Merge pull request #8632 from bangerth/clarify

Clarify the use of the adjective 'integral'.

Merge pull request #8626 from bangerth/readme

Clarify something in the readme file that seems to perpetually perplex people

Clarify the use of the adjective 'integral'.

Merge pull request #8629 from peterrum/fdt_explicit_constructor

Make constructor of p:d:t explicit

Make constructor of p:d:t explicit

Merge pull request #8627 from peterrum/pdt_rename_settings_

Rename settings_ to settings in distributed/tria.cc

Merge pull request #8619 from bangerth/evaluate

Rename TensorPolynomials::compute() to ::evaluate().

Rename settings_ to settings in distributed/tria.cc

Clarify something in the readme file that seems to perpetually perplex people.

Merge pull request #8618 from bangerth/doc-99

Update documentation of FE_PolyTensor.

Merge pull request #8598 from bangerth/doc

Update a documentation string.

Merge pull request #8624 from bangerth/doc-98

Augment documentation in one place.

Augment documentation in one place.

Merge pull request #8602 from masterleinad/fix_symenginetest

Fix Symengine test

Add a changelog entry.

Also convert tests.

Merge pull request #8592 from peterrum/parallel_distributedtrinagulationbase

Introduce parallel::DistributedTriangulationBase

Merge pull request #8620 from Rombur/free

Use std::free instead of free to avoid name collision when using hipcc

Merge pull request #8601 from starki0815/patch_petsc_matrix_base

Add assertion to PETScWrappers::MatrixBase::begin() and end().

Introduce DistributedTrinagulationBase

Conflicts:
include/deal.II/distributed/tria.h
include/deal.II/distributed/tria_base.h
source/distributed/tria.cc

Merge pull request #8609 from kronbichler/fix_warning

Avoid warning regarding VectorizedArray: no-user provided constructor

Use std::free instead of free to avoid name collision when using hipcc

Merge pull request #8610 from bangerth/glossary

Document the concept of 'coarse cell id' in the glossary.

Merge pull request #8587 from peterrum/pdt_dofhandlerpolicy_1D

Enable DoFHandlerPolicy of p:d:t for 1D

Avoid superfluous zero + add-into in tensor contraction

Rename TensorPolynomials::compute() to ::evaluate().

We've used this kind of terminology in a number of other places. The point is
that we don't 'compute' the polynomial at that point; its form is fixed. Rather,
we 'evaluate' the polynomial for a particular value of its argument.

Merge pull request #8613 from luca-heltai/occ-closed-curves

Fixed small bug in OCC::interpolation_curve.

Update documentation of FE_PolyTensor.

Fix Symengine test

Merge pull request #8614 from masterleinad/whitelist_complex_operator_overloads

Only allow floating point types in complex_overloads.h

Enable internal::DoFHandlerImplementation::Policy::ParallelDistributed for 1D

Merge pull request #8615 from dangars/hdf5_documentation_typo

Fix typo in HDF5 documentation

Fixed small bug in OCC::interpolation_curve.

Fix typo in HDF5 documentation

Merge pull request #8474 from masterleinad/cleanup_constexpr

Cleanup use of DEAL_II_CONSTEXPR

Only allow floating point types in complex_overloads.h

Document the concept of 'coarse cell id' in the glossary.

Merge pull request #8564 from bangerth/svg-2

Change GridOut::write_svg() defaults

Merge pull request #8577 from gassmoeller/add_particle_generators

Add particle generators namespace

Merge pull request #8611 from rezarastak/algorithms_documentation_fix

Documentation typos fixed in theta_timestepping.h and newton.h

Documentation typos fixed in theta_timestepping.h and newton.h

Merge pull request #8599 from bangerth/test

Add a test.

Merge pull request #8579 from peterrum/pdt_dofhandlerpolicy_generalization

Generalize DoFHandlerPolicy of p:d:t

Merge pull request #8604 from bangerth/21

Further edits to the introduction of step-21.

Augment the documentation in one place.

Add a changelog entry.

Change the defaults for GridOut::write_svg.

Adjust doxygen documentation style.

Merge pull request #8567 from peterrum/cellid-coarse-id

Modify the definition of CellId

Merge pull request #8608 from masterleinad/fix_tuple_h

Fix tuple.h

Further edits to the introduction of step-21.

Add a test.

Rename file and namespace.

Fix tuple.h

Merge pull request #8605 from masterleinad/fix_optional_optimization_tests

Replace boost::none by the std::optional default constructor

Merge pull request #8597 from GrahamBenHarper/graham_dev_polynomials_fe

Remove PolynomialType Template Argument from FE_PolyTensor

Generalize DoFHandlerPolicy of p:d:t

Modify the definition of CellId

Conflicts:
include/deal.II/grid/tria.h

Merge pull request #8586 from peterrum/cellid-getcoarsecellid

Return coarse-cell id by CellId

Merge pull request #8600 from peterrum/parallel_triangulationbase

Rename parallel::Triangulation to parallel::TriangulationBase

Merge pull request #8574 from bangerth/contract

Avoid a couple FP subtractions.

Remove template argument from FE_PolyTensor

Replace boost::none by the std::optional default constructor

Add get_coarse_cell_id to CellID

Conflicts:
include/deal.II/grid/tria.h

Merge pull request #8470 from omosebi1/saturationfix

Fix for Saturation Equation

Explains formulation of the saturation equation

Avoid a couple FP subtractions.

By noting that the existing code performs dim subtractions of
terms that are each a product of two values, we can reorder
things in such a way that we first accumulate the products
(which is a dot product) and then subtract the result. This
should allow for some vectorization.

The performance gain is almost certainly completely negligible,
but it makes the code marginally easier to read. The reason
why the indices involved here allow for this is because
'jacobian_pushed_forward_grads[i]' happens to be a
Tensor<3,dim> and 'shape_gradients[k][i]' is a
Tensor<1,dim>. So the types are so that their product
is in fact equivalent to the summation of the last index
as was written before.

Rename parallel::Triangulation to parallel::TriangulationBase

Merge pull request #8542 from maemar/generalized-subdivided-hyperL

Added the function GridGenerator::subdivided_hyper_L().

Add assertion to PETScWrappers::MatrixBase::begin() and end().

Add assertion to make sure that begin() and end() can only be called on a processor owning the entire matrix. Also make sure that begin() works in case the first row(s) of the matrix is(are) emtpy.
Fixes #8571.

Merge pull request #8594 from masterleinad/cxx17optional

Replace boost::optional by std_cxx17::optional.

Update a documentation string.

Merge pull request #8595 from rezarastak/add_inline

added inlined keyword to function definitions in quadrature_point_data.h

Merge pull request #8596 from bangerth/exscan

Use MPI_Exscan instead of MPI_Scan.

Merge pull request #8593 from peterrum/dofaccessor_mgdofindices_1D

Implement DoFAccessor::set/get_mg_dof_indices for 1D

Merge pull request #8585 from rezarastak/doxygen_forward_declarations

added #ifndef DOXYGEN to forward declarations

Merge pull request #8588 from GrahamBenHarper/graham_dev_polynomials_derived

Change Polynomial Classes to Derive from TensorPolynomialsBase

Use MPI_Exscan instead of MPI_Scan.

Merge pull request #8555 from marcfehling/hp-chainsofconstraints

New test: Chains of constraints on parallel hp-adaptive applications.

Replace boost::optional by std_cxx17::optional

Implement DoFAccessor::set_mg_dof_indices and get_mg_dof_indices for 1D

Change Polynomials classes to derive from TensorPolynomialsBase

added inlined keyword to function definitions in quadrature_point_data.h

Merge pull request #8572 from bangerth/cleanups

Make a few variables 'const'.

forward declatations removed from doxygen in all header files

Make a few variables 'const'.

Merge pull request #8569 from peterrum/cellaccessor_faceiterators

Add cell->face_iterators()

Merge pull request #8570 from melaniegerault/eccentric_hyper_shell

Add the links to the figures in the documentation of GridGenerator::eccentric_hyper_shell()

Merge pull request #8573 from melaniegerault/master

Exclude MacOS self-generated files from untracked files

added #ifndef DOXYGEN to some forward declarations

Merge pull request #8584 from masterleinad/fix_clang_tidy_symengine

Fix clang-tidy complaints for Symengine

Merge pull request #8580 from masterleinad/mf_additional_ref

Pass MatrixFree::AdditionalData by reference

Fix clang-tidy complaints for Symengine

.DS_Store etc. and .swp removed from untracked files

Merge pull request #8576 from peterrum/test_grid_accessor_01

Correct variable type in test grid/accessor_01

Merge pull request #8582 from simonsticko/fix_parallel_block_vector_warning

Update deprecated warning message in parallel_block_vector.h.

Update deprecated warning message in parallel_block_vector.h.

The warning suggests including a file which doesn't exist. Change the
message to the intended file.

Pass MatrixFree::AdditionalData by reference

Merge pull request #8513 from gassmoeller/change_pack_compression_to_default

Add compression options to pack and use default parameters

Merge pull request #8522 from gassmoeller/optimize_particle_packing

Implement pack_particles functions