaries of the hardware.
 
 To give an example of the algorithmic improvements, the computation of the
 values and gradients on all quadrature points for cell integrals has been
-significantly improved, giving around 10--20\% better performance for the case
+significantly improved, yielding 10--20\% better performance for cases where
 the kernels are compute bound. For the example of the reference cell gradient
 of a solution field $\mathbf u$ in three space dimensions, the new release
 applies the following change:
@@ -530,9 +545,10 @@ applies the following change:
 \end{equation*}
 The matrices $S_i$ contain the values of the one-dimensional shape functions
 in one-dimensional quadrature points and $D_i$ their derivatives. When applied
-with the usual sum factorization implementation described e.g.~in
+with the usual sum factorization implementation described, for
+example, in
 \cite{KronbichlerKormann2012}, the old kernels amounted to 9 partial
-summations---or rather 8 in the previous implementation of \dealii{} because
+summations -- or rather 8 in the previous implementation of \dealii{} because
 the application of $S_1$ for the $y$ and $z$ components of the gradient can be
 merged. The new code performs a basis transformation to a related basis with
 derivative matrix $D_i = D_i^{\mathrm{co}} S_i$, which is the basis of
@@ -550,7 +566,7 @@ detailed description of the matrix-free modules is given in the preprint
 
 This release does not contain any new tutorial programs, though
 several have been updated extensively for the changes to the manifold
-handling as well as to adjust for current functionality
+handling as well as to adjust for current functionality and coding styles
 compared to what that was available when the programs were first written.
 
 \dealii has a separate ``code gallery'' that

In the beginning the Universe was created. This has made a lot of people very angry and has been widely regarded as a bad move.

Douglas Adams


Typeset in Trocchi and Trocchi Bold Sans Serif.