fix typos in documentation of cmake usage

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30207 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add test with 4 cpus

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30206 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix test

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30205 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix test

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30204 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add a reference to a discussion elsewhere.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30203 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove accidentally checked in test outputs

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30202 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix test

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30199 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix test

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30198 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix SparsityTools::distribute_sparsity_pattern for block systems

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30197 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

some prm-files

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30196 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

copied step-42.cc from src/unified

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30195 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add Oleh to the credits

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30194 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

documentation patch by Oleh Krehel

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30193 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix bug in IndexSet

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30192 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Checking PETSc-SLEPc compatibility is VERSION_SUBMINOR independent and way to restrictive if not respected. Check MAJOR and MINOR only then go ahead with config.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30191 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add a publication (correct a publication)

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30190 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

documentation patch by Oleh Krehel

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30187 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add a brief initial sentence.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30186 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Comment adjustment.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30185 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

CMake: And guard the last to occurences of a C compiler as well

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30184 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

CMake: *sigh*

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30183 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

CMake: Bugfix, use use supplied cxx flags throughout the configure phase, clean up CMAKE_REQUIRED_* setup and update documentation

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30182 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add failing test

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30181 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add test

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30180 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

throw when you create a FE_Q of degree 0 (otherwise we try to allocate a LOT of memory)

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30179 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Clarify that a variable is a number of neighbors, not a has some/has no neighbors boolean.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30178 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix a typo. Add another half sentence.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30177 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Align semicolon as usual.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30176 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Minor adjustments.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30175 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

CMake: Adjust MPI error message

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30174 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

CMake: Cleanup

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30173 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

CMake: Cleanup and restructure

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30172 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

CMake: Fix typos

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30171 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

CMake: A new header for Make.global_options as well

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30170 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

CMake: Cleanup deal.IIConfig.cmake a bit

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30169 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Adapt step-18 to the resent changes in DataOut

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30168 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

No need for 'typename'.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30167 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Also instantiate a member template.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30166 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add explicit instantiations.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30165 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix names of header files.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30164 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Improve error message.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30163 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix wrong link (thanks, Jean!).

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30162 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Diss of nicole klein 2013

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30161 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Update.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30160 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix comment.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30159 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix a bug when using 64bit indices.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30158 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Link to download site from news page.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30157 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Re-indent function argument list.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30156 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove instantiation of a non-public function. This shouldn't be necessary since the function is now in an anonymous namespace and is not exported anyway.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30155 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Patch by Felix Gruber: Fix all sorts of misspellings and documentation markup fixes.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30154 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Reindent parameters in grid_generator.h

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30153 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Do not execute tutorial programs with mpirun -np 2. It violates the element of least surprise rule.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30152 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make tests work: convert DoFHandler::cell_iterator to DataOut::cell_iterator

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30151 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Implement DataOut::add_data_vector with DoFHandler argument to allow for different DoFHandlers

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30150 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Change GridGenerator from a class to a namespace. Undo introduction of local typedef size_type.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30149 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Better document GridTools::laplace_transform.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30148 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Change the comment headers in the examples so that they don't get stripped
away by strip_comments

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30147 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Get it right this time...

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30146 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Set the executable flag. Also adjust the starting revision number.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30145 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

benchmark: index.html is being generated

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30144 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

update benchmark (cmake, interactive graphs, etc.)

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30143 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Also assume that MPI is present when generating documentation.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30142 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Normalize results in a more useful way: don't just replace one version number by another, but by a generic string. This way we no longer have to bump version numbers every time we make a release.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30141 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Update a remaining license header

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30136 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove a vestige from the days of gcc2.95.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30135 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add something.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30133 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix some broken links. Update file properties.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30131 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

CMake: Silence clang warnings about unused arguments

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30125 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

CMake: Bugfix, use the same Generator for when querying for language support.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30124 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add instantiations for dim=1, spacedim=3 to avoid undefined symbols with Intel compiler

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30123 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix warning with clang: Do not use -funroll-all-loops

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30122 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Move tests that currently fail.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30121 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add a test that currently fails.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30120 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

CMake: Implement ENABLE_LANGUAGE_OPTIONAL

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30118 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

CMake: Be a bit more flexible in finding BLACS on DARWIN

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30117 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Get link to post-8.0 changes back in.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30116 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

update ignores

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30115 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

release step 7

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30113 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

update version information

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30110 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

release step: 1, adjust changes

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30108 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Comment out link to recent changes.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30107 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Announce 8.0.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30106 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Several more.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30105 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add funroll-all-loops if using gcc

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30104 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

CMake: A small workaround

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30103 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

New test. Currently fails, but clearly demonstrates the problem. The 'generic' output file has been verified to be correct.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30102 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix the current failure of the various dof_test_21_b variants.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30101 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

New tests. The outputs have been verified to be correct and have been generated with r29524, which is correct.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30100 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove unused variable.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30099 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove unused variable.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30098 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Set optimization flags for ICC to -O1 in accordance with the findings
here: http://code.google.com/p/dealii/issues/detail?id=30 . We may
revisit the issue at a later time, but for the moment this is the safe
approach.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30097 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Adjust output that differs by round-off.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30096 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add publication

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30095 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add publication

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30094 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Avoid filling a map with numeric_limit<types::boundary_id>::max() elements -- too many if we ever increase the number of bits in boundary_id.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30093 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix a bug.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30092 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Adjust output

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30091 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix global_dof_index in matrix-free class: It should only be used when dealing with deal.II's global dof indices, not the matrix-free dof indices which are transformed into a process-local index space and start at zero on all processors. This limits the MPI-local problem size to 4 billion, but i) that limit is still far away and ii) there were many internal uses of unsigned int left that would have needed re-organization. This change saves memory as dof indices can be saved in 32-bit integer instead of 64-bit integers and still allows problems with >4g global dofs.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30090 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Prettify output

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30089 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove stray typename

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30088 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d