platform fedora: update

Merge pull request #208 from gfcas/update_readme_file

Updated readme file

Update README.md

Co-authored-by: Timo Heister <timo.heister@gmail.com>

Merge pull request #216 from koecher/gmsh-update

gmsh removes comment

gmsh removes comment

Merge pull request #199 from gfcas/update_package_gmsh

Update package gmsh

Updated readme file

Update gmsh package

Merge pull request #207 from tjhei/disable_cmake_mpi_cxx_compiler

only set MPI_CXX_COMPILER if requested

Setting the compiler wrapper in CMake instead of in CC and CXX is
recommended, but only works for recent CMake versions (one configuration
I tested requires CMake 3.20 for the intel compiler).
With 9.3.1 deal.II supports setting CXX=mpicxx again, so only do the
above when a setting in candi.cfg is specified.
Works around #202
and fixes feature introduced in #159

Merge pull request #206 from gfcas/ignore-file

Remove candi dirs from .gitignore

Remove candi dirs from .gitignore

Merge pull request #205 from gfcas/ignore-file

Extend gitignore file

Merge pull request #204 from gfcas/remove_strange_file

Remove .single file

Extend gitignore file

Remove .single file

Merge pull request #203 from gfcas/update_version_master

Update VERSION file

Update VERSION file

Merge pull request #200 from koecher/update-authors

updates AUTHOR file based on the current commits on master

updates AUTHOR file based on the current commits on master

Merge pull request #198 from gfcas/add_package_symengine

Add package symengine

Merge pull request #197 from gfcas/replace_procs_by_jobs

Replace option --PROCS by --jobs and changes internal PROCS to JOBS variable consistently.

Replace option --PROCS by --jobs

Add package symengine

Merge pull request #194 from gfcas/add_package_ginkgo

Add ginkgo package

Merge pull request #195 from tjhei/master_dev

on the master branch always use dev deal.II version

Merge pull request #192 from gfcas/update_package_trilinos

Update package trilinos

Merge pull request #159 from tjhei/dealii_without_mpicxx

disable CXX/CC for deal.II itself

Add ginkgo package

on the master branch always use dev deal.II version

it makes sense to test the latest deal.II master version on the candi
master branch (in contrast to the 9.x branches)

Update superlu_dist package

Update trilinos confopts according to reported issue

Update trilinos package

disable CXX/CC for deal.II itself

As described in the comment, it is not ideal to set CXX/CC.

Update checksum verification (#187)

* Update checksum verification

* Minor corrections

Merge pull request #189 from gfcas/remove_stable_build_option

Remove STABLE_BUILD option

Correctly checkout the desired version for git repositories

Remove STABLE_BUILD option

Merge pull request #183 from gfcas/deal_ii_confopts

Rename to DEAL_II_CONFOPTS

Rename to DEAL_II_CONFOPTS

Add option to run tests after installation (#179)

* Add option to run tests after installation

* Change default value to OFF

Merge pull request #180 from gfcas/readme

Update readme

Merge pull request #182 from gfcas/instant_clean_option

Add instant clean up option

Unification ON|OFF (#176)

* Option CLEAN_BUILD

* Option native optimizations

* Option build examples

* Option stable build

* Update comments

Add GSL 2.6 (#178)

* Add GSL

* Add to package list in cfg file

* Remove multiple newlines

* Fix typo

* Update from koecher

Add instant clean up option

Merge pull request #175 from gfcas/update_cmake

Update cmake to version 3.16.3

Update readme

Update cmake to version 3.16.3

Merge pull request #173 from gfcas/dealii_examples_option

Option whether to build dealii examples

Merge pull request #172 from gfcas/update_arpack

Update to latest arpack version 3.8.0

Option whether to build dealii examples

Update to latest arpack version 3.8.0

Merge pull request #150 from tjhei/trilinos_mkl

fix trilinos tpetra when using intel MKL

Merge pull request #170 from gfcas/skip_prompts

Add option to skip prompts

Short documentation of skip option

Add option to skip prompts

Merge pull request #145 from tjhei/remove_nanoflann

remove nanoflann

Merge pull request #166 from tjhei/netcdf

add netcdf

Merge pull request #164 from koecher/guess-platform

Guess platform

Merge pull request #165 from tjhei/muparser

add muparser as separate package

add netcdf 4.7.4

add muparser as separate package

guess_platform: use major version for debian as well

removes opensuse unsupported platform files

guess_platform: find major os version

adds fedora29 platform file

candi.sh: new guess_platform: removes dependency from lsb_release

Merge pull request #158 from tjhei/ci_linux_blas

CI: add ubuntu 20.04 with openblas, rename and restructure OSX

Merge pull request #153 from tjhei/hdf5-1.10.7

hdf5: bump to 1.10.7

Merge pull request #161 from tjhei/openblas_fixes

openblas: update to 0.3.13 and fix OSX

Merge pull request #162 from tjhei/python3

handle python3 correctly

handle python3 correctly

If "python" does not exist in the environment, we set PYTHONVER to the
empty string, which makes configuration fail. Fix this.

Merge pull request #160 from tjhei/centos_cmake

take over #154 and #157 (centos cmake) to master branch

hdf5: bump to 1.10.7

fix openblas on OSX

update openblas to 0.3.13

I am getting compile errors with the old version on ubuntu 20.04:
getarch_2nd.c:12:35: error: ‘SGEMM_DEFAULT_UNROLL_M’ undeclared (first
use in this function); did you mean ‘XGEMM_DEFAULT_UNROLL_M’?

An update fixes this.

Addresses issue #155 old CentOS compilers

Addresses issue #154 CentOS cmake is too old

Merge pull request #152 from tjhei/ci_lapack

CI: fix OSX tester

debug build

use older cmake

output detailed.log

CI: add ubuntu 20.04 with openblas, rename and restructure OSX

CI: fix OSX build

- force cmake 3.18 as 9.2 does not support 3.19 (default in the VM)
- change the minimal build to use MPI as well (without it, blas is not
found for some reason). There is no good reason to test candi builds
without MPI.

Merge pull request #148 from rezarastak/remove_threads

remove WITH_THREADS

fix trilinos tpetra when using intel MKL

The choice to disable TPetra when using MKL lead to several downstream
Trilinos configuration errors. Instead, just disable the two
instantiations that are missing in MKL. Tested to work correctly with
Intel 19.0.5 and MKL.

remove WITH_THREADS

Merge pull request #146 from rezarastak/deprecate_old_ubuntu

deprecate unsupported ubuntu platforms

Merge pull request #147 from rezarastak/required_ubuntu_packages

bc and python must be available on ubuntu

bc and python must be available on ubuntu

deprecate unsupported ubuntu platforms

remove nanoflann

nanoflann is deprecated in deal.II and removed in 9.3.0-pre

Merge pull request #144 from tjhei/master-9.2.0

switch master branch to v9.2.0

switch master branch to v9.2.0

Merge pull request #141 from tjhei/petsc_slepc_update

Petsc/slepc update

Merge pull request #137 from tjhei/adolc-v2.7.2

update adol-c to 2.7.2

Merge pull request #136 from tjhei/arch_manjaro

basic working version for arch/manjaro

Merge pull request #140 from tjhei/ubuntu2004

support ubuntu 20.04

update slepc/petsc version to 3.13.x

This is required as our old version only supports Python 2.x, which is
end-of-life now.