Merge pull request #7279 from masterleinad/takeover_6769

[9.0.1] Take over #6769

Merge pull request #7291 from masterleinad/redo_6658

[9.0.1] Redo #6658

Merge pull request #7286 from tamiko/cmake_fixes

[9.0.1] Redo #7270

Merge pull request #7289 from masterleinad/redo_6929

[9.0.1] Redo #6929

CMake: Fix openmpi detection for Clang

Well, now that Clang has reached the version range of XCode, this cludge
obviously doesn't work any more. (Remember both compiler call themselves
"clang", but Apple insists on a different versioning scheme *sigh*).

Simply remove the version constaints for Clang. If someone hits an issue
with XCode. Well update your compiler to any version younger than 2
years, thanks.

Indent

Add test

Avoid out of bounds memory access

Move preprocessor check and add comments

add a missing RESET_CMAKE_REQUIRED

Bugfix: Use DEAL_II_(CXX|LINKER)_FLAGS in checks

Fix compiling with older Intel compilers

Merge pull request #7269 from drwells/dealii-9.0-7156

[9.0] redo 7156

Fix: 'iota' is not a member of 'std'

Fixes GCC compilation error:
 /source/base/mpi.cc:129:7: error: 'iota' is not a member of 'std'
That appears on newer gcc

Merge pull request #7261 from drwells/fix-petsc-detection

[9.0.1] fix PETSc detection

CMake: FindSLEPC.cmake: Fix regex for version number

Similarly to what was fixed in #7203, fix the regex to also pick up two
(or more digit) version numbers correctly.

*fix* petsc version 3.10 works now too (minor version was found by the regexp as "0" and not "10")

Merge pull request #6591 from davydden/bugfix/quicktest_scalapack_9

[9.0] take over #6590

quick-test: do not use lapack/create_matrix.h in scalapack test

Merge pull request #6588 from tamiko/pr_6587

[9.0] take over #6587

Fix .gitattributes

update VERSION for release

Merge pull request #6580 from tamiko/pr_6567

[9.0] take over #6567

Merge pull request #6579 from tamiko/pr_6577

[9.0] take over #6577

Fixed perl regex.

Fixed WB comment. Removed temporaryly the random new style.

Added div around inlined code.

Make sure program2doxygen does not change code blocks

Disable a test of a functionality that is currently experimental.

Merge pull request #6575 from tamiko/pr_6574

[9.0] take over #6574, #6573

Update the porting document.

Update some navbar links.

Merge pull request #6571 from tamiko/pr_6569

[9.0] take over #6569

Don't use tables in results.dox (copied from step 18)

Fixed some issues with step-60 doc.

Merge pull request #6570 from tamiko/pr_6564

Small doc fixes to the AD module

Small doc fixes to the AD module

Merge pull request #6563 from tamiko/pr_6542

[9.0] take over #6542

Fix DA's comments

Fix DD's comments; other documentation improvements

Add documentation for AD module

Fixes #6172

Merge pull request #6561 from tamiko/pr_6555

[9.0] take over #6555

Merge pull request #6560 from tamiko/pr_6553

[9.0] take over #6553

Correct whitespace in doxygen code section

Reformat table of images in step-18 results section

Add CSS environment for three column layout

Improve test lac/gmres_eigenvalues.

update VERSION for release

Merge pull request #6551 from tamiko/pr_6540

[9.0] take over #6540

Add the step-60 builds-on file.

Remove trailing whitespace.

Create another doxygen link.

Fix some markdown mishandling by doxygen.

My copy of doxygen does not correctly bold all statements with double
earmuffs; use HTML instead.

Remove spurious links to Boundary.

Fix some typos in step-60.

update VERSION for release

Merge pull request #6548 from tamiko/pr_6538

[9.0] take over #6537, #6538

Merge pull request #6549 from tamiko/pr_6544

[9.0] Take over #6544, #6543, #6541

Merge pull request #6547 from tamiko/pr_6536

[9.0] take over #6535, #6536

Clarify some text.

Remove a repetitive piece of text that doesn't add information.

Update the Gmsh entry in readme.html.

doc: say what we need from Gmsh

Remove a static Manifold from an example.

Clarify Manifold attachment in some functions.

Mention Manifold attachment in GridGenerator.

Attach a TorusManifold to a Torus.

Slightly decrease solver tolerance in lac/gmres_eigenvalues

Slighty increase tolerance in base/quadrature_chebyshev

Merge pull request #6514 from tamiko/pr_6393

[9.0] take over #6393

Merge pull request #6534 from tamiko/pr_6533

[9.0] take over #6533

Merge pull request #6515 from tamiko/pr_6508

[9.0] take over #6508, #6519

Make sure that also the output of the embedded value is on the deformed grid.

Merge pull request #6521 from tamiko/pr_6297

[9.0] take over #6297

Added doi.

Fixes to JP comments

Added references to step-60 in header files.

Added entries in tutorial.h.in

Added external cache.

Added possibility to read parameter from command line.

Written results, modified parameter file to use colorize

Added description of C and a solution example

Corrected refinement

First commented version of step-60

Co-authored-by: Giovanni Alzetta <giovannialzetta@hotmail.it>

Work around an internal compiler error on GCC7.

Only check for validity of the resulting Triangulation

Fix gmsh/create_tria_02

Merge pull request #6516 from tamiko/pr_6513

[9.0] take over #6291, #6511, #6513

put changelog entry back in place

Finally fix step-59 formula.

Fix typo.

Try to fix latex formula.

Explain the benefit of the fast diagonalization method in terms of iteration counts.

Link in step-59 in central tutorial page.

Write results section.

Write introduction.

Add step-59 tutorial program showing matrix-free DG.

Make sure not to attach a PropertyPool if not asked for

update VERSION for pre-release

Merge pull request #6509 from tamiko/pr_6475

[9.0] take over #6475