Transfinite interpolation: add a test

Merge pull request #11137 from peterrum/mpi_processes_within_communicator

Introduce Utilities::MPI::mpi_processes_within_communicator

Merge pull request #11136 from peterrum/initialize_indices_global_active_cell_index

Use global_active_cell_index in MatrixFree::initialize_indices

Merge pull request #11135 from peterrum/global_active_cell_index_comments

Extend docu on global_active_cell_index

Merge pull request #11098 from peterrum/vde_full

Introduce VectorDataExchange::Full

Merge pull request #11125 from lethe-cfd/update_ghost_particles

Update ghost particles without rebuilding them

Introduce Utilities::MPI::mpi_processes_within_communicator

Use global_active_cell_index in MatrixFree::initialize_indices

Extend docu on global_active_cell_index

Introduce VectorDataExchange::Full and introduce 2nd communicator in MatrixFree

Merge pull request #11092 from peterrum/dof_indices_contiguous_sm

MatrixFree: add DoFInfo::dof_indices_contiguous_sm

Merge pull request #11103 from peterrum/simplex_q_gauss_1D

Pass n_q_points_1D to Simplex::QGauss

Merge pull request #10490 from peterrum/cell_global_id

Give each cell a globally unique (level) ID

MatrixFree: add DoFInfo::dof_indices_contiguous_sm

Merge pull request #11126 from kronbichler/fix_transfinite_jacobian

Transfinite interpolation: Fix refresh of Jacobian

Added unit test
Improved documentation

Merge pull request #11130 from mathsen/reorder_mg

set number_cache.n_global_dofs to the right size in MultiGrid scenario

Merge pull request #11127 from kronbichler/transfinite_quadratic_approximation

Transfinite interpolation: inverse quadratic approximation in pull-back

Merge pull request #11129 from tjhei/rotation_matrix_type_fix

fix type in Physics rotation_matrix_2d and 3d

Pass n_q_points_1D to Simplex::QGauss

Give each cell a globally unique (level) ID

fix type in Physics rotation_matrix_2d and 3d

The values were computed as doubles, which means this function can not
be used with Number=float (no constructor for Tensor exists). Fix this.

set number_cache.n_global_dofs to the right size in MultiGrid scenario

Merge pull request #10439 from peterrum/tria_impl_merge

Introduce internal::TriangulationImplementation::Policy

Changelog

Transfinite interpolation: Use inverse quadratic approximation for pull_back

Transfinite interpolation: Fix refresh of Jacobian

Merge pull request #11121 from drwells/pyramid-wedge-face-vertices

Implement face_to_cell_vertices for pyramids and wedges.

First version of an update_ghost_particles
Does not contain any modification to send_recv

Implement face_to_cell_vertices for pyramids and wedges.

Merge pull request #11116 from masterleinad/fix_cudwrappers_used_objects

Fix multiple definitions for CUDAWrappes::internal::used_objects

Update source/matrix_free/cuda_matrix_free.cu

Co-authored-by: David Wells <drwells@email.unc.edu>

Merge pull request #11118 from drwells/fix-wedge-n_faces

Fix Wedge::n_faces().

Fix Wedge::n_faces().

Wedges have five faces.

Fix multiple definitions for CUDAWrappes::internal::used_objects

Merge pull request #11113 from kronbichler/avoid_invalid_reference

Do not capture by reference in range-based for over IndexSet

Merge pull request #11090 from eliasstudiert/simplex_write_svg

Extend GridOut::write_svg() for simplices

Another one

Do not capture by reference for iota_view

Merge pull request #11114 from kronbichler/remove_symmetric_tensor

Switch SymmetricTensor -> Tensor for better performance

Switch SymmetricTensor -> Tensor for better performance.

Remove yet another capture by reference in IndexSet

Remove another capture by reference

Do not use a reference in range-based for over IndexSet

Merge pull request #11074 from peterrum/ldv_shmem

Introduce MPI-3 shared-memory capabilities in L:d:V

Merge pull request #11104 from lethe-cfd/exchange_ghost_particles_optimization

Exchange ghost particles optimization by not rebuilding vertex_to_neighbor_subdomain

Merge pull request #11085 from kronbichler/inverse_quadratic_approximation

Inverse quadratic approximation for MappingQ::real_to_unit_cell

Introduce MPI-3 shared-memory capabilities in L:d:V

Merge pull request #11099 from jppelteret/step_44_update_assembly_01

Step 44: Unify assembly loop and introduce an optimisation

Construct approximation by two sets of points.

Also better document some variables and mark constant variables as const.

Extend GridOut::write_svg() for simplices

Add output for ctest. Replace forgotten write_eps by write_svg.

Add comment for quad-case. Avoid writing extra point in case of simplices.

Update ctest source-file.

Replace post-increment by pre-increment.

Change update flag to update the new flag. I also provisioned for new possible flags by just clearing the entire last hex character.

Introduce inverse quadratic approximation for MappingQ::real_to_unit_cell

Added the missing flag update

- Fixed formatting of comments
- Added . at the end of sentences in the comments.

Fixed indentation

Added vertex_to_neighbhor_subdomain to cache and use it therein the
particle_handler

Update step-44: Further optimise assembly loop

Merge pull request #11057 from bangerth/doc-19

Update documentation of PropertyPool.

Merge pull request #11073 from bangerth/doc-20

Better document the conceptual idea of FESystem.

Merge pull request #11110 from bangerth/fe_q

Better document a constructor of FE_Q.

Merge pull request #11111 from bangerth/particles

Make sure particles also copy their properties when switching property pools.

Merge pull request #11112 from bangerth/move

Micro-optimization: Use move semantics in one place.

Better document a constructor of FE_Q.

Micro-optimization: Use move semantics in one place.

This is the last use of the variable in this location -- might as well move instead of
copy it.

Make sure particles also copy their properties when switching property pools.

Merge pull request #11023 from marcfehling/fixedfraction-vectornorm

VectorNorm for fixed_fraction refinement.

Better document the conceptual idea of FESystem.

VectorNorm for fixed_fraction refinement.

Added fixed fraction tests to compare serial/parallel implementations.

Merge pull request #11027 from peterrum/simplex_min_max_simplex

Extend GridTools::min/max_cell_diameter for simplex

Merge pull request #11054 from kronbichler/trafo_real_to_unit_tolerance

Improve termination criterion for transform_real_to_unit_point

Merge pull request #11105 from peterrum/ca_serial

Make ConsensusAlgorithms "work" in serial

Make ConsensusAlgorithms work in serial

Introduce internal::TriangulationImplementation::Policy

Merge pull request #11101 from drwells/remove-boundary-usage-3

Remove two more references to the long removed Boundary class.

Merge pull request #11082 from peterrum/sm_cell_access

Generalize FEEvaluationBase::read_write_operation_contiguous for SM

Merge pull request #11038 from Rombur/mf_fe_nothing

Enable FE_Nothing in MatrixFree

Enable FE_Nothing in MatrixFree

Remove two more references to the long removed Boundary class.

Merge pull request #11096 from jppelteret/step_44_update_make_constraints_01

step-44: Improve how constraints are constructed

step-44: Improve how constraints are constructed.

Update step-44: Unified assembly function

Merge pull request #11076 from bangerth/slepc

Better document where to find information about the SLEPc wrappers.

Generalize FEEvaluationBase::read_write_operation_contiguous for SM

Merge pull request #11094 from peterrum/fix_get_shared_vector_data

Fix get_shared_vector_data

Fix get_shared_vector_data

Merge pull request #11075 from peterrum/matrixfree_partitioner_wrapper

Wrap partitioners within MatrixFree

Merge pull request #11091 from peterrum/sm_mf_pass_to_function

MatrixFree: pass SM vectors to functions

Wrap partitioners within MatrixFree

Test case for transformation

Restructure MappingQGeneric: Use internal header file

Adjust test output affected by roundoff behavior.

More specifically, the old code would reject some points because the line search
did not improve due to roundoff errors, searching in the neighboring cell instead.
The new code should be more robust, but obviously changes from the previous results.

Improve termination criterion for transform_real_to_unit_point

Also, do not project initial point to the unit cell because we might
often search outside and have a good initial guess there. But we need
a recovery strategy, which adds some code.

Extend GridTools::maximal_cell_diameter and ::minimal_cell_diameter for simplex

Merge pull request #11086 from kronbichler/update_mf_is_supported

Improve MatrixFree::is_supported(FiniteElement)

MatrixFree: pass SM vectors to functions

Merge pull request #11081 from peterrum/fe_face_evaluation_process_and_io_restructure

MatrixFree: restructure fe_face_evaluation_process_and_io

Merge pull request #11089 from peterrum/get_vector_data

MatrixFree: introduce get_vector_data()

MatrixFree: introduce get_vector_data()

Merge pull request #11088 from jppelteret/fix_compiler_warnings_01

Use non-reference type for copied RBL element