Merge pull request #7295 from luca-heltai/boost-rtree-wrapper

Boost rtree wrapper

Merge pull request #7305 from marcfehling/cell-weights-shared

Make 'CellWeights' available for any 'p::Triangulation'.

Merge pull request #7322 from tamiko/fix_a_test_5

Tests: Fix race condition between mpi and non-mpi variants

Merge pull request #7311 from masterleinad/restrict_functionparser

Restrict examples that require a working FunctionParser class

Tests: hp/solution_transfer_14: add mpirun=1 to test variant

Tests: hp/solution_transfer_15: add mpirun=1 to test variant

Tests: mpi/solution_transfer_02 add mpirun=1 to test variant

Merge pull request #7316 from tamiko/fix_a_test_2

Tests: base/reference.cc - avoid "use after scope"

Merge pull request #7317 from tamiko/fix_a_test_3

Tests: fe/fe_enriched_color_07 - use a better preconditioner

Make 'CellWeights' available for any 'p::Triangulation'.

Merge pull request #7304 from marcfehling/refactor-find-least

Refactored FECollection::find_least_face_dominating_fe_in_collection().

Merge pull request #7319 from masterleinad/restruct_cuda_10_cxx17

Disallow C++17 support when compiling with CUDA 10

Refactored FECollection::find_least_face_dominating_fe_in_collection().

Disallow C++17 support when compiling with CUDA 10

Merge pull request #7313 from tamiko/fix_a_test

Tests: base/utilities_13.cc - workaround for clang

fix typos

Tests: fe/fe_enriched_color_07 - use a better preconditioner

PreconditionSOR does the job here...

Tests: base/reference.cc - avoid "use after scope"

gcc might be a bit forgiving with our use after scope here,
unfortunately, clang isn't. Let's simply work around this issue by
creating using a sentinel that simply resets the SmartPointer when going
out of scope

Added rtree, pack_rtree, and Segment.

Tests: base/utilities_13.cc - workaround for clang

Clang issues a spurious arithmetic exception if this code snippet is
called with a reference long double pointing into the vector. Work
around this issue by explicitly writing out the long double twice.

Merge pull request #7302 from BenBrands/remove_reference

ScaLAPACKMatrix::reinit() and one constructor: pass shared_ptr by value

Restrict examples that require a working FunctionParser class

ScaLAPACKMatrix: pass process grid consistently as const ref. to shared_ptr

Merge pull request #7299 from masterleinad/fix_mpi_const_cast

Fix DEAL_II_MPI_CONST_CAST

Merge pull request #7298 from masterleinad/fix_clang_tidy_complains

Fix clang-tidy complaints

Merge pull request #6629 from kronbichler/vectorization_vsx

Implement VectorizedArray for Altivec/VSX (IBM Power)

Fix DEAL_II_MPI_CONST_CAST

Print vectorization for altivec

Add changelog.

Add configure check for altivec and enable it in vectorization.h

Implement float path for altivec vectorization.

Implement VectorizedArray for Altivec/VSX (IBM Power) in double precision.

Undefine vector, pixel, bool from altivec.h

Simplify aliases in step-16

Fix clang-tidy complaints

Merge pull request #7288 from bangerth/threads-2

Do not use deprecated function Threads::this_thread_id().

Merge pull request #7285 from bangerth/threads

Deprecate Threads::n_existing_threads() and Threads::this_thread_id().

Merge pull request #7268 from BenBrands/update_ScaLAPACK_save_parallel

adapt block size in save_parallel

Merge pull request #7280 from davydden/feature/hsfc

add inverse_Hilbert_space_filling_curve

add inverse_Hilbert_space_filling_curve

Merge pull request #7290 from bangerth/doc-update-3

Update the documentation of FECollection::find_last...().

Update the documentation of FECollection::find_last...().

Add a changelog entry.

Do not use deprecated function Threads::this_thread_id().

Deprecate Threads::n_existing_threads() and Threads::this_thread_id().

Merge pull request #7275 from bangerth/q-collection

Add a variadic constructor to hp::QCollection.

Merge pull request #6754 from tjhei/flat_manifold_normal_bug

Fix normal_vector crash for small cells

changelog

Merge pull request #7278 from bangerth/authors

Update author list of hp::DoFHandler.

Update author list of hp::DoFHandler.

Add a changelog entry.

Add a variadic constructor to hp::QCollection.

Merge pull request #7274 from bangerth/doc-update

Make documentation of hp::FECollection clearer.

Make documentation of hp::FECollection clearer.

Merge pull request #7264 from marcfehling/cell-weights

Introduced CellWeights class for load balancing by the number of DoFs.

Introduced CellWeights class for load balancing by the number of DoFs.

Merge pull request #7259 from tjhei/old_mpi_support

use const cast for old OpenMPI version

Merge pull request #7270 from tamiko/cmake_fixes

CMake: Uniformly use ADD_FLAGS and LIST(APPEND for CMAKE_REQUIRED

CMake: Remove PUSH_CMAKE_REQUIRED macro

CMake: Use ADD_FLAGS instead of PUSH_CMAKE_REQUIRED

adapt block size in save_parallel and load_parallel

Cleanup and bugfixes: Uniformly append CMAKE_REQUIRED* and properly clear after use

Bugfix: Use DEAL_II_(CXX|LINKER)_FLAGS in checks

Merge pull request #7258 from bangerth/copyright

Propagate the last year of changes into the documentation, round II

Make sure we can deal with empty variables when parsing copyright years.

Propagate the last year of changes into the documentation.

reformat

move section

use const cast for old OpenMPI version

Old versions of OpenMPI are missing const specifiers for input arguments
in
functions like MPI_Allgather. Introduce a macro to cast away const in
these
cases.

Merge pull request #7256 from bangerth/copyright-2

Fix copyright date format.

Merge pull request #7255 from bangerth/header

Do not unnecessarily create backup files that then litter the build directory

Merge pull request #7254 from bangerth/header-2

Provide the mod_header.pl.in with a copyright header and explanation.

Merge pull request #7250 from masterleinad/revert_b8c6d8

Remove DEAL_II_WITH_THREADS checks, revert #7246

Merge pull request #7257 from bangerth/copyright-3

Figure out the last copyright date for any of our source files.

Figure out the last copyright date for any of our source files.

Fix copyright date format.

This is the only file that had used two spaces after '(C)'.

Do not unnecessarily create backup files that then litter the build directory.

Provide the mod_footer.pl.in with a copyright header and explanation.

While there, also clean up some idiosyncratic use of CORE::say: we use
print everywhere else in PERL scripts, so do the same here.

Provide the mod_header.pl.in with a copyright header and explanation.

While there, also clean up some idiosyncratic use of CORE::say: we use
print everywhere else in PERL scripts, so do the same here.

Merge pull request #7252 from tamiko/fix_slepc

CMake: FindSLEPC.cmake: Fix regex for version number

CMake: FindSLEPC.cmake: Fix regex for version number

Similarly to what was fixed in #7203, fix the regex to also pick up two
(or more digit) version numbers correctly.

Merge pull request #7234 from bangerth/hp-2

Make the order of active_fe_indices stable

Merge pull request #6977 from jppelteret/ad-helpers_03

AD Helpers: Add helper for variational formulations (cell-level)

AD Helpers: Add helper for variational formulations (cell-level)

More fixes

Merge pull request #7248 from drwells/remove-if-true-and-semicolons

Remove if true and semicolons

Revert "Fix compiling with THREADS=ON"

This reverts commit 49e7b20b064893627a5b403449fdc29edf1cd3d8.

Fix compiling with THREADS=OFF

Add a changelog entry.

Remove the DummyMutex/ConditionVariable/Barrier classes.

We provided these in cases where someone wanted to not compile for multithreading,
in which case certain functionality from the TBB was not available. But the
implementations of these classes is now unconditionally available via the
C++11 standard library, and so we don't need the dummy implementations any
more.

Remove 'if (true)' statements.

Remove some unnecessary semicolons.

Merge pull request #7239 from bangerth/parallel

Do some hp DoF index allocation tasks in parallel.

Merge pull request #7247 from dealii/fix_warnings_in_configure_checks

Allow configure checks to be run with more warnings

Merge pull request #7246 from masterleinad/fix_compiling_threads

Fix compiling with THREADS=ON

Merge pull request #7244 from bangerth/deprecate

Deprecate the PosixThreadBarrier class.

Allow configure checks to be run with more warnings

Fix compiling with THREADS=ON

Add a changelog entry.

Deprecate the PosixThreadBarrier class.

Merge pull request #7235 from bangerth/mutex-3

Replace uses of Threads::Mutex::ScopedLock by std::lock_guard.