Add a couple of comments.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30557 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add tests for: Patch by Fahad Alrasched: Add extract_subvector_to() function to all vectors. Use it in DoFAccessor::get_dof_values().

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30556 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Patch by Fahad Alrasched: Add extract_subvector_to() function to all vectors. Use it in DoFAccessor::get_dof_values().

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30555 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

simplify (failing) test

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30549 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Doc: Adapt P4EST_DIR path in the readme to current changes

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30546 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Parse p4est versions like 0.3.4 and get patch numbers correct.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30545 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Detect p4est versions and provide preprocessor variables for it.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30544 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

CMake: Also export the old lib-suffix variables in Make.global_options

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30543 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Mention Matthias' change for issue 106 (https://code.google.com/p/dealii/issues/detail?id=106).

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30542 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

CMake: Bugfix: Fix issue 106 "common/Make.global_options defines 'enable-threads' wrongly

DEAL_II_WITH_TBB was renamed to DEAL_II_WITH_THREADS some time ago.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30541 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Patch by Denis Davydov: Document what exactly the gradient of a vector is.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30540 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix another buggy assertion.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30539 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix an assertion.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30538 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Update the documentation. Rename template arguments.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30537 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make member variables of the levels objects private.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30536 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Since these functions are now no longer used for cells, we can
significantly simplify them.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30535 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix one more typo.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30534 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove some unnecessary arguments from functions that now no longer need them.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30533 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Write necessary documentation. Avoid one #include file.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30532 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make a lot of things simpler now that we no longer use DoFObjects in hp::DoFLevels. Documentation coming next.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30531 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Mention Matthias and Bruno for the testsuite work.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30530 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Simplify a whole bunch of functions.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30529 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Simplify a couple of functions.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30528 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

No longer use DoFObjects for the hp DoFs on cells. This will make things a bit simpler and allow for some code simplification.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30527 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

run spell-checker on all example files

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30526 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Instantiate DataOut_DoFData in only one .inst.in file.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30525 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

remove some leftover class in generic_linear_algebra

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30522 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix comments and SSOR in generic_linear_algebra

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30521 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix duplicated instantiations

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30520 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Minor cleanups.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30519 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Correct type stored in one offset array. Remove some code duplication in hp::DoFHandler.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30518 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add memory_consumption(long unsigned int).

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30517 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Minor edits.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30516 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add an assertion to catch a case Chih-Che Chueh ran into.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30515 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

pass validation

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30514 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

improve html

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30513 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Minor cleanups in the various hp-related classes.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30512 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Numbering of html sections
todo class for html
div for table of contents

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30511 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

adjust title

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30504 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add library targets

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30503 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add some cmake

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30501 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

more comments

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30500 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix a bug while compiling with 64bit indices.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30497 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

New test case derived from step-10 which computes pi to 14 digits on 5 cells with mappings of orders 8 and 20.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30496 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Test WorkStream with empty functions

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30495 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make work without threads

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30494 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix compilation with C++11

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30493 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Documentation: Rewrite the documentation aboutdocumentation about  sample CMakeLists.txts

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30492 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

more intro for step-51

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30491 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make MultipleParameterLoop work again following yesterday's changes.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30487 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix tutorial program

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30485 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make compile again.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30484 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Write comments, cleanup second WorkStream call by using an empty function instead of a separate object, reinident file with astyle.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30483 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Allow including one input file from another.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30477 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Provide a way to also output the file name we are reading when reporting an error.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30476 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove code duplication.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30475 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Cleanup parts of the code.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30474 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

New test.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30473 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix bug in compute_normal_flux_constraints, new tests

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30472 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Update comment about no normal flux boundary conditions around reentrant corners

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30471 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Forgot a file

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30470 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Update instantiations.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30467 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add function VectorTools::compute_normal_flux_constraints

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30466 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

test output reasonable

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30465 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

use correct MPI communicator

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30464 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

print some output

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30463 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

text compiles

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30462 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

try to fix HDF5 not being exported to external projects

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30460 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

new test for mg to see if assembly works

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30459 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

new tet for mg::SparseMatrixCollection

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30458 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

clean code in Assembler::MGMatrixSimple
add mg::SparseMatrixCollection

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30457 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Adjust test output.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30456 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

more comments

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30455 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

CMake: Fix FindP4EST.cmake, see issue 102

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30454 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Adjust more test output

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30453 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Adjust some output

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30452 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Adjust output, mention change

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30451 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Change MappingQ support points from equispaced points into Gauss-Lobatto points. Let's see next if there are more tests failing outside fe.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30450 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix typo.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30449 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

two more SVG flags

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30448 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

check local renumbering

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30446 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix bug in local renumbering

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30445 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

CMake: Cleanup

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30441 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

CMake: Pick up debug and optimized versions of p4est if available

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30440 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add height and width parameters to svg output; add tangential ip

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30437 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add instantiations

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30435 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Mention changes.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30433 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Throw the exception at the end of ParameterHandler::declare_entry() so as to make sure that it can be caught, but that the entry nevertheless has been allocated properly.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30430 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix instantiation

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30428 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

remove warnings

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30427 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Cleanup includes

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30426 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Split out DataOut_DoFData from data_out.cc/h

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30425 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Split also solution_transfer (now four instantiation files) and fe_tools

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30423 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Avoid Vector::scale

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30421 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

remove warning

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30420 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Avoid deprecated function

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30419 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Adjust program output

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30414 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add instantiation that got lost when splitting files

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30413 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Marc fixes a typographical bug in MathGL output.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30412 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Split two more files into three files each.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30407 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d