Merge pull request #12969 from Rombur/kokkos_cmake

Fix bug in build system when using Kokkos

Merge pull request #12977 from peterrum/setup_constraints_refactor

Refactor HangingNodes::setup_constraints()

Merge pull request #12973 from tjhei/checkpointing_large_part2

fix checkpointing with >2GB per process

Merge pull request #12985 from peterrum/cuda_flags

Refactor HangingNodes::setup_constraints()

Improve default behaviour of CUDAWrappers::MatrixFree::reinit()

Merge pull request #12984 from drwells/remove-set_vertex_dof_index

Remove set_vertex_dof_index().

Merge pull request #12982 from peterrum/CollectionIterator_trait

Add iterator traits to hp::CollectionIterator

Remove set_vertex_dof_index().

This is no longer used as of e759ceee8e.

Merge pull request #12980 from peterrum/neighbor_child_on_subface_simplex

Fix CellAccessor::neighbor_child_on_subface()

Merge pull request #12979 from peterrum/merge_triangulations_simplex

Fix GridGenerator::merge_triangulations() for simplex meshes

Merge pull request #12976 from peterrum/FEImmersedSurfaceValues_assert

Add assert to FEImmersedSurfaceValues

Add assert to FEImmersedSurfaceValues

Fix GridGenerator::merge_triangulations() for simplex meshes

Add iterator traits to hp::CollectionIterator

Merge pull request #12981 from kronbichler/simd_simplify_blend

VectorizedArray: Simplify compare_and_apply_mask by blend instruction

VectorizedArray: Simplify compare_and_apply_mask by blend instruction

Fix CellAccessor::neighbor_child_on_subface()

Merge pull request #12978 from tjhei/mg_access_assert

add Assert to get_mg_dof_indices

add Assert to get_mg_dof_indices

Calling get_mg_dof_indices currently causes a segfault when you don't
have MG DoFs distributed. Fix by adding an Assert with a nice message in
two places (why not).

Merge pull request #12965 from bangerth/filters

Use iterator filters in our code base.

fix checkpointing with >2GB per process

This fixes save/load of fixed and variable checkpointing where
individual ranks write more than 2GBs of data.
Part of #12873 and #12752

Merge pull request #12967 from bangerth/comsol

More work for COMSOL meshes

Merge pull request #12970 from masterleinad/replace_cancel_builds_on_update

Replace cancel-builds-on-update by concurrency feature in the GitHub CI

Use proper types instead of string comparisons.

Merge pull request #12964 from tjhei/mpi_create_big_datatype

Utilities::MPI::create_mpi_data_type_n_bytes

round 2 of comments

Use emplace_back() over push_back().

Replace cancel-builds-on-update by concurrency feature in the GitHub CI

Fix bug in build system when using Kokkos

address comments

Add more tests.

Read more variants of COMSOL files.

Fix a test.

Merge pull request #12949 from bangerth/comsol

Merge pull request #12966 from bergbauer/cell_neighbor

FEEvaluation: Select correct code path for cell neighbors

Select correct code path for neighbor elements

Merge pull request #12024 from simonsticko/fe_immersed_surface_values

Add class FEImmersedSurfaceValues

Use iterator filters in our code base.

Merge pull request #12957 from bangerth/warning

Work around a (wrong) warning about an unused variable.

Add class NonMatching::FEImmersedSurfaceValues

That has the same shape function values/derivatives as FEValues,
but has JxW-values corresponding to integration over a surface
immersed in the cell. This is achieved by passing an
ImmersedSurfaceQuadrature instead of a Quadrature to the constructor.

Add a virtual function fill_fe_immersed_surface_values on Mapping to
be able to compute the correct JxW-values and surface normals. Make it
throw ExcNotImplemented by default, but override it with an
implementation on MappingCartesian and MappingQ.

Work around a (wrong) warning about an unused variable.

Utilities::MPI::create_mpi_data_type_n_bytes

part of #12752

Merge pull request #12963 from peterrum/DictionaryPayLoad_assert_fix

Fix assert in DictionaryPayLoad

Merge pull request #12952 from bangerth/filters

Provide C++20-style operator| to filter iterator ranges.

Fix assert in DictionaryPayLoad

Merge pull request #12962 from peterrum/CellIteratorContainer_inline

CellIteratorContainer: inline function

CellIteratorContainer: inline function

Merge pull request #12959 from peterrum/ConstraintKinds_memory_consumption

ConstraintKinds: implement memory_consumption()

Merge pull request #12945 from peterrum/subcell

Rename ConstraintKinds::type to subcell

Merge pull request #12951 from bangerth/doc-0

Minor updates to the documentation of CellData.

Merge pull request #12961 from bangerth/unsigned-2

Make the 'direction' argument of some GridTools functions 'unsigned'.

Convert a few places to use operator| to filter iterators.

Add a changelog entry.

Add tests.

Provide C++20-style operator| to filter iterator ranges.

Make the 'direction' argument of some GridTools functions 'unsigned'.

Merge pull request #12946 from peterrum/CellIteratorContainer

std::unique_ptr<const CellIteratorBase> -> CellIteratorContainer

ConstraintKinds: implement memory_consumption()

Merge pull request #12950 from bangerth/gridout

Merge pull request #12956 from simonsticko/simplify_mapping_cartesian

Remove some duplication in MappingCartesian

Merge pull request #12955 from bergbauer/read_dof_values_with_masks

Introduce mask in read_dof_values

Add MappingCartesian::maybe_update_volume_elements()

To remove some duplication in the class.

Add MappingCartesian::maybe_update_jacobians()

To remove some duplication in the class.

Merge pull request #12947 from peterrum/fix_types

Fix types

Add MappingCartesian::maybe_update_inverse_jacobians()

To remove some duplication in the class.

Introduce masks in read_dof_values

Fix types

Merge pull request #12948 from peterrum/step-64-feeval

Step-64: be explicit regarding templater parameter

Minor updates to the documentation of CellData.

Add a changelog entry.

Add the ability to output tet meshes in gnuplot format.

Add a changelog entry.

Add a test.

Add the ability to read COMSOL .mphtxt files.

Step-64: be explicit regarding templater parameter

std::unique_ptr<const CellIteratorBase> -> CellIteratorContainer

Merge pull request #12931 from gassmoeller/optimize_particle_generation

Optimize particle generation

Merge pull request #12937 from peterrum/mpi_compute_index_owner_internal_assert_message

Improve assert message in DictionaryPayLoad

Rename ConstraintKinds::type to subcell

Merge pull request #12944 from peterrum/ConstraintKinds_check

Check ConstraintKinds

Improve assert message in DictionaryPayLoad

Check ConstraintKinds

Merge pull request #12943 from bangerth/message-2

Improve an error message.

Merge pull request #12938 from bangerth/threads

Minor cleanups in thread_management.h.

Merge pull request #12942 from bangerth/tests-2

Convert loops in some tests to reference-cell-independent form.

Merge pull request #12941 from peterrum/FEValuesBase_content

FEValuesBase: move content around

Improve an error message.

Convert loops in some tests to reference-cell-independent form.

Merge pull request #12939 from bangerth/gmsh

Streamline documentation.

Minor cleanups in thread_management.h.

FEValuesBase: move content around

Streamline documentation.

Update documentation

Merge pull request #12932 from peterrum/fe_values_cell_iterator_base

FEValues: simplify CellIteratorBase

Merge pull request #12934 from bangerth/const

Mark FEValuesExtrator objects as 'const'.

Merge pull request #12936 from peterrum/ConstraintKinds_reorder

MatrixFreeFunctions::ConstraintKinds: rename and reorder

Merge pull request #12935 from bangerth/message

Improve an error message.

MatrixFreeFunctions::ConstraintKinds: rename and reorder

Improve an error message.