move check to configure_boost

blacklist boost version 1.58

addresses #1591

Merge pull request #1934 from Arezou-gh/local-triangulations

Add GridTools::build_triangulation_from_patch() and GridTools::get_cells_at_coarsest_common_level().

Add modified tests for build_triangulation_from_patch()

Merge pull request #2129 from kronbichler/master

Fix bug in matrix multiplication

Fix bug in matrix multiplication

Merge pull request #2127 from pesser/fix_warning

avoid warning about unused variable

avoid warning about unused variable

According to the documentation of ArpackSolver::solve the first parameter is
unused. Do not give it a name in the definition to avoid unused variable
warnings.

Merge pull request #2126 from davydden/compute_line_dof_identities_assert

remove invalid assert in compute_line_dof_identities() related to ele…

remove invalid assert in compute_line_dof_identities() related to element domination; add a unit test

Merge pull request #2125 from tjhei/msvc_fix

fix msvc compilation

fix msvc compilation

Merge pull request #2121 from sebastianGl31415/master

modified step-34 tutorial introduction

Merge pull request #2101 from drwells/continuation-line-whitespace

Skip whitespace at the start of continuing lines.

Merge pull request #2122 from bangerth/fix-64bit-output

Adjust the output of two tests for 64-bit runs.

Update intro.dox

I fixed language mistakes.

Merge pull request #2116 from kronbichler/master

Fix 2:1 balance on artificial cells over periodic boundaries.

Choose better names for tests

Use GeometryInfo to fix non-standard orientation case

Update a changelog entry.

Allow parameter files to end with a '\'.

Adjust the output of two tests for 64-bit runs.

modified step-34 tutorial introduction

Test beauty

Add changelog entry

Overload perpare_coarsening_and_refinement for the periodic case

Add additional test with hanging nodes. Fix bug in identification of periodic vertices.

Fix 2:1 balance on artificial cells over periodic boundaries.

Merge pull request #2119 from fsonner/sparsevankafix

Fix local second-order coupling in SparseVanka

Add SparseVanka fix message to changes.h

Merge pull request #2120 from tjhei/petsc_matrix_err_msg

improve PETSc sparse_matrix constructor error msg

improve PETSc sparse_matrix constructor error msg

If you construct a PETSc sparse matrix with invalid IndexSets for local
rows/columns, you only get a cryptic PETSc error code. This commit adds
a check in debug mode with a helpful error message.

Fix local second-order coupling in SparseVanka

Fixes issue #2118.

Merge pull request #2117 from tjhei/metis_small

fix METIS partitioning with too many processors

changelog

fix the case where we reduce to 1 domain

fix metis partitioning with too many processors

If you have more processors than cells to partition, METIS will behave
in a weird and undesired way:
- at some point all subdomains land on a single processor
- METIS produces an error message "***Cannot bisect a graph with 0
vertices!"

add test

Merge pull request #2113 from bangerth/further-FEValues-cleanups-40

Remove internal update_once/update_each functions

Fix copyright year range.

Slightly clarify a comment.

Remove declarations of functions that are no longer implemented.

Remove an outdated comment.

Replace it with links to places where the comments are up to date.

Remove now no longer used FE_PolyTensor::update_once/each.

Remove now no longer used FE_Poly::update_once/each.

Remove now no longer used FE_PolyFace::update_once/each.

Remove now no longer used FE_FaceQ::update_once/each.

Remove now no longer used FE_DGP_Nonparametric::update_once/each.

Merge pull request #2115 from bangerth/fix-doxygen-markup

Fix doxygen markup.

Merge pull request #2112 from bangerth/further-FEValues-cleanups-38

Initialize the last non-const field of FiniteElementData from constructor arguments

Fix doxygen markup.

doxygen generates unpleasantly looking markup if the text that goes with a
'@name' tag is spread over two lines. Fix this.

Add more authors to ParameterHandler.

Elaborate on the continuation line comment.

Document the line continuation tests.

Improve the style in parameter_handler.cc a bit.

Ignore surrounding whitespace if continuing lines.

This commit modifies the behavior present in both 23f306dfc5 (which did
not join lines if there was whitespace following a '\') and
0b962b1103 (which did not trim whitespace at the beginning of continued
lines).

We decided to remove whitespace at the beginning of a continued line
both because it was implemented that way in 23f306dfc5 (i.e., the 'fix'
in 0b962b1103 was wrong) and because it makes writing things
like (example provided by Alberto Sartori)

set Finite element space = FESystem[FE_Q(1)^d-\
                           FE_DGPMonomial(0)-\
                           FE_DGPMonomial(0)]

possible.

For the sake of posterity, here is part of the discussion (PR #2101)
which lead to the decision to remove trailing whitespace:

drwells:

I agree with @asartori86 that trailing whitespace is a mistake. I
suppose that I ultimately disagree because I think it is one that we
should 'forgive'. I think we are in agreement that we should join lines
if the last non-whitespace character is a `\`, then.

bangerth:

I agree, too, that trailing whitespace is a mistake. But there are two
options:

* Enforce it. In those cases you'll get an error about the next line not
  being what the parser expects, while the file looks completely correct
  visually. People will probably spend a long time rubbing their eyes
  before they realize the problem.

* Forgive it, at the cost of not being able to support valid cases where
  the user wants to have a backslash within the text, followed by only
  spaces. That seems like a rare case to happen in practice, and also a
  poor choice of syntax for whatever the user wanted to achieve.

From a usability standpoint, option 1 seems more appealing.

Merge pull request #2114 from bangerth/update-copyright-years

Update copyright year of all files touched in 2015.

Update copyright year of all files touched in 2015.

Merge pull request #2111 from tjhei/fix_step_40

fix crash in petsc step-40

Initialize the last non-const field of FiniteElementData from constructor arguments.

fix crash in petsc step-40

fix:

An error occurred in line <96> of file </ssd/deal-
git/source/lac/petsc_solver.cc> in function
    void dealii::PETScWrappers::SolverBase::solve(const
dealii::PETScWrappers::MatrixBase&, dealii::PETScWrappers::VectorBase&,
const dealii::PETScWrappers::VectorBase&, const
dealii::PETScWrappers::PreconditionerBase&)
The violated condition was:
    ierr == 0
The name and call sequence of the exception was:
    ExcPETScError(ierr)
Additional Information:
An error with error number 80 occurred while calling a PETSc function

Merge pull request #2106 from bangerth/further-FEValues-cleanups-37

Move some internal functions.

Merge pull request #2110 from bangerth/remove-unnecessary-friend-declaration

Remove a friend declaration that is unnecessary.

Remove a friend declaration that is unnecessary.

It also made no sense. Everything compiles just fine without it.

Merge pull request #2109 from bangerth/further-FEValues-cleanups-39

Remove a comment that's no longer correct.

Remove a comment that's no longer correct.

In fact, remove the entire section since there is a link to an extensive
documentation module just a couple of lines further down.

Merge pull request #2108 from bangerth/fix-changelog

Sort changelog entries into the right categories.

Merge pull request #2093 from drwells/mesh-concept

Mesh concept

Sort changelog entries into the right categories.

Merge GlossMeshAsAContainer and ConceptMeshType.

This moves the discussion completely into concepts.h.

Merge pull request #2107 from bangerth/fix-changelog

Fix grammar of an entry in the changelog.

Prefer 'MeshType' to 'Container' and 'GridClass'.

These things are already described as meshes in the documentation and there is
already a class named Mesh (buried in grid_reordering_internal.h), so the best
name for the concept is MeshType.

Fix grammar of an entry in the changelog.

Move some internal functions.

FESystem has a number of functions that are called in the member initializer list
of the constructors. These are all static functions, of course, and don't access
any member variables.

This patch moves them ouf of the class altogether. This has the advantage that
it reduces the size of the .h file, and that it reduces the number of functions
exported by the shared libraries. Rather, these functions may as well live
inside an anonymous namespace in the .cc file.

There are no functional changes, nor anything that would be visible to the user.

Merge pull request #2103 from bangerth/further-FEValues-cleanups-36

Remove an unused argument of FiniteElementData.

Remove an unused argument of FiniteElementData.

The value of this argument was unused by this class, but several derived
classes passed something down anyway. Fix this by simply removing the argument.

Remove a default constructor that likely doesn't do very much good.

Merge pull request #2102 from tjhei/fix_test

fix test codim_one/error_estimator_02

fix test codim_one/error_estimator_02

fixes dealii/tests/codim_one/error_estimator_02.cc:75:9: warning: using
integer absolute value function 'abs' when argument is of floating point
type [-Wabsolute-value]
    if (abs(p(1)-1.0)<1e-5)

Merge pull request #2097 from davydden/slepc_tests_no_iterations

do not print-out iteration counts for GHEP SLEPc unit tests

Merge pull request #2092 from tjhei/kelly_codim_one

Kelly codim one

do not print-out iteration counts for GHEP SLEPc unit tests

fix multithreading bug in test

add changelog

fix Neumann part of 1d Kelly estimator

Neumann conditions were evaluated at the wrong point. Also adjust test
(and print coordinates to prove that it is correct now).

Merge pull request #2096 from tjhei/doxygen_remove_duplicate_functs

doxygen: do not export duplicate functions

doxygen: do not export duplicate functions

Since we started handing .cc files to doxygen, every explicit template
declaration of a function inside a .cc would generate another line for
that function in the class documentation (not clickable and before the
correct ones). We fix this by hiding undocumented functions. A quick
test shows, that even with this change, undocumented functions inside
classes defined in the .h will still be exported, because things like
@name groups and @ingroup count as "documentation".

fix 1d Kelly estimator

fix test

Merge pull request #2094 from kronbichler/fix_test_runs

Only run tests if Trilinos is available.

Only run tests if Trilinos is available.

Merge pull request #2091 from drwells/fix-documentation-verbatim-block

Fix documentation verbatim block

remove unused code

fix test formatting

rewrite normal vector computation

Improve formatting in a documentation example.

Prefer code to verbatim environments.

The pair '@code' and '@endcode' will instruct doxygen to perform syntax
highlighting while the verbatim environment does not.

Merge pull request #2090 from drwells/dofhandlertype-doc

Fix some DoFHandlerType documentation.

Merge pull request #2089 from drwells/update-comment-indentation-1

Update comment indentation 1

Fix some DoFHandlerType documentation.