Merge pull request #8428 from kronbichler/force_inlining

Enforce inlining in simple tensor functions

Merge pull request #8441 from dangars/boost_files

Add boost files

Add boost files

The following files are necessary in order to compile deal.II
with boost 1.70 and clang 3.9:
is_function_cxx_03.hpp
is_member_function_pointer_cxx_03.hpp

Merge pull request #8403 from kronbichler/mapping_fe_field_levels

Enable MappingFEField on multigrid levels

Update documentation

Merge pull request #8432 from masterleinad/vectorized_array_output

Implement output operator for VectorizedArray

Merge pull request #8431 from masterleinad/fix_compiling_cuda

Fix compiling with CUDA

Merge pull request #8435 from masterleinad/restrict_petsc_step_27

Restrict mpi/petsc_step-27 to only be run with non-complex PETSc scalar type

Merge pull request #8436 from bangerth/add-note

Add a note to the count_lines.sh script.

Add a note to the count_lines.sh script.

Restrict mpi/petsc_step-27 to only be run with non-complex PETSc scalar type

Merge pull request #8386 from masterleinad/update_boost

Update bundled boost

Merge pull request #8424 from peterrum/base-vectorization-width-addon

Follow-up to PR #8342

Merge pull request #8423 from peterrum/grid-periodicity-1D

Enable periodicity for 1D

Merge pull request #8416 from bangerth/z

Update some commentary.

Changelog entry

Implement output operator for VectorizedArray

Merge pull request #8433 from rezarastak/cell_data_storage_fix

Bug in CellDataStorage::erase() fixed

Merge pull request #8427 from masterleinad/cuda_constraints_set_zero

 Add AffineConstraints::set_zero for MemorySpace::CUDA

Merge pull request #8434 from marcfehling/doc-hpref

Doc: Reviewed documentation for hp::Refinement.

Simplify symmetrize(Tensor<2,dim>)

Force inlining in several kinematics functions

Consistently enforce inlining in simple tensor functions.

This is necessary because compiler heuristics get bad in complicated situation, replacing simple
calls to one-liners when inlined into a lot of overhead through function calls. A complicated
situation is, e.g., when the same operations on tensors are done by several callers, say a
function templated on the polynomial degree in matrix-free computations where the quadrature
point loop does some operations with tensors in the same way for all degrees.

Doc: Reviewed documentation for hp::Refinement.

Merge pull request #8426 from peterrum/base-vectorization-constructor

Add two new methods to VectorizedArray

Bug in CellDataStorage::erase() fixed

Fix compiling with CUDA

Add two new methods to VectorizedArray

Changelog entry

Add AffineConstraints::set_zero for MemorySpace::CUDA

Merge pull request #8421 from marcfehling/pd-27

 New tests: Parallel distributed version of step-27.

Merge pull request #8422 from marcfehling/pd-feidx-transfer

Parallel distributed: Communicate active_fe_indices after refinement.

Enable periodicity for 1D

Merge pull request #8383 from peterrum/matrixfree-vectorizedarray-inst

Automated template instantiation for VectorizedArray

Add docu and constexpr to VectorizedArrayWidthSpecifier

Merge pull request #8425 from bangerth/xsdk

Add CHANGELOG.md and SUPPORT.md files.

Add CHANGELOG.md and SUPPORT.md files.

Update some commentary.

Parallel distributed: Communicate active_fe_indices after refinement.

New tests: Parallel distributed version of step-27.

Merge pull request #8420 from masterleinad/fix_error_spaces

Fix spaces in error messages

Fix spaces in error messages

Merge pull request #8412 from Rombur/cuda_import

LA::d::Vector import

Merge pull request #8415 from bangerth/y

Fix a bibtex entry.

Merge pull request #8417 from rezarastak/patch-1

documentation fix in distributed/tria.h

Merge pull request #8414 from bangerth/x

Minor clean-ups.

Add entry changelog

Add test for LA::d::Vector::import()

Add import() from one LA::d::Vector to another one

documentation fix in distributed/tria.h

Fix a bibtex entry.

Merge pull request #8314 from adam4130/step-14-bibtex

Use LaTeX bibliography in step-14

Remove a comment fragment.

Minor clean-ups.

Merge pull request #8411 from bangerth/b

Link to more resources on learning how to program.

Link to more resources on learning how to program.

Merge pull request #8413 from masterleinad/disable_intel_constepr

Disable __builtin_expect for Intel compiler with DEAL_II_CONSTEXPR

Merge pull request #8400 from peterrum/base-vectorization-makevectorizedarray

Add new make_vectorized_array function

Disable __builtin_expect for Intel compiler with constexpr enabled

Merge pull request #8407 from dangars/point_assignment_operator

Point assignment operator

Add changelog

Add test for Point assignment operator

Add Point assignment operator

Assignment operator from a Tensor<1, dim, Number> with different underlying
scalar type.

Additional capitalization fixes

Merge pull request #8349 from drwells/add-packaging-doc

Add notes on packaging for distributions.

Merge pull request #8409 from tjhei/doc_friends_no_dox

doc: no doxygen for friend declarations

Merge pull request #8402 from kronbichler/robustness_add_and_dot

Choose a more appropriate tolerance for vector add_and_dot

doc: no doxygen for friend declarations

It doesn't make sense to use doxygen format for friend declarations.
Even worse, it sometimes stops the correct documentation from showing
up.

As a bonus, this PR also has some hidden other fixes found while
replacing the comments.

Merge pull request #8408 from tjhei/doc_symmetric_tensor

doc: correct friend markup in tensor

Merge pull request #8405 from Rombur/distributed_import

Fix a bug in LA::d::Vector::compress on the host

Add new make_vectorized_array function

doc: correct friend markup in tensor

Documentation is messed up by using doxygen markup for the comments for
friend declarations as they replace the correct documentation
(SymmetricTensor::trace for example). Fix this.

Fix a bug in LA::d::Vector::compress on the host

compress() would fail if it was called in a CUDA file, for a
LA::d::Vector<Number, MemorySpace::Host> and
deal.II/la/la_parallel_vector.templates.h was included

Merge pull request #8395 from masterleinad/cuda_mf_initialize_vector

 Implement CUDAWrappers::MatrixFree::initialize_dof_vector

Merge pull request #8404 from masterleinad/fix_cell_data_transfer_petsc_complex

Fix CellDataTransfer tests for complex Petsc complex scalar type

Fix CellDataTransfer tests for complex Petsc complex scalar type

Changelog

Add tests for the new level feature

Enable constructor of MappingFEField on MG levels

Merge pull request #8401 from rezarastak/physics_elasticity_fix

Fixing the linker error of StandardTensors with clang 4.0.1

Choose a more appropriate tolerance for vector add_and_dot

Fixing the issue with clang 4.0.1

Merge pull request #8399 from peterrum/base-vectorization-enableifscalar

Fix EnableIfScalar for VectorizedArray

Merge pull request #8396 from rezarastak/ranged_for

ranged-for documentation fix

Merge pull request #8398 from tjhei/doc_quadrature_transfer

improve CellDataStorage documentation

Fix EnableIfScalar for VectorizedArray

improve CellDataStorage documentation

Merge pull request #8397 from peterrum/mpi-compute-index-owner-assert

Add assert to Utilities::MPI::compute_index_owner

Add assert to Utilities::MPI::compute_index_owner to check the equality of the size of the index sets on all processes

ranged-for documentation fix

Changelog entry

Implement CUDAWrappers::MatrixFree::initialize_dof_vector

Merge pull request #8394 from masterleinad/fix_step_28

Avoid initializing a numbered list in step-28 documentation

Avoid initializing a numbered list in step-28 documentation

Merge pull request #8385 from rezarastak/constexpr_symmetric_tensor

Constexpr SymmetricTensor and TableIndices

Merge pull request #8391 from kronbichler/alternative_output

Add alternative test output for some roundoff-sensitive tests

Changelog entry

Avoid output of roundoff-sensitive data. Print correct/wrong instead.

Merge pull request #8393 from kronbichler/test_robustness_03

Provide AVX-512 output for four additional tests

Merge pull request #8392 from kronbichler/test_robustness

Test robustness: avoid points directly at the periodicity boundary