Mention change (tests for collaboration to come). Clean up interface

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32497 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make FEEvaluation collaborate with some data from FEValues. Cleanup of some internal data structures to make this possible. Implement FEEvaluationDGP for DGP elements by truncating the tensor product. Shorten a few matrix-free stress tests in debug mode.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32496 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Adjust one test, augment documentation.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32495 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Propagate exceptions from the member functions of InverseMatrixRichardson.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32494 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

CMake: Use CMAKE_DL_LIBS instead of searching by hand

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32493 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove comparison operators from PointerMatrixBase and associated infrastructure. This wasn't used anywhere and was likely not working in at least some circumstances.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32492 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add a test for ProductMatrix::vmult.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32491 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add some documentation.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32490 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove template argument from FEEvaluationBase class. It is not needed there, only a derived class needs it. This is the first step to make FEEvaluation collaborate with some data generated by FEValues

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32489 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

exhume lapack_templates.h.in

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32488 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

improve step-7: switch to vtk; less smooth solution; finer coarse mesh; more cycles when adaptive refining; possible extensions

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32483 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

new FE_TraceQ by Angela

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32482 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

report on FE_TraceQ by Angela Klewinghaus; the actual implementation will be checked in by Matthias

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32481 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Run a test on previous commit.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32476 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

A patch by Denis Davydov: Multiply a real tensor by a complex number.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32475 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add python script to reformat and rewrap doxygen comments

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32474 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

doxygen formatting

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32473 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

doxygen formatting

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32472 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

doxygen formatting

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32471 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

doxygen formatting fixes

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32470 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix doxygen formatting

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32469 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

doxygen @code formatting

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32468 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

doxygen @code formatting

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32467 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

unify some doxygen formatting

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32466 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

improve wording

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32465 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

detect when assigning PETSc vectors to each other when they are not compress()ed

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32464 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

improve documentation

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32463 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

use p4est load_ext with p4est 0.3.4.3+

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32461 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Test multiplication of a complex tensor by a complex number.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32460 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Do not output iteration numbers. They are too sensitive

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32459 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

support for p4est >0.3.4.2 (patch by Alexander Grayver)

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32458 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

check proc count in parallel::distributed::Triangulation::load()

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32457 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Forgot this file

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32455 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Also create 1D version of FE_FaceQ/P to allow step-51 to run in 1D (in principle, output of faces does not work there and is not that easy to fix). Add a test for step-51. Test data of FE_FaceQ/P<1>. Fix output of test due to fix in r32451.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32454 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Explicitly specify template arguments in hopes to help MS VC++.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32453 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Better document FunctionMap::type.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32452 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix bug in support_on_face

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32451 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove this script since we now no longer run the regression service that was replaced by cdash.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32450 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Get rid of the regression_quick script. CDash has it all anyway.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32446 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fixed typos in step-2 tutorial, step-6.cc, and to the Function< dim > documentation.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32442 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Avoid warning

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32441 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Also free vector memory from deal.II's own parallel vectors.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32440 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix odd markup.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32439 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make DerivativeApproximation a namespace, rather than a class with all static members.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32438 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove dealii::swap(SmartPointer,SmartPointer) for MS VC++. It apparently only leads to confusion but isn't even strictly necessary.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32437 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Rewrite a piece of code in hopes of making it easier on MS VC++.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32436 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Silence compiler warning

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32430 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Provide ThreadLocalStorage::clear().

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32429 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Provide ThreadLocalStorage::clear().

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32428 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix typo

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32426 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove stray typename.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32423 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

run test only if we have tbb

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32421 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add multithreaded function_parser test

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32420 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix tbb quicktest

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32419 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add another test for FunctionParser

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32418 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

CMake: Bugfix

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32416 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

update affinity quicktest to work with 1 cpu and on mac

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32415 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Quicktests: Use mpirun configured by FindMPI.cmake instead of generic "mpirun -n"

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32414 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Try to work around a bug in MS VC++. This is not pretty, but if it gets the job done I'm ok with it.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32413 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Hopefully make MS VC++'s life a bit easier. Also leave a note in the documentation in a couple of places.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32412 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

CMake: Bugfix: Add header to quick_tests. Closes bug 185.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32411 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Get the list of friends of a class right after a recent change.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32410 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Do not qualify an element in its own namespace.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32409 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Use the correct include file.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32408 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Reduce template contortion level by one in hopes that this helps MS VC++.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32407 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Pass array by reference instead of by value. This should also help MS VC++ which doesn't like the situation as is.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32406 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make the spelling of 'lda' and 'level_dof_access' uniform between dof_accessor.h and .templates.h. Help MS VC++ by introducing a typedef rather than trying to be overly tricky with the return type of the face() function.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32405 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add test for GridTools::transform

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32404 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

CMake: Fix a configuration error on Debian Testing wrt. libSuiteSparse_config.a

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32403 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

make GridTools::transform work with hanging nodes

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32402 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove code duplication.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32401 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Test PETSc FullMatrix reinit function.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32400 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Generalize test.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32397 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove a piece of debug code.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32396 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

One more test for curls.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32395 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix a bug reported by Christoph Heiniger (including a description of how it should be fixed): The computation of curls was wrong.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32394 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix example code that trips up doxygen

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32393 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Minor adjustments for style and in hopes of getting MS VC++ to like the file better than it used to.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32391 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Avoid what I believe is an unnecessary '::template ' in hopes that it makes MS VC++ happier.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32389 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

formatting

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32388 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add publication

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32387 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Refill comments

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32386 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Introduce mmult and second factorization routine.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32385 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

DataOutBase no longer is a class.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32384 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add weighted mass matrix

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32381 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add functions for clearing and initializing an MGTransferPrebuilt object

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32380 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Newton::threshold() was missing

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32379 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Help MS VC++ recognize which template function to take.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32378 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Complete specify namespace for a symbol to help MS VC++.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32377 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Address a few follow-up issues with the previous patches.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32376 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

More conversions from class to namespace DataOutBase. Reindent these files.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32375 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Bugfixes: Make compilation of bundled libraries work again

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32374 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

I have no idea where this cache invalidation comes from - disable for now

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32373 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

CMake: Bugfix: Get the caching right in FindPETSC.cmake and
FindTRILINOS.cmake

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32372 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Well, well. Also adjust the project configuration...

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32371 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

CMake: Break everything (tm)

 - Provide a quick sanity check to test the final link interface.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32370 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

CMake: Break everything (tm)

- Do not record full path of system libraries and use reduced link line
  instead.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32369 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

CMake: Break everything (tm).

- Redesign complete feature configuration process

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32368 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove the awkward private inheritance from DataOutBase to DataOutInterface that has tripped up virtually every compiler we have ever tried. Instead, make DataOutBase a namespace.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32367 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Mark new functions in header file as inline

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32365 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d