Revert false correction.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31733 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fixed bug regarding the use of ComponentMask in make_zero_boundary_constraints.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31732 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Bufix: Well, it is a good idea to not destroy formerly working functionality

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31731 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Testsuite: Remove the dependency of setup_tests on a built library, let's see...

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31730 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Testsuite: Refactor testsuite setup into its own project.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31728 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Link to the CS&D paper.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31726 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Minor indentation changes.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31725 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Cleanup ExceptionBase: Inherit from std::exception and do the c_string handling directly to avoid the const_casts

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31723 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Introduce IterationNumberControl to perform a fixed number of solver steps without throwing an exception.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31722 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

defer backtrace lookup in dealii::Exception for performance reasons

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31720 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

CMake: Bugfix: Only run "make sign" if it is necessary

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31718 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

CMake: Provide a possibility to automatically sign generated executables on Mac OSX

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31717 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Documentation: Add a small section about how to create a new category

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31716 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

replace include of dof_handler_policy.h in dof_handler.h by forward declaration

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31713 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

test only works if you have petsc and trilinos

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31712 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

rework r31702

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31711 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix r31695, explicit instantiations are not needed after all

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31710 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

rewrap comments (phew)

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31709 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

update documentation

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31708 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Testsuite: Bugfix: Allow to run the testsuite script from within an insource build

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31707 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Bug fix.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31706 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Provide more context in the documentation and link to a paper in preparation.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31705 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

do not use typeid internally because this is broken on intel 13+. Instead: emulate this in the DoFHandlerPolicy classes. Also update test output

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31702 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add missing instantiations (for intel)

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31701 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

test: add whitespace to output so that numdiff can work, output more digits

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31700 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

loosen tolerance in test to make it pass

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31699 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

output more digits in test

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31698 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

output more digits in test

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31697 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

mention changes

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31696 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix template instantiations for GridGenerator::parallelogram, do not pass array as a reference

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31695 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Augment documentation.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31694 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix the failure of find_cell_10a by implementing a better stopping criterion for the Newton iteration, using a variable metric Newton method.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31693 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix typo

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31692 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Also run test in optimized mode.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31691 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix one testcase, see https://code.google.com/p/dealii/issues/detail?id=134 . Since we are having so much trouble with this function, I also left my debug code in there, guarded with \#ifdef DEBUG_NO_NORMAL_FLUX. Adjust testcase.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31690 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix one testcase, see https://code.google.com/p/dealii/issues/detail?id=134 . Since we are having so much trouble with this function, I also left my debug code in there, guarded with \#ifdef DEBUG_NO_NORMAL_FLUX.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31689 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix non-MPI case

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31688 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix description

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31687 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fixed: FETools::inteprolation_difference was not working with TrilinosWrappers::MPI::Vectors with ghost entries, also, TrilinosWrappers::VectorBase has a get_mpi_communicator method now.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31686 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix a note in a comment.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31684 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Testsuite: Fix data_out_stack_0?

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31683 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Bugfix: Define FP_USE_THREAD_SAFE_EVAL in case of enabled multithreading support.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31682 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Set missing svn:keywords property on a bunch of files

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31681 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix a lot of stray $Id$s

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31680 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix error message.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31679 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Minor language fix.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31678 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

update comment

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31677 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix test output

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31676 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

assert that we have a enough fe components in compute_no_normal_flux_constraints

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31675 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add failing test for no_flux

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31674 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add PETSC_WITH_COMPLEX to Config.sample

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31673 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Testsuite: Fix the issue with binary outputs and data_out_base_dx

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31672 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Split a function in hopes to alleviate linker errors with ICC.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31671 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Testsuite: Also accept numerical values that have a relative error of less than 1.e-8 (but an absolute error of more than 1.e-6)

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31670 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

CMake: Bugfix: Do not use >/dev/null on native Windows targets

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31669 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

CMake: Remove debug output

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31668 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Replace the expensive computation of a set intersection with the cheap computation whether two sets have a nonempty intersection at all. We don't need the intersection anyway.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31667 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

CMake: Print TEST_DIR during configuration so that one actually has a clue which TEST_DIR was processed

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31666 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fixed output

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31665 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add missing initialization

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31664 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Adjust the output of some tests so that we get below the threshold of numdiff.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31663 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Initialize a variable to avoid a testsuite failure with ICC 14.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31662 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Avoid instantiating FE_FaceQ and FE_FaceP in 1d.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31661 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Match function instantiation to the original declaration in hopes to
make ICC 14 happy. Unfortunately, this is not the case.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31660 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Provide a missing template instantiation.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31659 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Augment an exception message. This doesn't solve the problem, but it
gets us closer to it...

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31658 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add a harmless macro PETSC_WITH_COMPLEX.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31653 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Put in a missing word that was bugging me...

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31652 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add a reasonable (unfinished) petsc test.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31651 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add requested output to slepc quicktest.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31650 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

No need to say
  class.template function ()
when no explicit template arguments are provided.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31649 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Provide some more information about auxiliary compiler in detailed.log

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31648 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix compile error with new default constructor of CellData.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31647 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

CMake: Bugfix, do not use removed macro

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31646 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

CMake: Unify naming in detailed.log

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31645 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

CMake: Unify registration of feature configurations and provide a central
possibility to filter configuration options in macro_register_feature.cmake

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31644 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Bugfix: Filter out spurious "FALSE" in (BLAS|LAPACK)_LIBRARIES

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31643 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add a configure check for a regression with icc-14.0.0 and libstdc++-4.7 in C++11 mode

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31642 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Provide default constructor for CellData to fix testsuite failures with Intel ICC 14.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31641 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

try again to fix test

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31640 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix test

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31638 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add a note.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31637 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

simplify test find_cell_10

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31636 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix a bug in WorkStream when using graph coloring.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31635 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

simplify test

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31634 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Wolfgang's patch for thread management (use pointer to).

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31633 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

try to keep SparseMatrix in module

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31632 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix 2 tests

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31631 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix a bug in WorkStream for disconnected graph.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31630 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

tests: use deal.II constant for PI, might fix tests on cygwin

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31629 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Reorganize the licensing stuff a bit. Add some last license headers and pointers

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31628 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove file doxygen.sty from the doc directory - it is ancient can be generated on the fly by modern doxygen

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31627 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Move reports over to the homepage

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31626 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

revert UML

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31619 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Use deal.II style on previous patch.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31618 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Link to header stdlib.h on FreeBSD.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31617 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Revert "Revert 29343 again, for the same reason as before." which itself reverted the revert of [...]

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31616 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Provide documentation.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31615 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add another test.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31614 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Adjust a few miscompilations.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31613 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d