Only use 9 arguments. 10 doesn't work any more.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@17182 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix date.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@17180 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Completely rewrite passing back and forth function descriptors from the Threads::spawn functions to the place where threads are created and then where the function is called on the new thread. Previously, this was done using function pointers and boost::tuple for argument lists. Now, we use the boost::bind and boost::function libraries that encapsulate all these things nicely. The end result is a reducting in the size of base/include/base/thread_management.h of 4,050 lines, finally making the file readable again.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@17179 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Reduce the number of arguments of a helper function from 10 to 9 to make it work with the new and upcoming threading framework.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@17177 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix the remaining bug in dealing with level_1_difference_at_vertices in 1d.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@17158 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add apparently missing space.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@17157 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix a bug in GridOut<1>::write_gnuplot.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@17156 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add the coarsening_* tests.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@17155 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Replace -soname by a generic way that also works for MAC OS X.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@17154 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix some stale documentation

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@17152 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Update lac directory

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@17147 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add one more file with generic preconditioner interfaces.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@17146 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Made the interface to Trilinos preconditioners more generic. Now AMG can be controlled in the same way as Ifpack preconditioners. Moreover, AMG now has an AdditionalData() field which takes precondition parameters.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@17145 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add proper output file.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@17144 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add the ability to read meshes in GMSH format version 2.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@17143 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Force link of library file even if a previous file existed of that name.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@17142 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add a comment.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@17141 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Ignore versioned shared libs.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@17140 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Use versioned dynamic libraries to make installing on distributions like Fedora or Debian a bit simpler.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@17139 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Deal with external UMFPACK directories that are in different directories such as /usr

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@17138 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove version number since it easily outdates.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@17137 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Use the proper dimensions for the maximal number of iterations.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@17136 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Use the proper dimensions for the maximal number of iterations.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@17135 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Use the proper dimensions for the maximal number of iterations.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@17134 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Forgot to check in one more file

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@17128 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add output files for recently upgraded gcc.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@17127 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add output files for recently upgraded gcc.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@17126 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add some more output files after recent gcc update.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@17125 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Update tests after the system and its compiler has been upgraded on strange.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@17124 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add a test that currently fails because we can't seem to enforce level-1-difference at vertices in 1d.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@17123 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Improve the situation somewhat but deal.II/coarsening_02_1d is still failing, albeit after more refinement steps.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@17122 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Be less conservative but potentially less correct also. We'll see if this comes back to biting us. To be on the safe side, add an assertion to the code.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@17118 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Update tests after previous system and compiler upgrade.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@17117 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Update tests after previous system and compiler upgrade.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@17116 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix a bug where we produce meshes that do not honor the Triangulation::limit_level_difference_at_vertices flag.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@17114 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Added a new function for data exchange to Trilinos vector. Added a block direct solve as Trilinos preconditioner.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@17113 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Patch by Adam Powell: Use the amsmath package to create latex formulas.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@17108 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Don't use -Wno-long-double on MAC when not available.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@17092 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix typo.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@17074 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Set svn:ignore.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@17073 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Adjust to recent changes in SolutionTransfer.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@17065 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Adjust output.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@17064 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove some old code meant to suppress warnings that now produces warnings itself.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@17062 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

'mutable' should be at the beginning of the declaration.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@17061 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add test.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@17055 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove auto-generated file.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@17045 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix comment.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@17042 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add new tests that test without building a rhs vector.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@17041 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add comment.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@17040 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add a TODO.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@17039 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Expect gfortran 4.4.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@17038 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

When generating an empty matrix, call FillComplete() in case that empty matrix is requested somewhere.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@17033 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Added a few references to serial TrilinosWrappers vectors.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@17032 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Added a copy constructor to the Trilinos sparse matrix class.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@17031 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Introduce a temporary vector in the Trilinos SparseMatrix class that is used for faster vmult_add and matrix_scalar_product operations.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@17018 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fixed an error that was caused by a different constructor in the new Trilinos 9.0.0 version.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@17017 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Forgot to add a file.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@17011 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Group the comments in a better way.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@17008 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix totally botched sentence.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@17007 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix typo.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@17006 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Added a reinit function.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@16908 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Reduced residual tolerance for CG solve in inverse matrix by a factor of 10. It is essential to solve the inner matrix to high enough accuracy, since inaccuracies significantly increase the number of outer GMRES iterations.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@16907 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Changed preconditioner for pressure mass matrix from SSOR to IC. We need twice as many iterations then, but the costs for each iteration are only one fourth, so we still gain.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@16906 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Allow default argument on SparseILU::initialize.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@16904 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Link to results section of step-6 for a discussion of preconditioners.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@16903 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add a comparison of solvers/preconditioners.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@16902 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add a few results.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@16899 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Release the preconditioner object before a re-generation.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@16898 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Trilinos Ifpack preconditioner wrapper classes are now derived from a PreconditionBase class. Add a wrapper class to the Trilinos AztecOO solver for basic (non-block) systems.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@16897 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Update to r48848 from http://svn.boost.org/svn/boost/trunk/boost/detail/spinlock.hpp

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@16893 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Continue documenting.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@16892 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Comment on boundary conditions.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@16891 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Rename a couple of variables.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@16890 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Augment documentation

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@16889 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Augment.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@16888 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Document the first two auxiliary functions. Avoid one mistake.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@16887 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove the pressure boundary values -- they are only ever zero, and don't provide much insight anyway.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@16886 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Incorporate the fix from http://thread.gmane.org/gmane.comp.lib.boost.devel/176050 to make it work again on x86_64 using the Intel compiler.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@16885 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix misspelling.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@16884 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Discuss no normal flux-boundary conditions.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@16883 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Re-scale some images.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@16882 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Use @code...@endcode.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@16881 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Clarify normal stress.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@16880 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make using a sparsity pattern without epetra_map work.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@16879 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove the Epetra_Maps and the communicator objects necessary for that.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@16878 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Allow creation of local block vectors without an Epetra_Map.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@16877 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Avoid an unnecessary cast.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@16876 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add the possibility to create block sparse matrices without an Epetra_Map when running on a single processor.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@16875 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Replace {mathbb T} by {cal T} since we don't include the amsmath style.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@16874 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Mention Trilinos.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@16873 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Move definition of the Rayleigh number into the EquationData namespace as well.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@16872 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Outlook.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@16871 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Document smaller time step.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@16870 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Describe the testcase.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@16869 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add pending directory, necessary for some older compilers.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@16868 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add forgotten expansions of Trilinos MPI vectors.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@16867 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Upgrade to boost 1.36.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@16866 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Import boost 1.36.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@16865 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove old boost 1.33.1 version

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@16864 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Silence a warning.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@16863 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d