Merge a bunch of functions now that hp::DoFHandler and DoFHandler behave similarly.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30670 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Note the hp::DoFHandler cell dof indices cache.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30669 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Introduce a way to query the address of the DoF cache in a generic way. This will allow unifying in the next step.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30668 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add missing fields to memory_consumption().

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30667 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Implement the hp::DoFHandler cell dof indices cache in the same way as we already have for the ::DoFHandler.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30666 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

update ignores

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30665 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

update test

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30664 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add new test for multigrid an slit geometry

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30663 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

parallel mg: clean up debug output, add additional checks

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30662 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

avoid deprecated p4est enum

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30661 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

reverse condition for multigrid

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30660 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

reformat comments

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30659 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

parallel geometric multigrid: limit the level difference at vertices

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30658 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Rename a bunch of classes.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30657 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Move DoFObjects into dof_faces.h since this is now the only place where it is referenced.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30656 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Implement the compression scheme for DoF indices stored on cells.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30655 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

VectorTools::point_value and VectorTools::point_difference are now throwing an error if the required point is not available on the current processor

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30654 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

one more c++11 bugfix (thanks Ian Rose)

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30653 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fixed typo

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30652 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

commit results for local refinement

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30651 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

doxygen: change EXAMPLE_PATH such that the lines from Block_matrix_array.cc can be included into the documentation of BlockMatrixArray

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30650 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add a space to an error message.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30649 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Avoid a C++11-ism.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30648 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make it compile with gcc 4.1.2, I hope.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30647 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

More C++11 fixes.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30646 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix a couple C++11 usages.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30645 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Use '> >' instead of '>>' to end a template.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30644 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Bugfix: Avoid duplicate symbols

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30640 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Documented the possibility of periodic boundaries on distributed meshes

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30639 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Added a test for periodicity constraints on distributed meshes

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30638 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make compile without C++11

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30637 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

change test to not use hyper_cube_slit

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30636 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

removed unused variable in match_tree_recursively

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30634 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix missing std::

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30633 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix bug in distributed::Triangulation and SolutionTransfer introduced in r30624

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30632 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make 64bit compile again.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30631 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add missing relative path.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30630 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix typo

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30629 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix r30622 by specifying relative path

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30628 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Minor intro update

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30627 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

modify the parameter GUI to handle Map and List paremeters as strings

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30626 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

identify_periodic_face_pairs creates periodicity information for two given boundary_ids on distributed meshes

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30625 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Added support for periodic boundary conditions on distributed meshes

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30624 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

CMake: Replace explicit file list with globbing expression

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30622 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Mark some Trilinos variables as advanced

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30619 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Improve conditioning of project_bv_curl_conforming.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30613 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix warning

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30607 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Inline documentation for step-51

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30605 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

simplify test (do not need update_ghost_values() anymore)

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30604 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

always do update_ghost_values in parallel::distributed::Vector::operator=

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30603 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix test output

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30602 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

revert part of 30600 (accident)

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30601 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix bug in hp::DoFHandler and copy_triangulation(), this fixes tests/hp/copy_tria_bug.cc

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30600 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

document bug in hp::DoFHandler

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30599 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

run test for par::dist::vector too

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30598 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

ghost import for distributed::parallel:BlockVector::operator= and add new constructors

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30597 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix test output

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30596 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix bug in parallel MG: need to import additional level ghost neighbors which are coarser

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30595 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Rename an (internal) file to match the name of the class declared therein.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30594 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Rename a variable to be more descriptive.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30593 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

cleanup, remove unneeded semicolons

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30592 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add a note.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30591 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix a bug in compute_no_normal_flux_constraints when dealing with odd meshes.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30590 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Update documentation in a couple of places.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30578 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove debug calls previously left in accidentally.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30577 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Use the correct data type for (invalid) default values of an array.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30576 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Update numbers.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30575 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix link.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30574 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Document the bitset in collect_periodic_face_pairse, closes issue 114

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30572 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Comment on shadowed libraries

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30570 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix a bug in the debug version of trilinos_sparse_matrix.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30565 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Mark a variable as const (because we can, and then we should).

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30564 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix a couple of apparently wrong uses of types::global_dof_index -- we will never have more than 4B coarse mesh cells. (Famous last words...)

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30563 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Minor doc edits.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30562 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove a TODO.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30561 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Introduce a macro to compare p4est version numbers.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30560 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Simplify code in a minor way.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30559 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Correct comment.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30558 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add a couple of comments.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30557 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add tests for: Patch by Fahad Alrasched: Add extract_subvector_to() function to all vectors. Use it in DoFAccessor::get_dof_values().

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30556 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Patch by Fahad Alrasched: Add extract_subvector_to() function to all vectors. Use it in DoFAccessor::get_dof_values().

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30555 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

simplify (failing) test

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30549 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Doc: Adapt P4EST_DIR path in the readme to current changes

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30546 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Parse p4est versions like 0.3.4 and get patch numbers correct.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30545 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Detect p4est versions and provide preprocessor variables for it.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30544 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

CMake: Also export the old lib-suffix variables in Make.global_options

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30543 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Mention Matthias' change for issue 106 (https://code.google.com/p/dealii/issues/detail?id=106).

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30542 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

CMake: Bugfix: Fix issue 106 "common/Make.global_options defines 'enable-threads' wrongly

DEAL_II_WITH_TBB was renamed to DEAL_II_WITH_THREADS some time ago.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30541 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Patch by Denis Davydov: Document what exactly the gradient of a vector is.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30540 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix another buggy assertion.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30539 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix an assertion.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30538 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Update the documentation. Rename template arguments.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30537 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make member variables of the levels objects private.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30536 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Since these functions are now no longer used for cells, we can
significantly simplify them.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30535 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix one more typo.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30534 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove some unnecessary arguments from functions that now no longer need them.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30533 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Write necessary documentation. Avoid one #include file.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30532 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make a lot of things simpler now that we no longer use DoFObjects in hp::DoFLevels. Documentation coming next.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30531 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Mention Matthias and Bruno for the testsuite work.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30530 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Simplify a whole bunch of functions.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30529 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d