Comment cleanup in Quadrature

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22700 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Implement face iterators also in 1d -- i.e. you can write cell->face()->at_boundary() and similar queries also for 1d triangulations.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22699 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

hide calls to sub-makes

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22698 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

...and remove deleted dependency

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22697 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove duplication of make functionparser

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22696 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add a function that resets the pointer and deletes the object pointed to

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22695 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

remove n_quadrature_points member variable after being deprecated for nearly 3 years

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22694 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

do not use deprecated access to Quadrature::n_quadrature_points anymore

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22693 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Get rid of the declaration of a specialization that now no longer exists.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22692 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

avoid another problem in 1D

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22691 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Disable the TriaAccessor<0,dim,spacedim> class completely.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22690 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Modify Guido's change in r22657 so that we only really provide the
additional functions for TriaAccessor<0,1,spacedim>, not for the more
general class TriaAccessor<0,dim,spacedim>. This moves us in the
direction where we ask 1d cells for cell->face() which will return an
object of the kind TriaAccessor<0,1,spacedim>.

We could in principle implement the more general case as well, but
that would only be useful if we want to do get the end points of a
face in 2d, for example (TriaAccessor<0,2,spacedim>) but there is no
use for such a thing in dimension independent programming.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22689 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

remove mutex after several tests did not produce any clashes

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22688 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make bits/grid_generator_01 work again.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22687 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make compile.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22686 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Produce some output.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22685 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Some more.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22684 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Use a more elegant way to do nothing.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22683 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix compiler errors

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22682 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Automatically delete source/Makefile.dep if remaking fails

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22681 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fixed wrong numbering of degrees of freedom in interface_constraints

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22680 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove unnecessary directory.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22679 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Avoid a few compiler warnings.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22678 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Avoid compiler warning on zero-sized arrays.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22677 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Change distributed and fe directories so that files are compiled only once and not for each dimension once.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22676 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fixed size of interface_constraints in FE_Nedelec

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22675 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove unnecessary include file.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22674 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Typo.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22673 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Nicer way to initialize pointer.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22672 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Try to allocate exact sizes for entries in close() function

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22671 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Update some more.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22670 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

One paper that has appeared.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22669 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Use common style.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22668 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Update.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22667 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

PETSc::SparseMatrix now gives an error in debug mode when you try to add additional non-zero entries.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22666 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add necessary header files.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22665 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add documentation. Simplify.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22664 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

New test.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22663 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Use std_cxx1x::shared_ptr instead of boost::shared_ptr.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22662 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Reverted previous bug fix and removed offending code

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22661 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Bug fix on missing iostream include

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22660 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Update publications

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22659 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

set ignore flags

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22658 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add pseudo-functionality to 0-dim TriaAccessor and remove specialization for GridGenerator::

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22657 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix last patch deal with petty compiler behavior

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22656 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Rename back all files in grid/ since the entire directory has now been converted and we can state in the Makefile that this is a dimension-independent directory.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22655 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Convert the remaining files in this directory.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22654 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Provide output when re-making Makefile.dep.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22653 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

More in the same direction.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22652 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

One more file moved to compile-once mode.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22651 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add comment to function that Guido had already checked in. Thanks! (I
had it in my tree, but had forgotten to check it in...)

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22650 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

test cochain runs on 2D with local refinement and on 3D with global

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22649 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

More conversions to compile only once.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22648 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add outut to identify grid

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22647 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove Makefile.dep here as well

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22646 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

First test for integrators... failing due to program crashing in constructor of FE_Nedelec in 3D. Results being produced for 2D and 3D-P0 are good

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22645 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Library compiles again ;)

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22644 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add option of inverting blocks with SVD

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22643 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add local integrators and list namespaces in module

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22642 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

More steps towards compiling each file only once.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22641 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make sure we include "../tests.h"

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22640 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

More changes to compile only once.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22639 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Convert yet one more file.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22638 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Convert one more file.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22637 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Another file that needs to be compiled only once. Shaves 4 seconds off overall compile time :-)

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22636 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

remove unused directory

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22635 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Re-generate the dependency lists for the */Makefile.dep files if any
of the .cc files change.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22634 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Do rounding explicitly.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22633 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make sure online documentation shows the classes related to MPI and p4est as well.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22632 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

introduce templates for LAPACK functions

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22631 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove a part of the Makefile that has long been unused (in build-test-do):
# if test -d tests ; then \
#    @echo BEGIN MAKE TESTS OUTPUT `date -u '+%Y-%m-%d %T'` ; \
#    cd tests ; $(MAKE) report+mail ; \
#    @echo END MAKE TESTS OUTPUT `date -u '+%Y-%m-%d %T'` ; \
#    @echo ; \
#  fi

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22630 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

some restructuring and test for SVD

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22629 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

implement SVD

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22628 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

allow for different mail programs. I am sure we did that in earlier versions, but the functuonality must have been sacrificed...
now we can test on mashines without working mail again

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22627 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Ensure that all values we work with are finite.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22626 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Couple more lines.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22625 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove targets related to a recently removed file.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22624 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix a couple wrong links in the documentation.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22623 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

run autoconf on previous change

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22622 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Test for new version of SVD

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22621 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix end-of-group marker.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22620 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

change default back to just running tests without producing report (the old behavior)

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22619 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Extend documentation.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22618 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make compile again.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22617 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make sure we also build ../include/deal.II/lac/lapack_templates.h in time.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22616 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove a mark of todos that I had long taken care of.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22615 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

check for more LAPACK

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22614 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make sure we build the .inst files as well.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22613 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Patch by Matrin Kronbichler: Make things work with Trilinos 9 again.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22612 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

start some work on SVD

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22611 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

A very minor correction to configure --help

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22610 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Ensure that we only rebuild those parts of the Makefile that are really necessary. This didnt

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22609 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add a sentence.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22608 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

More updated test results.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22607 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix typo in FE_Nedelec

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22606 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Update output: the location of the error message has moved from the .h file to the .cc file in r22506.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22605 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make sure we don't call GridTools::partition_triangulation on
parallel::distributed::Triangulation objects.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22604 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove now no longer used third Makefile template.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22603 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Documentation fixes.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22602 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Bring in synch with the Makefile.small template.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22601 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d