Merge pull request #47 from Rombur/repo_path

Repo path

Install hdf5 and Trilinos in their own directory.

Move INSTALL_PATH for third-party library to dealii-prepare.package.

Change repository layout.

Merge pull request #48 from Rombur/export_metis

deal.II: Export METIS_DIR if the parmetis.package is installed.

Export METIS_DIR

Update README.md

Update README.md

Update README.md

Update README.md

Extend the readme documentation for the newly available command line options.

Merge pull request #44 from koecher/candi-package-fetch

candi: package_fetch restructuring

candi: download_archive minor fix; check for rm ARCHIVE_FILE success and comments.

deal.II: @tjhei (Timo Heister) provides a mirror server from Clemson for deal.II

candi: allow insecure ssl downloads for curl

candi: Tested download looping and download MIRROR; disable SNAPSHOT downloads

Merge pull request #45 from koecher/trilinos-compiler-variables

deal.II: Trilinos compiler variables and fixing ParMETIS for Trilinos

Merge pull request #46 from tjhei/detect_petsc_configure_fail

detect PETSc configure fail

detect PETSc configure fail

Only execute make if configure succeeds

deal.II: undo Trilinos v11 patching for SuperLU, since it will not work with SuperLU v4.x

deal.II: apply Trilinos 11 Amesos/SuperLU patch

deal.II: dealii-prepare fixes bug for auto SuperLU

deal.II: SuperLU/ParMETIS/Trilinos patch; Minor fix due to a comment of @tjhei

candi: included loop over MIRROR and SOURCE for archives
NOTES:
* untested version
* MIRROR variable in project-deal.II.cfg must be disabled for the final version

TODOs:
* MIRRORS for hg, git, svn ...

deal.II: ParMETIS, SuperLU_Dist + Trilinos: fixes some small errors.

deal.II: trilinos: set up compilers safely, if $CC, $CXX and/or $FC are present

candi:
* package_fetch redesign: for archives (.tar.bz2, .tar.gz, ...) a new download_archive function is called.
* package_verify: this is only needed for archives, and thus it is moved little above under the name verify_archive
* verify_archive is called by download_archive
* Further devolopment: make the download + checksumming process more dynamic (auto rm corrupted file, mirrors)

Merge pull request #42 from tjhei/update_cmake2

deal.II: cmake: ubuntu12: switch to cmake 3.4.0 in binary form

switch to cmake 3.4.0 in binary form

Merge pull request #40 from koecher/trilinos-v11

deal.II: Trilinos v11 update and ubuntu14 update

deal.II: Trilinos (v11) updated version to 11.14.3

deal.II: ubuntu14 (14.04): set Trilinos to v11 if STABLE_BUILD + deal.II v8.3.0

deal.II: switched off the parameter gui by default; Issue #34

Merge pull request #38 from koecher/trilinos-multiversion

Trilinos multiversion
Closes #22. Update of cmake.package and trilinos.package (version 11) may be given later.

deal.II: trilinos package: safe major versioning

deal.II: updated ubuntu12 first comment to set additionally the PATH variable

deal.II: ubuntu12 added more recent cmake to be able to compile deal.II v8.3.0

deal.II: ubuntu12 compiler set help message

deal.II: ubuntu12 environment-modules package not available

deal.II: Moved some variables for Trilinos versioning out of candi.sh

Merge pull request #37 from Rombur/trilinos-multiversion

Add support for automatic choice of Trilinos version.
Okay, thank you, but I will reorder it a bit, since now we have a new package specific variable in the main bash script, which is not very easy to maintain in future.

Clean auto-choice of Trilinos version.

Revert change in candi.cfg.

Add support for Ubuntu12.

Add support for automatic choice of Trilinos version.

deal.II: allows to build Trilinos 11 or 12

Merge branch 'release_preparings_v0.6'

Merge branch 'master' into release_preparings_v0.6

Merge pull request #31 from koecher/allow_overwriting_vars

Allow overwriting vars

Merge pull request #35 from tjhei/opencascade

add opencascade

add missing opencascade references

disable opencascade by default

add opencascade to platforms

add opencascade

Merge pull request #33 from Rombur/mkl_trilinos

If MKL is ON, setting MKL_DIR is enough when using Trilinos.
Ah, perfect. Thx for working that out.

If MKL is ON, setting MKL_DIR is enough when using Trilinos.

deal.II: petsc / MKL bug fix

deal.II: MKL usage for PetSC and Trilinos

deal.II: corrected version folder to master, if unstable build is forced

deal.II: updated ubuntu 14 description

Merge remote-tracking branch 'origin/allow_overwriting_vars' into release_preparings_v0.6

deal.II: updated centos7 platform information for CentOS 7.1

deal.II: minor work on p4est; added CHECKSUM for v1.1 and removed unnecessary code lines

Merge pull request #32 from koecher/keyword_load_instead_of_skip

Keyword load instead of skip

candi: unsets LOAD variable appropriately

candi: introducing a new keyword 'load' for package handling.
Details: preparation packages such as dealii-prepare were set to skip:dealii-prepare
which is confusing the users.
The patch of this branch introduces a new keyword load for optimising the user
experience.

Merge pull request #23 from tjhei/avoid_forcing_superlu

avoid forcing SuperLUDist/ParMETIS to on
This is correct, the opposite of having metis off is not having parmetis and superlu on.

Merge pull request #20 from tjhei/fix_p4est_unset

fix unset in p4est

Merge pull request #30 from tjhei/p4est_from_tarball

use p4est tarball
Looks good. Thx a lot.

Merge tjhei:candi:allow_overwriting_vars into koecher:candi:allow_overwriting_vars

use p4est tarball

candi/deal.II: corrected creation of modulefiles

replaces ~ by $HOME in the given prefix dir string

candi: major work: allows to set the PREFIX_PATH and PROCS variable from the outside.
Warning: the usage interface is now:
./candi.sh
./candi.sh --prefix=<PREFIX_PATH> or -p=* | --PREFIX_PATH=*
./candi.sh --np=<PROCS> or -np=* | --procs=* | --PROCS=* | -j*
./candi.sh --platform=<PROJECT/platform/supported/myplatform>  or -pf=*

candi: work on some comments, reorded global timer start

Merge pull request #27 from Rombur/blas_lapack

Make linux_cluster more robust

Make platform linux_cluster more robust and warn that BLAS_DIR and LAPACK_DIR need to be set to use Trilinos.

Merge pull request #25 from tjhei/catch_package_spec_fail

fix error handling in package_specific_setup
Thx a lot for figuring that out.

Merge pull request #18 from tjhei/catch_and_fix_errs

fix bugs in candi.sh and fail if download fails
Cool thing. Thx for working this out.

Merge pull request #17 from Rombur/boost_1.59

Update boost to boost-1.59

fix error handling in package_specific_setup

avoid forcing SuperLUDist/ParMETIS to on

If a platform defines SuperLUDist=OFF it will be forced to ON if we have
METIS, which then causes packages fail to build because they think
SuperLUDist is being installed. Fix this.

fix unset in p4est

fix bugs in candi.sh and fail if download fails

- missing space before "["
- if we get a 404 an empty download is created and the script tries to
continue: delete file and abort instead

allow overriding prefix_path

allow overriding PROCS

Update boost to boost-1.59

Issue #16 : this fix closes issue #16; addionally Amesos2 is now compiling

Issue #4 : tests if curl is available on the system; if not, wget is used in any case

Merge pull request #15 from Rombur/add_qt4

Add command to install qt4 for ubuntu 14 and ubuntu 15.

Add command to install qt4 for ubuntu 14 and ubuntu 15.

Merge pull request #13 from tjhei/dont_force_cxx11

do not force cxx11 in dealii

do not force cxx11 in dealii

My gcc 4.8 fails CXX11 so I can not install dealii this way. There is no
reason you force a certain std because we autodetect it.

gcc: updated to v5.2.0

mpi: mpich updated and added centos7 as supported platform

gcc: updated to v4.9.3

Merge pull request #12 from koecher/dealii8.3-trilinos12-SuperLU41

dealii8.3 trilinos12 super lu41

deal.II: updated download location for trilinos

deal.II: updated compiler strings

deal.II: package preparation: corrected final package name for deal.II-prepare

deal.II: Trilinos 12.2.1 added md5 checksum