Merge pull request #4448 from bangerth/set-flags

Fix DataOutInterface::set_flags() for GnuplotFlags.

Merge pull request #4446 from tamiko/fix_feature_config

CMake: Fix path to deal.IIFeatureConfig.cmake

Add a test.

Add a changelog entry.

Fix DataOutInterface::set_flags() for GnuplotFlags.

CMake: Fix path to deal.IIFeatureConfig.cmake

Merge pull request #4444 from davydden/gmg_clear

add mg::Matrix::reset() and MGCoarseGridApplySmoother::clear()

add mg::Matrix::reset() and MGCoarseGridApplySmoother::clear()

Merge pull request #4437 from davydden/feature_info

add deal.IIFeatureConfig.cmake which contains detailed info about con…

newlines

add deal.IIFeatureConfig.cmake which contains detailed info about configured features

Merge pull request #4438 from kronbichler/reduce_size_trilinos_test

Reduce size of Trilinos preconditioner test

Merge pull request #4435 from kronbichler/augment_documentation_fe_evaluation_2

Finalize FEEvaluation documentation update from #4431

Reduce size of Trilinos preconditioner test

Merge pull request #4436 from jppelteret/update_tests_4427

Reduce computation time of step-18 based tests

Finalize FEEvaluation documentation update from #4431

Reduce computation time of step-18 based tests

Merge pull request #4422 from drwells/add-trilinos-index-access

Move Trilinos index functions into a new header file.

Merge pull request #4433 from drwells/fix-task_09-2

Clean up task_09 a bit.

Move Trilinos index functions into a new header file.

Merge pull request #4428 from tamiko/remove_build_tests

Tests: Remove build_tests/ category

Documentation: fix

Merge pull request #4432 from kronbichler/shorten_mf_gmg_tests

Shorten matrix-free multigrid tests

CMake: Update description

Doc: Update documentation to latest "build tests" changes

add a changes entry

Tests: Force building examples in run_buildtest.cmake

Tests: Remove build_tests/ category

The build_tests/ category had been an ugly hack for compiling all
configurable example steps.

But nowadays we already compile all (configurable) example steps as part
of the main build process - so this is redundant. Further, selectively
running a subset of example steps (as was done) is ugly and useless
(output is never compared).

Thus, let's simply remove the category and custom cmake script files.

Clean up task_09 a bit.

This commit applies some small cleanups to this test (e.g., preferring C++11
functionality to POSIX) and, in addition, makes the following changes:
1. The OK message won't be set to deallog until after tasks is destroyed (i.e.,
   all threads must join).
2. If on a POSIX platform, unset the thread environment variable so that we
   really can run the 'right' number of threads.

Merge pull request #4431 from kronbichler/augment_documentation_fe_evaluation

Document FEEvaluation behavior for partially filled SIMD lanes

Document FEEvaluation behavior for partially filled SIMD lanes

Shorten matrix-free multigrid tests

Merge pull request #4430 from davydden/pum_test

make fe_enriched_step-36 do less refinements and thereby faster

make fe_enriched_step-36 do less refinements and thereby faster

Merge pull request #4429 from drwells/fix-task_09

Fix tests/base/task_09.cc.

Fix tests/base/task_09.cc.

The current implementation of the Task class will call join() on the created
thread in its destructor. Hence, the tasks in the loop run in sequence instead
of in parallel since they immediately go out of scope after each loop iteration,
which is not the point of the test.

Merge pull request #4424 from tamiko/fix_tag_feature

CMake: Bugfix: run get_latest_tag only if git is recent enough

Merge pull request #4423 from drwells/remove-petsc-vector-references

Remove remaining references to PETScWrappers::Vector.

CMake: Bugfix: run get_latest_tag only if git is recent enough

Fixes #4420

Remove remaining references to PETScWrappers::Vector.

Merge pull request #4369 from class4kayaker/timer_data

Add function to access timer data from within program

Add function to access timer data from within program

Merge pull request #4413 from bangerth/use-MPI_Abort

Use MPI_Abort instead of std::abort.

Merge pull request #4418 from bangerth/address-coverity-2

Check that a stream is good while we read.

Merge pull request #4417 from bangerth/address-coverity

Better document why we take a large argument by value.

Check that a stream is good while we read.

This addresses another (correct) Coverity warning.

Better document why we take a large argument by value.

This addresses an issue found by Coverity. We copy the argument intentionally.

Merge pull request #4416 from SoilRos/master

fixed direct reference of _feature to petsc in CHECK_MPI_INTERFACE

Merge pull request #4407 from davydden/cmake_tag

cmake: query for latest tag

fixed direct reference of _feature to petsc in CHECK_MPI_INTERFACE

install git scripts and use get_latest_tag.sh to get Git tag

Merge pull request #4414 from davydden/mf_base_constraints

factor out pre- and post-processing of dst/src inside MatrixFreeOpera…

add auxiliary git bash scripts

Merge pull request #4412 from bangerth/avoid-warning

Avoid warnings about unused variables.

Merge pull request #4410 from drwells/add-update-ghosts-tests

Add tests for update_ghost_values.

Use MPI_Abort instead of std::abort.

Avoid warnings about unused variables.

Add tests for update_ghost_values.

These functions need to exist (for PETSc and Trilinos vectors and block
vectors) but should not do anything.

factor out pre- and post-processing of dst/src inside MatrixFreeOperators::Base::mult_add() into two functions

Merge pull request #4409 from drwells/remove-read-input-docs

Remove references to the old read_input function.

Remove references to the old read_input function.

add DEAL_II_GIT_TAG to deal.IIConfig.cmake

add an optional argument to DEAL_II_QUERY_GIT_INFORMATION macro

Merge pull request #4403 from luca-heltai/regularize-mesh

Regularize corner cells.

Implemented regularize corner cells

cmake: query for latest tag

Merge pull request #4406 from drwells/add-update-ghost-values-stubs

Implement update_ghost_values stubs.

Implement update_ghost_values stubs.

Merge pull request #4405 from Rombur/cuda_setup_tests

Guard FIND_PACKAGE(CUDA) with DEAL_II_WITH_CUDA.

Merge pull request #4401 from davydden/solvercontrol

add ConsecutiveControl

Guard FIND_PACKAGE(CUDA) with DEAL_II_WITH_CUDA.

Merge pull request #4402 from Rombur/cuda_tests

Check for cuda only if configured with cuda support.

add ConsecutiveControl

Check for cuda only if configured with cuda support.

Merge pull request #4398 from davydden/remove_wrong_todo

remove wrong TODO in template-arguments.in

REAL_SERIAL_VECTORS and SERIAL_VECTORS are not the same.

The former contains only real-valued vectors, i.e.
DEAL_II_EXPAND_PETSC_MPI_VECTOR_REAL will be empty if
PETSc is build with complex linear algebra.

Merge pull request #4394 from drwells/fix-rebase-print

Fix the output of the deprecation script.

Fix the output of the deprecation script.

Some tags (e.g., 'rebase_here') may not be version numbers so we should not drop
the first letter.

Merge pull request #4293 from Rombur/matrixfree_gpu

Matrix-free gpu

Add changelog entry.

Add test for CUDA support of matrix-free.

Add CUDA support of matrix-free.

Rename cuda_vector tests.

Augment documentation of CUDA atomic.

Add CUDA support for tensor.

Merge pull request #4397 from masterleinad/fix_pgi

Fixes for compiling with PGI

Fixes for compiling with PGI

Merge pull request #4395 from masterleinad/remove_reorder_cuthill_mckee

Remove deprecated SparsityTools::reorder_Cuthill_McKee

Merge pull request #4396 from masterleinad/remove_unused_helper

Remove unused helper function

Remove unused helper function

Remove deprecated SparsityTools::reorder_Cuthill_McKee

Merge pull request #4391 from masterleinad/remove_ez_rows_columns

Remove deprecated BlockSparseMatrixEZ<Number>::n_rows/n_cols

Merge pull request #4390 from masterleinad/fix_chunk_sparsity_pattern_12

Fix chunk_sparsity_pattern_12

Remove deprecated BlockSparseMatrixEZ<Number>::n_rows/n_cols

Fix chunk_sparsity_pattern_12

Merge pull request #4389 from masterleinad/remove_system_j_s_m

Remove Utilities::System::job_supports_mpi()

Remove Utilities::System::job_supports_mpi()

Merge pull request #4388 from bangerth/avoid-warning-2

Avoid a warning about an unused constructor argument.

Modify CMake for CUDA matrix-free.

Avoid a warning about an unused constructor argument.

Annoyingly, my compiler warns about =default constructors whenever we name constructor
arguments. It says they are unused -- which is patently wrong: the argument is used
just fine, we just never explicitly reference the *name* of the argument. Either way,
work around this.