fix NonlinearSolverSelector MPI_COMM

We forgot to initialize the mpi communicator inside this class, which is
then passed to SUNDIALS and causes random crashes.

Fixes #17326.

Merge pull request #17351 from tamiko/fix_tests_for_clang_04

Test hp/dof_renumbering_04: add output variant

Merge pull request #17350 from tamiko/fix_tests_for_clang_03

Test grid/grid_generator_pipe_junction: do not compare test output

Merge pull request #17348 from tamiko/fix_tests_for_clang_01

Test opencascade/stl_(write|refinement): disable floating point exceptions

Merge pull request #17344 from tamiko/sundials_update_04

Test sundials/arkode_01: add output variant for sundials 7

Merge pull request #17343 from tamiko/sundials_update_03

Test sundials/ida_(06|07): add output variant with repeated line removed

Merge pull request #17341 from tamiko/sundials_update_02

Test sundials/kinsol_08: remove calls to deprecated and removed functions

Merge pull request #17340 from tamiko/sundials_update_01

Test sundials/n_vector: adjust an assert for sundials 7

Merge pull request #17330 from tamiko/do_not_write_into_source_directory

Test examples/step-60: do not write "used_parameters.prm" into source directory

Test hp/dof_renumbering_04: add output variant

Add a new output variant for clang-18 and libc++.

Test grid/grid_generator_pip_junction: do not compare test output

The resulting vtk output file is very large and output differs depending
on standard library implementation. Instead of adding yet another output
variant for clang-18 with libc++ simply disable output comparison and
only run the test.

Test opencascade/stl_write: disable floating point exceptions

Test opencascade/stl_refinement: disable floating point exceptions

Merge pull request #17334 from tamiko/make_test_more_robust_02

Test examples/step-30: do not compare test output

Merge pull request #17336 from tamiko/make_test_more_robust_04

Test examples/step-36: do not compare test output

Merge pull request #17339 from marcfehling/msvc-1

Minor cleanup of Windows workflow.

Merge pull request #17342 from marcfehling/typo

Fix typo.

Merge pull request #17338 from tamiko/make_test_more_robust_05

Test examples/step-75: add an avx512 variant

Merge pull request #17335 from tamiko/make_test_more_robust_03

Test examples/step-31: add an output variant for avx256/avx512

Merge pull request #17333 from tamiko/make_test_more_robust_01

Test examples/step-52: disable unstable output

Test sundials/kinsol_08: remove calls to deprecated and removed functions

Test sundials/n_vector: adjust an assert for sundials 7

Test sundials/arkode_01: add output variant for sundials 7

The number of RHS evaluations changed by 2. Let's simply add an output
variant.

Fix typo.

Test sundials/ida_(06|07): add output variant with repeated line removed

Test examples/step-75: add an avx512 variant

Let cmake create folders.

Add a comment why we only test in serial.

Test examples/step-36: do not compare test output

Step 36 computes a spectrum with slepc containing eigenvalues with
multiplicities. Unfortunately, it is up to chance (i.e., slepc version,
compiler and cpu) which multiplicities it prints and how many iterations
it needs for that. Thus disable comparing the test output.

Test examples/step-31: add an output variant for avx256/avx512

This test seems to be stable among different architectures and
configurations with avx256 and avx512. let's simply add an output
variant.

Tests examples/*: also pick up *run_only output variants

Test examples/step-30: do not compare test results

This test is not stable under round-off errors producing different
results on various different configurations. Disable for now.

Test examples/step-52: disable unstable output

In reference to #9684: The output of most of the time stepping methods
is very fragile and prone to roundoff-error amplification. Thus, disable
output and only test that we run successfully.

Test examples/step-60: do not write "used_parameters.prm" into source directory

Merge pull request #17298 from drwells/petsc-vector-serialize-header

PetscWrappers::VectorBase: add a missing header.

Merge pull request #17279 from tamiko/bring_back_modules

Doxygen: bring back modules/topics for doxygen 1.9.8 onwards

Merge pull request #17276 from tamiko/pathsearch_be_gone

Deprecate PathSearch, remove internal use

tests: fix tests failing due to pathsearch changes

Doxygen: set up DoxygenLayout.xml "topics" or "modules" depending on doxygen version

Merge pull request #17278 from marcfehling/msvc-examples-5

Modernized Windows workflow.

PetscWrappers::VectorBase: add a missing header.

We need this to serialize pairs.

Merge pull request #17324 from tjhei/tests-step-75-alt

tests/examples/step-75 add output

Merge pull request #17320 from bangerth/try-emplace-task

Add TaskResult::try_emplace_task().

Merge pull request #17315 from bangerth/guards

Move an #ifdef guard.

Merge pull request #17177 from kronbichler/new_mf_transfer

 Implement new multigrid transfer with MatrixFree infrastructure

Merge pull request #17303 from peterrum/compute_no_normal_flux_constraints_normal

VectorTools::compute_no_normal_flux_constraints: use mapping in the case of linear manifold

Merge pull request #17319 from bangerth/doc

Add a comment to the documentation of Lazy<T>.

tests/examples/step-75 add output

add second output for avx/avx512

Merge pull request #17307 from bergbauer/consistent_normal_vector

Consistently use interior normal vector

Merge pull request #17297 from bangerth/close

No need to explicity call 'close()' at the end of a scope.

Merge pull request #17295 from bangerth/unsigned

Make some variables 'unsigned'.

Merge pull request #17316 from bangerth/shared

Add a test for shared::Triangulation.

VectorTools::compute_no_normal_flux_constraints: use mapping in the case of linear manifold

Merge pull request #17314 from jpthiele/test-ex-75-avx

Add check for vectorization level to test output of step-75

Make some variables 'unsigned'.

No need to explicity call 'close()' at the end of a scope.

Merge pull request #17310 from tjhei/fix-test-step-34

tests/examples/step-34: remove solver output

Merge pull request #17308 from tjhei/fix-test-step33

step-33: disallow MPI

Merge pull request #17313 from jpthiele/tpetra-ifpack2-old-trilinos

Guard isSupported check in preconditioners to Trilinos >=13.0.0

Add a test for shared::Triangulation.

Merge pull request #17209 from vyushut/CTest_step_fifties

testing step-50 to step-59

Add a test.

Add TaskResult::try_emplace_task().

Merge pull request #17296 from bangerth/check

Check that we can read from/write to streams.

Add a comment to the documentation of Lazy<T>.

Merge pull request #17311 from kronbichler/fix_ifpack2

Fix Ifpack2 preconditioner type

Move an #ifdef guard.

Guard isSupported check in preconditioners to Trilinos >=13.0.0

Specify vectorization level for ex-75 test

testing step 50 to step 59.FINAL

Fix Ifpack2 preconditioner type

tests/examples/step-34: remove solver output

step-33: disallow MPI

Merge pull request #17292 from jpthiele/tpetra-tests-chunk2

Add set of passing Tpetra tests

Check that we can read from/write to streams.

Merge pull request #17183 from jpthiele/tpetra-precon

Add wrappers for Tpetra Ifpack2 preconditioners

Merge pull request #17293 from jpthiele/changes-file-amesos2

Add missing changes file for Tpetra Amesos2 interface

Consistently use interior normal vector

Add set of passing Tpetra tests

Add Tpetra wrappers for Trilinos Ifpack2 preconditioners

Merge pull request #17301 from bangerth/rename

Rename a private member variable.

Add missing changes file for Tpetra Amesos2 interface

Merge pull request #17287 from bergbauer/divergence

Implement divergence for FEPointEvaluation

Merge pull request #17288 from bergbauer/normal_derivative

Implement normal_derivative for FEPointEvaluation

Merge pull request #17294 from bangerth/basename

Name variables according to their purpose.

Merge pull request #17284 from bangerth/topic

Use 'topic' instead of 'module' in the documentation.

Rename a private member variable.

Name variables according to their purpose.

Use 'topic' instead of 'module' in the documentation.

Merge pull request #17130 from vyushut/CTest_step_thirties

Converting the step30-39 tutorials to CTests.

Merge pull request #17232 from vyushut/CTest_step_sixties

Testing step-60 to step-69.

Merge pull request #17289 from kronbichler/fix-doc

Improve documentation of FEEvaluation::submit_xxx()

Merge pull request #17290 from drwells/hp-collection-iterators

Add more comparisons to hp::Collection::CollectionIterator.

the vtk's are outputted now

step-62 and step-66 are omitted for now.

hp::Collection::CollectionIterator: add some more comparisons.

These are required by _GLIBCXX_DEBUG.

hp::Collection::CollectionIterator: give an exception a name.

Derivative instead of gradient

Implement divergence for FEPointEvaluation

Improve documentation of FEEvaluation::submit_xxx()