Merge pull request #8154 from tamiko/deuglify_step_42

deuglify step-42

Merge pull request #8151 from masterleinad/fix_icc_19_warning

Avoid ICC-19 warning

Merge pull request #8135 from kronbichler/gcc9-warning-0

gcc9 warning: Provide copy constructor for class with operator=

Merge pull request #8140 from tamiko/cppcheck-1

cppcheck: Fix include/deal.II/algorithms/general_data_storage.h

Merge pull request #8155 from tjhei/tutorial_improvements

improve tutorial layouts

improve tutorial layouts

- remove a TODO
- replace aspect URL and use ASPECT not Aspect
- fix some formulas
- use table headers

deuglify step-42

Merge pull request #8148 from drwells/disable-fp-exceptions-hdf5

Disable floating point exceptions in two HDF5 tests.

Avoid ICC-19 warning

Merge pull request #8150 from masterleinad/missing_header_symengine

Add missing header in symengine_tensor_operations.h

Add missing header in symengine_tensor_operations.h

Merge pull request #8147 from kronbichler/fix_two_tests

Make two tests more stable

Merge pull request #8142 from drwells/cppcheck-9.1

Cppcheck 9.1

Create vector before assigning

Merge pull request #8149 from drwells/add-6774-changelog

Add a changelog entry for 6774.

Merge pull request #8139 from tamiko/disable-gcc-9-warning

Ignore -Wdeprecated-copy in external headers

fix changelog entry format

Cppcheck: Fix general_data_storage.h

Add a changelog entry for 6774.

Disable floating point exceptions in two HDF5 tests.

Merge pull request #8145 from masterleinad/warn_cuda_threads_native

Warn about using CUDA+Threads+march=native

cppcheck: initialize a member in the init list.

cppcheck: Pass a vector by reference.

cppcheck: Match variable names in the header and source.

cppcheck: explicitly call a virtual function in a ctor.

cppcheck: remove a duplicate static constant.

This is the same as the one in the base class.

Make point comparison more stable in case of roundoff

Allow test with 48 iterations

Add recommendation

Merge pull request #8146 from tjhei/doxygen_style_tables

doxygen style tables

Merge pull request #8143 from tjhei/table_empty_lines

remove empty lines in html tables

Merge pull request #8141 from tamiko/cppcheck-2

cppcheck: avoid an unused variable

use doxygen style for html tables with border

Warn about using CUDA+Threads+march=native

remove newlines in tables

lower case html tables

cppcheck: add an assertion.

cppcheck: prefer ++i to i++

Merge pull request #8128 from kronbichler/disable_simd_includes

Disable intrinsics includes if DEAL_II_VECTORIZATION_LEVEL=0

Merge pull request #8137 from tamiko/update-copyright

Update copyright years.

Add another default method

gcc9 warning: Provide copy constructor for class with operator=

Merge pull request #8138 from tamiko/update_trilinos_version

Update Trilinos version.

Disable diagnostics pragma in a few boost and tbb headers

cppcheck: avoid an unused variable

ignore -Wdeprecated-copy in external headers

Update Trilinos version.

Update copyright years.

Disable vectorization with CUDA

Disable vectorization if DEAL_II_VECTORIZATION_LEVEL=0

Merge pull request #8133 from bangerth/fix

Fix a couple of comments.

Fix a couple of comments.

Merge pull request #8130 from bangerth/fixup

Fix the two comments from #8127.

Merge pull request #8129 from bangerth/table

Provide a much nicer way to format a table in step-56.

Fix the two comments from #8127.

Provide a much nicer way to format a table in step-56.

Merge pull request #8127 from tjhei/wrap_comment_warnings

release: wrap_comment warnings

Merge pull request #8123 from drwells/improve-plural

Use 'Tensor objects' instead of 'Tensors'.

Merge branch 'master' into wrap_comment_warnings

Merge pull request #8012 from Rombur/cuda_tutorial

Step-64 : matrix-free CUDA

Merge pull request #8124 from masterleinad/fix_codespell_findings

Fix codespell findings

a few more

release: wrap_comment warnings

Not all of them here might be crictical, but some are clearly bugs
(@name). In general, if @ref is not in a single line, doxygen sometimes
(not always) fails to create the correct link.
The line breaks in differentation/ are likely going to fix some of the
doxygen complaints about missing links.

Merge pull request #8033 from jppelteret/sd-scalar_tensor_operations_01

SD scalar and tensor operations: Substitution and evaluation

Fix codespell findings

Use 'Tensor objects' instead of 'Tensors'.

This fixes doxygen links

Improve documentation of SD tensor operations

Co-Authored-By: Daniel Arndt <arndtd@ornl.gov>

Improve documentation of SD scalar operations

Co-Authored-By: Daniel Arndt <arndtd@ornl.gov>

Merge pull request #8121 from jppelteret/sd-doc_02

Super small doc fixes for SD math functions

Tidy up some grammar used to describe SD math functions

Correct an incomplete latex command in math mode

Merge pull request #8120 from jppelteret/sd-doc_01

Add documentation module for symbolic differentiation

Fix some spelling errors in documentation of AD module

Add documentation module for symbolic differentiation

Merge pull request #8117 from drwells/fix-uninitialized-warning

Fix a clang warning about an uninitialized read.

Merge pull request #8115 from tjhei/doxygen_fixes3

doxygen fixes

Merge pull request #8116 from tjhei/doxygen_fixes4

fix tables in tutorials

Merge pull request #8119 from drwells/double-word-typos

Fix some double-word typos.

Fix some double-word typos.

e.g., "the the".

Rename some internal functions

Add further documentation on template parameters

Add a changelog entry

Add test for SD tensor substitution and evaluation

Add test for SD scalar substitution and evaluation

Add specialisation for rank-0 Tensor functions

- Differentiation::SD::tensor_substitution_map()
- Differentiation::SD::tensor_substitute()
- Differentiation::SD::tensor_substitute_evaluate()

Move definition of a template function to the header file

Implement substitution and evaluation for SD tensors

Implement substitution and evaluation for SD scalar types

Merge pull request #8118 from drwells/add-newline

Add a missing newline.

Fix use of class name FEFaceFvalues in ScratchData documentation

Fix some doxygen parameters

Merge pull request #8107 from tamiko/for_auto_cell

use auto & cell instead of auto cell

Add a missing newline.

Merge pull request #8085 from bangerth/can

Run setting canonical pages as part of the doxygen generation process.

Fix a clang warning about an uninitialized read.

teach clang format not to break section in tutorials

fix indentation

fix tables in tutorials

it turns out doxygen breaks the formatting if you have empty lines
within a table (check
https://www.dealii.org/developer/doxygen/deal.II/step_56.html#TimingResults
for an example)

more fixes

fix doxygen problems