Use types::global_dof_indices.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30931 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Use types::global_dof_indices.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30930 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

The big documentation overhaul

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30929 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Finish documentation

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30925 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix a bug in work_stream when using graph_coloring.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30922 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Use graph coloring whith work_stream.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30921 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add note about yesterday's change to PETSc wrappers.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30920 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix typo in documentation.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30919 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Avoid outputting 'number-number' since ./normalize might turn that into numbernumber if the second number just so happens to be zero -- and then consequently completely confuse numdiff.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30917 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Work around a change in PETSc 3.4.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30916 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

instantiate selectors for const vectors

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30915 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fixed bug in add_periodicity. There were errors when the mesh is not immediately refined.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30914 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add homogeneous boundary operator

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30907 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

More work.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30903 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Some more work.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30902 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

More small rewrites.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30901 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Resize picture.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30900 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Use pictures from the central repository.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30898 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

More editing. Return some values rather than having functions have several output arguments.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30897 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove the original tex version of the introduction.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30896 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove the out-of-source check from DEAL_II_INVOKE_AUTOPILOT

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30895 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix typos and set diffusion in step-51.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30894 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Use standard indentation scheme.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30893 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Minor edits.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30892 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Rename images to standard naming scheme. Add the image that describes the obstacle.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30891 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Work on the introduction.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30890 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

modified dealii/data_out.cc to test both write_visit_record functions

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30888 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

forgot to add a new entry in changes.h

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30887 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

added write_visit_record that allows for multiple blocks and more than one time step

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30886 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix grammar of message.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30885 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Minor markup improvements.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30884 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix leftover note.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30883 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix two tests.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30878 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add an instantiation that was previous missing in optimized mode.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30877 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix typo.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30876 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add two.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30872 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Change graph_coloring to accept an user-defined function to get the conflict_indices.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30846 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix test

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30839 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Added new tests for collect_periodic_face_pairs

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30835 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Added tests for collect_periodic_face_pairs and unified code in make_periodicity_constraints

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30832 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add hdf5 test

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30828 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

tests: move cat_file to other header

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30827 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Document the exception that is being thrown.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30826 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Step-51 documentation fixes.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30818 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fixed HDF5 multiprocessor bug

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30812 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add test for graph_coloring.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30809 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add test

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30803 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

find_active_cell_around_point now throws the exception ExcPointNotFound

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30802 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

disable checking MPI_init_thread return value because some implementations always return _SINGLE.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30799 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fixed add_periodity

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30798 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add a test for graph_coloring.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30797 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Explain integrals

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30795 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Step-51 documentation updates.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30792 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

update ignores

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30788 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix asserttion in test

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30787 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix r30770

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30786 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Went through the complete tutorial and made the presentation consistent.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30785 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Improve documentation of positive entries for constrained entries.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30784 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix typos in documentation.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30783 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Start graph coloring abilities for work_stream.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30781 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Write section on results with solution pictures and convergence graphs. Now we only need to upload the images

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30779 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

replace mpi_init by mpi_init_thread

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30770 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

More comments. One more test

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30766 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix subface interpolation.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30765 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix a few issues. Still not correct.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30763 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Help non-C++11 compilers.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30761 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

First step towards implementing FE_FaceP in analogy to FE_FaceQ. Cleanup some code.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30760 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix list

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30756 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove 'typename'.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30755 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix signature disparaty in 64-bit mode.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30748 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Comment a bit more

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30747 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add a comment on vector-valued problems

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30746 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Reindent file with astyle

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30743 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Avoid yet another (completely legitimate) warning.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30742 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Avoid (completely legitimate) warning.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30741 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Avoid (completely legitimate) warning.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30740 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix faulty markup.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30736 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

A couple more.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30735 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Write some more comments.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30733 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Changed the data type for periodic face pairs

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30732 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Comment on post-processing

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30731 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix performance test: same quadrature

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30728 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Correct a few instances where using the Vector::size_type is more correct than
defining an unrelated typedef in some namespace.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30724 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Do not declare a member function as 'inline' in the .cc file as that appears
to confuse GCC when using -flto.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30723 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

benchmarks: add test for hp

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30719 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

benchmarks: also compile tool

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30718 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

CMake: Bugfix, look for template-arguments at the right place

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30709 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

CMake: Improvement: Support direct build directory usage

With this commit it is now possible to use the build directory directly
without the need to install the project first.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30705 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Revert the globs in ./source - This was a very bad idea

It is crucial to have a notion of call back into cmake if a new file
appears under ./source - otherwise, we are in trouble...

It is not that bad for the developer who made the change (just run cmake
before make) - but everybody else getting the changes via svn up (or
similar) has no way to know whether a run of cmake is necessary or not.
And we leave users with a build system in an invalid state

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30700 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Provide further links.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30698 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Provide further links.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30697 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix units of kappa.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30695 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Splitted test for periodicity into two tests for periodicity and point_value

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30684 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make compile again

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30683 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix a few issues, write more in-code comments.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30682 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix compile problem with clang

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30681 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make tolerance sharper again.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30680 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Modified the distributed periodicity test to catch the exception thrown in VectorTools::point_value

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30679 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

CMake: Bugfix: Also compile and link the example steps when $ make (release|debug) is called

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30678 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Doc: Some progress wrt. the CMake documentation

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30677 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d