Fix grammar.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9737 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Mention Michael's 3d algorithm.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9736 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Mention Oliver's latest achievements.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9735 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Another patch for the 3D version of initialize_constraints. Actually
numerical inaccuracies caused the ConstraintMatrix to complain about
different values for the same entry. The reason for these problems is
the loss of symmetry in the FP-approximation of the shape functions
for higher polynomial degrees (cf. comment in code).
This problem is now fixed.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9734 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix of CellAccessor<3>::neighbor_child_on_subface function

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9733 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

DataOutBase<2,3>::write_tecplot did not write the variable name z. This is now fixed.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9732 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Change of results due to fix of neighbor_child_on_subface (see patch 1.71 of tria_accessor.cc)

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9731 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix check for neighbor_child_on_subface

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9730 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix neighbor_child_on_subface function. When face orientations do not match, run over all neighbor children until the right one is found. This might not be optimal in terms of time, but at least it works.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9729 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Use correct include guard.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9728 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix a bug in GridGenerator::cylinder<3>

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9727 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9726 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Small test case for which neighbor_child_on_subface fails.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9725 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Improve the message sent by one exception.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9724 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Expand comment.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9723 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add assertion to neighbor_child_on_subface function.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9722 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Implemented a small fix, which sets near zero elements in the constraint
matrix, which stem from numerical inaccuracies, to zero.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9721 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

When HAVE_HSL_MA27 and HAVE_HSL_MA47 are undefined, the errno.h file is not included which is needed for errno==EINTR to be compiled. Therefore revert last patch.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9720 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Added a note about the changes in class FE_Q for 3D.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9719 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Added a testcase for the FE_Q class in 3D, which tests the automatically
generated constraint matrices.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9718 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Now the constraint matrices for 3D FE_Q elements are generated
automatically for arbitrary degree, which makes the use of these
elements possible.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9717 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Move some code under #ifdef guards. This works, but the main reason we
do it is that if we include these header files icc71 can't be used any
more on newer linux systems due to a stupid interaction with
/usr/include/linux.h that simply kicks out non-gcc versions (icc8
identifies itself as gcc, so isn't affected)...

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9716 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Be fine with tiny differences.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9715 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Extend a comment.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9714 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Revert to previous state whenever possible and add comment.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9713 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

GridGenerator::laplace_transformation function: don't request all boundary points being included in new_points.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9712 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix of the StraightBoundary<3>::get_new_point_on_quad function.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9711 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Extension of CylinderBoundary class to represent circular tubes also along the y- and z-axis.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9710 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Bug fix: the StraightBoundary<3>::get_new_point_on_quad requested for children of lines of the quad which in general do not exist. Get around this by using the centers of the lines.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9709 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Need to define USE_CONTRIB_HSL so that it shows up in
common/Make.global_options and can be used in contrib/Makefile.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9708 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add umfpack to defaults.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9707 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Check for functions in -lumfpack.a

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9706 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Mention PETSc 2.2.1

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9705 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Augment documentation.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9704 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

and missing \ ... don't do this if you are tired

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9703 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add missing parts of path

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9702 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove vanished variables

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9701 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make two variables const only for newer petsc versions.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9699 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Two patches that are necessary for the upgrade to petsc 2.2.1

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9697 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

New test and add comment to old one.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9696 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Work around interface changes in PETSC 2.2.1

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9695 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make things compile with PETSc 2.2.1, which has changed interfaces again...

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9694 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix formatting.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9692 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Blow away Makefile.dep if it was created but is empty. This usually indicates a problem with running make_dependencies, but it only shows up by very distracting follow-up problems.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9691 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

# rules to generate the program. let is be dependent on the global flags for
# the following reason: if you go to a different system, but keep with the
# same directory, you get into trouble because make_dependencies is not
# deleted by "make clean"; following this, we generate empty Makefile.dep's
# because we can't run the executable. So better be careful and regenerate
# make_dependencies whenever we think it may be beneficial

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9690 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Introduce a field that stores which constraints exist already. This is desirable since we would otherwise have to walk through the list of existing constraints in add_line, which is an O(N) operation that has to be repeated O(N) times. This quadratic algorithm is now gone, making the SPEC testcase a full 5% faster than previously. The main reason is that it used to walk through a lot of memory and create a horrific number of cache misses, which are now all gone.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9689 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Replace #if by the proper #ifdef.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9688 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Some profiling shows that loops over dim are not always unrolled. Do
so by hand for the two most often called functions in Tensor<1,dim>:
operator= and operator* (the latter is most often called during matrix assembly).

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9687 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add a few more words.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9686 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add some graphics.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9685 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove comments that aren't accurate. Update other comments.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9684 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove comments that aren't accurate.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9683 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9682 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

missing @p

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9681 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

last @em removed

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9680 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Revert patch 1.66. Lines are given only once for following cases: no mapping given, no additional boundary face points required and for cells that have no boundary lines. Now the regression tests: constraints, grid_out produce the old results.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9679 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

remove test output to std::cout

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9678 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9677 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Update.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9676 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

New tests.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9675 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Extension of get_interpolation_matrix to arbitrary source fe's.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9674 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

make class exist, but empty if not configured

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9673 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Documentation for doxygen

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9672 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

doc reformatted

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9671 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove test output line.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9670 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

New test. (2004/09/19)

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9669 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

configure external umfpack

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9668 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

New test (2004/07/12)

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9667 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9666 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

New tests. Modify some tests so that they can work with the block iterators. (2004/07/12)

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9665 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

New tests (2004/06/29)

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9664 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Update.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9663 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove error checking from this test. (2004/04/01)

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9662 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

new tests

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9661 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

New tests

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9660 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Update.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9659 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

New test.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9658 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

More changed files due to the fixed CompressedSparsityPattern::max_entries_per_row bug (2004/06/21)

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9657 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

function moved

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9656 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix a bug where CompressedSparsityPattern::max_entries_per_row ignored the first row of a matrix (2004/06/21)

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9655 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Update results. Changes are due to patch 1.25 (2004/07/12) of sparse_matrices.cc.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9654 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add missing include file.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9653 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix assertion.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9652 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make it compile also in 2d.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9651 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add a TODO.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9650 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

GridOut::write_gnuplot now supports curved boundaries also in 3d

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9649 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Doc update of the GridOutFlags::Gnuplot::n_boundary_face_points variable.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9648 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Implementation for GridOut::write_gnuplot for curved boundaries in 3d.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9647 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Replace line based output in GridOut<3>::write_gnuplot by face based output. lines are given twice but no change in gnuplot view.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9646 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Simplification of code in GridOut<2>::write_gnuplot. No change of output.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9645 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

exception bug removed

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9644 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

exception bug removed

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9643 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Declare missing exception.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9642 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

update

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9641 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

better handling of const vectors

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9640 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

changed exception

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9639 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add a TODO for Guido.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9638 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Move TODO to right place.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9637 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add a TODO for Guido.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9636 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix same problem again.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9635 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d