Merge pull request #10469 from luca-heltai/parameters-step-70

Fixed default parameters for step-70.

Fixed default parameters for step-70.

update VERSION for release

Merge pull request #10291 from tjhei/9.2-step-70-formula

[9.2] fix step-70 doxygen formula

[9.2] fix step-70 doxygen formula

fix broken formula (no & allowed in multline)

Merge pull request #10292 from tjhei/9.2_step-69-formulas

[9.2] fix step-69 doxygen formula

switch to mathtt

[9.2] fix step-69 doxygen formula

this works with and without mathjax

Merge pull request #10290 from tamiko/pr_10289

Take over #10289 contrib/python_wrapper: set environment correctly

contrib/python_wrapper: set environment correctly

Merge pull request #10288 from tamiko/pr_10280

Take over #10280

Also link in 3d results.

Link in step-70 pictures and videos.

Merge pull request #10279 from tamiko/pr_10275

[9.2] Take over #10275

Merge pull request #10278 from tamiko/pr_10272

[9.2] Take over #10272

Merge pull request #10277 from drwells/step-70-fix-petsc-9.2

Rename a variable in step-70 to better match its intent.

Leave more references to step-70.

step-70: remove unused variable

Merge pull request #10276 from masterleinad/takeover10269

[9.2] Take over #10269: fix PETSc step-70 compilation

Merge pull request #10267 from tamiko/pr_10266

[9.2.] Take over #10266

step-70: add missing compress() call

fixes #10270

fix PETSc step-70 compilation

candidate for 9.2

Fix python test with input file

update VERSION for release

Merge pull request #10265 from tamiko/pr_10259

[9.2] Take over #10259

Merge pull request #10260 from masterleinad/takeover10258

[9.2] Takeover #10258: Fix some tests failing without LAPAPCK support and with -Werror

Merge pull request #10264 from tamiko/pr_10257

[9.2] Take over #10257

Merge pull request #10261 from masterleinad/takeover10256

[9.2] Take over #10256: arpack/step-36_ar_with_iterations: Remove iteration count

Make a function simpler to read.

Move a function.

Update documentation inside the step-70.cc file.

Simplify some code.

Rename the penalty parameter.

Move a piece of code to a better location.

Use mpi_communicator instead of MPI_COMM_WORLD.

Simplify more pieces of code.

Simplify a piece of code.

Add a reference to step-70.

Edits to the in-code documentation of step-70.

Fix doxygen issue.

Make it clear to doxygen that "2018." at the beginning of a line is
not an attempt to create a numbered list...

sacado/helper_scalar_coupled_3_components_01_4: avoid race condition

arpack/step-36_ar_with_iterations: Remove iteration count

Fix some tests failing without LAPAPCK support and with -Werror

Merge pull request #10250 from tamiko/pr_10232

Merge pull request #10252 from tamiko/pr_10244

Merge pull request #10254 from tamiko/pr_10249

mark code snippet as workaround slated for removal

improve test and add symmetric variant as well

add a test

Workaround: Add additional complex ProductTypeImpl specializations

The workaround introduced in 32ecab6 needs an additional variant to
deduce the product type of Tensor<..., complex<Number>> and
complex<Number> correctly.

Co-authored-by: Daniel Arndt <arndtd@ornl.gov>

Merge pull request #10251 from tamiko/pr_10241

[9.2] Take over #10241, #10242, #10245

Edits to the results section of step-70.

Minor edits to the introduction of step-70.

Add a reference for step-70.

Re-classify step-70 as a fluids dynamics tutorial.

Fix a formatting problem with step-60.

Specifically, if doxygen sees the end of a list, it sometimes gets confused and indents
the next line of text as well. That's annoying if the next line of text is the first line
of the commented program (or, more specifically, the heading for the commented program).

Improve spelling in step-70.

update copyright years

with fixed script from #10241 and after a lot of other changes came in.

extend update-copyright script (missing files)

- fix not going 2 levels deep into src/include, reported in #10240
- add .cu files

Fixed even more copyright years manually.

Fixed a few copyright years manually.

Updated doi.

Merge pull request #10248 from masterleinad/takeover10228

[9.2] Take over 10228: Fix warning in step70

Merge pull request #10247 from masterleinad/takeover10235

[9.2] Take over #10235: Specialize BoundingBox<0> to prevent instantiating BoundingBox<-1>.

Fix warning in step70

Specialize BoundingBox<0> to prevent instantiating BoundingBox<-1>.

A zero-dimensional bounding box doesn't make sense and causes weird problems
with intel's compiler when the compiler tries to instantiate
BoundingBox::cross_section().

We have to use this workaround and not something like

    BoundingBox<spacedim != 1 ? spacedim - 1 : 1, Number>
    cross_section(const unsigned int direction) const;

to make MSVC happy.

Merge pull request #10238 from drwells/step-70-make-unique-9.2

[9.2] takeover #10236

Merge pull request #10231 from tamiko/pr_10230

Use std_cxx14::make_unique in step-70.

Merge pull request #10229 from tamiko/pr_10227

[9.2] Take over #10227

Test boost/extract_rep*_02: adjust test output for libc++

We have to adjust the output after
bfe81e2b89a39792ee48dd7d028e8860cc44551e also for the libc++ variant.

See 9038e6000b681910227e24302e964835a344ddf8

For reference, the difference between libstdc++ and libc++ output is as
follows:
```
--- extract_representative_set_02.with_p4est=true.mpirun=3.output       2020-05-15 09:27:53.256578723 -0500
+++ extract_representative_set_02.with_p4est=true.mpirun=3.output.libstdc++     2020-05-15 09:58:47.149994734 -0500
@@ -137,16 +137,16 @@
 0.5 -0.707107

 DEAL:1::-0.0732233 -0.0732233
-0.21967 -0.0732233
-0.21967 0.292893
+0.292893 -0.0732233
+0.292893 0.292893
 -0.0732233 0.292893
 -0.0732233 -0.0732233

-DEAL:1::0.21967 -1.11022e-16
-1 -1.11022e-16
+DEAL:1::0.21967 -0.0732233
+1 -0.0732233
 1 0.382683
 0.21967 0.382683
-0.21967 -1.11022e-16
+0.21967 -0.0732233
```

Fix warning in step-70

update VERSION for release

Merge pull request #10226 from tamiko/pr_10225

[9.2] Take over #10225

Fix test output forgotten in #9969

Merge pull request #10224 from tamiko/pr_10220

[9.2] Take over #10220

Merge pull request #10223 from tamiko/pr_9078

[9.2] Take over #9078

Merge pull request #10218 from tamiko/pr_10174

[9.2.] Take over #10174

tests: add additional output file for intel

Merge pull request #10216 from marcfehling/take_over10215

[9.2] Take over #10215: Bugfix: Cells may not receive any variable size data.

Review by Marc.

Fixed parameters_23.prm

Fixed indent.

Some minor changes. Add support for output directory.

- Changed the default values for the parameters for the 2D case. The default case should run easily and produce better results
- Finalized resulted for the 2D case
- Minor modifications to introduction

- Fixed indentation
- Corrected small typos /sentences in introduction
- Removed the automatic deletion of .vtk files for step-70

First draft of results

Fixed indent.

Working 3d.

Switched to FGMRES.

Fixed small issues.

Fix more typos and add a paragraph about particles

Fix some typos

Addresses all of the corrections and comments of @peterrum
Introduction and documentation can still be improved.

Fixed codimension one build.

Short fix to documentation

- Corrected typos and mistakes
- Finished first pass at documenting step-70
- Changed the default parameter of nitsche penalization to ensure convergence of iterative solver in parallel
- Changed the function driving the motion of the impeller to ensure it comes back at it's original place in then end

Some more docs.

Allow filenames and cad files.