Add missing empty line.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22329 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add target for creation of plain files and rename cg to solver to make changes easier

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22321 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix SolverSelector when using a custom SolverControl. It got copied into a member and thus sliced. Changed into using a SmartPointer.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22316 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix SolverSelector test with new interface. We also need to set a SolverControl in every case.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22315 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

And make the test pass.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22314 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add test for SolverSelector with a custom SolverControl.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22313 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

make test pass now that FGMRES is fixed.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22312 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix memory leak in FGMRES.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22311 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

new test documenting a memory leak in FGMRES.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22310 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add a print function to log the whole block info

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22301 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add one.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22300 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Set bash in common make options

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22299 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Trivial aesthetic change that helps cross-referencing.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22298 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

H(curl)-save application of boundary values for hanging-nodes.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22297 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

automatically create quadrature if none is provided

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22295 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Correct position of PETSC_MPI_CONSISTENCY. Still no functionality... (TODO)

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22293 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Also pass the locations of evaluation points through DataPostprocessor.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22292 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Suppress a warning and in the process move the common function for testing into a header file of its own.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22290 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Reinsert toc entry for plain program

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22289 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

remove internal classes from module

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22288 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Include header file that is now apparently necessary.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22279 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

run examples instead of doxygen in build tests

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22278 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

1D libraries are not used

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22277 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove auto-generated files.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22276 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add serialization directory to the list of tests.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22275 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

introduce CXX_BRAND

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22274 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

correctly set detailed version string

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22273 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

run autoconf on pgCC tests

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22272 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

test for portland group compiler version... no autoconf here, so apologies in advance if things break

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22271 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

standardize test for functions and test more

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22270 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

new exception

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22269 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

use more verbose exception and eliminate unused ExcNotUsed

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22268 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

remove unnecessary dependence on mapping_q.h from fe_values.h

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22267 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add new tests for serialization.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22266 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove auto-generated file.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22265 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add functions for serialization.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22264 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add new tests for serialization.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22263 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Allow adding the empty range [N,N) for IndexSets on spaces of size N.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22257 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

adjust documentation to Baerbel's changes

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22253 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add a target run and adjust timestepping to Baerbel's changes

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22252 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

pgCC complained about accessing base class of base class directly

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22247 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Build the boost serialization library.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22233 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove another couple of warnings. They may be legit but we're only *using* boost, not developing it, and there is nothing we can do about this case right here.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22232 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Work around a number of problems that cause warnings and/or errors.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22231 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make objects non-const so that we can load into them.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22228 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add a newline to the end of the file.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22201 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add a constructor that does reinit at the same time

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22200 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

eliminate compiler warnings

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22199 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Move forward declarations to the top of the file.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22198 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

decapitalize namespace MG to mg

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22197 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

we NEED different row and column indices for the edge matrices in multigrid

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22196 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add simplified reinit with row length vector

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22195 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add assertion of vector sizes

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22194 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Write a bit on multilevel matrices... to be continued

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22193 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix typo in documentation.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22189 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

removed output

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22188 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

start making MGLocalBlocksToGlobalBlocks work

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22187 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add MG namespace for reimplementation

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22186 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

implementation of MGMatrixBlockVector

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22185 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

some modifications to use both cg and dg elements in mg

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22183 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

replace another exception

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22182 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

removed output

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22181 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove parts we don't need.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22180 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22179 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add a new directory. It isn't currently used but will be soon.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22177 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

some more modifications to use dg and cg in multigrid at the same time

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22169 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make FETools a namespace, rather than a class with all static member functions.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22162 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Reindent file.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22161 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove the declaration of a function that has not existed in quite a while.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22160 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Exclude declaration of explicit specialization from doxygen runs.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22159 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

catch the right exception

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22158 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

implement MGMatrixBlockVector

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22157 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add vector values not using Vector to Function
add Functions::CosineGradFunction

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22155 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix wording.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22153 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

start testing cnsistency of basic functions

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22143 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add missing implementations

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22142 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

copy flow to higher number

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22140 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

use automatic output file name

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22139 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fixed bug that prevented mapping q eulerian to work properly in codim one.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22133 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

test LSingularityGradFunction and add missing stuff

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22125 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add gradient of LSingularityFunction

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22124 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add virtual constructor

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22123 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add missing suffix

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22122 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Work a bit on the documentation and state order of indices.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22121 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix documentation.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22120 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Ubuntus default /bin/sh can not deal with "{a,b}" in shell commands and could not generate the doxygen documentation because of that.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22119 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove questionable statement.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22118 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

change it back to the previous version

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22117 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Simplify structure a bit.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22116 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Rename enum according to our usual convention.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22115 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix ignoring block comments

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22114 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

further steps on the way to include an actual plain program

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22113 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Correct output files, without debug output.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22112 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Cast explicitly.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22111 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

The creation of deal.dox needs the bash echo. Since Ubuntu's /bi/sh is only POSIX, we need to specify bash

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22110 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

This was tricky: In this test we use the GnuplotPatch class to produce output for each patch. We do so through the WorkStream framework, so we can be sure that only one output operation is happening at the same time, but it's not predictable on which thread this will happen (this doesn't matter, of course -- all we care for is that the Copier operation of the WorkStream class runs only once at any given time). Now, GnuplotPatch directs output to the deallog class. Unfortunately, GnuplotPatch uses a different ostringstream buffer for output on each thread to avoid multiple threads stepping on each others toes writing into the string buffer. The string buffer is only flushed atomically to the actual output stream once we pipe a std::endl into deallog. The problem happens because we set std::precision on deallog from the main thread -- where it is honored if GnuplotPatch::assemble happens to run on the main thread, but if WorkStream schedules GnuplotPatch::assemble on another thread then the deallog class uses a different ostringstream buffer that didn't have the precision set in the same way. The precision then doesn't matter any more once the result is dumped into deallog.get_file_stream() since at that point it is only a bunch of characters, not a number any more. The result is that the output is not predictable and changes in precision from run to run of the program.

The solution to the problem is to not set the precision of the output streams at all and use the default values. The buffers the deallog class uses for other threads then have the same precision as that of the main thread.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22109 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove sections of plain program from contents

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22108 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

directory for plain programs

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22107 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

prepare use of doxygen @example

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22106 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add solver to group

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22105 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d