Added tests for lac/ShiftedMatrix

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32720 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Added tests for lac/PointerMatrix

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32719 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix undefined symbol CellAccessor<3,2>::subdomain_id that appears for some compilers due to r32708 by making a very simple function inline

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32718 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Avoid error when copying Table<2,bool>.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32716 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Forgot one directory

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32715 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix DoFTools::extract_constant_modes for FE_Q_DG0

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32714 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

No need for \f$...\f$, we have our own scripts that expand $...$ to exactly this.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32713 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix an aweful edit I made in the last patch.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32712 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add two standard accessors, m() and n(), and do some cleaning.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32711 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add Triangulation<1,spacedim>::fill_vertices_with_ghost_neighbors deleted in 32708 again because the 1D part does not use the generic code.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32710 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fully qualify namespace to make clang happy

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32709 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Unify several copies of the same function into a single templated one. Saves a good amount of duplicated code.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32708 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove a comment that does not provide any significant information.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32707 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add an assignment operator from a regular SparseMatrix.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32706 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix order of destruction in PreconditionAMG when temporary trilinos_matrix was used for construction.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32705 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Clarify a statement.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32697 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Be more conservative with #includes.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32691 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Clarify language.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32690 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Augment comments in several places to make them less unintelligible.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32689 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make sure we return a value in a function that has a return type.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32688 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Also make sure we have the correct output file :-(

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32686 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Adjust implementation of laplace_transform to what had been documented.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32685 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Adjust implementation of laplace_transform to what had been documented.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32684 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix a typo.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32683 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make detection of quadrature rule name in FE_Q/DGQArbitraryNodes more resilient for unknown quadrature rules

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32679 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Clarify some language.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32678 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Update the documentation: VisIT can read .pvtu since version 2.5.1

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32677 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Improve error message.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32676 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

r32662 overwrote the changes in r32640, reapplied them

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32672 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove stray occurrences of 'typename'.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32671 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix some typos

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32670 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Some rewording on PETSc compatibility.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32669 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove tested version number - encourage using latest PETSc.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32668 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Disable multithreading part in case threads are not used

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32667 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

update test

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32666 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add failing test

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32665 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Avoid C++11-isms.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32664 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Do not use 'typename' outside templates.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32663 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Added support for inhomogeneous tangential and normal flow constraints

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32662 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix a problem pointed out by Lei Qiao in one of the formulas.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32661 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Clarify documentation.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32660 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Move TriaAccessor::parent_index to class CellAccessor since we keep this information only for cells. It could not have worked at any time for non-cells. Also update documentation in a couple of places.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32659 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add a missing header file (for MS VC++) as pointed out by Helcio Mayor.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32658 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make the documentation of one function slightly clearer.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32656 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add a test by Ross Kynch for VectorTools::project_boundary_values_curl_conforming.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32655 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove a file that is no longer needed (and hasn't been for a long time).

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32654 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Rewrite a piece of code that accessed an internal representation of the data used in a vector.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32653 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Avoid a problem with MS VC++ by adding a configuration check and providing a work-around in that case.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32652 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Improve some assertions

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32651 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Update test results.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32650 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Minor documentation typo in equation

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32649 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Tricial crap. Toby needs the dee.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32648 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

step-7: change variable name that confused students

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32647 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix doxygen formatting problem

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32646 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

remove offensive output line

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32645 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add missing include

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32644 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix doxygen warning

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32643 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fixed some problems regarding Trilinos vectors with different maps

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32642 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix bug in project_bv_curl_conf for dim=2.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32640 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

adjust ThetaTimestepping

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32639 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

move Newton test and add test in compatibility mode

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32638 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

test failed in optimized

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32634 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

introduce AnyData, OperatorBase and test that we do not break compatibility

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32633 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Provide link to publications in 2014.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32629 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Added tests for lac/ProductMatrix

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32628 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Deleted old files product_matrix_01.cc and product_matrix_01.output

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32627 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Second attempt to suppress clang warning in time_stepping.h

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32625 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix test output

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32624 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Disable another ICC warning.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32614 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

remove MGDoFHandler from example

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32613 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Temporary fix for Issue 191, allow sadd for Trilinos vectors

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32612 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add new but failing test.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32611 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add to documentation.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32610 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix doxygen groups

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32609 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add a #include that is needed for MS VC++.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32608 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Clarify an error message slightly.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32607 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add test

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32606 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Provide a short description of the class and fix a grammar error.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32605 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

make step6 compile again

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32604 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

make step5 compile again

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32603 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

rewrap comments

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32602 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

improve documentation

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32601 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Doc: Do not refer to external deal.ico, but use local one

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32600 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix a typo. Clarify a statement.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32599 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Bugfix: CMake: Remove leftover code. We are able to find muparser externally :-]

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32598 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Change q_point to q_index so students do not think it is a point
Do the quadrature loop in step 3 outside the loop over shape functions, thus being consistent with later steps and allowing for easier modifications;

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32597 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Revert "*errrr* with a dash..."

This reverts commit ed2ff1c166feb2e880852d2c3ea9e010d6e293ba.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32596 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

*errrr* with a dash...

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32595 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Append version number to soname with a dot

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32594 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove accidentally committed code

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32593 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Suppress log messages from SolverCG because the iteration numbers are too sensitive (and not central to this test, only needed for a reference solution)

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32592 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix one more warning about hiding a local variable.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32591 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix bug

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32590 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix bug: ParameterHandler::read_input() would parse the last line twice which will create an error if the last line in the .prm ends a section without a newline

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32589 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix test output

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32588 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add failing parameter_handler test

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32587 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

run test in debug mode only

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32586 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add simple distributed codim 1 test case

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32585 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix for codim one in distributed tria

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32584 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Run one less cylce in 1D test to avoid different results in convergence rate for Intel compiler.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32583 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d