Merge pull request #10496 from masterleinad/fix_petsc_complex_instantiation

Add missing instantiation for PETSc with complex values

Merge pull request #10465 from peterrum/internal_TriaAccessorImplementation_Implementation

Remove unneeded template argument

Merge pull request #10442 from peterrum/pft_update_test_output

Update output of test

Merge pull request #10501 from masterleinad/remove_percent

Remove % in documentation

Merge pull request #10502 from masterleinad/remove_appveyor

Remove appveyor

Merge pull request #10491 from tjhei/github_actions_indent

[CI] add githubactions indent/documentation check

Merge pull request #10499 from tjhei/ci_github_actions_windows_no_zlib

[CI] github-actions windows: disable zlib

Merge pull request #10485 from drwells/readme-link

Fix a dead link in the top level readme.

Remove appveyor

Remove % in documentation

[CI] github-actions windows: disable zlib

The zlib found on the system is a x86 lib that is not compatible with
our x64 build. Disable auto detection for now.

Merge pull request #10495 from tjhei/doxygen_ref_step_links_only_numbered

doxygen filter: do not try to link step- without number

Add missing instantiation for PETSc with complex values

doxygen filter: do not try to link step- without number

We are currently trying to create a hyperlink for every occurance of
step-BLA found in the documentation. This requires escaping words like
"step-number" using a backslash. This is confusing.
Instead, only do this if the dash is followed by a digit.

Fixes #10489

Merge pull request #10453 from peterrum/pft_level_fix

Fix distribution of levels in pft

[CI] add githubactions indent/documentation check

add a new "indent" check on github actions that mirrors what we do on
travisci (to ultimately replace it).

Merge pull request #10162 from jppelteret/sd-tests_01

Refactor some SD tests

Fix a dead link in the top level readme.

Merge pull request #10484 from tamiko/avoid_symbol_clash

CMake: Avoid another symbol clash with adol-c

Merge pull request #10483 from tamiko/fix_compilation

Fix compilation with c++14: add missing instantiation

Merge pull request #10477 from nfehn/refactoring_find_all_active_cells

refactoring of GridTools::find_all_active_cells_around_point()

Merge pull request #10456 from nfehn/find_active_cells

Fix bug in find_active_cell_around_point_tolerance()

refactoring of GridTools::find_all_active_cells_around_point()

CMake: Avoid another symbol clash with adol-c

silence doxygen

add missing instantiations

Merge pull request #10348 from mathmerizing/MGTransfer-add-constraints

Moved copy of vector into if block

Merge pull request #10458 from nfehn/docu_find_active_cells

remove redundant documentation for GridTools::find_active_cell_around_point() functions

Merge pull request #10470 from masterleinad/fix_more_address_sanitizer

Fix more issues found by AddressSanitizer

Merge pull request #10448 from bangerth/tria_object

Merge pull request #10457 from nfehn/bounding_box

add tolerance to BoundingBox::point_inside()

Merge pull request #10416 from masterleinad/remove_author_information

Remove author information from source files

Add a changelog entry.

Merge pull request #10467 from tjhei/quick_test_use_with_tbb

use WITH_TBB for the affinity quicktest

Added check whether there actually are any user_constraints

Merge pull request #10468 from tjhei/taskflow-update-2.5.0

update taskflow to 2.5.0

Fix type of variable in GridTools::compute_local_to_global_vertex_index_map

Fix IndexSet::is_ascending_and_one_to_one for empty objects

Fix move construction/assignment for Subscriptor

add docu and test, make implementation more readable

Updated changelog

use WITH_TBB for the affinity quicktest

update taskflow to 2.5.0

Only distributing user constraints before prolongation

Update output of test

Remove unneded template argument

Merge pull request #10466 from tjhei/doc_tensorproductconstructor

add some documentation to InterpolatedTensorProductGridData

Merge pull request #10464 from peterrum/line_orientation_simplify

Simplify line_orientation()

Merge pull request #10461 from masterleinad/fix_clang_10_bug_cleaned

Avoid use-after-scope when calling MappinQCache::initialize multiply

add documentation to InterpolatedTensorProductGridData

allow ghost cells

Simplify line_orientation()

Merge pull request #10369 from tjhei/matrix-free-no-bool

matrix-free: do not use bool args

Also fix TransfiniteInterpolationManifold::initialize

Avoid use-after-scope when calling MappinQCache::initialize multiply

remove deprecation macro for now

Merge pull request #10409 from tjhei/quick-test-taskflow

Merge pull request #10454 from bangerth/affine

Move some class declarations into the .h file.

Merge pull request #10451 from tjhei/taskflow-rename-without-cpp

rename cpp-taskflow to taskflow

remove redundant documentation

add tolerance to BoundingBox::point_inside()

Merge pull request #10455 from masterleinad/fix_clang_10_bug

fix bug in find_active_cell_around_point_tolerance()

Compactify documentation

Avoid std::initializer_list

Merge pull request #10452 from simonsticko/assert_range_in_tensor

Add assert on range of incoming index in Tensor::operator[] const.

Move some class declarations into the .h file.

Fix distribution of levels in pft

rename cpp-taskflow to taskflow

with the 2.5.0 release (2020/06/01), the library decided to rebrand as
"taskflow" instead of "cpp-taskflow". Reflect this change by replacing
all references in the library.

rename cpp-taskflow -> taskflow

Add assert on range of incoming index in Tensor::operator[] const.

CI: windows: make test with -j1

Merge pull request #10445 from bangerth/duplication

Remove some duplicated code.

Merge pull request #10446 from bangerth/comment

Fix a comment in the documentation.

Get rid of TriaObject.

TriaObject was a class that was a barely disguised ArrayView, but the class
name wouldn't have told you that. It's not actually very difficult to replace
it by ArrayView, which is what this patch does.

In the process, rename the TriaObjects::get_object() function to
TriaObjects::get_bounding_object_indices() which is both a more
descriptive name of what it returns, and matches the recently
introduced set_bounding_object_indices() function.

Merge pull request #10444 from gassmoeller/fix_zero_particle_property_output

Fix particles data out for no particles.

Fix a comment in the documentation.

Merge pull request #10421 from Rombur/cuda_global

Remove some duplicated code.

This removes a block of 5 lines of code that is repeated again a few lines below.

Add test

Fix particles data out for no particles.

Merge pull request #10441 from masterleinad/fix_warning_step_32

Fix implicit capture warning in step-32

Fix implicit capture warning in step-32

Add changelog entry

Fix a bug where only 1 CUDAWrappers::MatrixFree object was valid any
given time

Merge pull request #10437 from masterleinad/use_ranges_again

Revert "disable using c++ 20 iota-view and always use boost"

Merge pull request #10399 from drwells/hp-dofhandler-doc-1

Remove references to hp::DoFHandler in DoFAccessor.

Merge pull request #10440 from bangerth/rename

Rename TriaAccessor::set().

Remove trailing empty lines in comments

Remove author information from source files

Merge pull request #10433 from peterrum/move_functions

Move methods of TriaLevel, TriaFaces, and TriaObjects

Remove references to hp::DoFHandler in DoFAccessor.

Merge pull request #10374 from bangerth/return

Better document Threads::internal::return_value.

Merge pull request #10428 from tjhei/changelog_threading

threading changelog entry

Merge pull request #10429 from peterrum/cell_data_vector

Make CellData::vertices to std::vector

Rename TriaAccessor::set().

Merge pull request #10422 from lethe-cfd/insert_global_particles_properties

Adds the capacity to add properties to particle generators that use the dofs support points or the quadrature points

Merge pull request #10436 from peterrum/tria_iterators

Use range-based iterators in tria.cc

Merge pull request #10434 from peterrum/triaobject

Replace TriaObject