]> https://gitweb.dealii.org/ - dealii.git/commitdiff
Make particle handler serialization test consistent 15605/head
authorPasquale Africa <pafrica@sissa.it>
Mon, 3 Jul 2023 02:40:55 +0000 (02:40 +0000)
committerPasquale Africa <pafrica@sissa.it>
Mon, 3 Jul 2023 02:45:32 +0000 (02:45 +0000)
tests/serialization/particle_handler_04.cc
tests/serialization/particle_handler_04.mpirun=1.output

index deb5b72a68506e48ad04b4dddbc0b2cf7919922c..706a5d9892ed4d73ee7cc223a19b9785a0975a1d 100644 (file)
 
 
 // check and illustrate the serialization process for ParticleHandler
-// when the triangulation is fully distributed.
-// In this case, find_active_cell_around_point() currently cannot be used to
-// locate the cells around the particles and so we use a more naive insertion
-// mechanism.
+// for fully distributed triangulations
+
 #include <deal.II/distributed/fully_distributed_tria.h>
 
 #include <deal.II/fe/mapping_q.h>
 
 #include "serialization.h"
 
+template <int dim, int spacedim>
+void
+create_regular_particle_distribution(
+  Particles::ParticleHandler<dim, spacedim> &particle_handler,
+  const parallel::fullydistributed::Triangulation<dim, spacedim> &tr,
+  const unsigned int particles_per_direction = 3)
+{
+  for (unsigned int i = 0; i < particles_per_direction; ++i)
+    for (unsigned int j = 0; j < particles_per_direction; ++j)
+      {
+        Point<spacedim> position;
+        Point<dim>      reference_position;
+        unsigned int    id = i * particles_per_direction + j;
+
+        position[0] = static_cast<double>(i) /
+                      static_cast<double>(particles_per_direction - 1);
+        position[1] = static_cast<double>(j) /
+                      static_cast<double>(particles_per_direction - 1);
+
+        if (dim > 2)
+          for (unsigned int k = 0; k < particles_per_direction; ++k)
+            {
+              position[2] = static_cast<double>(j) /
+                            static_cast<double>(particles_per_direction - 1);
+              id = i * particles_per_direction * particles_per_direction +
+                   j * particles_per_direction + k;
+              Particles::Particle<dim, spacedim> particle(position,
+                                                          reference_position,
+                                                          id);
+
+              typename parallel::fullydistributed::
+                Triangulation<dim, spacedim>::active_cell_iterator cell =
+                  GridTools::find_active_cell_around_point(
+                    tr, particle.get_location());
+
+              particle_handler.insert_particle(particle, cell);
+            }
+        else
+          {
+            Particles::Particle<dim, spacedim> particle(position,
+                                                        reference_position,
+                                                        id);
+
+            typename parallel::fullydistributed::Triangulation<dim, spacedim>::
+              active_cell_iterator cell =
+                GridTools::find_active_cell_around_point(
+                  tr, particle.get_location());
+
+            particle_handler.insert_particle(particle, cell);
+          }
+      }
+}
+
+
+
 template <int dim, int spacedim>
 void
 test()
@@ -48,29 +101,9 @@ test()
 
   MappingQ<dim, spacedim> mapping(1);
 
-  // Create ParticleHandler and insert two particles
   Particles::ParticleHandler<dim, spacedim> particle_handler(tr, mapping);
-  std::vector<Point<spacedim>>              position(2);
-  std::vector<Point<dim>>                   reference_position(2);
-
-  for (unsigned int i = 0; i < dim; ++i)
-    {
-      position[0](i) = 0.125;
-      position[1](i) = 0.525;
-    }
-
-  Particles::Particle<dim, spacedim> particle1(position[0],
-                                               reference_position[0],
-                                               0);
-  Particles::Particle<dim, spacedim> particle2(position[1],
-                                               reference_position[1],
-                                               1);
-
-  typename Triangulation<dim, spacedim>::active_cell_iterator cell1(&tr, 2, 0);
-  typename Triangulation<dim, spacedim>::active_cell_iterator cell2(&tr, 2, 0);
-  particle_handler.insert_particle(particle1, cell1);
-  particle_handler.insert_particle(particle2, cell2);
 
+  create_regular_particle_distribution(particle_handler, tr);
   particle_handler.sort_particles_into_subdomains_and_cells();
 
   for (auto particle = particle_handler.begin();
@@ -80,14 +113,13 @@ test()
             << " is in cell " << particle->get_surrounding_cell(tr)
             << std::endl;
 
-  particle_handler.prepare_for_serialization();
-
-  // save additional particle data to archive
+  // save data to archive
   std::ostringstream oss;
   {
     boost::archive::text_oarchive oa(oss, boost::archive::no_header);
 
     oa << particle_handler;
+    particle_handler.prepare_for_serialization();
     tr.save("checkpoint");
 
     // archive and stream closed when
@@ -109,9 +141,9 @@ test()
     deallog << "In between particle id " << particle->get_id() << " is in cell "
             << particle->get_surrounding_cell(tr) << std::endl;
 
-  // verify correctness of the serialization. Note that the boost
-  // archive of the ParticleHandler has to be read before the triangulation
-  // (otherwise it does not know if something was stored in the user data of the
+  // verify correctness of the serialization. Note that the deserialization of
+  // the particle handler has to happen before the triangulation (otherwise it
+  // does not know if something was stored in the user data of the
   // triangulation).
   {
     std::istringstream            iss(oss.str());
@@ -122,8 +154,6 @@ test()
     particle_handler.deserialize();
   }
 
-  deallog << "After deserialization global number of particles is: "
-          << particle_handler.n_global_particles() << std::endl;
   for (auto particle = particle_handler.begin();
        particle != particle_handler.end();
        ++particle)
index 7c8ec417b60898caf49e329b8ad312675bc2eb38..a97ab8fe8fecd87a6d7a7ce5cec8d1635b3d4720 100644 (file)
 
 DEAL:0:2d/2d::Before serialization particle id 0 is in cell 2.0
-DEAL:0:2d/2d::Before serialization particle id 1 is in cell 2.12
-DEAL:0:2d/2d::0 0 2 1 2
+DEAL:0:2d/2d::Before serialization particle id 3 is in cell 2.1
+DEAL:0:2d/2d::Before serialization particle id 1 is in cell 2.2
+DEAL:0:2d/2d::Before serialization particle id 4 is in cell 2.3
+DEAL:0:2d/2d::Before serialization particle id 6 is in cell 2.5
+DEAL:0:2d/2d::Before serialization particle id 7 is in cell 2.7
+DEAL:0:2d/2d::Before serialization particle id 2 is in cell 2.10
+DEAL:0:2d/2d::Before serialization particle id 5 is in cell 2.11
+DEAL:0:2d/2d::Before serialization particle id 8 is in cell 2.15
+DEAL:0:2d/2d::0 0 9 1 9
 
-DEAL:0:2d/2d::After deserialization global number of particles is: 2
 DEAL:0:2d/2d::After serialization particle id 0 is in cell 2.0
-DEAL:0:2d/2d::After serialization particle id 1 is in cell 2.12
+DEAL:0:2d/2d::After serialization particle id 3 is in cell 2.1
+DEAL:0:2d/2d::After serialization particle id 1 is in cell 2.2
+DEAL:0:2d/2d::After serialization particle id 4 is in cell 2.3
+DEAL:0:2d/2d::After serialization particle id 6 is in cell 2.5
+DEAL:0:2d/2d::After serialization particle id 7 is in cell 2.7
+DEAL:0:2d/2d::After serialization particle id 2 is in cell 2.10
+DEAL:0:2d/2d::After serialization particle id 5 is in cell 2.11
+DEAL:0:2d/2d::After serialization particle id 8 is in cell 2.15
 DEAL:0:2d/2d::OK
 DEAL:0:2d/2d::
 DEAL:0:2d/3d::Before serialization particle id 0 is in cell 2.0
-DEAL:0:2d/3d::Before serialization particle id 1 is in cell 2.12
-DEAL:0:2d/3d::0 0 2 1 2
+DEAL:0:2d/3d::Before serialization particle id 3 is in cell 2.1
+DEAL:0:2d/3d::Before serialization particle id 1 is in cell 2.2
+DEAL:0:2d/3d::Before serialization particle id 4 is in cell 2.3
+DEAL:0:2d/3d::Before serialization particle id 6 is in cell 2.5
+DEAL:0:2d/3d::Before serialization particle id 7 is in cell 2.7
+DEAL:0:2d/3d::Before serialization particle id 2 is in cell 2.10
+DEAL:0:2d/3d::Before serialization particle id 5 is in cell 2.11
+DEAL:0:2d/3d::Before serialization particle id 8 is in cell 2.15
+DEAL:0:2d/3d::0 0 9 1 9
 
-DEAL:0:2d/3d::After deserialization global number of particles is: 2
 DEAL:0:2d/3d::After serialization particle id 0 is in cell 2.0
-DEAL:0:2d/3d::After serialization particle id 1 is in cell 2.12
+DEAL:0:2d/3d::After serialization particle id 3 is in cell 2.1
+DEAL:0:2d/3d::After serialization particle id 1 is in cell 2.2
+DEAL:0:2d/3d::After serialization particle id 4 is in cell 2.3
+DEAL:0:2d/3d::After serialization particle id 6 is in cell 2.5
+DEAL:0:2d/3d::After serialization particle id 7 is in cell 2.7
+DEAL:0:2d/3d::After serialization particle id 2 is in cell 2.10
+DEAL:0:2d/3d::After serialization particle id 5 is in cell 2.11
+DEAL:0:2d/3d::After serialization particle id 8 is in cell 2.15
 DEAL:0:2d/3d::OK
 DEAL:0:2d/3d::
 DEAL:0:3d/3d::Before serialization particle id 0 is in cell 2.0
-DEAL:0:3d/3d::Before serialization particle id 1 is in cell 2.56
-DEAL:0:3d/3d::0 0 2 1 2
+DEAL:0:3d/3d::Before serialization particle id 1 is in cell 2.0
+DEAL:0:3d/3d::Before serialization particle id 2 is in cell 2.0
+DEAL:0:3d/3d::Before serialization particle id 9 is in cell 2.1
+DEAL:0:3d/3d::Before serialization particle id 10 is in cell 2.1
+DEAL:0:3d/3d::Before serialization particle id 11 is in cell 2.1
+DEAL:0:3d/3d::Before serialization particle id 3 is in cell 2.6
+DEAL:0:3d/3d::Before serialization particle id 4 is in cell 2.6
+DEAL:0:3d/3d::Before serialization particle id 5 is in cell 2.6
+DEAL:0:3d/3d::Before serialization particle id 12 is in cell 2.7
+DEAL:0:3d/3d::Before serialization particle id 13 is in cell 2.7
+DEAL:0:3d/3d::Before serialization particle id 14 is in cell 2.7
+DEAL:0:3d/3d::Before serialization particle id 18 is in cell 2.9
+DEAL:0:3d/3d::Before serialization particle id 19 is in cell 2.9
+DEAL:0:3d/3d::Before serialization particle id 20 is in cell 2.9
+DEAL:0:3d/3d::Before serialization particle id 21 is in cell 2.15
+DEAL:0:3d/3d::Before serialization particle id 22 is in cell 2.15
+DEAL:0:3d/3d::Before serialization particle id 23 is in cell 2.15
+DEAL:0:3d/3d::Before serialization particle id 6 is in cell 2.54
+DEAL:0:3d/3d::Before serialization particle id 7 is in cell 2.54
+DEAL:0:3d/3d::Before serialization particle id 8 is in cell 2.54
+DEAL:0:3d/3d::Before serialization particle id 15 is in cell 2.55
+DEAL:0:3d/3d::Before serialization particle id 16 is in cell 2.55
+DEAL:0:3d/3d::Before serialization particle id 17 is in cell 2.55
+DEAL:0:3d/3d::Before serialization particle id 24 is in cell 2.63
+DEAL:0:3d/3d::Before serialization particle id 25 is in cell 2.63
+DEAL:0:3d/3d::Before serialization particle id 26 is in cell 2.63
+DEAL:0:3d/3d::0 0 27 3 27
 
-DEAL:0:3d/3d::After deserialization global number of particles is: 2
 DEAL:0:3d/3d::After serialization particle id 0 is in cell 2.0
-DEAL:0:3d/3d::After serialization particle id 1 is in cell 2.56
+DEAL:0:3d/3d::After serialization particle id 1 is in cell 2.0
+DEAL:0:3d/3d::After serialization particle id 2 is in cell 2.0
+DEAL:0:3d/3d::After serialization particle id 9 is in cell 2.1
+DEAL:0:3d/3d::After serialization particle id 10 is in cell 2.1
+DEAL:0:3d/3d::After serialization particle id 11 is in cell 2.1
+DEAL:0:3d/3d::After serialization particle id 3 is in cell 2.6
+DEAL:0:3d/3d::After serialization particle id 4 is in cell 2.6
+DEAL:0:3d/3d::After serialization particle id 5 is in cell 2.6
+DEAL:0:3d/3d::After serialization particle id 12 is in cell 2.7
+DEAL:0:3d/3d::After serialization particle id 13 is in cell 2.7
+DEAL:0:3d/3d::After serialization particle id 14 is in cell 2.7
+DEAL:0:3d/3d::After serialization particle id 18 is in cell 2.9
+DEAL:0:3d/3d::After serialization particle id 19 is in cell 2.9
+DEAL:0:3d/3d::After serialization particle id 20 is in cell 2.9
+DEAL:0:3d/3d::After serialization particle id 21 is in cell 2.15
+DEAL:0:3d/3d::After serialization particle id 22 is in cell 2.15
+DEAL:0:3d/3d::After serialization particle id 23 is in cell 2.15
+DEAL:0:3d/3d::After serialization particle id 6 is in cell 2.54
+DEAL:0:3d/3d::After serialization particle id 7 is in cell 2.54
+DEAL:0:3d/3d::After serialization particle id 8 is in cell 2.54
+DEAL:0:3d/3d::After serialization particle id 15 is in cell 2.55
+DEAL:0:3d/3d::After serialization particle id 16 is in cell 2.55
+DEAL:0:3d/3d::After serialization particle id 17 is in cell 2.55
+DEAL:0:3d/3d::After serialization particle id 24 is in cell 2.63
+DEAL:0:3d/3d::After serialization particle id 25 is in cell 2.63
+DEAL:0:3d/3d::After serialization particle id 26 is in cell 2.63
 DEAL:0:3d/3d::OK
 DEAL:0:3d/3d::

In the beginning the Universe was created. This has made a lot of people very angry and has been widely regarded as a bad move.

Douglas Adams


Typeset in Trocchi and Trocchi Bold Sans Serif.