document bug: n_dofs() is wrong after component_wise().

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22773 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Copy face boundary_id to surface cell material_id in extract_boundary_mesh.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22772 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Minor cleanups.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22771 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add comment.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22770 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix tests.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22769 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Split _01 test into two pieces: one that works for a sphere surface and one that doesn't.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22768 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix step-41: n_quadrature_points got removed.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22767 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Augment docs.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22766 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix wrong package name.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22765 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix compilation of step-32.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22764 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Simplify, now that we don't have this dimension-dependent stuff any more.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22761 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

update result files

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22760 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add function to create unit vectors

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22759 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add Bessel function configuration and check for GSL

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22758 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove unused function arguments.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22757 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove more stray 'typename's where necessary.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22756 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Ignore mapping parameter in 1d.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22755 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add Bessel function

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22754 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove stray 'typename'.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22753 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove illegal default argument from explicit instantiation.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22752 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add LogStream output for Vector

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22751 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add header. Minor adjustments.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22750 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Changed structure in dofs, hp, multigrid and numerics so that these directories are now dimension-independent. Some specializations for 1D could be removed by access to faces for 1D cells, but not all of them. The deal_II_dimension constant in .cc and .h files has been removed.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22749 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove file now no longer needed.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22748 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Added the function GridTools::extract_boundary_mesh (...).

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22747 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Two new tests for GridTools::extract_boundary_mesh (...).
codim_one/extract_boundary_mesh_01.cc is failing.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22746 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix step-40.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22745 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Provide a bibtex entry for the distributed paper.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22744 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Finish documenting.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22743 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

No need to @ref tutorial programs any more.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22742 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Finish documentation of setup_system.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22741 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add publication

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22740 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

A few more comments.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22739 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Ignore .vtu and .pvtu files. Also clean them up.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22738 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Also document solve().

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22737 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Say something about hypre.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22736 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Document output_results.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22735 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Link to step-40.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22734 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Crosslink step-40.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22733 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Some more comments.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22732 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Document refine_grid.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22731 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Reshuffle a couple lines of code.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22730 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Some more comments.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22729 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Adjust spacing in output.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22728 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Silence p4est.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22727 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove debug output and timings.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22726 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Announce PETScWrappers::PreconditionBoomerAMG.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22725 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Disable BoomerAMG/Hypre when not available through this PETSc installation.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22724 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add scalar version of Nitsche boundary residual

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22723 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

The purpose is solver, not cg

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22722 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

use LocalIntegrators instead of integrating by hand; results are still exactly the same

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22721 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

make quadrature_point inline

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22720 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

use BoomerAMG in step-40.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22719 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

implement interface to BoomerAMG through PETSc.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22718 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Crap, I messed up again :-(

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22717 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Move important changes up.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22716 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make sure we can compare iterator objects.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22715 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Instead of giving -1, let index() for vertex iterators return the global index of the vertex.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22714 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove a TODO that doesn't appear connected to anything any more.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22713 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Disallow assignment of DoF accessors.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22712 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make sure that face iterators can be copied in 1d.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22711 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove unused variables' names.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22710 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add get_dof_indices function to DoFAccessor of faces in 1d.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22709 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix type of iterator.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22708 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Work around a compile problem in the compiler on our test machine.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22707 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Provide declarations also for DoFAccessor<0,1,spacedim> to enable using vertices-as-faces also for DoF iterators. Most of the function bodies are still missing right now but since they are not currently needed anywhere this should not yield actual linker errors.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22706 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

be less strict to enable formulas with many iterations

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22705 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Ouch -- fix two numbers that managed to completely break every single test that uses 3d functionality...

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22704 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Correct now outdated paragraph.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22703 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Clean up previous patch: Move implementation of functions out of the class declaration. Minor changes from const functions that always fail to static functions that always fail.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22702 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Announce this:
  <li><p>New: There is now a class TriaAccessor<0,1,spacedim> that allows
  to write things like
  @code
    cell->face(0)->boundary_indicator();
    cell->face(1)->at_boundary();
  @endcode
  even if the cell corresponds to a one-dimensional triangulation where
  this was not previously possible.
  <br>
  (WB, 2010/11/11)
  </p></li>

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22701 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Comment cleanup in Quadrature

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22700 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Implement face iterators also in 1d -- i.e. you can write cell->face()->at_boundary() and similar queries also for 1d triangulations.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22699 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

hide calls to sub-makes

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22698 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

...and remove deleted dependency

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22697 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove duplication of make functionparser

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22696 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add a function that resets the pointer and deletes the object pointed to

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22695 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

remove n_quadrature_points member variable after being deprecated for nearly 3 years

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22694 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

do not use deprecated access to Quadrature::n_quadrature_points anymore

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22693 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Get rid of the declaration of a specialization that now no longer exists.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22692 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

avoid another problem in 1D

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22691 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Disable the TriaAccessor<0,dim,spacedim> class completely.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22690 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Modify Guido's change in r22657 so that we only really provide the
additional functions for TriaAccessor<0,1,spacedim>, not for the more
general class TriaAccessor<0,dim,spacedim>. This moves us in the
direction where we ask 1d cells for cell->face() which will return an
object of the kind TriaAccessor<0,1,spacedim>.

We could in principle implement the more general case as well, but
that would only be useful if we want to do get the end points of a
face in 2d, for example (TriaAccessor<0,2,spacedim>) but there is no
use for such a thing in dimension independent programming.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22689 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

remove mutex after several tests did not produce any clashes

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22688 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make bits/grid_generator_01 work again.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22687 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make compile.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22686 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Produce some output.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22685 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Some more.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22684 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Use a more elegant way to do nothing.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22683 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix compiler errors

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22682 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Automatically delete source/Makefile.dep if remaking fails

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22681 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fixed wrong numbering of degrees of freedom in interface_constraints

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22680 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove unnecessary directory.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22679 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Avoid a few compiler warnings.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22678 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Avoid compiler warning on zero-sized arrays.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22677 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Change distributed and fe directories so that files are compiled only once and not for each dimension once.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22676 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fixed size of interface_constraints in FE_Nedelec

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22675 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove unnecessary include file.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22674 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Typo.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22673 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Nicer way to initialize pointer.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@22672 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d