Tests: convert quicktests to regular tests

Merge pull request #14559 from tamiko/testsuite_fixes

Tests: make mpiexec and numdiff optional

Merge pull request #14564 from peterrum/power_of_two

Add helper function to indicate power of two

Merge pull request #14555 from tjhei/jenkins-remove-old-mpi

Merge pull request #14549 from adamqc/python-mesh-smoothing

Merge pull request #14563 from peterrum/json_docu

ParameterHandler: add example for json

Merge pull request #14565 from peterrum/feeval_fix_assert

FEEvaluation: fix assert

Merge pull request #14566 from peterrum/convert_hypercube_to_simplex_mesh_rename_tests

Rename tests

Merge pull request #14560 from peterrum/relax_assert

Relax assert

CMake: bugfix: do not pass an argument as environemt variable

This fixes the runscript invocation on windows configurations

Rename tests

FEEvaluation: fix assert

Add helper function to indicate power of two

ParameterHandler: add example for json

Relax assert

Tests: Use find_package(UnixCommands) to detect a suitable shell

Tests: make mpiexec and numdiff optional

Making numdiff (and mpiexec) optional has a number of advantages:

 - First of all, we can call deal_ii_pickup_tests() in user projects
   unconditionally. Previously, it was always necessary to add some
   CMake code to only call the macro if numdiff was available. Or,
   otherwise to frustrate everyone who just wants to configure and
   compile your project and doesn't happen to have numdiff installed.

 - This refactoring will allow us to simply call deal_ii_pickup_tests()
   for configuring out quick tests.

CMake: move a macro definition to the proper file

Merge pull request #14556 from bangerth/vtu-1

Replace one more occurrence of dim-predicated loops.

Merge pull request #14321 from peterrum/rotate

Rotate for dim=1 spacedim=2

Merge pull request #14331 from peterrum/fdm_compression_ad

TensorProductMatrixSymmetricSumCollection: allow to disable compression

TensorProductMatrixSymmetricSumCollection: allow to disable compression

Merge pull request #14520 from masterleinad/add_mold_linker

Add support for the mold linker

Remove a function argument.

Add get/set_mesh_smoothing to python bindings.

Replace one more occurrence of dim-predicated loops.

CI: disable old MPI build

Now that the new MPI build is working, delete the old one.

Merge pull request #14552 from peterrum/cgs_log

Modified Gram-Schmidt: add docu

Merge pull request #14550 from tamiko/fix_gmsh_configure

CMake: Bugfix: only export DEAL_II_GMSH_WITH_API if gmsh is configured

Try using mold in github actions

Modified Gram-Schmidt: add docu

Merge pull request #14546 from drwells/step-70-no-boost

step-70: remove a dependency on boost.

Merge pull request #14543 from masterleinad/fix_undefned_var_template

Address Wundefined-var-template

Rotate for dim=1 spacedim=2

Merge pull request #14417 from peterrum/cheby_forth_kind

Introduce 4th-kind Chebyshev preconditioner

Merge pull request #14548 from masterleinad/fix_indent_jenkins

Fix indentation in Jenkinsfile.mpi

CMake: Bugfix: only export DEAL_II_GMSH_WITH_API if gmsh is configured

If the gmsh library is installed but the gmsh executable is missing we
currently disable gmsh support. This implies that we will not link
against the gmsh library.

Unfortunately, on first configure pass the variable `GMSH_WITH_API` is
still populated with a `TRUE` value and the `DEAL_II_GMSH_WITH_API`
variable gets set by accident and final linkage fails.

This issue is hard to spot because a second invocation of cmake will
cure the configure mistake (and the debian/ubuntu packages do not run
any autodetection).

Fix indentation in Jenkinsfile.mpi

Merge pull request #14542 from tjhei/jenkins-mpi

Introduce 4th-kind Chebyshev preconditioner

step-70: remove a dependency on boost.

indent

Merge pull request #14541 from masterleinad/fix_deprecations

Fix some deprecations

Address Wundefined-var-template

[CI] add new MPI Jenkinsfile

This enables a new Jenkins project on a new server,
https://ci.tjhei.info to run the tests with MPI enabled.

a

Fix some deprecations

Merge pull request #14540 from tamiko/use_pthread_flag

CMake: Ensure we use "-pthread" instead of "-lpthread" for thread support

CMake: Ensure we use "-pthread" instead of "-lpthread" for thread support

Merge pull request #14538 from luca-heltai/changelog-zampini

Added changelog for #14531

Added changelog.

Merge pull request #14535 from mschreter/mca_1d_remove_saddle_point

MarchingCubeAlgorithm<1>: Remove determination of a saddle point

Merge pull request #14531 from tjhei/step-77-fix

Merge pull request #14528 from tamiko/cmake_cleanup_3

Merge pull request #14533 from vovannikov/solver_control_history

Solver control history

remove saddle point

Merge pull request #14534 from masterleinad/clang_no_trivial_copy

Don't use __has_trivial_copy

Add change-log entry

Update test

Clear history for a new step

Merge pull request #14532 from bangerth/50

Remove a 'using' declaration in step-50 that is in the way.

update test results

Remove a 'using' declaration in step-50 that is in the way.

Merge pull request #14524 from bangerth/d2

Avoid using dealii:: qualified names.

Merge pull request #14529 from drwells/step-70-include

Fix compilation of step-70.

Avoid using dealii:: qualified names.

also fix test

STEP-77: fix bug

Fix compilation of step-70.

I'm not sure how this ever worked.

Merge pull request #14522 from bangerth/12b

Reference the correct step.

Merge pull request #14523 from bangerth/12b-2

Just do 'using namespace dealii' in main().

Merge pull request #14526 from bangerth/12b-3

List step 12b in the list of tutorials.

Merge pull request #14527 from bangerth/resources

Add to the resources for programmers mentioned in step-1.

add a news/changes entry

CMake: remove switch_library_preference()

CMake: remove DEAL_II_PREFER_STATIC_LINKAGE

CMake: Remove DEAL_II_STATIC_EXECUTABLE configure option

CMake: remove DEAL_II_SETUP_DEFAULT_COMPILER_FLAGS configure option

Add to the resources for programmers mentioned in step-1.

Merge pull request #14521 from masterleinad/fix_test_warnings

Fix some warnings in tests

List step 12b in the list of tutorials.

Just do 'using namespace dealii' in main().

Reference the correct step.

Fix some warnings in tests

Add support for the mold linker

Merge pull request #14519 from tjhei/invalid_int_assignment

fix warning: -1 assignment to unsigned

Merge pull request #14504 from bangerth/vtu-6

Run the different parts of creating VTU output in parallel.

Merge pull request #14513 from luzpaz/equality-to-none

Fix 'testing equality to None' python issue

Merge pull request #14514 from tamiko/fix_github_actions_2

Merge pull request #14515 from tamiko/master

Merge pull request #14516 from vyushut/step-85

step-85: add namespace to documentation

Merge pull request #14506 from tamiko/cmake_cleanup_1

CMake: Remove deal.IIFeatureConfig.cmake

more fixed environments
step-85: environment added

CMake: Bugfix: only add to the linker line what is needed

The `INTERFACE_LINK_LIBRARIES` option of the Kokkos target might contain
much more than we actually need. So restrict the fixup to finding the
missing linker flag and adding this one.

This works around an issue with the regression tester where the link
interface of the Kokkos::kokkos target contains entries that make the
final link fail.

github/actions: install kokkos outside of deal.II source directory

Fix 'testing equality to None' python issue

"Testing whether an object is '`None`' using the `==` operator is inefficient and potentially incorrect."

Merge pull request #14511 from luzpaz/typos/various

Update examples/step-60/step-60.cc

Co-authored-by: Marc Fehling <mafehling.git@gmail.com>

Merge pull request #14512 from luzpaz/typos/asser

Fix typos in source function name