Leave a TODO to eventually remove this namespace alias

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15433 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Rename namespace dealii::deal_II_numbers into namespace dealii::numbers.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15432 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Re-indent

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15431 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add a nicer graph using a more sophisticated visualization program.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15429 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add an xref.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15428 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix reference

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15427 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

xref to the tutorial.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15426 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove std::fill of an array that now is empty.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15425 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix a typo.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15424 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

make sure derivative degrees of freedom at the boundary do not cause problems

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15423 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Streamline and remove old compilers that we haven't tested on in a long time.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15422 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Link to the authors file from the navbar.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15421 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix stray parenthesis.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15420 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

List tutorial program authors.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15419 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

xref step-29

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15418 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix number.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15417 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Some small changes about step-29

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15416 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

this assertion was wrong for a sparsity pattern of size zero

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15415 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add FilteredMatrix::clear()

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15414 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Ignore certain files.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15413 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Set props.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15412 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add first header.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15411 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add a newline to the end of the file and finish the sentence that was checked in by accident before.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15410 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Also link with 3d.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15409 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix double reference (program2doxygen introduces the second one).

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15408 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Re-scale pictures.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15407 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15406 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Improve link and spacing.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15405 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Work on a number of the comments, though the program already was in very good shape.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15404 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Link to step-29

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15403 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

The entry on primitive FEs was pretty much devoid of an actual description...

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15402 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Better line wrap.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15401 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

document last changes

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15400 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Use the Timer class rather than handwritten calls to clock().

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15399 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

test FilteredMatrix

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15398 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add scaled matrix and impreove FilteredMatrix

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15397 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Link to tutorial programs where the Timer class is used.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15396 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

By default, do not produce a preamble for UCD output files (both mesh and data) since some graphical programs don't grok that and, instead of giving an error message, simply refuse to load the file. It is therefore fairly complicated to find out what is going on.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15395 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

test BlockIndices

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15394 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add BlockIndices::block_start

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15393 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Link in step-29.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15389 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Link in step-29.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15388 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add step-29 directory to list.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15387 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix a number of small issues.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15386 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix output

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15385 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add RT tests for hp. The corresponding functions in the RT element are currently not implemented, so this isn't going to work.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15384 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix the properties of all these files.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15383 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix an actual bug: wrong index

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15380 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix a number of issues.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15379 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Updated step-29 with commented source code and results

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15378 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Boundary projection for RT

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15377 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

temporary fix for boundary projection in 3D
boundary mass matrix must be reprogrammed in order to allow for transformed shape functions

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15376 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

reenter test for dof on THIS face

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15375 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add testing of face values

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15373 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

On Mac OS X, link with the Accelerate or vecLib frameworks instead of individual blas or lapack libraries

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15367 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix a comment.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15366 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix the bug that we only re-set the rhs vector to zero if we were building the matrix, instead of every time. Disable adaptivity again for the moment since it is too fragile. Do output only every few steps.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15365 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Only rebuild the matrix when necessary.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15364 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Accelerate the solver by a factor of 6 by preconditioning the Schur complement with the mass matrix :-) -- thanks, Guido

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15363 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Reduce required accuracy of solvers somewhat.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15362 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add a few code snippets that I will later use to discuss a few aspects.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15361 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Enable running more than one time step again.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15360 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Use a better refinement algorithm. Re-structure the code that refines the mesh up front.

Also, add the term <T, div(u) q> to the bilinear form for the T-equation. This term is zero on the continuous level, but isn't on the discrete level.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15359 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix a bug where we were using the wrong FEValues object to calculate the temperature of a neighboring cell. Break a few overly long lines. Switch refinement back on.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15358 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix the same typo another time.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15357 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add refinement between time steps. There's a subtle bug right now, which will have to be figured out, so de-activate this for the moment.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15356 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix a typo.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15355 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make the code that does local refinement actually work.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15354 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Added is_finite() function for complex numbers

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15353 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

By default don't stop latex if there are errors.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15352 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

rely more on precollected dofs

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15351 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

A first step towards adaptive meshes. Still have to implement the rhs for mesh size changes.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15350 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add SparseMatrix::print_pattern

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15349 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

remove test that fails for DG

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15348 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make run in 3d as well.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15347 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Let gravity point outward instead of upward. Use instable temperature layering.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15346 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Reduce order of quadrature formulas to what is needed. Reduce amount of output.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15345 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make the program 20% faster by improving the extract_* functions

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15344 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove debug output, make time step closer to the limit.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15343 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Prepare for using adaptive meshes. Fix computation of time step size.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15342 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Compute the time step the correct way.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15341 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Use a more interesting geometry. Precondition the DGQ0 mass matrix, which while diagonal, still needs a number of CG iterations on non-uniform meshes.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15340 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Revert to using DG elements for the temperature field.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15339 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Use umfpack as a (very good) preconditioner. Improve screen output.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15337 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make computations even faster. Produce better output file names that sort more easily, also create output for the first time step by assigning it number 0.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15335 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make code much faster by using less accuracy and better preconditioners. Remove some debug output

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15334 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Reference the new feature used in step-22

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15329 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Reference the new feature used in step-22

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15328 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

update output

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15327 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add a new testcase.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15326 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix a bug: in 1d, vector ranges can well contain only a single element.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15325 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Avoid the use of head -10, it is deprecated. Use head -n 10 instead.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15324 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Document the new feature of being able to output vector components.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15317 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix a bug where we don't keep track of counters properly.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15316 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix an obvious oversight.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15315 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add the possibility to identify certain output components as vectors. Still has to be tested and used in step-22, but getting there.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15314 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Re-organize some things. In particular, remove the common functions and constructors for postprocessor and no-postprocessor -- this actually made things a bit more complicated than necessary because we had to deal with two sources of data at the same time, where only one is used at any given time. Make our lives simpler by splitting things up. This will also make things simpler when we finally add the vector data stuff in a next step.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15313 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Implement the data structures to deal with vector-valued output.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15312 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Undo accidental changes

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15311 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Break an overly long line.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15310 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d