Speedup extract_locally_relevant_dofs

Merge pull request #1950 from tjhei/disable_deallog_console

Disable deallog console

Merge pull request #1953 from drwells/detemplate-distribute-sparsity-pattern

Detemplate distribute sparsity pattern

Improve docs for distribute_sparsity_pattern.

Update tests to not use '<>' unnecessarily.

De-template distribute_sparsity_pattern.

Formerly, when deal.II supported several dynamic sparsity patterns,
these functions had a template argument and were instantiated for each
distinct sparsity pattern type. Each function is currently only
instantiated once (for DynamicSparsityPattern and
BlockDynamicSparsityPattern, respectively) so the template is no longer
necessary.

Merge pull request #1954 from bangerth/doc-update-41

Update documentation.

Update documentation.

We used to use @arg in a few places here we meant @param.

Merge pull request #1952 from bangerth/changelog-update

Add another entry to the changelog.

Merge pull request #1941 from drwells/SP-to-SparsityType

Prefer SparsityType to SP.

Prefer SparsityPatternType to SP and SparsityType.

This commit uses SparsityPatternType as the template concept name for
things resembling a sparsity pattern. This replaces a few other template
parameters.

Add another entry to the changelog.

extend step-3 documentation

fix broken tests

fix other tests manually

remove deallog.depth_console(0) call in tests

changelog

step-50: switch from deallog to pcout, cleanup

remove nonsense

move deallog discussion from step4 to step3

Enable it in step3 and move the discussion there to match the output
printed in the results section.

remove deallog.depth_console(0) from examples

make 0 the default for deallog.depth_console

Disable printing deallog output to the screen by default.

Merge pull request #1951 from bangerth/clean-up-changelog

Clean up a number of changelog entries.

Document a recent change.

Clean up some changelog entries.

Merge pull request #1944 from drwells/fix-parameter-handler-dos-files

Fix parameter handler dos files

Add a test for DOS-format parameter files.

This verifies that issue #1691 was fixed by commit e9244cdffe.

Modify Utilities::trim to remove all whitespace.

This fixes issue #1691, where a ParameterHandler could not read files
with DOS line endings because Utilities::trim did not discard the '\r'
characters.

Merge pull request #1948 from kronbichler/fix_scalability_distributed_tria

Fix quadratic complexity of p::d::Tria::fill_vertices_with_ghost_neighbors

Fix quadratic complexity inside p::d::Tria::fill_vertices_with_ghost_neighbors

Merge pull request #1945 from drwells/fix-bzip-check-typo

Fix a typo in a CMake check.

Fix a typo in a CMake check.

Merge pull request #1940 from bangerth/fix-test-5

Fix output file.

Merge pull request #1939 from tjhei/fix_la_vector_output_test

fix tests/lac/la_vector_output

Fix output file.

fix tests/lac/la_vector_output

ofstream std::string constructor would require c++11

Merge pull request #1935 from tjhei/doxygen_fixes

Doxygen fixes

latex formula fixes

other doxygen errors

fix markup in step-45

Merge pull request #1931 from tjhei/fix_get_curl_on_clang

fix get_curl on clang broken in #1920

fix get_curl on clang broken in #1920

Merge pull request #1927 from bangerth/fix-test-2

Fix wrong reference to variable in test.

Merge pull request #1929 from asartori86/fix_doc_vector_tools

fixed doc introduced in #1928

fixed doc

Fix wrong reference to variable in test.

Merge pull request #1928 from asartori86/fix_doc_vector_tools

fixed doc in vector_tools.h

fixed doc

Merge pull request #1907 from drwells/DH-to-DoFHandlerType

DH to DoFHandlerType

Merge pull request #1925 from bangerth/document-fe-2

Finish rewriting the documentation of class FiniteElement.

Finish rewriting the documentation of class FiniteElement.

Escape words that also denote namespaces.

Merge pull request #1909 from bangerth/use-signaling-nans

Provide and use signaling nans

Add another test.

Add tests.

Fix copy constructor of SymmetricTensor.

Add a changelog entry.

Initialize mapping and FE output with signaling NaNs.

Merge pull request #1912 from bangerth/fix-internal-edges

Make GridGenerator::extract_boundary_mesh() copy manifold ids.

Add a file that contains ways to generate signaling NaNs.

Merge pull request #1923 from tjhei/fix_symtensor_contract

clarify namespace in double_contraction of SymmetricTensor

clarify namespace in double_contraction of SymmetricTensor

MSVC stumbled over this.

Allow setting manifold ids on interior edges and faces.

Merge pull request #1913 from bangerth/document-fe-1

Provide much more documentation for class FiniteElement and friends.

Provide much more documentation for class FiniteElement and friends.

Merge pull request #1918 from tjhei/write_svg_fix

avoid Point(true) constructor in write_svg

Merge pull request #1919 from tjhei/fix_step_52

step-52: avoid typename outside template functions

Merge pull request #1920 from tjhei/fix_step_48

MSVC fix for fe_evaluation

MSVC fix for fe_evaluation

It looks like MSVC struggles with operator? in template parameters unless you wrap them in parenthesis.

step-52: avoid typename outside template functions

avoid Point(true) constructor in write_svg

Pointd are always initialized to zero anyways and this call confuses MSVC.

Merge pull request #1895 from drwells/remove-noquerymode-check

Remove the DEAL_II_LIBLAPACK_NOQUERYMODE check.

Merge pull request #1916 from kronbichler/master

Fix documention introduced in #1914

Fix documention introduced in #1914

Merge pull request #1915 from tjhei/msvc_fixes

MSVC fixes

Merge pull request #1914 from kronbichler/master

Fix overflow issue with parallel::distributed::Vector

MSVC fixes

Fix overflow issue with parallel::distributed::Vector

Merge pull request #1910 from drwells/remove-mgdofhandler-references

Remove MGDoFHandler references

Improve spacing in a code sample.

Update references to the MGDoFHandler class.

This class was removed in the 8.0 release. I updated the example to show
how one can get the same result with a DoFHandler (i.e., call
distribute_mg_dofs).

Merge pull request #1902 from bangerth/do-some-work-in-get_data

Do some work in get_data instead of fill_fe_values

Merge pull request #1908 from bangerth/fix-cartesian-mapping

Compute higher order derivative mappings in MappingCartesian.

Compute higher order derivative mappings in MappingCartesian.

These fields were previously only computed for cells, but not for faces or subfaces.
This happened to work by accident because these fields are initialized by zeros.
But I'm changing this so that they are initialized by signaling NaNs, and so we need
to be explicit about this.

Improve indentation.

Prefer DoFHandlerType to DH.

Merge pull request #1906 from bangerth/fix-error-message

Fix error messages.

Fix error messages.

There was a space  missing in a couple of places, but more importantly we cannot
directly output objects of type types::boundary_id (==char). They need to be cast
to integers to yield something useful.

Merge pull request #1904 from bangerth/update-reference

Hallelujah.

Update a reference.

Merge pull request #1903 from jppelteret/fix_docs_gridgenerator

Added note on mesh refinement to GridGenerator::extrude_triangulation

Added note on mesh refinement to GridGenerator::extrude_triangulation

Fixes #1887

Revert order of loops and if statements.

This is in analogy to what was already done in #1821.

Do some work already in get_data().

Do not delay until fill_fe_values(), if something can already be done early on.

Merge pull request #1899 from bangerth/use-american-english

Use American English spelling of "signaling".

Use American English spelling of "signaling".

Merge pull request #1898 from bangerth/fix-tests

Fix tests.

Fix tests.

This adjusts tests for changes introduced when fixing
GridGenerator::extract_boundary_mesh().

Merge pull request #1897 from bangerth/fix-comment

Fix a comment.

Fix a comment.