Merge pull request #5921 from davydden/scalapack_split_test

scalapack: split _06 test into four

Merge pull request #5948 from bangerth/inline

Inline a message text instead of going through contortions.

Merge pull request #5950 from bangerth/remove-include

Remove now unnecessary #includes.

Merge pull request #5944 from masterleinad/fix_modernize-use-emplace

Fix findings of "modernize-use-emplace"

Merge pull request #5951 from BenBrands/documentation

Fix minor flaw in documentation in table.h

fix_minor_flaw_in_documentation

Remove now unnecessary #includes.

Inline a message text instead of going through contortions.

Fix findings of "modernize-use-emplace"

Merge pull request #5947 from tjhei/shell_checks

fix bash script stylistic issues

Merge pull request #5946 from tjhei/add_clang_tidy_script

add contrib/utilities/run_clang_tidy.sh

fix bash script stylistic issues

using shellcheck

add contrib/utilities/run_clang_tidy.sh

Merge pull request #5945 from bangerth/avoid-stringstreams

Avoid where possible to use std::ostringstream to generate filenames.

Merge pull request #5940 from tjhei/clang_tidy_exceptions

Exception fixes and cleanup (clang-tidy)

Avoid where possible to use std::ostringstream to generate filenames.

To students, this seems like an unnecessary detour. This may have been useful in
olden times, but we now have helper functions to convert numbers to text without
having to create a std::ostringstream in user code, and we also have std::to_string().

Finally, this avoids the awkward idiom
  std::ostringstream filename;
  ...
  std::ofstream output (filename.str().c_str());
where we have to call .str().c_str().

Instead of this, just create the filename in place and be done with it.

Merge pull request #5942 from tjhei/remove_unused_exceptions

remove some unused exceptions

Merge pull request #5939 from tjhei/mpi_type_fix

fix MPI type and remove confusing assert

Merge pull request #5936 from masterleinad/more_clang_tidy_performance

clang-tidy performance findings

Exception fixes and cleanup (clang-tidy)

- mark DeclExceptionX with NOLINT (ignore that we copy args)
- adjust some DeclExceptionX arguments
- cleanup/simplify string concat that clang-tidy complains about

remove unused exceptions

fix MPI type and remove confusing assert

clan-tidy correctly complains about an incorrect MPI type (signed vs
unsigned). While here, remove the assert() that doesn't make much sense:
the subdomain id is not the data to be sent, but the destination and
compilation would fail if it wasn't an int (or convertible to it).
Introduced by @bangerth in 2016.

clang-tidy performance findings

Merge pull request #5870 from kkormann/issue_5667_integrators

Integrators for DG face integrals with tests.

Merge pull request #5925 from drwells/fix-fe-unity

Fix the memory usage of the /source/fe unity files.

Integrators for DG face integrals with tests.

Merge pull request #5934 from BenBrands/LapackFullMatrix

Use more LAPACK and BLAS routines in LAPACKFullMatrix

Merge pull request #5933 from sophy1029/fix-hats

Fix the location of hats on symbols in the documentation.

LAPACKFullMatrix::add() uses BLAS routine

Merge pull request #5935 from tjhei/expand_all_instantiations

expand_all_instantiations cmake target

expand_all_instantiations cmake target

This target is useful to be able to run clang-tidy as it needs all .inst
files but doesn't require a built project.

LAPACKFullMatrix: make operators *= and /= use Lapack function

Fix the location of hats on symbols in the documentation.

Merge pull request #5922 from tcclevenger/grid_out_1proc

Change GridOut::write_mesh_per_processor_as_vtu

Merge pull request #5930 from drwells/fix-unsigned-char

Use types::boundary_id in a code sample.

Use types::boundary_id in a code sample.

Merge pull request #5924 from masterleinad/fix_references_to_boundary

Fix references to Boundary

Fix references to Boundary

Merge pull request #5929 from bangerth/fix-formatting

Fix some odd formatting.

Fix some odd formatting.

changes

Merge pull request #5898 from davydden/lapack_tmmult_diag

LAPACKFullMatrix - add another Tmmult()

Merge pull request #5869 from BenBrands/scalapack

ScaLAPACKMatrix: add functions to perform addition, multiplication and row/column scaling

Merge pull request #5926 from drwells/move-implementation-to-source

Move an implementation to a source file.

Merge pull request #5414 from GivAlz/new_distributed_computeptloc

New function: distributed compute point locations (and tests)

Change scale rows/columns and split tests

scalapack: fix a minor resize bug in eigenpairs_symmetric()

scalapack: minor cleanup of eigenpairs_symmetric()

Move an implementation to a source file.

Fix the memory usage of the /source/fe unity files.

Recent changes, such as b15febd0c2, 36b74d6ee1, and fd1bf6a6f8 caused the memory
usage of one of the unity files to go above 5 GB: these splits lower the high
water mark to about 3 GB.

Merge pull request #5923 from masterleinad/fix_tbb

Fix warning in TBB

scalapack: split _06 test into four

Fix warning in TBB

Merge pull request #5920 from drwells/step-45-manifold

Use SphericalManifold in step-45.

Merge pull request #5908 from Rombur/cuda_vector

Fix a bug in CUDAWrappers::Vector::reinit

Merge pull request #5911 from jwitte08/int_overflow_tpmatrix

Fix integer overflow in TensorProductMatrix

Use SphericalManifold in step-45.

Added distributed compute point locations and two tests

Merge pull request #5918 from masterleinad/more_msvc_fixes

Fix get_fe_by_name  for MSVC

Fix integer overflow in TensorProductMatrix

Merge pull request #5917 from masterleinad/more_msvc

Avoid using operator[] in dof_info.h for accessing the end iterator

Fix get_fe_by_name  for MSVC

Merge pull request #5885 from masterleinad/fixup_make_unique_new

Use more std::unique_ptr and std::make_shared/unique

Replace operator[] in dof_info.h where necessary

Merge pull request #5907 from masterleinad/fix_msvc

Fix some warnings and errors reported by MSVC

Merge pull request #5915 from davydden/scalapack_ppocon

scalapack: query lwork from ppocon

scalapack: query lwork from ppocon

Merge pull request #5912 from mathgirl/step3typos

Typos corrected in step-3

Typos corrected in step-3

add a changelog entry

make mTmult more clever if A==B

make Tmmult more clever if A==B

add LAPACK::Tmmult() to do a tripple product with a diagonal matrix

Merge pull request #5910 from tjhei/document_l_singualarity_func2

followup: document Functions::LSingularityFunction

followup: document Functions::LSingularityFunction

Merge pull request #5909 from tjhei/document_l_singualarity_func

document Functions::LSingularityFunction

document Functions::LSingularityFunction

Fix a bug in CUDAWrappers::Vector::reinit

The second time that reinit was called the wrong number of elements was set to
zero.

Merge pull request #5906 from masterleinad/fix_clang_tidy_performance

Fix issues found by clang-tidy checks=performance*

Fix some warnings and errors reported by MSVC

Fix issues found by clang-tidy checks=performance*

Use make_unique/shared in examples

Use make_unique/shared in particles

Use make_unique/shared in multigrid

Use make_unique/shared in grid

Use make_unique/shared in dofs

Use make_unique/shared in numerics

Use make_unique/shared in meshworker

Use make_unique/shared in matrix_free

Use make_unique/shared in lac

Use make_unique/shared in hp

Use make_unique/shared in fe

Use make_unique/shared in base

Implement std_cxx14::make_unique also for unbounded C-style arrays

Merge pull request #5882 from masterleinad/unique_get_fe_by_name

Let FETools::get_fe_by_name return a std::unique_ptr

Merge pull request #5896 from bangerth/use-uint8_t-2

Use std::uint8_t instead of 'unsigned char' for refinement flags.

Merge pull request #5895 from bangerth/signed-vs-unsigned-char

Explicitly list signed/unsigned char.

Merge pull request #5894 from bangerth/use-uint8_7

Use std::uint8_t for refinement cases.

Generalise Scalapack scale_columns and scale_rows functions

Merge pull request #5904 from davydden/doc_project

fix grammar in VectorTools::project()