Use 'entries.back()' instead of '*--entries.end()' which is not only easier to
read but also compiles with the SGI compiler.

Re-indent inline functions.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@18363 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Include <sstream> instead of <ostream> and hope that it provides the right
declarations. The old way failed with the SGI compiler.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@18362 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Move DEAL_II_NAMESPACE_OPEN to where it belongs.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@18358 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Don't let doxygen see some inline functions since it complains that it doesn't know which declaration they belong to.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@18354 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

DETAILS_AT_TOP has become obsolete with doxygen 1.5.7

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@18353 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Update output file.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@18352 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Set variable to correct size before passing to DoFTools::count_dofs_per_component.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@18351 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Set output array to correct size and only output elements that were actually written to.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@18350 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Set output array to correct size and only output elements that were actually written to.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@18349 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Set variable to correct size before passing to DoFTools::count_dofs_per_component.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@18348 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add one more testcase.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@18340 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix erroneous resizing of output argument in count_dofs_per_component/block.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@18339 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Link to tutorial.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@18338 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Avoid a problem with doxygen not finding the matching declaration of a function.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@18337 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix language based on feedback.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@18336 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add language

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@18335 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add one more.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@18334 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Some more things to make step-32 more similar to step-31.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@18323 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Optimized constructor of Trilinos matrices on one processor. This makes assembly and some other initialization operations a bit faster.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@18322 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make the compute_viscosity function 'const'.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@18312 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make the compute_viscosity function 'const'.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@18311 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Bring step-32 back in line with step-31 (at least for the moment, so that we can compare more easily): revert to artificial viscosity with beta=0.015, alpha=1; use gravity pointing upward; introduce the factor of 2 in the Stokes matrix that makes the difference between the symmetric gradient and the gradient.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@18310 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Reset to the same testcase as in step-31 so we can compare.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@18308 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

A patch by Victor Prosolin <flyaway1212@gmail.com> that fixes an oversight: When we write GMSH version 2 files, we also need to treat vertices properly.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@18305 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Notice server name change for svn.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@18303 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Dummy Trilinos objects need to be generated with MPI_COMM_SELF rather than MPI_COMM_WORLD in order to avoid dead-locks when only using subcommunicators.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@18302 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Update comments in Trilinos AMG preconditioner.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@18300 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix testcase for good this time.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@18298 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix two issues that for whatever reason only on mac osx wouldn't compile.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@18297 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove apparent leftover from times when I was trying out things with boost.graph.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@18283 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

We can do the writing into Trilinos vectors better. Create a reference to daxpy in Lapack templates (not used anywhere right now, but can be nice to have).

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@18282 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

A few small changes that make the program a bit faster.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@18281 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Also rename ThreadMutex->Mutex and ThreadCondition->ConditionVariable in non-MT mode.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@18278 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Apply the changes that I accidentally submitted to the old server yesterday. Now the timer class makes sense in MPI, too, and the FEValues::get_function_xxx have a shortcut when the vector contains zeros.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@18277 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Address the important problem that previously, whenever the last Threads::Thread<> object went out of scope, the location where a thread would deposit its return value was in deleted memory and thus potentially very bad. We now handle this by making sure that the thread itself keeps a lock on the destruction of the object in which the return_value is located, by keeping another shared_ptr to it, and only releases the lock whenever the return value has been deposited.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@18272 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Ignore report files I save for various svn revisions.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@18264 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Put back in the code that (de-)registers threads and catches exceptions.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@18262 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Implement sensible copy semantics for the Mutex class.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@18260 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make compile on systems without cstdint.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@18259 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add directories that apparently need to exist on x86_64 even though we don't appear to need them on x86.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@18258 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Re-adjust tolerances again and produce new 'real generic' output.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@18257 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@18256 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add a few more.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@18255 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add a TODO.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@18251 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Re-apply Martin's patch 18223, since we now produce the correct instantiations.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@18248 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Generate a number of instantiations automatically using the pre-processor. This should hopefully take care of the instantiations that were missing for Martin's change 18223.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@18247 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add an explicit instantiation.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@18246 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Also compile for codim-1.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@18245 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Undo Martin's patch 18223 for a moment since it leads to linker errors about an undefined function.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@18244 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Revise the SPARSITY_PATTERN expansion.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@18243 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Generate an expansion variable for sparsity patterns.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@18242 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Set properties.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@18235 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Properly set properties.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@18234 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Properly set properties.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@18233 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add required include file.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@18232 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Replace a C assert() by our own Assert().

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@18231 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Implement Mutex and ConditionVariable using boost or C++0x support.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@18230 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add include files for mutices and condition variables.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@18229 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Initialize a variable to avoid (spurious) warnings.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@18228 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Check for a bug in gcc C++0x support.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@18227 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Only compile boost threads when threads are actually required.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@18226 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Update list of publications.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@18225 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Use CompressedSimpleSparsityPattern to create mass matrix sparsity pattern in project function, which uses less memory.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@18223 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make compile.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@18222 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Provide the boost thread implementation only if the C++ compiler doesn't.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@18221 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Set properties.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@18220 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Set properties.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@18219 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Use boost threads instead of doing everything ourselves by hand calling POSIX and what not. Makes our code a lot simpler as well :-)

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@18218 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Check for all those new C++0x header files.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@18217 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix output.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@18216 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix HalfHyperShellBoundary in 3d.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@18215 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make sure we can use namespace std_cxx0x=std in C++0x mode.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@18210 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Mention TimerOutput class.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@18209 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix stupid mistake in non-C++0x mode.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@18208 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fixed a few functions so that TimerOutput actually works.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@18207 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Detect whether compiler supports C++0x and if so enable it through the compatibility header files.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@18206 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add missing header file for newer compilers (needed for std::abort).

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@18205 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Use alternative form to get at the elements of a tuple. Only this latter form is sanctioned by C++0x.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@18204 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Use new namespace std_cxx0x.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@18202 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove unnecessary include from boost.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@18201 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Use new namespace std_cxx0x.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@18200 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@18199 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Use new namespace std_cxx0x.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@18198 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Use namespace std_cxx0x where appropriate. The only place where we don't is where we use boost::graph, which isn't going to be part of C++0x as far as I know.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@18197 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Use the new namespace std_cxx0x in lac/ as well.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@18196 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove unnecessary include files.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@18195 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Use a namespace std_cxx0x and import into it elements from BOOST. If a compiler at a later time supports C++0x we can make things easier on us because we only have to modify this one place, rather than all throughout the code.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@18194 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add missing include file.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@18193 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

roundoff

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@18192 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

cell_JxW_values, which was not really the right concept, has been removed

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@18191 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

improved has_support_on_face in RaviartThomasNodal

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@18189 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Use data structures better adjusted to the task. Use proper doxygen comment format.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@18188 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Use a reasonable final time.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@18186 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Provide a function for generating nice output of computing times. Use that in step-32.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@18185 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Slight update in comments.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@18184 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove generated files.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@18182 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Suppress miniscule numbers.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@18180 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Regenerate output after Guido's transform() changes.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@18179 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Match output precision to avoid up- or down-rounding.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@18178 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Match output precision to avoid up- or down-rounding.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@18177 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d