Merge pull request #1915 from tjhei/msvc_fixes

MSVC fixes

Merge pull request #1914 from kronbichler/master

Fix overflow issue with parallel::distributed::Vector

MSVC fixes

Fix overflow issue with parallel::distributed::Vector

Merge pull request #1910 from drwells/remove-mgdofhandler-references

Remove MGDoFHandler references

Improve spacing in a code sample.

Update references to the MGDoFHandler class.

This class was removed in the 8.0 release. I updated the example to show
how one can get the same result with a DoFHandler (i.e., call
distribute_mg_dofs).

Merge pull request #1902 from bangerth/do-some-work-in-get_data

Do some work in get_data instead of fill_fe_values

Merge pull request #1908 from bangerth/fix-cartesian-mapping

Compute higher order derivative mappings in MappingCartesian.

Compute higher order derivative mappings in MappingCartesian.

These fields were previously only computed for cells, but not for faces or subfaces.
This happened to work by accident because these fields are initialized by zeros.
But I'm changing this so that they are initialized by signaling NaNs, and so we need
to be explicit about this.

Merge pull request #1906 from bangerth/fix-error-message

Fix error messages.

Fix error messages.

There was a space  missing in a couple of places, but more importantly we cannot
directly output objects of type types::boundary_id (==char). They need to be cast
to integers to yield something useful.

Merge pull request #1904 from bangerth/update-reference

Hallelujah.

Update a reference.

Merge pull request #1903 from jppelteret/fix_docs_gridgenerator

Added note on mesh refinement to GridGenerator::extrude_triangulation

Added note on mesh refinement to GridGenerator::extrude_triangulation

Fixes #1887

Revert order of loops and if statements.

This is in analogy to what was already done in #1821.

Do some work already in get_data().

Do not delay until fill_fe_values(), if something can already be done early on.

Merge pull request #1899 from bangerth/use-american-english

Use American English spelling of "signaling".

Use American English spelling of "signaling".

Merge pull request #1898 from bangerth/fix-tests

Fix tests.

Fix tests.

This adjusts tests for changes introduced when fixing
GridGenerator::extract_boundary_mesh().

Merge pull request #1897 from bangerth/fix-comment

Fix a comment.

Fix a comment.

Merge pull request #1896 from bangerth/fix-extract_boundary_mesh

Fix extract boundary mesh

Add a changelog entry.

New tests.

Adjust test. One part of the existing test simply no longer makes any sense.

Augment documentation.

Fix an issue with GridGenerator::extract_boundary_mesh().

Order the vertices of the surface mesh in such a way that the coordinate
systems of all cells that make up the surface are either right-handed or
left-handed when viewed from one side of the resulting surface.

Merge pull request #1891 from bangerth/fix-FE_DGPNonparametric

Adjust FE_DGPNonparametric to not return values on the reference cell.

Merge pull request #1892 from bangerth/fix-test

Fix a test so that it also runs in 64-bit mode.

Fix a test so that it also runs in 64-bit mode.

Provide changelog.

Adjust test.

Adjust FE_DGPNonparametric to not return values on the reference cell.

This is because the element does not define its shape functions by mapping
from the reference cell, so evaluating anything on the reference cell
makes no sense. Fix this by throwing an exception, as discussed in
the documentation of the corresponding functions in the base class.

Improve exception message.

Merge pull request #1890 from tamiko/fix_mpi_detection

CMake: Compatibility fixes for CMake 3.4.0

CMake: Compatibility fixes for CMake 3.4.0

CMake 3.4.0 no longer exports MPI_<LANGUAGE>_COMPILER as cached variable.
Therefore, we also have to make sure to unset ordinary variables (in
addition to cached variables) for our "retry" pass.

Merge pull request #1800 from Rombur/la_vector

Add LinearAlgebra::Vector derived from ReadWriteVector and VectorSpaceVector

Remove sadd(scalar,Vector) from VectorSpaceVector interface.

Merge pull request #1882 from tjhei/remove_depr_multithreadinfo

remove deprecated MultithreadInfo code

changelog entry

remove deprecated MultithreadInfo code

Merge pull request #1884 from barker29/patch-1

Update tria_boundary_lib.cc

Update tria_boundary_lib.cc

Bug fix to allow CylinderBoundary<2,3>

Fix a typo in a comment.

Merge pull request #1880 from tjhei/rework_expand_instantiation_macros

fix expand_instantiation split logic

fix expand_instantiation split logic

We optionally split instantiations in the generated .inst files based on
two macros SPLIT_INSTANTIATIONS_COUNT and SPLIT_INSTANTIATIONS_INDEX.
Intel 14 generates an error with an invalid % 0 in the old solution,
which happens if _COUNT is undefined. Fix this by defining a macro at
the beginning of the .inst file.

Merge pull request #1881 from drwells/undo-vector-scalar-add-deprecation

Revert deprecation of Vector::add(scalar).

Update a deprecation message in changes.h.

These functions are no longer deprecated and should not be marked as
such in the changelog.

Revert deprecation of Vector::add(scalar).

This commit partially reverts commit
a45f633f0fc797a499559887d2b5d6be6bf1a508. The un-deprecated functions
were found to be useful an Aspect application, where one subtracted the
mean value from a vector of pressure values.

Merge pull request #1863 from bangerth/document-get_data

Document FiniteElement::get_*_data().

Merge pull request #1878 from Rombur/vertex_iterator

Allow to iterate on vertices when dim = 2 or 3.

Improve operator --

Improve documentation.

Allow to iterate on vertices when dim = 2 or 3.

Merge pull request #1875 from tjhei/quick_test_msg

display friendly quicktest message

display friendly quicktest message

Merge pull request #1873 from tjhei/trilinos_ml_deterministic

make Trilinos ML deterministic

make Trilinos ML deterministic

Trilinos version 12.2 and older initialize a random seed every time the
ML preconditioner is constructed leading to non-deterministic behavior.
Reported in 2011, this has been finally fixed in 12.4 with the new
"initialize random seed" parameter. Yay!

Merge pull request #1877 from ESeNonFossiIo/warning

silence warning

Merge pull request #1864 from bangerth/doc-update-39

Update documentation of FiniteElement::shape_*.

silence warning

Merge pull request #1874 from tjhei/trilinos_warning

fix trilinos warning

fix trilinos warning

Merge pull request #1872 from bangerth/doc-update-40

Update documentation about sparsity patterns.

Update documentation about sparsity patterns.

Merge pull request #1871 from bangerth/work-around-compiler-bug

Work around a bug in gcc 4.6.

Work around a bug in gcc 4.6.

Merge pull request #1868 from jppelteret/fix_precondition_selector

Remove errant line left over from a merge conflict.

Remove errant line left over from a merge conflict.

Merge pull request #1867 from drwells/consistent-template-type-names

Consistent template type names

Prefer PolynomialType to POLY.

Prefer StreamType to STREAM.

Prefer PreconditionerType to PRECONDITIONER.

Fix an astyle indentation issue.

Prefer SolverType to SOLVER.

More MATRIX to MatrixType

More VECTOR -> VectorType

Prefer BlockVectorType to BLOCK_VECTOR.

More MATRIX -> MatrixType

Even more VECTOR -> VectorType

More VECTOR -> VectorType

More VECTOR -> VectorType

Remove trailing blank lines

More VECTOR -> VectorType

MATRIX to MatrixType, part 1

TODO double check Range, Domain, and VECTOR

VECTOR to VectorType, part 2

VECTOR to VectorType, part 1

Update documentation of FiniteElement::shape_*.

The updated documentation makes it clearer what implementations are
supposed to do if they overload these functions, and what the default
implementation already does. It also fixes incorrect references in
shape_3rd/4th_derivatives().

Document FiniteElement::get_*_data().

Merge pull request #1859 from luca-heltai/fix-diag-blop

Fixed bug in DiagonalBlockLinearOperator.

Merge pull request #1860 from bangerth/add-output-object-to-get_data

Add an output data object to FE::get_*_data().

Merge pull request #1854 from davydden/slepc_unit_tests_initial_space

Slepc unit tests and initial space

Add read/write operations to LinearAlgebra::Vector.

Fixed indentation.

Added test for BlockDiagonalOperator bug.

Merge pull request #1858 from luca-heltai/fix-header

Fixed header.