Merge pull request #6335 from tamiko/fix_adolc_test

CMake: Link in Boost libraries for ADOLc check

Merge pull request #6340 from drwells/update-copyright-notices-2

Update copyright notices 2

Merge pull request #6290 from GivAlz/fix_distributed_cpt_loc

Fixed distributed cpt locations return tuple and added test

CMake: simplify check

CMake: Add boost and adolc compatibility check

Make sure to only ever use an external ADOL-C library (that uses the
Boost pool allocator and is linked against external boost) if deal.II is
also configured with external Boost.

CMake: Let FindADOLC.cmake check whether adolc uses Boost pool allocator

Let the find module check whether adolc uses the Boost pool allocator.
If yes, add all boost libraries to the link interface.

CMake: add a safeguard

CMake: run boost configure before adolc configure

Merge pull request #6341 from masterleinad/fix_subscribe_move

Only run assign_subscriptor in Debug mode

Only run assign_subscriptor in Debug mode

Merge pull request #6337 from drwells/update-gridgenerator-examples-3

Update gridgenerator examples 3

Update step-15 results.

Use VTU output in step-15.

Merge pull request #6333 from masterleinad/fix_subscribe_move

Check own subscriptions when assigning in Subscriptor

Reformat some copyright headers.

Reassign copyright from mathlab to deal.II.

Done with the permission of Luca Heltai.

Merge pull request #6331 from tjhei/update_copyright

update copyright years

Merge pull request #6304 from drwells/update-gridgenerator-examples-2

Update gridgenerator examples 2

Change step-10 to use FE_Nothing.

Update step-10 for 9.0.

This commit changes the output (which was altered as a result of the new
TFI scheme for placing new vertices) and the manifold handling (which
was altered by the 'attach default manifolds to triangulations' change
in GridGenerator).

Merge pull request #6338 from drwells/update-gridgenerator-examples-4

Update GridGenerator examples 4

Merge pull request #6310 from kronbichler/matrix_free_module

Matrix free module

Update step-11.

There is no graphical output for this step so this is easy.

Merge pull request #6324 from kronbichler/fix_compile_warning

Fix warning about missing return statement in ICC

Check own subscriptions when assigning in Subscriptor

update copyright years

Merge pull request #6292 from masterleinad/fix_coverity_issues

Fix various issues reported by coverity

Merge pull request #6321 from masterleinad/add_codecov_support

Add Codecov support

Merge pull request #6327 from masterleinad/fix_typo_dof_handler

Replace DofHandler by DoFHandler

Replace DofHandler by DoFHandler

Update documentation

Require codecov-bash to be downloaded manually

Fix warning about missing return statement in ICC.

Link main matrix-free objects and data structures to module.

Write doxygen module for MatrixFree with face capabilities.

Merge pull request #6285 from kkormann/issue_5667_fe_eval_template

Introduce face functionality to fe_evaluation.

Merge pull request #6323 from bangerth/typo

Fix a grammar mistake.

Merge pull request #6322 from masterleinad/fix_petsc_instantiation

Instantiate distribute_local_to_global for another combination of PETScWrapper objects

Fix a grammar mistake.

Merge pull request #6305 from masterleinad/object_fe_collection_dh

Store the FECollection object and not just the pointer in DoFHandler and hp::DoFHandler

Instantiate distribute_local_to_global for another combination of PETScWrapper objects

Add codecov support

Merge pull request #6320 from tjhei/doxygen_fixes2

more doxygen fixes

more doxygen fixes

Merge pull request #6319 from tjhei/doxygen_fixes

doxygen fixes

doxygen fixes

warnings/errors that appear during doxygen generation

Introduce face functionality to fe_evaluation.

Distinguish cell and face type by new template argument.

Merge pull request #6318 from tjhei/doxygen_formatting2

fix some ugly doxygen formatting

fix some ugly doxygen formatting

Merge pull request #6315 from masterleinad/less_iterations_complex_solver

Allow less iterations in petsc_complex/solver_real_02

Merge pull request #6316 from tjhei/doxygen_formatting

Doxygen formatting

Merge pull request #6317 from tjhei/doxygen_add_rol

enable ROL in doxygen

enable ROL in doxygen

otherwise rol namespace will not be in the documentation

put @ref on separate lines

fix doxygen group sections

Allow less iterations in petsc_complex/solver_real_02

Remove parameter names for defaulted member functions

Merge pull request #6313 from masterleinad/capitalize_gmsh

Capitalize Gmsh appropriately

Capitalize Gmsh appropriately

Merge pull request #6309 from masterleinad/fix_cuda

Fix failing CUDA test

Add assertion for nonempty hp::FECollection

Fix failing CUDA test

Merge pull request #6295 from luca-heltai/minmax-diameter-with-mapping

Min/Max diameter with mapping

Merge pull request #6302 from tamiko/fix_a_test_16

Tests: metis/metis_05 add output variant

Merge pull request #6308 from tamiko/cmake_würgaround

CMake: Ensure to be compatible with version 3.11 FindBlas.cmake

CMake: Ensure to be compatible with version 3.11 FindBlas.cmake

We have to work around some upstream changes [1] that break our project
configuration. Let's simply filter out the "PkgConfig::PKGC_BLAS" string
and hope for the best.

[1] https://gitlab.kitware.com/cmake/cmake/issues/17934

Store the FECollection object and not just the pointer in DoFHandler and hp::DoFHandler

Merge pull request #6299 from tjhei/msvc_support

blacklist MSVC 2015 or older

Tests: metis/metis_05 add output variant

Merge pull request #6301 from bangerth/update-changelog

Minor updates to changelog entries.

Minor updates to changelog entries.

Merge pull request #6284 from tamiko/fix_cornercase

Tests: Always create a small 'detailed.log' file

Initialize mapping_type in FE_PolyTensor

Avoid uninitialized value in GridIn::read_mesh

Check dynamic_cast in TimeDependent

Use AssertNothrow in Utilities::MPI::MPI_InitFinalize

Restore formatting options in Abaqus_to_UCD

Fixed issues by TH and WB.

Merge pull request #6298 from tamiko/petsc_390

PETSc: Port to version 3.9.0

blacklist MSVC 2015 or older

because we can no longer support it

Doc: Update latest known version to 3.9.0

Merge pull request #6287 from drwells/update-gridgenerator-examples-1

Update basic Manifold usage in the examples.

Update basic Manifold usage in the examples.

Merge pull request #6281 from masterleinad/hp_dh

Store a copy of the FECollection object in hp::DoFHandler

add a changes entry

PETSc: Port to version 3.9.0

In version 3.9.0 *SolverPackage was renamed to *SolverType. Guard the
two instances where we call such functions.

Use correct type in GridIn::skip_comment_lines

Merge pull request #6293 from tjhei/harden_deprecated_check

harden cmake deprecation check

Changelog.

Added test.

Added optional mapping to minimal/maximal grid diameter.

harden cmake deprecation check

It turns out MSVC 2015 passes the CXX14 check for the deprecated
attribute, but then complains when it is used in a constructor:
E:\jenkins\workspace\workspace\dealii-windows-
compile\CC\msvc2015\label\win\include\deal.II/base/table_indices.h(129):
error C2416: attribute 'deprecated' cannot be applied in this context

Fix this.

Fixed distributed cpt locations return tuple and added test

Merge pull request #6289 from BenBrands/rm_scalapack_15_b

Remove failing ScaLAPACK tests

Remove failing ScaLAPACK tests

Merge pull request #6288 from masterleinad/householder_base

Don't derive Householder from FullMatrix

Don't derive Householder from FullMatrix

Merge pull request #6286 from masterleinad/fix_msvc_comparison

Fix MSVC warning regarding comparison of signed and unsigned numbers

Merge pull request #6185 from drwells/remove-more-Boundary-references

Remove more boundary references

Fix MSVC warning regarding comparison of signed and unsigned numbers