Merge pull request #15629 from masterleinad/fix_remaining_deprecations

Remove remaining deprecations

Merge pull request #15631 from bangerth/vsv-trilinos-tpetra

Get rid of VectorSpaceVector in the LinearAlgebra::TpetraWrappers::Vector class.

Merge pull request #15621 from tamiko/fix_cmake_caching_03

CMake: record git information in a separate configuration file

Merge pull request #15561 from bangerth/affine-constraints-6

Parallelize some operations in AffineConstraints::close().

Merge pull request #15560 from tjhei/test-steps

Test example steps directly

Merge pull request #15527 from bergbauer/fix_ecl

FEFaceEvaluation: Fix ECL for continuous elements

Merge pull request #15632 from bangerth/virtual

Mark a 'virtual' function as such.

Merge pull request #15618 from bangerth/fold

Use C++17-style fold expressions.

Merge pull request #15625 from drwells/update-reordering-module

Significantly expand the orientation module.

Merge pull request #15609 from bangerth/typename

Standardize on 'template <typename X>.

Merge pull request #15614 from bangerth/loop-tria

Fix range-based for loops over the cells of triangulations.

Merge pull request #15617 from tamiko/fix_cmake_caching_02

CMake: avoid updating deal.II{Config,Targets}.cmake when nothing changed

Mov reorder_old_to_new_style to tests/test_grids.h

Merge pull request #15589 from masterleinad/remove_deprecated_matrix_free_evaluation

Remove deprecated MatrixFree::FE[Face]::Evaluation functions taking bools

Merge pull request #15600 from tamiko/fix_scalapack

lac/scalapack.cc: fix an out-of-bounds write that leads to a double free

Merge pull request #15601 from tamiko/fix_petsc_test

Test petsc/petsc_ts_05: avoid stack-use-after-return

Merge pull request #15630 from tamiko/dont_run_on_drafts

github: do not run checks on drafts

github: trigger on ready_for_review event

github: do not run checks on drafts

Change log entry

Remove deprecated Triangulation::create_triangulation_compatibility

Remove deprecated PETScWrappers::PreconditionerBase alias

Remove deprecated GridTools::cell_measure overload

Fix comment for GridTools::consistently_order_cells

Remove MappingQCache initialize

Remove deprecated LinearAlgebra::CommunicationPatternBase

Remove deprecated TriaAccessor::number_of_children()

Merge pull request #15616 from drwells/more-17-updates

Update the documentation in a few places to refer to C++17.

Merge pull request #15613 from tamiko/fix_cmake_caching_01

CMake: fix caching of C++ language feature checks

Merge pull request #15612 from tamiko/fix_compilation_with_trilinos_12.14

lac/trilinos_tpetra...h: Fix compilation on Ubuntu 20.04

Merge pull request #15611 from masterleinad/remove_deprecated_cellmesaure_gridreordering

Remove deprecated functions in GridReordering

Merge pull request #15627 from bangerth/affine-constraints-8

Fix the name of a variable.

Merge pull request #15628 from bangerth/debug

Only run a test in debug mode.

Mark a 'virtual' function as such.

Get rid of VectorSpaceVector in the LinearAlgebra::TpetraWrappers::Vector class.

Significantly expand the orientation module.

Fix ECL in read_write_operation_contiguous

Merge pull request #15619 from masterleinad/fix_optimization_tests_cxx17

Fix missing include file for optimization/line_minimization.h

add a news/changes entry

CMake: record git information in a separate configuration file

Merge pull request #15594 from lethe-cfd/step-68-typos

Clear the meaning of  frequency in step-68

Merge pull request #15590 from lethe-cfd/step-68-performance-test

Add Step-68 performance test

Only run a test in debug mode.

The test checks that we fail in by triggering an Assert. But we only hit that
error in debug mode, of course.

Fix the name of a variable.

reindent

Parallelize some operations in AffineConstraints::close().

Add sequential parallel_for.

Use std::move instead of std::swap.

Merge pull request #15605 from pcafrica/particle_fullydistributed_test

Make ParticleHandler serialization tests consistent

Merge pull request #15566 from tjhei/jenkins-ampere

[CI] add arm64 ampere linux build

Merge pull request #15559 from pcafrica/instantiate_fullydistributedtria

Instantiate templates for p::f::T

add a news/changes entry

lac/scalapack.cc: fix an out-of-bounds write that leads to a double free

```
==1080297==ERROR: AddressSanitizer: attempting free on address which was not malloc()-ed: 0x60200003da70 in thread T0
    #0 0x55bcdd907b7d in operator delete(void*) (/srv/temp/testsuite-IQZ1b8kK/build/tests/scalapack/scalapack_06b.debug/scalapack_06b.debug+0x17cb7d)
    #1 0x7fc52a4d2047 in void std::__1::__libcpp_operator_delete[abi:v160006]<void*>(void*) /usr/include/c++/v1/new:276:3
    #2 0x7fc52a4d2047 in void std::__1::__do_deallocate_handle_size[abi:v160006]<>(void*, unsigned long) /usr/include/c++/v1/new:300:10
    #3 0x7fc52a4d2047 in std::__1::__libcpp_deallocate[abi:v160006](void*, unsigned long, unsigned long) /usr/include/c++/v1/new:316:14
    #4 0x7fc52a4d2047 in std::__1::allocator<int>::deallocate[abi:v160006](int*, unsigned long) /usr/include/c++/v1/__memory/allocator.h:131:13
    #5 0x7fc52a4d2047 in std::__1::allocator_traits<std::__1::allocator<int>>::deallocate[abi:v160006](std::__1::allocator<int>&, int*, unsigned long) /usr/include/c++/v1/__memory/allocator_traits.h:288:13
    #6 0x7fc52a4d2047 in std::__1::__split_buffer<int, std::__1::allocator<int>&>::~__split_buffer() /usr/include/c++/v1/__split_buffer:362:9
    #7 0x7fc52a4d2047 in std::__1::vector<int, std::__1::allocator<int>>::__append(unsigned long) /usr/include/c++/v1/vector:1049:5
    #8 0x7fc52a8282d2 in std::__1::vector<int, std::__1::allocator<int>>::resize(unsigned long) /usr/include/c++/v1/vector:1910:15
    #9 0x7fc52a8282d2 in dealii::ScaLAPACKMatrix<double>::eigenpairs_symmetric(bool, std::__1::pair<unsigned int, unsigned int> const&, std::__1::pair<double, double> const&) /srv/temp/testsuite-IQZ1b8kK/dealii/source/lac/scalapack.cc:1684:17
    #10 0x7fc52a826813 in dealii::ScaLAPACKMatrix<double>::eigenpairs_symmetric_by_index(std::__1::pair<unsigned int, unsigned int> const&, bool) /srv/temp/testsuite-IQZ1b8kK/dealii/source/lac/scalapack.cc:1446:12
    #11 0x55bcdd911907 in void test<double>(unsigned int, unsigned int, double) /srv/temp/testsuite-IQZ1b8kK/dealii/tests/scalapack/scalapack_06b.cc:134:21
    #12 0x55bcdd90ebc8 in main /srv/temp/testsuite-IQZ1b8kK/dealii/tests/scalapack/scalapack_06b.cc:207:9
    #13 0x7fc4f5250989  (/usr/lib64/libc.so.6+0x23989)
    #14 0x7fc4f5250a44 in __libc_start_main (/usr/lib64/libc.so.6+0x23a44)
    #15 0x55bcdd7f73f0 in _start (/srv/temp/testsuite-IQZ1b8kK/build/tests/scalapack/scalapack_06b.debug/scalapack_06b.debug+0x6c3f0)
```

Fix range-based for loops over the cells of triangulations.

Fix missing include file for optimization/line_minimization.h

Use C++17-style fold expressions.

CMake: simplify Target.config generation

Let us call the export(TARGETS ...) function at one central place. This
simplifies the configuration logic significantly and avoids accidentally
recreating the file.

CMake: avoid updating deal.IIConfig.cmake when nothing changed

CMake: split compiler/linker flags sanity checks into extra file

Update the documentation in a few places to refer to C++17.

Merge pull request #15568 from bangerth/sol-trans

Minor simplification of some code.

Merge pull request #15534 from masterleinad/remove_deprecated_local_size

Remove deprecated Vector member functions

Standardize on <typename DataType>.

Standardize on <typename TransferType>.

Remove deprecations in MatrixFree

Merge pull request #15591 from masterleinad/step_64_wo_cuda

Allow running step-64 without CUDA

Merge pull request #15593 from bangerth/26

Introduce a variable that explicitly names the end time in step-26.

Merge pull request #15597 from tamiko/fix_fe_enriched

Test fe/fe_enriched_color_07: fix test

Merge pull request #15596 from masterleinad/remove_deprecated_solve_jacobian_system

Remove deprecated solve_jacobian_system

CMake: fix caching of C++ language feature checks

Fix some issues with the recent refactoring for C++17. In particular, we
have to be careful not to accidentally rerun all of these checks on
every (re)configure.

lac/trilinos_tpetra...h: Fix compilation on Ubuntu 20.04

Remove deprecated functioins in GridReordering

Merge pull request #15607 from tjhei/github-ci-disable-branch

disable github CI build of branches

Bugfix: do not invoke diff during configure

Instead, update the deal_ii_add_test() macro to allow defining a test
with generated source files.

update documentation

Tests examples: use a diff rule to update source files during test invocation

update patches to -c format, improve step-40 stability

undo gitignore change

Tests examples: only use binary directory for temporary files

add step-40

address comments

test examples

Standardize on 'template <typename X>.

disable github CI build of branches

Merge pull request #15563 from masterleinad/require_cxx17

Require C++17

Merge pull request #15598 from tjhei/jenkins-schedule-random

jenkins: test in random order

Change inverse frequency to interval

Merge pull request #15579 from bangerth/typename

Standardize on 'typename VectorType'.

Make particle handler serialization test consistent

Merge pull request #15542 from bangerth/tasks

Do not allow access to return value of tasks that ended in exceptions.

Fix missing #include

Instantiate templates for p::f::T

Remove deprecated MatrixFree::FE[Face]::Evaluation functions taking bools

Test petsc/petsc_ts_05: avoid stack-use-after-return

Fixes:
```
134: ==1438450==ERROR: AddressSanitizer: stack-use-after-return on address 0x7fa4f4d4bfb0 at pc 0x56248d8610c2 bp 0x7ffeebad19b0 sp 0x7ffeebad19a8
134: READ of size 1 at 0x7fa4f4d4bfb0 thread T0
134:     #0 0x56248d8610c1 in ExponentialDecay::ExponentialDecay(double, dealii::PETScWrappers::TimeStepperData const&, bool, bool, int)::'lambda'(double, dealii::[148/1839]
ers::MPI::Vector const&, dealii::PETScWrappers::MPI::Vector const&, double, dealii::PETScWrappers::MatrixBase&, dealii::PETScWrappers::MatrixBase&)::operator()(double, deali
i::PETScWrappers::MPI::Vector const&, dealii::PETScWrappers::MPI::Vector const&, double, dealii::PETScWrappers::MatrixBase&, dealii::PETScWrappers::MatrixBase&) const /srv/t
estsuite/dealii/tests/petsc/petsc_ts_05.cc:91:15
134:     #1 0x7fa538cf812b in std::__1::__function::__value_func<void (double, dealii::PETScWrappers::MPI::Vector const&, dealii::PETScWrappers::MPI::Vector const&, double,
dealii::PETScWrappers::MatrixBase&, dealii::PETScWrappers::MatrixBase&)>::operator()[abi:v160006](double&&, dealii::PETScWrappers::MPI::Vector const&, dealii::PETScWrappers:
:MPI::Vector const&, double&&, dealii::PETScWrappers::MatrixBase&, dealii::PETScWrappers::MatrixBase&) const /usr/include/c++/v1/__functional/function.h:510:16
134:     #2 0x7fa538cf812b in std::__1::function<void (double, dealii::PETScWrappers::MPI::Vector const&, dealii::PETScWrappers::MPI::Vector const&, double, dealii::PETScWra
ppers::MatrixBase&, dealii::PETScWrappers::MatrixBase&)>::operator()(double, dealii::PETScWrappers::MPI::Vector const&, dealii::PETScWrappers::MPI::Vector const&, double, de
alii::PETScWrappers::MatrixBase&, dealii::PETScWrappers::MatrixBase&) const /usr/include/c++/v1/__functional/function.h:1156:12                                              134:     #3 0x7fa538cf812b in int dealii::PETScWrappers::call_and_possibly_capture_ts_exception<std::__1::function<void (double, dealii::PETScWrappers::MPI::Vector const&, d
ealii::PETScWrappers::MPI::Vector const&, double, dealii::PETScWrappers::MatrixBase&, dealii::PETScWrappers::MatrixBase&)>, double&, dealii::PETScWrappers::MPI::Vector&, dea
lii::PETScWrappers::MPI::Vector&, double&, dealii::PETScWrappers::MatrixBase&, dealii::PETScWrappers::MatrixBase&>(std::__1::function<void (double, dealii::PETScWrappers::MP
I::Vector const&, dealii::PETScWrappers::MPI::Vector const&, double, dealii::PETScWrappers::MatrixBase&, dealii::PETScWrappers::MatrixBase&)> const&, std::exception_ptr&, st
d::__1::function<void ()> const&, double&, dealii::PETScWrappers::MPI::Vector&, dealii::PETScWrappers::MPI::Vector&, double&, dealii::PETScWrappers::MatrixBase&, dealii::PET
ScWrappers::MatrixBase&) /srv/testsuite/dealii/include/deal.II/lac/petsc_ts.templates.h:87:9
134:     #4 0x7fa538cf78cc in dealii::PETScWrappers::TimeStepper<dealii::PETScWrappers::MPI::Vector, dealii::PETScWrappers::MatrixBase, dealii::PETScWrappers::MatrixBase>::s
olve(dealii::PETScWrappers::MPI::Vector&)::'lambda'(_p_TS*, double, _p_Vec*, _p_Vec*, double, _p_Mat*, _p_Mat*, void*)::operator()(_p_TS*, double, _p_Vec*, _p_Vec*, double,
_p_Mat*, _p_Mat*, void*) const /srv/testsuite/dealii/include/deal.II/lac/petsc_ts.templates.h:489:26
134:     #5 0x7fa538cf73d7 in dealii::PETScWrappers::TimeStepper<dealii::PETScWrappers::MPI::Vector, dealii::PETScWrappers::MatrixBase, dealii::PETScWrappers::MatrixBase>::s
olve(dealii::PETScWrappers::MPI::Vector&)::'lambda'(_p_TS*, double, _p_Vec*, _p_Vec*, double, _p_Mat*, _p_Mat*, void*)::__invoke(_p_TS*, double, _p_Vec*, _p_Vec*, double, _p
_Mat*, _p_Mat*, void*) /srv/testsuite/dealii/include/deal.II/lac/petsc_ts.templates.h:472:31
134:     #6 0x7fa504afbcac in TSComputeIJacobian (/usr/lib64/libpetsc.so.3.19+0x10fbcac)
134:     #7 0x7fa504aa1672  (/usr/lib64/libpetsc.so.3.19+0x10a1672)
134:     #8 0x7fa504afd307 in SNESTSFormJacobian (/usr/lib64/libpetsc.so.3.19+0x10fd307)
134:     #9 0x7fa504a43e66 in SNESComputeJacobian (/usr/lib64/libpetsc.so.3.19+0x1043e66)
134:     #10 0x7fa504a35e98 in SNESSolve_NEWTONLS (/usr/lib64/libpetsc.so.3.19+0x1035e98)
134:     #11 0x7fa504a4968e in SNESSolve (/usr/lib64/libpetsc.so.3.19+0x104968e)
134:     #12 0x7fa504aa25e4  (/usr/lib64/libpetsc.so.3.19+0x10a25e4)
134:     #13 0x7fa504aa014a  (/usr/lib64/libpetsc.so.3.19+0x10a014a)
134:     #14 0x7fa504b03013 in TSStep (/usr/lib64/libpetsc.so.3.19+0x1103013)
134:     #15 0x7fa504b03e02 in TSSolve (/usr/lib64/libpetsc.so.3.19+0x1103e02)
134:     #16 0x7fa538cd2ccc in dealii::PETScWrappers::TimeStepper<dealii::PETScWrappers::MPI::Vector, dealii::PETScWrappers::MatrixBase, dealii::PETScWrappers::MatrixBase>::
solve(dealii::PETScWrappers::MPI::Vector&) /srv/testsuite/dealii/include/deal.II/lac/petsc_ts.templates.h:880:24
134:     #17 0x56248d85849f in ExponentialDecay::run() /srv/testsuite/dealii/tests/petsc/petsc_ts_05.cc:182:32
134:     #18 0x56248d855ca6 in main /srv/testsuite/dealii/tests/petsc/petsc_ts_05.cc:242:20
134:     #19 0x7fa502a50989  (/usr/lib64/libc.so.6+0x23989)
134:     #20 0x7fa502a50a44 in __libc_start_main (/usr/lib64/libc.so.6+0x23a44)
134:     #21 0x56248d73e2d0 in _start (/srv/temp/build/tests/petsc/petsc_ts_05.debug/petsc_ts_05.debug+0x742d0)
```

Minor simplification of some code.

Merge pull request #15588 from drwells/fix-step-36-tests

Fix the step-36 tests.

Merge pull request #15552 from pcafrica/particle_serialization

Remove deprecated Vector member functions

Merge pull request #15582 from bangerth/doc-x

Merge pull request #15585 from bangerth/doc-y