Merge pull request #5344 from drwells/fix-periodicity-index

Fix a tensor index.

Fix a tensor index.

Merge pull request #5341 from gassmoeller/fix_data_out_filter_test

Fix recent test and test result

Fix test and test result

Merge pull request #5340 from bangerth/add-assertion

Add an assertion to provide a nicer error message.

Add an assertion to provide a nicer error message.

Merge pull request #5331 from luca-heltai/tuple-pattern

Patterns::Tuple

Added another constructor type.

Fixed typo.

Merge pull request #5261 from gassmoeller/fix_data_out_filter

Restructure DataOutFilter

Merge pull request #5332 from jppelteret/tests-sacado_2

Add some Sacado::RFad and nested RFad-DFad examples to the testsuite

Merge pull request #5334 from gassmoeller/reintroduce_old_interpolate

Reintroduce old `VectorTools::interpolate` as fallback

Added variadic versions.

Merge pull request #5333 from bangerth/dataout-complex

Let DataOut vector wrappers report whether the data type is complex.

Update documentation

Restructure DataOutFilter

Reinsert old function

Merge pull request #5321 from vishalkenchan/shared_tria/restore_protected_behavior

re-declare update_number_cache() as protected

Merge pull request #5318 from masterleinad/fix_boost_iostreams

Fix boost iostreams

Merge pull request #5330 from masterleinad/restrict_boost_requirements

Relax requirements for external BOOST for DEAL_WITH_ZLIB=OFF

Merge pull request #5329 from masterleinad/remove_bzip2

Remove BZIP2 dependency

Let DataOut vector wrappers report whether the data type is complex.

Merge pull request #5322 from tjhei/gzip_optional

make zlib optional

Reinsert test

Add some Sacado::RFad and nested RFad-DFad examples to the testsuite

Merge pull request #5277 from kronbichler/renumber_mg_dofs_parallel

Implement parallel DoF renumbering on multigrid levels

make zlib optional

distributed DoFHandler and GridTools::exchange_cell_data_to_ghosts
relied on gzip support inside boost but we enable/require
boost::iostreams if and only if DEAL_II_WITH_ZLIB=ON. Disable
compressing the streams in that case.

Fixed comments by Denis

New tuple pattern.

Merge pull request #5310 from nicola-giuliani/telles_bug

typo in qtelles

Merge pull request #5315 from gassmoeller/fix_vector_tools_interpolate

Fix VectorTools::interpolate for parallel computations

Merge pull request #5325 from bangerth/fix-exceptions

Add a check when comparing iterators.

Merge pull request #5328 from tjhei/exc_messages

add exception messages

Remove BZIP2 from the documentation

Add extra guard fo BOOST setup

Fix VectorTools::interpolate

Relax requirements for external BOOST for DEAL_WITH_ZLIB=OFF

Merge pull request #5233 from bangerth/function-template-arg

Rename the scalar template type of Function and derived classes.

Remove BZIP2 dependency

Merge pull request #5326 from tamiko/fix_numdiff_check

Avoid numdiff check race condition in test

add exception messages

towards #610

Merge pull request #5327 from masterleinad/fix_typo_cmake_doc

Fix typo in description of CMake setup for packages

Fix typo

Add additional error string and name the boost libraries with absolute pathes

Move check to configure_boost.cmake

redeclare update_number_cache() as protected

Avoid numdiff check race condition in test

Use randomly generated file names for collision free (concurrent) checks
for numdiff support.

Otherwise, if a test subproject is configured concurrently (which might
happen if ctest accidentally triggers a reconfigure due to changed files
in the main project), the following error might occur:
    "The detected numdiff executable was not able to pass a simple relative
    tolerance test."

Revert "Avoid numdiff check race condition in test"

This reverts commit 41d4678230e24635583eb892fdf473c5d6847a05.

Merge pull request #5323 from tjhei/test_numdiff_race_condition

Avoid numdiff check race condition in test

Check that Boost.Iostreams is usuable for an external BOOST package

Merge pull request #5312 from jppelteret/tests-sacado

Add some modified Sacado::Fad::DFad examples to the testsuite

Merge pull request #5319 from davydden/lapack-add

add LAPACKFullMatrix::add()

Merge pull request #5324 from tjhei/zlib_test_output

fix zlib tests

Add a check when comparing iterators.

Right now, comparing iterators only compares their level and index, but surprisingly
not the triangulation pointers. There is an assertion higher up that makes sure
that if the triangulation pointers of both objects are both non-nullptr, that they
are the same, but it is conceivable that one of the objects in invalid and the
other has a valid pointer. Internally, if that is the case, we have the invariant
that for iterators for which the triangulation pointer is nullptr, that the
level and index values are also invalid, and so nothing bad can happen (TM) with
the current code.

But it still seems prudent to also compare triangulation pointers, even if we know
that if one only of the pointers is nullptr, then the other comparisons for equality
must necessarily also fail because of the invariant -- we should just err on the
side of safety.

I've thought whether the pointers should be compared first or last. I put it first
because I think that the common case is to compare 'cell != endc', and in that
case one has a valid pointer and the other does not, so the first check will
already fail.

fix zlib tests

Avoid numdiff check race condition in test

Do not remove the test files to avoid a race condition if
cmake decides to rerun in a concurrent situation. Otherwise this would
trigger the following error:
"The detected numdiff executable was not able to pass a simple relative
tolerance test."

added test for singular integration

typo in qtelles

add LAPACKFullMatrix::add()

Merge pull request #5316 from bangerth/fix-exceptions

Avoid exceptions without message.

Merge pull request #5308 from bangerth/change-signature

Change argument of DoFRenumbering::downstream() to Tensor<1,dim>.

Add some modified Sacado::Fad::DFad examples to the testsuite

Adjust tests.

Avoid exceptions without message.

Merge pull request #5267 from davydden/unit_tests_docu

extend example of user projects testsuite to contain header files

Merge pull request #5311 from kronbichler/avoid_vector_view

Replace use of VectorView in library

mention how to include the main header

Merge pull request #5313 from gassmoeller/fix_mapping_cartesian

Fix mapping cartesian update inverse jacobian

Fix mapping cartesian

Add changelog.

Merge pull request #5150 from gassmoeller/add_distributed_refinement_signal

Add distributed refinement/coarsening/serialization signals

Match instantiation to declaration.

Add changelog.

Change argument of DoFRenumbering::downstream() to Tensor<1,dim>.

That's because this kind of argument indicates a *direction*, not a point, and
for the former Tensor<1,dim> is the correct data type.

Avoid VectorView in favor of copy_locally_owned_data_from.

Optimize copy_to/from_mg for another frequent case.

Use LA::d::Vector::copy_locally_owned_data_from rather than operator=

Avoid VectorView in matrix-free operators.

Introduce LA::d::Vector::copy_locally_owned_data_from.

Merge pull request #5302 from GivAlz/test_compute_pt_loc

Add test for Functions::FEFieldFunction::compute_point_locations

Added test for Functions::FEFieldFunction::compute_point_locations

Merge pull request #5309 from bangerth/minor-cleanups

Minor cleanups and doc updates.

Add a note to the documentation.

Use C++11-style initialization of a std::map.

Reindent a line.

Remove an unnecessary empty line.

Merge pull request #5307 from Rombur/cuda_fix

Add missing include in cuda_vector.h

Add missing include in cuda_vector.h

Merge pull request #5303 from kronbichler/fix_partitioner_import_ghosts

Make sure to actually zero the ghost entries in partitioner import call.

Merge pull request #5306 from bangerth/cleanup

Clean up code in MGLevelGlobalTransfer::fill_and_communicate_copy_indices.

Merge pull request #5304 from bangerth/rename-member

Make Vector::values a std::unique_ptr.

Clean up code in MGLevelGlobalTransfer::fill_and_communicate_copy_indices.

Make Vector::values a std::unique_ptr.

Merge pull request #5305 from tjhei/readme_qt_styles

add note on how to install qtcreator style files

add note on how to install qtcreator style files

Make sure to actually zero the ghost entries in partitioner import call.

Merge pull request #5275 from bangerth/doc-update-2

Update some discussion in DataOutFilter.

Merge pull request #5288 from bangerth/remove-includes

Remove unnecessary #include statements.

Remove unnecessary #include statements.

These are all in files that don't actually make use of the classes so #included.

Merge pull request #5291 from drwells/vector-operation-header

Move VectorOperation into its own header.

Merge pull request #5296 from masterleinad/use_emplace_back

Prefer using emplace_back