reflect changes in VectorTools::project

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14000 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Another paper to check

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@13999 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

One more paper

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@13998 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove obsolete output.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@13997 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

tecplot_binary output requires TecplotFlags::tecplot_binary_file_name to include the file name!

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@13996 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Added new ParameterHandler output style for command line description of available parameters.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@13995 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Made whitespace character a default delimiter for utility function break_text_into_lines() which can also be changed to other delimiters.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@13994 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

adjust to changes in VectorTools

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@13992 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

adjust to changes in VectorTools

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@13991 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

allow for more iterations in VectorTools::project and eliminate output of iterative method

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@13990 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Update of minimize_boost file which was required for updating to boost_1_33_1.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@13989 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Bug fix: As min=2.22507e-308 and max=1.79769e+308 we should allow -max<=x<=max instead of only min<=x<=max.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@13988 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Leave a TODO

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@13987 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Check in results for this platform

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@13986 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Another reference to check

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@13985 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix output for strange

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@13984 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Implement a strategy to split nodes for the complex case into master and slave nodes. This fixes two testcases, but the new crash_12 testcase still fails

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@13983 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

New test that presently also fails. A generalization of a few previous ones.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@13982 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Mention step-23/step-24

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@13981 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Small last fixes

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@13980 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

One more

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@13979 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add a note on new LAPACK functions

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@13978 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix error in non-LAPACK version

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@13977 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

apply a fix in non-LAPACK mode
add PreconditionLU

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@13976 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

stop output to cout

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@13975 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

test for LU decomposition

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@13974 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

LU decomposition added to LAPACKFullMatrix
some items in LAPACKFullMatrix fixed

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@13973 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

introduce numbers for full matrix tests

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@13972 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add instantiations for float again

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@13971 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

group member functions

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@13970 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add a TODO.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@13969 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Don't reserve the right amount of space, since we usually come back to that place later and request even more. The present code then leads to excessive numbers of calls to memory allocation.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@13968 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

new version of function contract(), contracting a tensor of rank three with one of rank two over given indices

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@13967 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Minor doc updates

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@13966 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Microfix. The interface of compute_eigenvalues was not changed for the
non-lapack version of the code.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@13965 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

change ignore list

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@13964 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

change description

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@13963 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add eigenvector computation to compute_eigenvalues
access to eigenvectors is missing yet and needs thinking

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@13962 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Update

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@13961 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Modify this testcase to only check the hanging nodes the test's name suggest. Correctness changes will be tested in a separate set of tests based on the deal.II/interpolate_* and deal.II/project_* tests at one point.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@13960 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

New movie, with nice surface view

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@13959 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@13958 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Don't appear to need these any more

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@13957 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Update

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@13956 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix output files

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@13954 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Added a missing explicit template instantiation (Mac OSX complained
about that).

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@13953 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Mention pgi 6.2. Remove notes on old versions

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@13952 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Do not test for __builtin_expect when using the Portland Group compiler

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@13951 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

values updated for gcc 4.1.0 on charm

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@13950 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Allow to run through. Check in output

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@13949 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

This is finally the right approach: only identify dofs if there are no more than 2 finite elements associated with an object. This also fixes hp/crash_10.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@13948 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Implement something where we don't willy-nilly identify dofs, but only do so from dominated to the most dominating element.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@13947 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Check in some output

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@13946 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

A testcase that should illustrate the problem with crash_10 and hp_hanging_nodes_02 (but doesn't right now, because we have a problem with eliminating DoFs).

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@13945 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Generate some more enlightening output.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@13944 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Minor changes without net effect

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@13943 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove a bunch of include files that we don't need no more.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@13942 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

New presently crashing test. Add comments.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@13941 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

do not compute condition number of a 1d system; no idea why this worked

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@13940 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Mention that chains of constraints are now ok.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@13939 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

When resolving chains of constraints, we not only have to merge re-constrained dofs, but also unify them with already existing constraints. This finally solves 5 failures in tests/hp

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@13938 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Don't treat DoFs that have already been treated.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@13937 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Cache more data, clean up implementation a bit.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@13936 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

make sure, condition numbers are only computed if there are at least two eigenvalues

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@13935 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Rename functions to avoid confusing them with assertions.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@13934 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Cache a few more things. Clean up a bit.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@13933 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Cache the subface matrices for the simple case.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@13932 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Clean up a few things

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@13931 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Update svn:ignore

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@13930 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Update comments and output

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@13929 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add a TODO.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@13928 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

New test that presently fails.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@13927 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Implement the possibility to create chains of constraints and have them resolved at the time we call close().

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@13926 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

two more testcases that are going to be fixed with the next check in.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@13925 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

crash_08 is going to be fixed with the next check in.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@13924 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add an assertion

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@13923 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Do a cast to the expected data type. This shouldn't be necessary, but apparently confuses pgCC if not done and then produces a linker error.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@13922 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove naming of template parameter, to avoid confusion and quell a warning by pgCC.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@13921 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Update a few comments

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@13920 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Output has changed.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@13919 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Implement the second algorithm described in the paper.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@13918 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Crash_07 is now fixed

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@13917 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

new PointerMatrixVector

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@13916 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

test for new PointerMatrixVector

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@13915 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make documentation read better

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@13914 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Change the order of indices in the {sub,}face_interpolation matrices to make it conform to the one in the hp paper. Also makes a few things a bit simpler, though it's mostly a matter of taste.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@13913 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Change the order of indices in the {sub,}face_interpolation matrices to make it conform to the one in the hp paper. Also makes a few things a bit simpler, though it's mostly a matter of taste.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@13912 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Introduce the new status file always containing the last attempted processing step\
Use this file to speed up "make report"

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@13911 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove some really old information

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@13910 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

a script for evaluating the new status file in tests

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@13909 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Use proper argument types for the single precision functions

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@13908 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add new testcase that produces cyclic constraints.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@13907 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Check in a bit of debug code that I will remove again later on.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@13906 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

test for all LAPACK functions separately in order to cope with Petsc's LAPACK version

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@13905 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add documentation

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@13904 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Final round of tests.
The result of the last test is reported wrongly because phony.h has been touched again at this point.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@13903 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

second round of regression test tests

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@13902 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

first round of regression test tests

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@13901 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix output files

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@13900 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Give intuitive meaning.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@13899 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d