Remove IndexSet overloads in DataOut

Merge pull request #7807 from masterleinad/fix_msvc_cxx17_boost

Fix compiling bundled boost with MSVC and C++17

Merge pull request #7832 from tjhei/step-15-doc

step-15: small doc update

step-15: doc update

Merge pull request #7792 from drwells/fix-doc-frame-link

Fix link targets in frames.

Merge pull request #7827 from masterleinad/fix_tpetra_fabs_complex

Fix Tpetra test for std::fabs without std::complex overload

Merge pull request #7816 from tamiko/workaround_for_ldlld

CMake: Reorganize MPI sanity check

Merge pull request #7763 from drwells/fix-dual-dof-handler-sparsity

Fix dual dof handler sparsity

Fix Tpetra test for std::fabs without std::complex overload

Merge pull request #7818 from masterleinad/apply_all_indicators_ucd_cell

Set cell manifold ids when the apply_all_indicators_to_manifold flag is used.

Merge pull request #7820 from masterleinad/check_scalapack_symbols

Check SCALAPACK symbols

Merge pull request #7825 from Rombur/fix_no_threads

Add missing #ifdef DEAL_II_WITH_THREADS around tbb calls

Unify two symbol checks

Add missing #ifdef DEAL_II_WITH_THREADS around tbb calls

CMake: Refactor MPI sanity check into setup_finalize.cmake

Revert "Only permit use of ld.lld linker when the Clang compiler is used."

This reverts commit 7ca10c52d89ec0e201320acaa9b34822d47779df.

CMake: Reorganize MPI sanity check

Fix a bug in make_sparsity_pattern(dh, dh, sp).

This function relied GridTools::get_finest_common_cells which was
written before any of the parallel triangulations were implemented and
thus assumed that all cells without children were active. This commit
modifies that function to only return active cells that are also locally
owned, which fixes the sparsity pattern function.

Reflow comments.

Merge pull request #7808 from Rombur/tbb

Encapsulate the calls to tbb::parallel_for

Merge pull request #7751 from starki0815/interpolate_to_different_mesh_hp

interpolate_to_different_mesh for hp::DoFHandler

interpolate_to_different_mesh for hp::DoFHandler

Make interpolate_to_different_mesh work with hp::DoFHandler objects. Added also four tests for the implementation as well as the relevant instantiations.

Check SCALAPACK symbols

Set cell manifold ids when the apply_all_indicators_to_manifold flag is used.

Merge pull request #7815 from jppelteret/fix_linker_error

Only permit use of ld.lld linker when the Clang compiler is used.

Only permit use of ld.lld linker when the Clang compiler is used.

Fixes #7811

Use std::lambda instead of boost::lambda

Make clear that the predicate must be const

Encapsulate the calls to tbb::parallel_for

Merge pull request #7810 from jppelteret/sd-symengine_cmake

Add CMake module and configuration files for SymEngine

Add CMake module and configuration files for SymEngine

Merge pull request #7803 from kronbichler/fix_matrixfree_type_traits

Fix MatrixFree::loop() for the case where VectorType is not a vector

Fix compiling bundled boost with MSVC and C++17

Merge pull request #7804 from davydden/feature/fe_eval_type_traits_5

remove unneeded assert in internal::update_ghost_values_finish()

Merge pull request #7805 from bangerth/assertion

Improve the error text of an assertion.

Improve the error text of an assertion.

remove unneeded assert in internal::update_ghost_values_finish()

Fix MatrixFree::loop() for the case where VectorType is not a vector

Merge pull request #7800 from masterleinad/update_msvc

Update allowed MSVC version in bundled boost

Merge pull request #7798 from drwells/remove-make_slice

Remove make slice

Update allowed MSVC version in bundled boost

Merge pull request #7799 from bangerth/doc

Update documentation of class Vector.

Update documentation of class Vector.

Excise remaining inclusions of vector_slice.h.

Merge pull request #7777 from marcfehling/p-flags

Introduced p-refinement and p-coarsening flags.

Merge pull request #7776 from marcfehling/signals-repartition

Signals for p::d::Triangulation::repartition.

Merge pull request #7797 from masterleinad/fix_warnings_convert_to_pattern

Fix warnings in Convert::to_pattern()

Excise remaining calls to VectorSlice.

Merge pull request #7795 from tjhei/use_lld

enable lld linker if available

Fix warnings in Convert::to_pattern()

enable lld linker if available

Introduced p-refinement and p-coarsening flags.

Fix link targets in frames.

The first link is currently unclickable and it should have
'target="body"' anyway since it should not be framed.

The second link works but it should not be framed.

Merge pull request #7787 from davydden/feature/fe_eval_type_traits_4

add and use type traits for data exchange in matrix-free

Merge pull request #7791 from kronbichler/fix_mg_dof_renumbering

Fix renumbering of level dofs for FE_Q

streamline treatment of block and non-block vectors in MatrixFree using updated VectorDataExchange

use type-traits to generalize VectorDataExchange

add internal type-traits to be used with VectorDataExchange of matrix-free framework

Add changelog

Fix renumbering of mg dofs for FE_Q

Merge pull request #7785 from Rombur/cuda_add_and_dot

Fix a bug in cuda add_and_dot

Fix a bug where add_and_dot was giving the wrong results if the vector size was
greater than 4096

Merge pull request #7760 from masterleinad/fix_compiling_sacado_cuda

Fix compiling with Sacado and CUDA

Merge pull request #7789 from tjhei/valgrind_warn

fix uninitialized reads

Merge pull request #7786 from luca-heltai/demangle

Type to string.

fix uninitialized reads

valgrind warns about uninitialized reads in the following two MPI
functions. The totals are only available on rank 0. Note that the value
doesn't matter as the results will be thrown away for rank !=0.

Merge pull request #7782 from davydden/feature/fe_eval_type_traits_3

add and use more type traits in FEEvaluation

Type to string.

Merge pull request #7781 from kronbichler/manifold_fixes

Two small manifold fixes

add LA::d::Vector::set_ghost_state() and use it in VectorDataExchange::update_ghost_values_finish() to allow reading from ghosts in LA::d::Vector::local_element() const

add more vector_access_XYZ internal function in FEEvaluation and improve const-correctness of reader class

Merge pull request #7783 from kronbichler/fix_changelog_dates

Fix file name date in two changelog entries

Fix date markup for changelog.

Fix file name date in two changelog entries

add two more type traits to FEEvaluation

Add changelogs

Add test for EllipticalManifold::push_forward_gradient

Add test for cylindrical manifold

Fix CylindricalManifold::get_new_point

Fix EllipticalManifold::push_forward_gradient

Fix documentation of cylindrical manifold

Merge pull request #7767 from marcfehling/fe-hierarchy

Added hierarchy to hp::FECollection.

Explicitly set noexcept specifier for move constructor.

Call post_distributed signals in the end of 'execute_coarsening_and_refinement' and 'repartition'.

Added 'repartition' signals. Attached 'active_fe_transfer' functions to them.

Added hierarchy to hp::FECollection.

Merge pull request #7775 from masterleinad/codim_material_id_manifold

Fix inteference if material_id with the manifold object in the codimension case

Merge pull request #7770 from bangerth/decompress

Convert a few explicit loops to range-based for loops.

Move the TODO

Merge pull request #7773 from marcfehling/feidx-policy

hp::DoFHandler::ActiveFEIndicesTransfer: Separate work from memory management

Merge pull request #7180 from masterleinad/switch_to_tpetra

Implement TpetraWrappers::Vector

Fix inteference if material_id with the manifold object in the codimension case

Merge pull request #7717 from marcfehling/set-fe-3

Added 'set_fe' functionality to DoFHandlers.

Document the execution space some more

Merge pull request #7772 from tjhei/old_gcc_bb_bug

work around gcc 4.8.5 behavior in GridTools::Cache

hp::DoFHandler::ActiveFEIndicesTransfer: Separate work from memory management.

work around gcc 4.8.5 behavior in GridTools::Cache

fixes #7771

Merge pull request #7769 from rezarastak/quadrature_point_data_comment_fix

Out of date description of quadrature_point_data test fixed

Convert a few explicit loops to range-based for loops.

Merge pull request #7768 from tamiko/sparsity_pattern_iterator

SparsityPattern::Iterator - add a constructor for initalizing an iterator from an accessor