Extended step-26 documentation with regard to positivity preservation.

Merge pull request #5682 from masterleinad/replace_cylinder_boundary

Replace CylinderBoundary by CylindricalManifold in tests

Merge pull request #5703 from masterleinad/replace_hypershell

 Replace HyperShellBoundary by SphericalManifold in tests

Merge pull request #5698 from masterleinad/rebase_opencascade_boundaries

Rebase Opencascade Boundary classes

Merge pull request #5697 from masterleinad/replace_cone_boundary

 Replace ConeBoundary by CylindricalManifold

Merge pull request #5700 from Rombur/cuda_assert

Make AssertCuda use Assert instead of AssertThrow

Merge pull request #5702 from vishalkenchan/bug_fix/rol_vector_adaptor

ROL: bug fix applyBinary function in Rol::VectorAdaptor

Merge pull request #5701 from masterleinad/fix_tests_5691

Fix failing tests after #5691

Merge pull request #5699 from Rombur/pedantic

Do not use pedantic when cuda support is enabled

Use SphericalManifold in mpi/p4est_2d_constraintmatrix_03

Simplify mpi/p4est_2d_constraintmatrix_03

Do not use pedantic when cuda support is enabled

nvcc generates code that produces a lot of warnings when pedantic is used.
Since the code is generated by nvcc there is nothing we can do about it except
not using pedantic.

Replace HyperShellBoundary by SphericalManifold in tests

Merge pull request #5684 from masterleinad/replace_boundary

Replace StraightBoundary by FlatManifold in tests

bug fix applyBinary function in Rol::VectorAdaptor

Changelog entry

Fix failing tests after #5691

Simplify computation of normal vector in 2D

Replace StraightBoundary by FlatManifold in tests

Move implementation of normal_vector and get_normal_at_vertices from StraightBoundary to FlatManifold

Make AssertCuda use Assert instead of AssertThrow

We used AssertThrow instead of Assert in AssertCuda because of a bug that has
now been fixed.

Rebase Opencascade Boundary classes onto FlatManifold

Changelog entry

Update documentation

Replace ConeBoundary by CylindricalManifold in tests

Implement CylindricalManifold::push_forward_gradient

Simplify CylindricalManifold::push_forward

Merge pull request #5694 from bangerth/glossary

Write something about the Z order in the glossary.

Write something about the Z order in the glossary.

Merge pull request #5691 from gassmoeller/write_float_vtu

Write data and vertices as floats

Add changelog

Update test results

Write data and vertices as floats

Merge pull request #5689 from bangerth/fix

Use the correct iterator type in DoFRenumbering::hierarchical().

Merge pull request #5692 from masterleinad/avoid_compiler_warning

Avoid compiler warning regarding writing past the end of an array

Merge pull request #5693 from masterleinad/fix_typo_grid_out

Fix typo in GridOutFlags::Vtu

Fix typo

Avoid compiler warning regarding writing
beyond the end of an array

Use the correct iterator type in DoFRenumbering::hierarchical().

Merge pull request #5685 from bangerth/fix-hierarchical

Clean up some odds and ends.

Merge pull request #5687 from bangerth/doc-update

Update a couple of comments for p::s::Triangulation.

Merge pull request #5688 from bangerth/micro-fix

Make an input argument to a function 'const'.

Make an input argument to a function 'const'.

Update a couple of comments.

Rename a variable for clarity.

Clean up some odds and ends.

Replace CylinderManifold by CylindricalManifold in tests

Merge pull request #5680 from bangerth/add-tests

Add a couple of tests for TrilinosWrappers::SparseMatrix::n_nonzero_entries().

Merge pull request #5611 from juan42/add_idas_detection

Add check if sundials has idas

Merge pull request #5668 from eldarkh/fix-hdiv-seminorm

Fix the way H-div seminorm is computed

Add a couple of tests for TrilinosWrappers::SparseMatrix::n_nonzero_entries().

Merge pull request #5679 from masterleinad/improve_fix_tests

Add GMSH quicktest

Fix Hdiv seminorm

Merge pull request #5678 from masterleinad/improve_fix_tests_2

Fix BOOST/ZLIB quicktest

Add GMSH quicktest

Fix BOOST/ZLIB quicktest

Merge pull request #5676 from kronbichler/vectorized_array_streaming_stores

Streaming store operation for VectorizedArray

Merge pull request #5677 from davydden/test/zlib_boost_quick_test

tests: add a quick test for Zlib with Boost

Add changelog.

New test.

Add VectorizedArray::streaming_store.

tests: add a quick test for Zlib with Boost

Merge pull request #5670 from ExtremOPS/updateSparseMatrixMMULT

Update sparse matrix mmult with DynamicSparsityPattern::compute_mmult_pattern(..)

Merge pull request #5674 from bangerth/doc-update-2

Update the documentation of some PETScWrappers::MatrixBase member variables

Update the documentation of some PETScWrappers::MatrixBase member variables.

Merge pull request #5671 from bangerth/doc-update

Move deleted operators out of the private: section of a class.

Merge pull request #5673 from masterleinad/fix_intel_warnings

Fix Intel 18 warnings in OpenCASCADE wrapper

Move deleted operators out of the private: section of a class.

There is no longer a reason to hide these operators. They aren't usable anyway, so we
may as well document this publicly.

Fix Intel 18 warnings in OpenCASCADE wrapper

added change log

improved readability inside SparseMatrix::mmult(..) with DynamicSparsityPattern::compute_mmult_pattern(..)

Merge pull request #5604 from masterleinad/extract_hanging_node_parallel

Make DoFTools::extract_hanging_node_dofs for p::d/s::Triangualations

Merge pull request #5669 from davydden/arclength_boundary_02

disable unstable arclength_boundary_02 test

Merge pull request #5672 from masterleinad/update_project_to_object_01

Update test output for grid/project_to_object_01

Merge pull request #5665 from tjhei/trilinos_sparsity_copy_from

implement missing TrilinosWrappers::SparsityPattern::copy_from()

Update test output for grid/project_to_object_01

Simplify the logic used and extract all locally relevant DoFs

disable unstable arclength_boundary_02 test

Merge pull request #5562 from gassmoeller/optimize_spherical_manifold_get_new_point

Optimize spherical manifold get_new_point into get_new_points

implement missing TrilinosWrappers::SparsityPattern::copy_from()

also test the different copy_from implementations.

Merge pull request #5656 from davydden/feature/blas64

support 64bit BLAS

Merge pull request #5663 from bangerth/grammar

Fix the grammar of a few doc strings.

Fix the grammar of a few doc strings.

Merge pull request #5661 from masterleinad/64_bit_serialize

Add 64-bit output variant for serialization/hp_dof_handler_01

support 64bit BLAS

Merge pull request #5660 from masterleinad/increase_precision_arpack_parpack

Increase precision in arpack/parpack_advection_diffusion_petsc

Merge pull request #5652 from drwells/lapack-size-type

Change LAPACKFullMatrix::size_type to unsigned int.

Merge pull request #5659 from davydden/feature/norm_sqr

add LA::d::BlockVector::norm_sqr() and LA::d::Vector::norm_sqr()

Update tests

Merge pull request #5632 from ExtremOPS/multiplySparsityPattern

Multiply sparsity pattern

Increase precision in arpack/parpack_advection_diffusion_petsc

Add 64-bit output variant for serialization/hp_dof_handler_01

add LA::d::BlockVector::norm_sqr() and LA::d::Vector::norm_sqr()

added changelog entry

added two unit tests and its output for compute_mmult_pattern(..)

added DynamicSparsityPattern::compute_mmult_pattern(..)

Merge pull request #5654 from masterleinad/update_number_cache_periodicity

Update NumberCache after adding periodicity to a p::d::Triangulation

Change LAPACKFullMatrix::size_type to unsigned int.

This fixes compilation with 64 bit indices and also makes things more consistent
with base class functions (e.g., TransposeTable::n_rows() returns an unsigned
int).

Add comment why to call update_number_cache

Update NumberCache after adding periodicity to a p::d::Triangulation