Fix typos and set diffusion in step-51.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30894 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Use standard indentation scheme.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30893 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Minor edits.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30892 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Rename images to standard naming scheme. Add the image that describes the obstacle.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30891 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Work on the introduction.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30890 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

modified dealii/data_out.cc to test both write_visit_record functions

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30888 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

forgot to add a new entry in changes.h

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30887 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

added write_visit_record that allows for multiple blocks and more than one time step

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30886 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix grammar of message.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30885 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Minor markup improvements.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30884 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix leftover note.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30883 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix two tests.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30878 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add an instantiation that was previous missing in optimized mode.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30877 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix typo.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30876 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add two.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30872 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Change graph_coloring to accept an user-defined function to get the conflict_indices.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30846 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix test

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30839 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Added new tests for collect_periodic_face_pairs

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30835 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Added tests for collect_periodic_face_pairs and unified code in make_periodicity_constraints

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30832 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add hdf5 test

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30828 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

tests: move cat_file to other header

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30827 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Document the exception that is being thrown.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30826 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Step-51 documentation fixes.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30818 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fixed HDF5 multiprocessor bug

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30812 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add test for graph_coloring.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30809 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add test

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30803 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

find_active_cell_around_point now throws the exception ExcPointNotFound

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30802 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

disable checking MPI_init_thread return value because some implementations always return _SINGLE.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30799 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fixed add_periodity

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30798 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add a test for graph_coloring.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30797 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Explain integrals

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30795 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Step-51 documentation updates.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30792 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

update ignores

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30788 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix asserttion in test

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30787 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix r30770

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30786 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Went through the complete tutorial and made the presentation consistent.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30785 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Improve documentation of positive entries for constrained entries.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30784 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix typos in documentation.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30783 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Start graph coloring abilities for work_stream.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30781 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Write section on results with solution pictures and convergence graphs. Now we only need to upload the images

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30779 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

replace mpi_init by mpi_init_thread

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30770 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

More comments. One more test

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30766 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix subface interpolation.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30765 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix a few issues. Still not correct.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30763 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Help non-C++11 compilers.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30761 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

First step towards implementing FE_FaceP in analogy to FE_FaceQ. Cleanup some code.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30760 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix list

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30756 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove 'typename'.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30755 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix signature disparaty in 64-bit mode.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30748 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Comment a bit more

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30747 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add a comment on vector-valued problems

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30746 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Reindent file with astyle

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30743 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Avoid yet another (completely legitimate) warning.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30742 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Avoid (completely legitimate) warning.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30741 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Avoid (completely legitimate) warning.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30740 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix faulty markup.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30736 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

A couple more.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30735 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Write some more comments.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30733 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Changed the data type for periodic face pairs

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30732 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Comment on post-processing

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30731 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix performance test: same quadrature

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30728 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Correct a few instances where using the Vector::size_type is more correct than
defining an unrelated typedef in some namespace.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30724 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Do not declare a member function as 'inline' in the .cc file as that appears
to confuse GCC when using -flto.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30723 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

benchmarks: add test for hp

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30719 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

benchmarks: also compile tool

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30718 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

CMake: Bugfix, look for template-arguments at the right place

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30709 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

CMake: Improvement: Support direct build directory usage

With this commit it is now possible to use the build directory directly
without the need to install the project first.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30705 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Revert the globs in ./source - This was a very bad idea

It is crucial to have a notion of call back into cmake if a new file
appears under ./source - otherwise, we are in trouble...

It is not that bad for the developer who made the change (just run cmake
before make) - but everybody else getting the changes via svn up (or
similar) has no way to know whether a run of cmake is necessary or not.
And we leave users with a build system in an invalid state

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30700 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Provide further links.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30698 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Provide further links.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30697 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix units of kappa.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30695 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Splitted test for periodicity into two tests for periodicity and point_value

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30684 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make compile again

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30683 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix a few issues, write more in-code comments.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30682 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix compile problem with clang

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30681 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make tolerance sharper again.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30680 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Modified the distributed periodicity test to catch the exception thrown in VectorTools::point_value

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30679 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

CMake: Bugfix: Also compile and link the example steps when $ make (release|debug) is called

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30678 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Doc: Some progress wrt. the CMake documentation

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30677 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Some small fixes

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30676 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Step51 documentation updates.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30675 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Small editorial changes.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30674 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove unused variable.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30673 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Added DoFTools::extract_locally_*_dofs function instantiations for hp::DofHandler class

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30672 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove a lot of code, now that all DoFHandlers have cell dof caches.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30671 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Merge a bunch of functions now that hp::DoFHandler and DoFHandler behave similarly.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30670 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Note the hp::DoFHandler cell dof indices cache.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30669 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Introduce a way to query the address of the DoF cache in a generic way. This will allow unifying in the next step.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30668 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add missing fields to memory_consumption().

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30667 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Implement the hp::DoFHandler cell dof indices cache in the same way as we already have for the ::DoFHandler.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30666 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

update ignores

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30665 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

update test

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30664 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add new test for multigrid an slit geometry

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30663 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

parallel mg: clean up debug output, add additional checks

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30662 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

avoid deprecated p4est enum

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30661 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

reverse condition for multigrid

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30660 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

reformat comments

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30659 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

parallel geometric multigrid: limit the level difference at vertices

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30658 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Rename a bunch of classes.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30657 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Move DoFObjects into dof_faces.h since this is now the only place where it is referenced.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30656 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d