]> https://gitweb.dealii.org/ - release-papers.git/commitdiff
Add .bib file
authorpeterrum <peterrmuench@aol.com>
Wed, 10 Mar 2021 12:29:57 +0000 (13:29 +0100)
committerpeterrum <peterrmuench@aol.com>
Wed, 10 Mar 2021 12:29:57 +0000 (13:29 +0100)
9.3/paper.bib [new file with mode: 0644]

diff --git a/9.3/paper.bib b/9.3/paper.bib
new file mode 100644 (file)
index 0000000..cb2873f
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,1080 @@
+%% do not edit this file, edit in the deal.II main repository, copy here, but
+%% keep this note in here for the next one.
+
+%% The deal.II paper
+
+@Article{BangerthHartmannKanschat2007,
+  title = {deal.{II} --- a General Purpose Object Oriented Finite Element Library},
+  author = {Bangerth, W. and Hartmann, R. and Kanschat, G.},
+  journal = {{ACM} Trans. Math. Softw.},
+  volume = {33},
+  number = {4},
+  year = {2007},
+  doi = {10.1145/1268776.1268779}
+}
+
+@Article{dealII2020design,
+   title   = {The {deal.II} finite element library: {D}esign, features, and
+              insights},
+   author  = {Daniel Arndt and Wolfgang Bangerth and Denis Davydov and Timo
+              Heister and Luca Heltai and Martin Kronbichler and Matthias Maier
+              and Jean-Paul Pelteret and Bruno Turcksin and David Wells},
+   journal = {Computers \& Mathematics with Applications},
+   volume  = {in press},
+   year    = {2020},
+   DOI     = {10.1016/j.camwa.2020.02.022},
+}
+
+@Misc{changes84,
+  Title                    = {List of Changes},
+  Note                     = {\url{https://www.dealii.org/developer/doxygen/deal.II/changes_between_8_3_and_8_4.html}},
+  Url                      = {https://www.dealii.org/developer/doxygen/deal.II/changes_between_8_3_and_8_4.html}
+}
+
+@Misc{changes85,
+  Title                    = {List of Changes},
+  Note                     = {\url{https://www.dealii.org/developer/doxygen/deal.II/changes_between_8_4_2_and_8_5_0.html}},
+  Url                      = {https://www.dealii.org/developer/doxygen/deal.II/changes_between_8_4_2_and_8_5_0.html}
+}
+
+@Misc{changes90,
+  key={List of Changes},
+  Title                    = {List of Changes for 9.0},
+  Note                     = {\url{https://www.dealii.org/developer/doxygen/deal.II/changes_between_8_5_and_9_0.html}},
+  Url                      = {https://www.dealii.org/developer/doxygen/deal.II/changes_between_8_5_0_and_9_0.html}
+}
+
+@Misc{changes91,
+  key={List of Changes},
+  Title                    = {List of Changes for 9.1},
+  Note                     = {\url{https://www.dealii.org/developer/doxygen/deal.II/changes_between_9_0_1_and_9_1_0.html}},
+  Url                      = {https://www.dealii.org/developer/doxygen/deal.II/changes_between_9_0_1_and_9_1_0.html}
+}
+
+@Misc{changes92,
+  key={List of Changes},
+  Title                    = {List of Changes for 9.2},
+  Note                     = {\url{https://www.dealii.org/developer/doxygen/deal.II/changes_between_9_1_1_and_9_2_0.html}},
+  Url                      = {https://www.dealii.org/developer/doxygen/deal.II/changes_between_9_1_1_and_9_2_0.html}
+}
+
+@article{dealII80,
+  title = {The \texttt{deal.II} Library, Version 8.0},
+  author = {W. Bangerth and T. Heister and L. Heltai and G. Kanschat
+   and M. Kronbichler and M. Maier and B. Turcksin and T. D. Young},
+  journal = {arXiv preprint \url{http://arxiv.org/abs/1312.2266v3}},
+  year = {2013},
+}
+
+@article{dealII81,
+  title = {The \texttt{deal.II} Library, Version 8.1},
+  author = {W. Bangerth and T. Heister and L. Heltai and G. Kanschat
+   and M. Kronbichler and M. Maier and B. Turcksin and T. D. Young},
+  journal = {arXiv preprint \url{http://arxiv.org/abs/1312.2266v4}},
+  year = {2013},
+}
+
+@article{dealII82,
+  title = {The \texttt{deal.II} Library, Version 8.2},
+  author = {W. Bangerth and T. Heister and L. Heltai
+            and G. Kanschat and M. Kronbichler
+            and M. Maier and B. Turcksin
+            and T. D. Young},
+  journal = {Archive of Numerical Software},
+  volume = 3,
+  year = {2015},
+}
+
+@article{dealII83,
+  title = {The \texttt{deal.II} Library, Version 8.3},
+  author = {W. Bangerth and T. Heister and L. Heltai
+            and G. Kanschat and M. Kronbichler
+            and M. Maier and B. Turcksin},
+  journal = {Archive of Numerical Software},
+  volume = {4},
+  number = {100},
+  year = {2016},
+  pages = {1--11},
+  issn = {2197-8263},
+  doi = {10.11588/ans.2016.100.23122},
+}
+
+ @article{dealII85,
+    title   = {The \texttt{deal.II} Library, Version 8.5},
+    author  = {D. Arndt and W. Bangerth and D. Davydov and T. Heister and
+             L. Heltai and M. Kronbichler and M. Maier and J.-P. Pelteret
+             and B. Turcksin and D. Wells},
+    journal = {Journal of Numerical Mathematics},
+    year    = {2017},
+    volume =    25,
+    number =    3,
+    pages =     {137--146},
+    Doi     = {10.1515/jnma-2016-1045}
+  }
+
+@article{dealII84,
+                   title   = {The \texttt{deal.II} Library, Version 8.4},
+                   author  = {W. Bangerth and D. Davydov and T. Heister and
+                     L. Heltai and G. Kanschat and M. Kronbichler and M. Maier
+                     and B. Turcksin and D. Wells},
+                   journal = {Journal of Numerical Mathematics},
+                   year    = {2016},
+                   volume  = {24},
+                   number  = {3},
+                   pages   = {135--141},
+                   doi     = {10.1515/jnma-2016-1045}
+                 }
+
+
+
+@article{dealII90,
+title = {The \texttt{deal.II} Library, Version 9.0},
+author  = {G. Alzetta and D. Arndt and W. Bangerth and V. Boddu and
+               B. Brands and D. Davydov and R. Gassmoeller and T. Heister and
+               L. Heltai and K. Kormann and M. Kronbichler and M. Maier and
+               J.-P. Pelteret and B. Turcksin and D. Wells},
+journal = {J. Numer. Math.},
+volume  = "26",
+number = "4",
+pages   = "173--184",
+year    = 2018,
+doi = "10.1515/jnma-2018-0054"
+}
+
+
+@article{dealII91,
+  doi = {10.1515/jnma-2019-0064},
+  url = {https://doi.org/10.1515/jnma-2019-0064},
+  year = {2019},
+  month = dec,
+  publisher = {Walter de Gruyter {GmbH}},
+  volume = {27},
+  number = {4},
+  pages = {203--213},
+  author = {Daniel Arndt and Wolfgang Bangerth and Thomas C. Clevenger and Denis Davydov and Marc Fehling and Daniel Garcia-Sanchez and Graham Harper and Timo Heister and Luca Heltai and Martin Kronbichler and Ross Maguire Kynch and Matthias Maier and Jean-Paul Pelteret and Bruno Turcksin and David Wells},
+  title = {The deal.{II} library,  Version 9.1},
+  journal = {Journal of Numerical Mathematics}
+}
+
+
+%% The deal.II web page and online reference.
+%% Please cite specific versions only if you really need to
+
+@Manual{DealIIReference,
+  title =        {{\tt deal.{I}{I}} Differential Equations Analysis Library,
+                  Technical Reference},
+  author =       {W. Bangerth and T. Heister and G. Kanschat},
+  note =         {\texttt{http://www.dealii.org}},
+  url =          {http://www.dealii.org}
+}
+
+@Manual{DealIIReference600,
+  title =        {{\tt deal.{I}{I}} Differential Equations Analysis Library,
+                  Technical Reference},
+  author =       {W. Bangerth and G. Kanschat},
+  note =         {\texttt{http://www.dealii.org}},
+  url =          {http://www.dealii.org/6.0.0},
+  year = 2007
+}
+
+@Manual{DealIIReference610,
+  title =        {{\tt deal.{I}{I}} Differential Equations Analysis Library,
+                  Technical Reference},
+  author =       {W. Bangerth and G. Kanschat},
+  note =         {\texttt{http://www.dealii.org}},
+  url =          {http://www.dealii.org/6.1.0},
+  year = 2008
+}
+
+@Manual{DealIIReference621,
+  title =        {{\tt deal.{I}{I}} Differential Equations Analysis Library,
+                  Technical Reference},
+  author =       {W. Bangerth and G. Kanschat},
+  note =         {\texttt{http://www.dealii.org}},
+  url =          {http://www.dealii.org/6.2.1},
+  year = 2009
+}
+
+@Manual{DealIIReference631,
+  title =        {{\tt deal.{I}{I}} Differential Equations Analysis Library,
+                  Technical Reference},
+  author =       {W. Bangerth and G. Kanschat},
+  note =         {\texttt{http://www.dealii.org}},
+  url =          {http://www.dealii.org/6.3.1},
+  year = 2010
+}
+
+@Manual{DealIIReference700,
+  title =        {{\tt deal.{I}{I}} Differential Equations Analysis Library,
+                  Technical Reference},
+  author =       {W. Bangerth and G. Kanschat},
+  note =         {\texttt{http://www.dealii.org}},
+  url =          {http://www.dealii.org/7.0.0},
+  year = 2011
+}
+
+@Manual{DealIIReference710,
+  title =        {{\tt deal.{I}{I}} Differential Equations Analysis Library,
+                  Technical Reference},
+  author =       {W. Bangerth and G. Kanschat},
+  note =         {\texttt{http://www.dealii.org}},
+  url =          {http://www.dealii.org/7.1.0},
+  year = 2011
+}
+
+%% Additional papers on deal.II and special aspects
+
+@TechReport{BangerthKanschat1999,
+  title = {Concepts for Object-Oriented Finite Element Software -- the \texttt{deal.II} library},
+  address = {Heidelberg},
+  author = {Bangerth, W. and Kanschat, G.},
+  institution = {SFB~359},
+  number = {1999-43},
+  type = {Preprint},
+  year = {1999},
+  url = {http://www.dealii.org/developer/reports/deal-paper.pdf}
+}
+
+
+@article{SartoriGiulianiBardelloni-2018-a,
+       Author = {Sartori, Alberto and Giuliani, Nicola and Bardelloni, Mauro and Heltai, Luca},
+       Journal = {SoftwareX},
+       Pages = {318--327},
+       Title = {{deal2lkit: A toolkit library for high performance programming in deal.II}},
+       Volume = {7},
+       Year = {2018}}
+
+
+@Article{BangerthKayserHerold2007,
+  author =       {W. Bangerth and O. Kayser-Herold},
+  title =        {Data Structures and Requirements for $hp$ Finite Element
+                  Software},
+  journal =      {ACM Trans. Math. Softw.},
+  year =         2009,
+  volume =       36,
+  number =       1,
+  pages =        {4/1--4/31}
+}
+
+@Article{JanssenKanschat2011,
+  author =       {Janssen, B. and Kanschat, G.},
+  title =        {Adaptive multilevel methods with local smoothing for
+                  {${H}^1$}- and {$H^{\text{curl}}$}-conforming high order
+                  finite element methods},
+  journal =      {SIAM J. Sci. Comput.},
+  year =         2011,
+  volume =       33,
+  number =       4,
+  pages =        {2095--2114},
+  doi = {10.1137/090778523}
+}
+
+@Article{Kanschat2004,
+  title = {Multi-level methods for discontinuous {G}alerkin {FEM} on locally refined meshes},
+  author = {Kanschat, G.},
+  journal = {Comput. \& Struct.},
+  number = {28},
+  pages = {2437--2445},
+  volume = {82},
+  year = {2004},
+  doi = {10.1016/j.compstruc.2004.04.015}
+}
+
+@Article{BangerthBursteddeHeisterKronbichler11,
+  author =       {W. Bangerth and C. Burstedde and T. Heister
+                  and M. Kronbichler},
+  title =        {Algorithms and data structures for massively parallel generic
+  adaptive finite element codes},
+  journal =      {ACM Trans. Math. Softw.},
+  year =         2011,
+  volume =       38,
+  pages =        {14/1--28}}
+
+
+@Article{KronbichlerKormann2012,
+  author =       {M. Kronbichler and K. Kormann},
+  title =        {A generic interface for parallel cell-based finite element operator application},
+  journal =      {Comput. Fluids},
+  year =         2012,
+  volume =       63,
+  pages =        {135--147}}
+
+@Article{KronbichlerWall2018,
+  author =       {Kronbichler, M. and Wall, W. A.},
+  title =        {A performance comparison of continuous and discontinuous {G}alerkin
+                  methods with fast multigrid solvers},
+  journal =      {SIAM J. Sci. Comput.},
+  pages =        {A3423--A3448},
+  volume =       40,
+  number =       5,
+  year =         2018,
+  doi =          {10.1137/16M110455X}}
+
+@Article{KronbichlerKormann2019,
+  author =       {M. Kronbichler and K. Kormann},
+  title =        {Fast matrix-free evaluation of discontinuous {G}alerkin finite element operators},
+  journal =      {ACM Trans. Math. Soft.},
+  volume =       45,
+  number =       3,
+  pages =        {29:1--29:40},
+  year =         2019,
+  doi =          {10.1145/3325864}}
+
+@Article{KronbichlerLjungkvist2019,
+  author =       {Kronbichler, M. and Ljungkvist, K.},
+  title =        {Multigrid for Matrix-Free High-Order Finite Element Computations on Graphics Processors},
+  journal =      {ACM Trans. Parallel Comput.},
+  volume =       {6},
+  number =       {1},
+  pages =        {2/1--32},
+  year =         2019}
+
+@inproceedings{Arndt2020sppexa,
+author = {Daniel Arndt and Niklas Fehn and Guido Kanschat and Katharina Kormann and Martin Kronbichler and Peter Munch and Wolfgang A. Wall and Julius Witte},
+title = {{ExaDG} -- High-Order Discontinuous {G}alerkin for the Exa-Scale},
+booktitle="Software for Exascale Computing -- SPPEXA 2016--2019",
+series={Lecture Notes in Computational Science and Engineering 136},
+year="2020",
+publisher="Springer International Publishing",
+address="Cham",
+editor="Bungartz, Hans-Joachim
+and Nagel, Wolfgang E.
+and Reiz, Severin
+and Uekermann, Benjamin
+and Neumann, Philipp",
+doi = {10.1007/978-3-030-47956-5_8}
+}
+
+
+@techreport{DeSimoneHeltaiManigrasso2009,
+        Author = {A. DeSimone and L. Heltai and C. Manigrasso},
+        Institution = {SISSA},
+        Number = {42/2009/M},
+        Title = {Tools for the Solution of {PDEs} Defined on Curved Manifolds with deal.{II}},
+        Year = {2009}}
+
+@techreport{HeltaiMola2015,
+        Author = {L. Heltai and A. Mola},
+        Institution = {SISSA},
+        Title = {{Towards the Integration of CAD and FEM using open source libraries: a
+Collection of deal.II Manifold Wrappers for the OpenCASCADE Library}},
+        Year = 2015,
+        Note = {Submitted}}
+
+@techreport{HeltaiBangerthKronbichlerMola2019,
+  author =       {Heltai, L. and Bangerth, W. and Kronbichler, M. and Mola, A.},
+  title =        {Using exact geometry information in finite element computations},
+  institution =  {arXiv:1910.09824},
+  year =         2019}
+}
+
+@article{trilinos64,
+  author    = {C. Jhurani and
+               T. M. Austin and
+               M. A. Heroux and
+               J. M. Willenbring},
+  title     = {Supporting 64-bit global indices in {E}petra and other {T}rilinos
+               packages -- {T}echniques used and lessons learned},
+  journal   = {arXiv},
+  volume    = {1307.6638},
+  year      = {2013},
+  ee        = {http://arxiv.org/abs/1307.6638},
+  bibsource = {DBLP, http://dblp.uni-trier.de}
+}
+
+
+@Article{BH13,
+  author =       {Wolfgang Bangerth and Timo Heister},
+  title =        {What makes computational open source software libraries successful?},
+  journal =      {Computational Science \& Discovery},
+  year =         2013,
+  volume =       6,
+  pages =        {015010/1--18}}
+
+
+@Article{FHB13,
+  author =       {J. Frohne and T. Heister and W. Bangerth},
+  title =        {Efficient numerical methods for the large-scale, parallel
+                  solution of elastoplastic contact problems},
+  journal =      {submitted},
+  year =         2013}
+
+@Article{TKB16,
+  author =       {B. Turcksin and M. Kronbichler and W. Bangerth},
+  title =        {\textit{WorkStream} -- a design pattern for multicore-enabled finite element computations},
+  journal =      {ACM Transactions on Mathematical Software},
+  year =         2016,
+  volume =       43,
+  number =       1,
+  pages =        {2/1--2/29}
+}
+
+@Misc{cpp11,
+  key =          {C++11},
+  author =       {International Standards Organization},
+  title =        {{ISO/IEC} 14882:2011: The {C}++11 Programming Language Standard},
+  howpublished = {\url{http://www.iso.org/iso/iso_catalogue/catalogue_tc/catalogue_detail.htm?csnumber=50372}},
+  year =         2011}
+
+@Article{trilinos,
+  author =       {M. A. Heroux and R. A. Bartlett and V. E. Howle and R. J. Hoekstra and J. J. Hu
+                  and T. G. Kolda and R. B. Lehoucq and K. R. Long and R. P. Pawlowski and
+                  E. T. Phipps and A. G. Salinger and H. K. Thornquist and R. S. Tuminaro and
+                  J. M. Willenbring and A. Williams and K. S. Stanley},
+  title =        {An overview of the {T}rilinos project},
+  journal =      {ACM Trans. Math. Softw.},
+  year =         2005,
+  volume =       31,
+  pages =        {397--423}}
+
+@Misc{trilinos-web-page,
+     Author      = "M. A. Heroux and others",
+    Title      = "{Trilinos} web page",
+    Note     = "\url{http://trilinos.org}",
+    Year     = "2018"}
+
+# From http://www.mcs.anl.gov/petsc/documentation/referencing.html
+@Misc{petsc-web-page,
+            author = {S. Balay and S. Abhyankar and M.~F. Adams and J. Brown and P. Brune
+                      and K. Buschelman and L. Dalcin and V. Eijkhout and W.~D. Gropp
+                      and D. Karpeyev and D. Kaushik and M.~G. Knepley
+                      and D. May and L. Curfman McInnes and R. Mills and T. Munson
+                      and K. Rupp and P. Sanan B.~F. Smith and S. Zampini
+                      and H. Zhang and H. Zhang},
+            title =  {{PETS}c {W}eb page},
+            url =    {http://www.mcs.anl.gov/petsc},
+            howpublished = {\url{http://www.mcs.anl.gov/petsc}},
+            year = {2018}
+          }
+
+@TechReport{petsc-user-ref,
+            author = {S. Balay and S. Abhyankar and M.~F. Adams and J. Brown and P. Brune
+                      and K. Buschelman and L. Dalcin and V. Eijkhout and W.~D. Gropp
+                      and D. Karpeyev and D. Kaushik and M.~G. Knepley
+                      and D. May and L. Curfman McInnes and R. Mills and T. Munson
+                      and K. Rupp and P. Sanan B.~F. Smith and S. Zampini
+                      and H. Zhang and H. Zhang},
+            title  = {{PETS}c Users Manual},
+            institution = {Argonne National Laboratory},
+            year   = 2018,
+            number = {ANL-95/11 - Revision 3.9},
+            url    = {http://www.mcs.anl.gov/petsc}
+          }
+
+
+@Article{umfpack,
+  author =       {T. A. Davis},
+  title =        {Algorithm 832: {UMFPACK V4.3}---an unsymmetric-pattern multifrontal method},
+  journal =      {ACM Trans. Math. Softw.},
+  year =         2004,
+  volume =       30,
+  pages =        {196--199}}
+
+@Book{Rei07,
+  author =       {J. Reinders},
+  title =        {Intel Threading Building Blocks},
+  publisher =    {O'Reilly},
+  year =         2007}
+
+@Article{p4est,
+  author =       {C. Burstedde and L. C. Wilcox and O. Ghattas},
+  title =        {\texttt{p4est}: {S}calable algorithms for parallel
+                  adaptive mesh refinement on forests of octrees},
+  journal =      {SIAM J. Sci. Comput.},
+  volume =       33,
+  number =       3,
+  pages =        {1103-1133},
+  year =         2011}
+
+@Article{Burstedde2018,
+  author =       {C. Burstedde},
+  title =        {Parallel tree algorithms for {AMR} and non-standard data access},
+  journal =      {arXiv e-prints},
+  keywords =     {Computer Science - Distributed, Parallel, and Cluster Computing, 65D18, 65M50, 65Y05, 68W10},
+  year =         2018,
+  month =        {Mar},
+  eid =          {arXiv:1803.08432},
+  pages =        {arXiv:1803.08432},
+  archivePrefix = {arXiv},
+  eprint =       {1803.08432},
+  primaryClass = {cs.DC},
+  adsurl =       {https://ui.adsabs.harvard.edu/abs/2018arXiv180308432B},
+  adsnote =      {Provided by the SAO/NASA Astrophysics Data System}
+}
+
+@Book{arpack,
+  author =       {R. B. Lehoucq and D. C. Sorensen and C. Yang},
+  title =        {{ARPACK} users' guide: solution of large-scale eigenvalue problems with implicitly restarted Arnoldi methods},
+  publisher =    {SIAM, Philadelphia},
+  year =         1998}
+
+@Misc{mumps-web-page,
+  key =          {MUMPS},
+  title =        {{MUMPS: a MUltifrontal Massively Parallel sparse direct Solver}},
+  note =         {\url{http://graal.ens-lyon.fr/MUMPS/}}}
+
+
+@Article{ADE00,
+  author =       {P.R. Amestoy and I.S. Duff and J.-Y. L'Excellent},
+  title =        {Multifrontal parallel distributed symmetric and unsymmetric solvers},
+  journal =      {Comput. Methods in Appl. Mech. Eng.},
+  year =         2000,
+  volume =       184,
+  pages =        {501--520}}
+
+
+@article{MUMPS:1,
+   author  = {P. R. Amestoy and I. S. Duff and J. Koster and J.-Y. L'Excellent},
+   title   = {A Fully Asynchronous Multifrontal Solver Using Distributed Dynamic Scheduling},
+   journal = {SIAM Journal on Matrix Analysis and Applications},
+   volume  = {23},
+   number  = {1},
+   year    = {2001},
+   pages   = {15-41}
+ }
+
+
+@article{MUMPS:2,
+   author  = {P. R. Amestoy and A. Guermouche and J.-Y. L'Excellent and S. Pralet},
+   title   = {Hybrid scheduling for the parallel solution of linear systems},
+   journal = {Parallel Computing},
+   volume  = {32},
+   number  = {2},
+   year    = {2006},
+   pages   = {136-156}
+}
+
+@Misc{ginkgo-web-page,
+  key = {ginkgo},
+  title = {Ginkgo: high-performance linear algebra library for manycore
+    systems},
+  note ={\url{https://github.com/ginkgo-project/ginkgo}}
+}
+
+@Misc{opencascade-web-page,
+  key =          {OpenCASCADE},
+  title =        {{OpenCASCADE: Open CASCADE Technology, 3D modeling \& numerical simulation}},
+  note =         {\url{http://www.opencascade.org/}}}
+
+
+@Misc{muparser-web-page,
+  key =          {muparse},
+  title =        {{muparser: Fast Math Parser Library}},
+  note =         {\url{http://muparser.beltoforion.de/}}}
+
+@Misc{symengine-web-page,
+  key =          {symengine},
+  title =        {{SymEngine: fast symbolic manipulation library, written in C++}},
+  note =         {\url{https://github.com/symengine/symengine}, \url{http://sympy.org/}}}
+
+@Misc{hdf5,
+    author = {{The HDF Group}},
+    title = "{Hierarchical Data Format, version 5}",
+    year = {1997-2018},
+    note = {\url{http://www.hdfgroup.org/HDF5/}}
+}
+
+@article{karypis1998fast,
+  title={A fast and high quality multilevel scheme for partitioning irregular graphs},
+  author={Karypis, G. and Kumar, V.},
+  journal={SIAM J. Sci. Comput.},
+  volume={20},
+  number={1},
+  pages={359--392},
+  year={1998},
+  publisher={SIAM}
+}
+@article{rew1990netcdf,
+  title={{NetCDF}: an interface for scientific data access},
+  author={Rew, R. and Davis, G.},
+  journal={Computer Graphics and Applications, IEEE},
+  volume={10},
+  number={4},
+  pages={76--82},
+  year={1990},
+  publisher={IEEE}
+}
+@Article{Hernandez:2005:SSF,
+   author  = "V. Hernandez and J. E. Roman and V. Vidal",
+   title   = "{SLEPc}: A Scalable and Flexible Toolkit for the Solution of Eigenvalue
+              Problems",
+   journal = "{ACM} Trans. Math. Software",
+   volume  = "31",
+   number  = "3",
+   pages   = "351--362",
+   year    = "2005"
+}
+
+@article{Lachat1976,
+author = {Lachat, J. C. and Watson, J. O.},
+doi = {10.1002/nme.1620100503},
+issn = {0029-5981},
+journal = {International Journal for Numerical Methods in Engineering},
+number = {5},
+pages = {991--1005},
+title = {{Effective numerical treatment of boundary integral equations: A formulation for three-dimensional elastostatics}},
+url = {http://doi.wiley.com/10.1002/nme.1620100503},
+volume = {10},
+year = {1976}
+}
+
+@article{Telles-2005-a,
+author = {Telles, JCF},
+journal = {International Journal for Numerical Methods in Engineering},
+mendeley-groups = {FEM},
+mendeley-tags = {filedpapers},
+number = {5},
+publisher = {Wiley Online Library},
+title = {{A self-adaptive co-ordinate transformation for efficient numerical evaluation of general boundary element integrals}},
+type = {Journal article},
+volume = {24},
+year = {2005}
+}
+
+@article{GiulianiMolaHeltai-2015-a,
+author = {Giuliani, Nicola and Mola, Andrea and Heltai, Luca and Formaggia, Luca},
+doi = {10.1016/j.enganabound.2015.04.006},
+file = {:Users/heltai/Library/Mobile Documents/com\~{}apple\~{}CloudDocs/Mendeley//Giuliani et al.\_2015\_FEM SUPG stabilisation of mixed isoparametric BEMs application to linearised free surface flows.pdf:pdf},
+journal = {Engineering Analysis with Boundary Elements},
+keywords = {linearised free surface},
+pages = {8--22},
+title = {{FEM SUPG stabilisation of mixed isoparametric BEMs: application to linearised free surface flows}},
+volume = {59},
+year = {2015}
+}
+
+@book{Cottrell2009,
+author = {Cottrell, JA A and Hughes, TJR J R and Bazilevs, Y.},
+file = {:Users/heltai/Library/Mobile Documents/com\~{}apple\~{}CloudDocs/Mendeley/Cottrell, Hughes, Bazilevs\_2009\_Isogeometric analysis toward integration of CAD and FEA.pdf:pdf},
+mendeley-groups = {Igastokes,Books,Geostrophisics,FEM},
+publisher = {John Wiley \& Sons Inc},
+title = {{Isogeometric analysis: toward integration of CAD and FEA}},
+url = {http://books.google.com/books?hl=en\&lr=\&id=9Q9y0Xtz5E4C\&oi=fnd\&pg=PR5\&dq=Isogeometric+analysis:+toward+integration+of+CAD+and+FEA\&ots=JLSZtYQkL3\&sig=MZdoIBEu1cZs2sAwnPDy4WVOaVE},
+year = {2009}
+}
+
+@book{AbramowitzStegun,
+               author                = {M. Abramowitz and I.A. Stegun},
+               title                     = {Handbook of Mathematical Functions},
+               publisher            = {Dover},
+               year                    = {1965}
+}
+
+@techreport{MadayPatera,
+               author                 = {Y. Maday and A.T. Patera and E.M. Rønquist},
+                title                     = {A well-posed optimal spectral element approximation for the {S}tokes problem},
+               number                = {87-47},
+               institution            = {ICASE},
+               address                = {Hampton, VA},
+               year                    = {1987}
+}
+
+
+@article{MaierBardelloniHeltai-2016-a,
+        Author = {Matthias Maier and Mauro Bardelloni and Luca Heltai},
+        Journal = {Computers and Mathematics with Applications},
+        Title = {Linear{O}perator -- a generic, high-level expression syntax for linear algebra},
+        Doi = {10.1016/j.camwa.2016.04.024},
+        number = {1},
+        pages = {1--24},
+        volume = {72},
+        Year = {2016}}
+
+@misc{MaierBardelloniHeltai-2016-b,
+ author       = {Matthias Maier and
+                 Mauro Bardelloni and
+                 Luca Heltai},
+ title        = {{LinearOperator Benchmarks, Version 1.0.0}},
+ month        = mar,
+ year         = 2016,
+ doi          = {10.5281/zenodo.47202},
+ url          = {http://dx.doi.org/10.5281/zenodo.47202}
+}
+
+@article{Davydov2016,
+  Author = {Denis Davydov and Tymofiy Gerasimov and Jean-Paul Pelteret and Paul Steinmann},
+       Day = {12},
+       Doi = {10.1186/s40323-017-0093-0},
+       Issn = {2213-7467},
+       Journal = {Advanced Modeling and Simulation in Engineering Sciences},
+       Month = {Dec},
+       Number = {1},
+       Pages = {7},
+       Title = {Convergence study of the h-adaptive {PUM} and the hp-adaptive {FEM} applied to eigenvalue problems in quantum mechanics},
+       Volume = {4},
+       Year = {2017},
+}
+
+@misc{gsl2016,
+    author        = {Galassi, M and Davies, J and Theiler, J and Gough, B and Jungman, G and Alken, P and Booth, M and Rossi, F and Ulerich, R},
+    title         = {GNU Scientific Library Reference Manual (Edition 2.3)},
+    journal       = {Library available online at http://www. gnu. org/software/gsl},
+    year          = {2016}
+}
+
+@misc{nanoflann,
+  author = {Blanco, Jose Luis and Rai, Prankal Kumar},
+  title = {nanoflann: a {C}++ header-only fork of {FLANN}, a library for
+    {N}earest {N}eighbor ({NN}) with {KD}-trees},
+  howpublished = {\url{https://github.com/jlblancoc/nanoflann}},
+  year = {2014}
+}
+
+@inproceedings{adol-c,
+  author = {A. Walther and A. Griewank},
+  title = {Getting started with {ADOL}-{C}},
+  booktitle = {Combinatorial Scientific Computing},
+  publisher = {U. Naumann and O.Schenk},
+  series = {Chapman-Hall CRC Computational Science},
+  pages = {181-202},
+  year = {2012}
+}
+
+@Article{Griewank1996a,
+  author    = {Griewank, Andreas and Juedes, David and Utke, Jean},
+  title     = {Algorithm 755: {ADOL-C}: a package for the automatic differentiation of algorithms written in {C/C++}},
+  journal   = {ACM Transactions on Mathematical Software (TOMS)},
+  year      = {1996},
+  volume    = {22},
+  number    = {2},
+  pages     = {131--167},
+  doi       = {10.1145/229473.229474},
+  publisher = {ACM},
+}
+
+@article{sundials,
+  title={{SUNDIALS}: Suite of nonlinear and differential/algebraic equation solvers},
+  author={Hindmarsh, Alan C and Brown, Peter N and Grant, Keith E and Lee, Steven L and Serban, Radu and Shumaker, Dan E and Woodward, Carol S},
+  journal={ACM Transactions on Mathematical Software (TOMS)},
+  volume={31},
+  number={3},
+  pages={363--396},
+  year={2005},
+  publisher={ACM}
+}
+
+@article{assimp,
+  title={Open asset import library (assimp)},
+  author={Schulze, Thomas and Gessler, Alexander and Kulling, Kim and Nadlinger, David and Klein, Jonathan and Sibly, Mark and Gubisch, Matthias},
+  journal={Computer Software, URL: https://github. com/assimp/assimp},
+  year={2012}
+}
+
+@Misc{clang-tidy,
+  Title                    = {{Clang-Tidy}},
+  Author                   = {LLVM},
+  HowPublished             = {\url{http://clang.llvm.org/extra/clang-tidy/}},
+}
+
+@Misc{coverity,
+  Title                    = {{C}overity {S}can ({Synopsys, Inc.})},
+  Key = {Coverity},
+  HowPublished             = {\url{https://scan.coverity.com}},
+}
+
+@TechReport{GHPB16,
+  author =       {R. Gassm{\"o}ller and E. Heien and E. G. Puckett and W. Bangerth},
+  title =        {Flexible and scalable particle-in-cell methods for massively parallel computations},
+  institution =  {arXiv:1612.03369},
+  year =         2016}
+
+
+@Article{KHB12,
+  author =      {M. Kronbichler and T. Heister and W. Bangerth},
+  title =       {High Accuracy Mantle Convection Simulation through Modern Numerical Methods},
+  journal =     {Geophysics Journal International},
+  year =        2012,
+  volume =      191,
+  pages =       {12--29}}
+
+@Article{HDGB17,
+  author =       {T. Heister and J. Dannberg and R. Gassm{\"o}ller and W. Bangerth},
+  title =        {High Accuracy Mantle Convection Simulation through Modern Numerical Methods. {II}: Realistic Models and Problems},
+  journal =      {Geophysics Journal International},
+  year =         2017,
+  volume =    210,
+  pages =     {833--851}}
+
+@techreport{ridzal2014rapid,
+  title={Rapid Optimization Library.},
+  author={Ridzal, Denis and Kouri, Drew Philip},
+  year={2014},
+  institution={Sandia National Laboratories (SNL-NM), Albuquerque, NM (United States)}
+}
+
+@BOOK{slug,
+  AUTHOR = {Blackford, L. S. and Choi, J. and Cleary, A. and
+            D'Azevedo, E. and Demmel, J. and Dhillon, I. and
+            Dongarra, J. and Hammarling, S. and Henry, G. and
+            Petitet, A. and Stanley, K. and Walker, D. and
+            Whaley, R. C.},
+  TITLE = {{ScaLAPACK} Users' Guide},
+  PUBLISHER = {Society for Industrial and Applied Mathematics},
+  YEAR = {1997},
+  ADDRESS = {Philadelphia, PA},
+  ISBN = {0-89871-397-8 (paperback)}
+}
+
+@article{GiulianiMolaHeltai-2018-a,
+       Author = {Giuliani, Nicola and Mola, Andrea and Heltai, Luca},
+       Journal = {Advances in Engineering Software},
+       Number = {March},
+       Pages = {39--58},
+       Title = {{$\pi$-BEM: A flexible parallel implementation for adaptive, geometry aware, and high order boundary element methods}},
+       Volume = {121},
+       Year = {2018}}
+
+@article{geuzaine2009gmsh,
+  title={Gmsh: A 3-D finite element mesh generator with built-in pre-and post-processing facilities},
+  author={Geuzaine, Christophe and Remacle, Jean-Fran{\c{c}}ois},
+  journal={International journal for numerical methods in engineering},
+  volume={79},
+  number={11},
+  pages={1309--1331},
+  year={2009},
+  publisher={Wiley Online Library}
+}
+
+@TechReport{ClevengerHeisterKanschatKronbichler2019,
+  author =       {Clevenger, T. C. and Heister, T. and Kanschat, G. and Kronbichler, M.},
+  title =        {A flexible, parallel, adaptive geometric multigrid method for {FEM}},
+  institution =  {arXiv:1904.03317},
+  year =         2019}
+
+
+@BOOK{lapack,
+    AUTHOR = {Anderson, E. and Bai, Z. and Bischof, C. and
+              Blackford, S. and Demmel, J. and Dongarra, J. and
+              Du Croz, J. and Greenbaum, A. and Hammarling, S. and
+              McKenney, A. and Sorensen, D.},
+    TITLE = {{LAPACK} Users' Guide},
+    EDITION = {Third},
+    PUBLISHER = {Society for Industrial and Applied Mathematics},
+    YEAR = {1999},
+    ADDRESS = {Philadelphia, PA},
+    ISBN = {0-89871-447-8 (paperback)}
+}
+
+@misc{Pelteret2016a,
+  author    = {Pelteret, J-P. V. and McBride, A.},
+  title     = {The \texttt{deal.II} code gallery: Quasi-Static Finite-Strain Compressible Elasticity},
+  year      = {2016},
+  url       = {https://dealii.org/developer/doxygen/deal.II/code_gallery_Quasi_static_Finite_strain_Compressible_Elasticity.html},
+  note      = {Accessed April 2018. doi: \href{http://dx.doi.org/10.5281/zenodo.1228964}{\texttt{10.5281/zenodo.1228964}}},
+  doi       = {10.5281/zenodo.1228964},
+}
+
+@InCollection{Bartlett2006a,
+  author        = {Bartlett, R. A. and Gay, D. M. and Phipps, E. T.},
+  title         = {Automatic Differentiation of C++ Codes for Large-Scale Scientific Computing},
+  booktitle     = {International Conference on Computational Science {\textendash} {ICCS} 2006},
+  publisher     = {Springer Berlin Heidelberg},
+  year          = {2006},
+  editor        = {Alexandrov, V.N. and van Albada, G.D. and Sloot, P.M.A. amd Dongarra, J.},
+  pages         = {525--532},
+  doi           = {10.1007/11758549_73},
+  organization  = {Springer},
+}
+
+@Misc{cusolver,
+  key = {cusolver},
+  title = {cu{SOLVER} {L}ibrary},
+  note = {\url{https://docs.nvidia.com/cuda/cusolver/index.html}}
+}
+
+@Misc{cusparse,
+  key = {cusparse},
+  title = {cu{SPARSE} {L}ibrary},
+  note = {\url{https://docs.nvidia.com/cuda/cusparse/index.html}}
+}
+
+
+@article{BR85,
+  doi = {10.1090/s0025-5718-1985-0771031-7},
+  url = {https://doi.org/10.1090/s0025-5718-1985-0771031-7},
+  year = {1985},
+  publisher = {American Mathematical Society ({AMS})},
+  volume = {44},
+  number = {169},
+  pages = {71--79},
+  author = {Christine Bernardi and Genevi$\lbrace${\`{e}}ve Raugel},
+  title = {Analysis of some finite elements for the {S}tokes problem},
+  journal = {Mathematics of Computation}
+}
+
+@PhdThesis{Zag06,
+  author =       {S. Zaglmayr},
+  title =        {High Order Finite Element Methods for Electromagnetic Field Computation},
+  school =       {Johannes Kepler University, Linz, Austria},
+  year =         2006}
+
+
+@article{Kynch2017,
+  doi = {10.1016/j.compstruc.2016.05.021},
+  url = {https://doi.org/10.1016/j.compstruc.2016.05.021},
+  year = {2017},
+  month = mar,
+  publisher = {Elsevier {BV}},
+  volume = {181},
+  pages = {41--54},
+  author = {R. M. Kynch and P. D. Ledger},
+  title = {Resolving the sign conflict problem for hp{\textendash}hexahedral {N}{\'{e}}d{\'{e}}lec elements with application to eddy current problems},
+  journal = {Computers {\&} Structures}
+}
+
+@inproceedings{ljungkvist2017,
+ author = {Ljungkvist, Karl},
+ title = {Matrix-free Finite-element Computations on Graphics Processors with Adaptively Refined Unstructured Meshes},
+ booktitle = {Proceedings of the 25th High Performance Computing Symposium},
+ series = {HPC '17},
+ year = {2017},
+ isbn = {978-1-5108-3822-2},
+ location = {Virginia Beach, Virginia},
+ pages = {1:1--1:12},
+ articleno = {1},
+ numpages = {12},
+ url = {http://dl.acm.org/citation.cfm?id=3108096.3108097},
+ acmid = {3108097},
+ publisher = {Society for Computer Simulation International},
+ address = {San Diego, CA, USA},
+ keywords = {GPU, adaptive refinement, finite element methods, hanging nodes, matrix free},
+}
+
+@article{hoefler2010scalable,
+  title={Scalable communication protocols for dynamic sparse data exchange},
+  author={Hoefler, Torsten and Siebert, Christian and Lumsdaine, Andrew},
+  journal={ACM Sigplan Notices},
+  volume={45},
+  number={5},
+  pages={159--168},
+  year={2010},
+  publisher={ACM New York, NY, USA}
+}
+
+@techreport{munch2020hyperdeal,
+    title={hyper.deal: An efficient, matrix-free finite-element library for high-dimensional partial differential equations},
+    author={Peter Munch and Katharina Kormann and Martin Kronbichler},
+    year={2020},
+    institution={arXiv:2002.08110}
+}
+
+@article{Gordon82,
+author = {Gordon, William J. and Thiel, Linda C.},
+title = {Transfinite mappings and their application to grid generation},
+journal = {Appl. Math. Comput.},
+volume = 10,
+pages = {171--233},
+year = 1982,
+doi = {10.1016/0096-3003(82)90191-6}
+}
+
+@article{BabuskaSuri1990,
+  title = {The p- and h-p versions of the finite element method, an overview},
+  author = {Babuška, I. and Suri, M.},
+  year = {1990},
+  journal = {Computer Methods in Applied Mechanics and Engineering},
+  volume = {80},
+  pages = {5--26},
+  issn = {0045-7825},
+  doi = {10.1016/0045-7825(90)90011-A},
+  number = {1}
+}
+
+@article{Mavriplis1994,
+  title = {Adaptive mesh strategies for the spectral element method},
+  author = {Mavriplis, C.},
+  year = {1994},
+  journal = {Computer Methods in Applied Mechanics and Engineering},
+  volume = {116},
+  pages = {77--86},
+  issn = {0045-7825},
+  doi = {10.1016/S0045-7825(94)80010-3},
+  number = {1}
+}
+
+@article{MelenkWohlmuth2001,
+  title = {On residual-based a posteriori error estimation in \textit{hp}-{{FEM}}},
+  author = {Melenk, J. M. and Wohlmuth, B. I.},
+  year = {2001},
+  journal = {Advances in Computational Mathematics},
+  volume = {15},
+  pages = {311--331},
+  issn = {1019-7168, 1572-9044},
+  doi = {10.1023/A:1014268310921},
+  number = {1-4}
+}
+
+@inproceedings{HoustonSeniorSueli2003,
+  title = {Sobolev regularity estimation for hp-adaptive finite element methods},
+  booktitle = {Numerical {{Mathematics}} and {{Advanced Applications}}},
+  author = {Houston, P. and Senior, B. and Süli, E.},
+  editor = {Brezzi, Franco and Buffa, Annalisa and Corsaro, Stefania and Murli, Almerico},
+  year = {2003},
+  pages = {631--656},
+  publisher = {{Springer Milan}},
+  location = {{Milano}},
+  doi = {10.1007/978-88-470-2089-4_58},
+  isbn = {978-88-470-2089-4}
+}
+
+@article{HoustonSueli2005,
+  title = {A note on the design of \textit{hp}-adaptive finite element methods for elliptic partial differential equations},
+  author = {Houston, P. and Süli, E.},
+  year = {2005},
+  journal = {Computer Methods in Applied Mechanics and Engineering},
+  volume = {194},
+  pages = {229--243},
+  issn = {0045-7825},
+  doi = {10.1016/j.cma.2004.04.009},
+  number = {2}
+}
+
+@article{EibnerMelenk2007,
+  title = {An adaptive strategy for \textit{hp}-{{FEM}} based on testing for analyticity},
+  author = {Eibner, T. and Melenk, J. M.},
+  year = {2007},
+  journal = {Computational Mechanics},
+  volume = {39},
+  pages = {575--595},
+  issn = {1432-0924},
+  doi = {10.1007/s00466-006-0107-0},
+  number = {5}
+}
+
+
+
+@Article{GLHPB18,
+  doi = {10.1029/2018gc007508},
+  url = {https://doi.org/10.1029/2018gc007508},
+  year = {2018},
+  month = sep,
+  publisher = {American Geophysical Union ({AGU})},
+  volume = {19},
+  number = {9},
+  pages = {3596--3604},
+  author = {Rene Gassm\"{o}ller and Harsha Lokavarapu and Eric Heien and Elbridge Gerry Puckett and Wolfgang Bangerth},
+  title = {Flexible and Scalable Particle-in-Cell Methods With Adaptive Mesh Refinement for Geodynamic Computations},
+  journal = {Geochemistry,  Geophysics,  Geosystems}
+}
+
+@article{Brenner2005,
+  doi = {10.1007/s10915-004-4135-7},
+  url = {https://doi.org/10.1007/s10915-004-4135-7},
+  year = {2005},
+  month = jun,
+  publisher = {Springer Science and Business Media {LLC}},
+  volume = {22-23},
+  number = {1-3},
+  pages = {83--118},
+  author = {Susanne C. Brenner and Li-Yeng Sung},
+  title = {$C^0$ Interior Penalty Methods for Fourth Order Elliptic Boundary Value Problems on Polygonal Domains},
+  journal = {Journal of Scientific Computing}
+}
+
+@Article{clevenger_stokes19,
+  Title                    = {Comparison between Algebraic and Matrix-free Geometric Multigrid for a {S}tokes Problem},
+  Author                   = {Thomas C. Clevenger and Timo Heister},
+  Journal                  = {submitted},
+  Year                     = {2019},
+  Url                      = {https://arxiv.org/abs/1907.06696}
+}

In the beginning the Universe was created. This has made a lot of people very angry and has been widely regarded as a bad move.

Douglas Adams


Typeset in Trocchi and Trocchi Bold Sans Serif.