Merge pull request #8889 from rezarastak/grid_tools_doc

Small rewording of doc for compute_point_locations()

Apply suggestions from code review

Co-Authored-By: Daniel Arndt <arndtd@ornl.gov>

Merge pull request #8888 from masterleinad/bind_thread_management

Remove some uses of std::bind from thread_management.h

Merge pull request #8887 from masterleinad/avoid_thread_managenent

Avoid including thread_management.h

Remove some uses of std::bind from thread_management.h

Merge pull request #8890 from rezarastak/doxygen_perl

PERL_PATH removed from options.dox

PERL_PATH removed from options.dox

Rewording of the doc in compute_point_locations

Avoid including thread_management.h

Merge pull request #8886 from rezarastak/dist_solution_trans_doc_fix

Minor documentation fix in P::D::SolutionTransfer

reorder part of the doc in P::D::SolutionTransfer

Minor documentation fix in P::D::SolutionTransfer

Merge pull request #8881 from masterleinad/fix_cuda_aware_mpi

Fix behavior for CUDA-aware MPI

Fixup style for preprocessor  check

Avoid setting values when inserting ghost entries

Avoid using std::memset for device data

Merge pull request #8880 from kronbichler/cuda_synchronize_mpi

Synchronize CUDA device in MPI ghost exchange

Synchronize CUDA device in MPI ghost exchange

Merge pull request #8879 from masterleinad/Fix_ms_host_la_templates_campi

Fix using MemorySpace::Host with la_parallel_vector.templates.h and CUDA-aware MPI

Fix using MemorySpace::Host with la_parallel_vector.templates.h and CUDA-aware MPI

Merge pull request #8736 from fvanmaele/perl-canonical-doxygen

doxygen: rewrite set_canonical_doxygen.py in Perl

Merge pull request #8875 from kronbichler/cuda_improve_mf_loop

Bypass vector copy in MatrixFree::cell_loop with MPI

Changelog

Merge pull request #8847 from tjhei/kinematics_always_inline

kinematics.h: fix always_inline

Merge pull request #8813 from kronbichler/partitioner_use_ranges

 Process indices in ComputeIndexOwner by intervals

Merge pull request #8876 from masterleinad/fix_host_compiler

Fix setting host compiler

Merge pull request #8871 from peterrum/cuda-step64-update

Update step-64

Update step-64

Merge pull request #8811 from kronbichler/speedup_mg_transfer_copy_indices

Avoid sorting a large array in MG fill_copy_indices

Fix setting host compiler

Merge pull request #8874 from masterleinad/clang-9-tidy

Fix some clang-tidy 9 findings

Use proper partitioner in step-64

Bypass vector copies if partitioners match

Avoid sorting a large array in MG fill_copy_indices

Merge pull request #8872 from peterrum/gpu-comment-fix2

Update the GPU matrix-free documentation (2) [WIP]

Update the GPU matrix-free documentation (2)

Merge pull request #8870 from masterleinad/require_mpirun_p4est

Require mpirun when requesting p4est in tests

Require mpirun when requesting p4est in tests

Merge pull request #8858 from jwitte08/get-cell-index

add MatrixFree::get_cell_level_and_index()

Merge pull request #8860 from masterleinad/fix_fe_nothing_coarsening

Fix SolutionTransfer when coarsening from FE_Nothing

Merge pull request #8868 from peterrum/parallel-computeverticeswithghostneighbors-assert

Enable assert again

Fix some clang-tidy 9 findings

Enable assert again

Merge pull request #8867 from dougshidong/fix_manifold_get_new_point

Add changelog for #8861

Add changelog for #8861

Merge pull request #8864 from bangerth/direction

Change 'direction' of make_periodicity_constraint() to 'unsigned int'.

Merge pull request #8865 from masterleinad/fix_cuda_tests

Fix failing CUDA tests

Merge pull request #8838 from peterrum/gpu-qpoint

Eliminate q_point from functor and other GPU functions

Fix failing CUDA tests

Merge pull request #8854 from peterrum/shapeinfo-collocation

Compute shape_gradients/hessians_collocation in ShapeInfo

Merge pull request #8861 from dougshidong/fix_manifold_get_new_point

Fix Manifold get_new_point()

Add a changelog entry.

Change 'direction' of make_periodicity_constraint() to 'unsigned int'.

Store underlying Mapping

Store 1D quadrature

add and test MatrixFree::get_cell_level_and_index()

Merge pull request #8859 from masterleinad/document_periodic_direction

Document direction parameter for periodic constraints

Merge pull request #8863 from peterrum/parallel-computeverticeswithghostneighbors-newtest

Add missing test output

Compute shape_gradients_collocation and shape_hessians_collocation in ShapeInfo

Remove unused variable

Merge pull request #8862 from peterrum/parallel-computeverticeswithghostneighbors-fix

Fix a bug introduced in #8783

Add missing test

Merge pull request #8857 from jwitte08/extend-tpmatrix

Extend TensorProductMatrixSymmetricSum

Fix a bug introduced in #8783

Fix get_new_point optimization.

A performance-if ignores next point when current point weight = 0.

However, since the current point weight is 0, we should be replacing the current point with the next point, not skipping the next point.

Fix Manifold get_new_point()

The weights can be negative, we simply want to avoid dividing by 0.

Use alias

Fix SolutionTransfer when corsening from FE_Nothing

Rename template parameter size to n_rows_1d

Document direction parameter for periodic constraints

Merge pull request #8856 from jwitte08/expose-mapping

Store Mapping in MatrixFree's MappingInfo

Merge pull request #8855 from jwitte08/store-quadrature

Store 1D quadrature in ShapeInfo

Eliminate q_point from functor and other GPU functions

Store 1D quadrature

Store underlying Mapping

Expose static size and value type

Merge pull request #8839 from peterrum/gpu-collocation-derivation

Merge computation of values and gradients in the matrixfree CUDA code

Merge pull request #8846 from kronbichler/tria_accessor_avoid_dynamic_cast

Avoid dynamic_cast in ghost/artificial cell queries

Merge pull request #8853 from peterrum/shapeinfo-accessibility

Modify method accessibility in ShapeInfo

Modify method accessibility in ShapeInfo

Remove obsolete header file

Add comment

Merge pull request #8783 from peterrum/parallel-computeverticeswithghostneighbors

Clean up compute_vertices_with_ghost_neighbors

Merge pull request #8770 from bangerth/doc

Document DataPostprocessor for the case of complex-valued solutions.

Merge pull request #8848 from tjhei/grid_tools_gcc49_warning

fix gcc 4.9 warning

Merge pull request #8810 from kronbichler/mg_copy_indices_in_table

Change the storage type of MG copy indices to table

Merge pull request #8849 from peterrum/pft-util-doxygen

Make p:f:t:Utilities visible in Doxygen

Document DataPostprocessor for the case of complex-valued solutions.

Make p:f:t:Utilities visible in Doxygen

Merge computation of values and gradients in the matrixfree CUDA code

fix gcc 4.9 warning

fixes:
source/grid/grid_tools.cc:550:28: warning: missing initializer for
member ‘dealii::SubCellData::boundary_lines’ [-Wmissing-field-
initializers]

Merge pull request #8837 from peterrum/gpu-comment-fix

Update the GPU matrix-free documentation

kinematics.h: fix always_inline

- put function annotation in declaration
- fixes #8757

Improve CUDA documentation

Merge pull request #8844 from bangerth/doc-rt

Rewrite the introduction to the RT element.

Merge pull request #8845 from tjhei/intel-disable-const-initializer

intel: disable const initializer warning

intel: disable const initializer warning

Rewrite the introduction to the RT element.

Avoid dynamic_cast in ghost/artificial cell queries

Changelog