Fix another typo.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14488 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Move a test that now works away from fail/

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14487 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

rename testcase, since grid_generator_04 has already been added

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14486 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Set props.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14485 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14484 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Only use the maximal coefficient for each |k|.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14483 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Move test that now works.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14482 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Move test that now works.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14481 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix previously wrong output.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14480 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Typo.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14479 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Spelling error in documentation

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14478 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Workaround for gmsh output mesh.
New funcition:
GridGenerator::hyper_cube_with_cylindrical_hole.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14477 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Test for GridGenerator::hyper_cube_with_cylindrical_hole

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14476 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Generalize GridIn::read_netcdf to multiple bmarker on zero plane.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14475 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Don't forget to copy the list of RefinementListeners when copying a Triangulation.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14474 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Move things a bit forward.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14473 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Proper order for names

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14472 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add another convenient reinit function

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14471 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

More text.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14470 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Leave a TODO.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14469 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix a case reported on the mailing list. extract_dofs for hp DoF handlers still to be implemented.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14468 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

A first couple of paragraphs on the new smoothness indicator

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14467 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Update authors' universities.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14466 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Update authors.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14465 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add support for previously unorientable meshes to the news.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14464 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

update

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14463 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix a comment typo.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14462 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add a TODO, fix a reference.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14461 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove the feature of logging all communications. This takes time and memory, and appears to be the cause of weird crashed on some occasion that may be related to race conditions in multithreaded programs.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14460 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove the feature of logging all communications. This takes time and memory, and appears to be the cause of weird crashed on some occasion that may be related to race conditions in multithreaded programs.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14459 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix a bug where we were happily using iterators into a list even though this list is having its elements erased.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14458 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add subscriber information

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14457 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix a problem with a static variable

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14456 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Do not mark local variables static. They are EVIL.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14455 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Adjust to new interface of QProjector.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14454 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Adjust to new interface of QProjector.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14453 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Due to more quadrature projections we have to increase the tolerance for passing the test.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14452 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

It is now possible to read all gids provided in the regression tests, therefore the output has changed (no Exception).

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14451 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Announce the last changes merged from branch_general_meshes.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14450 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix a bug resulting from previous merges.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14449 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Use new interfaces to GeometryInfo and QProjector where necessary. Furthermore, let the FiniteElements tell, how dofs on faces and lines in 3D have to be permuted if the face has non-standard orientation, flip or rotation and/or the lines have non-standard orientation. Let DoFAccessor use this information if asked for the dofs on a cell. Currently this is only implemented for FE_Q and FESystem, for the other FEs there is a TODO. This is the last partial merge from branch_general_meshes.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14448 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Adjust QProjector to create all eight (instead of two) face-quadrature rules originating from all combinations of face_orientation, face_flip and face_rotation. This is a partial merge from branch_general_meshes.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14447 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Modify creation and refinement of Triangulations to respect the new flags face_flip, face_rotation and line_orientation. This is a partial merge from branch_general_meshes.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14446 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Adjust GeometryInfo to use information from the new flags face_flip, face_rotation and line_orientation. Add some information about these flags (their meaning and purpose). This is a partial merge from branch_general_meshes.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14445 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Introduce new flags face_flip and face_rotation for cells in 3D and line_orientation for quads in 3D. This is necessary in order to treat previously non-orientable meshes. This is a partial merge from branch_general_meshes.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14444 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Modify GridReordering: Instead of throwing an Assertion, return the original connectivity if the grid could not be oriented. This is a partial merge from branch_general_meshes.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14443 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Update doc.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14442 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

New function GridGenerator::moebius() creating a loop of cells which are rotated against each other before one end of the string is attached to the other one. This is a partial merge from branch_general_meshes.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14441 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Also apply patch here.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14440 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add another test.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14439 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add a comment.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14438 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove a comment since for this finite element, there is nothing we need to do as far as adjusting quad dof indices are concerned.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14437 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Minor adjustments.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14436 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

update a few comments.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14435 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

cache the last field for which we didn't do this yet.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14434 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix up a TODO

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14433 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Also write the corresponding tests for the Laplace matrix.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14432 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Finish the tests that check the mass matrix generator functions.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14431 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add a currently half-finished test

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14430 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add a test for SparseMatrixEZ::print_formatted().

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14429 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fixed MatrixCreator::create_mass_matrix and create_laplace_matrix

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14428 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Added SparseMatrixEZ::print_formatted

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14427 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Implement a version indicator for the intermediate format.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14426 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add a warning that intermediate format is volatile.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14425 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Clarify a comment.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14424 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix a hopelessly outdated comment.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14423 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

implement vector data for residuals
remove superfluous arguments to local residuals

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14421 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove the mess introduced by the effort to be backward compatible in the deal.II intermediate format. Wolfgang will commit a comment in the doc stating that no compatibility can be assumed.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14415 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

update

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14413 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

update

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14412 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

update

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14411 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

update

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14410 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

update

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14409 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

update output files

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14408 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove file that isn't needed.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14407 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix output.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14406 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Some time ago, the check for finite numbers has been included in the deal.II
libarary. In the method MatrixBase::set this check was still using the
std-lib methods instead of the method provided by deal.II. This caused
problems on a slightly outdated Mac OS-X system.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14405 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

In the previous version it was impossible to use the "Assert"
macros, if the dealii namespace was not globally included. This
is now fixed.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14404 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add proper forward declarations of partial specializations before they are used

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14403 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add proper forward declarations of partial specializations before they are used

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14402 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Update the documentation a bit.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14401 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix a few typos.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14400 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

update number of tests

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14399 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add a TODO

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14398 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fixed inversion of FullMatrix objects.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14397 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Move Tobias' entry (patch 14392) from General to deal.II where this entry seems to fit in better.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14396 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make it compile in debug.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14395 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make DataOutReader::read() backwards compatible with old version of the deal.II intermediate format.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14394 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

update some test refs due to patch 14392: a) different roundoff error, b) extended deal.II intermediate format, c) bug fix for FE_RaviartThomas and FE_ABF elements (mapped function values)

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14393 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Extend DataOutBase and DataOut to store mapped (quadrature) points in each patch at the boundary. Use a mapping to obtain function values and thus fix a bug for FE_RaviartThomas and FE_ABF elements, which need such a mapping for the function values.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14392 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

delete test ref for x86_64-unknown-linux-gnu+gcc4.1, as it is identical to the one for ...gcc3.3

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14391 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

provide a simpler constructor for ComressedBlockSparsityPattern

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14390 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Put parentheses around the stronger binding operator.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14389 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

implement count dofs per block for multigrid

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14388 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Use -Wno-return-type if the flag -Wreturn-type (otherwise included in -Wall) would lead to strange warning messages.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14387 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

New output files.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14386 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

update

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14385 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Changed the Makefile for Petsc libraries.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14384 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

New test: test dof reordering if the face is rotated against the standard orientation. Test this via projection of a function to a mesh using FE_Q<3>(3) elements. Currently only works on branch_general_meshes. Should be moved to tests/bits eventually.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14383 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

New test for GridGenerator::moebius(). Currently only works on branch_general_meshes. Should be moved to tests/bits eventually.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@14382 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d