Merge pull request #11969 from marcfehling/signal-post-p4est-refinement

New Triangulation signal `post_p4est_refinement`.

Merge pull request #11984 from kronbichler/avoid_quadratic_complexity

Convert a few more cell loops into range-based for loops

Avoid quadratic complexity in coarse grid cells.

Merge pull request #11980 from marcfehling/shared-signal

Fix hp-coarsening on p:s:Triangulation.

Merge pull request #11978 from masterleinad/fix_typo_grid_tools_collect_periodic_faces

Fix typo in GridTools::collect_periodic_faces

Merge pull request #11979 from drwells/improve-mpi-checks-3

Add some more AssertThrowMPIs.

Merge pull request #11976 from peterrum/parse_input_from_json

Wrap boost error message in ParameterHandler::parse_input_from_json()

Fix hp::Refinement::choose_p_over_h() for hp-coarsening on p:s:Triangulation.

Fix hp-coarsening on p:s:Triangulation.

Fix typo in GridTools::collect_periodic_faces

Merge pull request #11966 from marcfehling/future-children

Moved `dominated_future_fe_on_children` from class member to internal namespace.

Add some more AssertThrowMPIs.

Merge pull request #11977 from peterrum/FineDoFHandlerView

Small changes in FineDoFHandlerView

Small changes in FineDoFHandlerView

Merge pull request #11975 from peterrum/particles_keyword

Work on particles keyword

Wrap boost error message in ParameterHandler::parse_input_from_json

Merge pull request #11973 from peterrum/gc_affine_constraints

Remove AffineConstraint from MGTwoLevelTransfer

Work on particles keywork

Merge pull request #11963 from Rombur/arborx_update

Add nearest predicate to ArborX wrapper

Merge pull request #11974 from jppelteret/references_02

Fix another entry in references.bib

Fix another entry in references.bib

Merge pull request #11972 from agrayver/docfix

Update doc

Merge pull request #11967 from marcfehling/dof-cleanup

Cleanup doc in DoFHandler.

Remove AffineConstraint from MGTwoLevelTransfer

Merge pull request #11958 from peterrum/compute_matrix_petrsc

MatrixFreeTools::compute_matrix() for PETScWrappers::MPI::SparseMatrix

Merge pull request #11970 from jppelteret/references_01

Fix references.bib

Update doc

Fix references.bib

Merge pull request #11968 from peterrum/gc_replace_ca_distributed

Replace AffineConstraints::distribute() in MGTwoLevelTransfer

New Triangulation signal `post_p4est_refinement`.

Moved `dominated_future_fe_on_children` from class member to internal namespace.

Update changelog

Refactor ArborX access traits and add nearest neighbor predicate

Enable ArborX documentation in Doxygen

Miscellaneous cleanup in DoFHandler.

Replace AffineConstraints::distribute() in MGTwoLevelTransfer

Merge pull request #11961 from marcfehling/divide-parallel-tests

Divide parallel tests `limit_p_level_difference` between Triangulation types.

Merge pull request #11962 from marcfehling/doc-triabase

Minor fix in doc for `p:d:TriaBase`.

Merge pull request #11888 from marcfehling/signal-pre-transfer

Refactored order of data transfer in p:d::Tria.

MatrixFreeTools::compute_matrix() for PETScWrappers::MPI::SparseMatrix

Merge pull request #11959 from peterrum/petsc_vector_Subscriptor

Derive PETScWrappers::PreconditionBase from Subscriptor

Merge pull request #11960 from marcfehling/restore-subdomain

Minor changes to `TemporarilyRestoreSubdomainIds`.

Minor fix in doc for `p:d:TriaBase`.

Divide parallel tests `limit_p_level_difference` between Triangulation types.

Minor changes to `TemporarilyRestoreSubdomainIds`.

Derive PETScWrappers::PreconditionBase from Subscriptor

Merge pull request #11943 from marcfehling/future-coarsen

Treat cells to be h-coarsened as their parent in `hp::Refinement::limit_p_level_difference()`.

Merge pull request #11948 from marcfehling/copy-tria-2

p:d:T:copy_triangulation() for refined meshes. Second attempt.

Merge pull request #11951 from peterrum/mf_asser_compatible

MF::check_vector_compatibility(): improve assert message

Merge pull request #11952 from mschreter/FEEvaluation_1d_additions

FEEvaluation with dim==n_components==1: Add additional support of submit_gradient and get_divergence

Merge pull request #11940 from bergbauer/bcast

Add bcast function

MF::check_vector_compatibility(): improve asser message

Treat cells to be h-coarsened as their parent in `hp::Refinement::limit_p_level_difference()`.

Copy triangulation in MGTransferGlobalCoarsening.

p:d:T:copy_triangulation() for refined meshes.

New p4est connectivity copy functions.

Connect parallel_forest to connectivity.

added get_divergence and submit_gradient of a rank-2 tensor, both in 1d; improved formatting

Merge pull request #11950 from bangerth/kinsol-3

Use better function names.

Merge pull request #11946 from marcfehling/copy-tria-serial

Use manifold iterator range in copy_triangulation().

Merge pull request #11928 from marcfehling/local_cell_relations_map

Minor improvements regarding local_cell_relations.

Add broadcast function.

Use better function names.

Merge pull request #11908 from bangerth/kinsol-2

Update SUNDIALS KINSOL interfaces to their current master

Merge pull request #11945 from Rombur/fix_typo

Fix typos

Only run tests with KINSOL 5.0 and above.

Add more KINSOL tests.

Enable a test also for later SUNDIALS versions.

Make KINSOL available for SUNDIALS versions >4.x.

Add commentary to a test case.

Mark ignored arguments as such.

Fix typos

Use manifold iterator range in copy_triangulation().

Merge pull request #11862 from peterrum/simplex_write_mesh_per_processor_as_vtu

GridOut::write_mesh_per_processor_as_vtu() for simplex

GridOut::write_mesh_per_processor_as_vtu() for simplex

Merge pull request #11941 from marcfehling/explicit-instantiations

Hide explicit instantiations in Utilities::MPI from doxygen.

Merge pull request #11942 from marcfehling/dofh-improvements

Minor changes to DoFHandler functionalities.

Merge pull request #11937 from marcfehling/limit-levels

Move `DoFHandler::prepare_c_and_r()` to `hp::Refinement::limit_p_level_difference()`.

Minor changes to DoFHandler functionalities.

Hide explicit instantiations in Utilities::MPI from doxygen.

Merge pull request #11882 from peterrum/mapping_q_cache_init_vector

Add further new MappingQCache::initialize() functions

Move DoFhandler::prepare_c_and_r() to hp::Refinement::limit_p_level_difference().

Add further MappingQCache::initialize() functions

Merge pull request #11938 from peterrum/ReadWriteVector_serial_vector

LinearAlgebra::ReadWriteVector accept serial vectors

Merge pull request #11936 from drwells/document-identity

Better document IdentityFunction.

Merge pull request #11804 from peterrum/remote_fe_point_evaluation

Add utility functions to evaluate values of arbitrary (remote) points

Merge pull request #11910 from peterrum/pst_allow_artificial_cells

Extend text regarding allow_artificial_cells

LinearAlgebra::ReadWriteVector accept serial vectors

Extend text regarding allow_artificial_cells

Better document IdentityFunction.

This came up in review but wasn't fixed before it got merged.

Merge pull request #11900 from jppelteret/sd_batch_optimiser_01

SD BatchOptimizer: Implement cached evaluation

Merge pull request #11935 from jppelteret/ad-doc_02

Fix some links in the AD/SD documentation module

Enhance documentation of local_cell_relations.

Review p:fd:Tria::update_cell_relations().

Fix some links in the AD/SD documentation module

SD BatchOptimizer: Implement cached evaluation

Merge pull request #11932 from bangerth/kinsol

Move implementation of functions into the .cc file.

Merge pull request #11934 from peterrum/hp_collection

Introduce hp::Collection

Add utility functions to evaluate values of arbitrary (remote) points