Merge pull request #9529 from KatrinMang/add_split_by_block

Add split_by_block() into IndexSet

add split_by_block into index_set

Merge pull request #9543 from GrahamBenHarper/graham_dev_dox2

Fix use of array concatenation in checkdoxygen.py

Fix use of array concatenation

Merge pull request #9505 from GrahamBenHarper/graham_dev_dox

Upgrade checkdoxygen.py to check for multiple-defined section headers

Upgrade checkdoxygen.py to check for multiple-defined headers

Merge pull request #9540 from tjhei/64bit_n_global_active_cells

Fix overflow in tria.n_global_active_cells()

Fix overflow in tria.n_global_active_cells()

for large computations.

Merge pull request #9533 from tjhei/assert_throw_lapack

Use AssertThrow when LAPACK or other dependencies are not installed

Merge pull request #9534 from tjhei/mg_tansfer_64bit_but_not_really_a_bug

Use a 64bit type in one other MGTransfer location

Merge pull request #9536 from bangerth/nonlocal

Avoid nonlocal control flow since it's so hard to read.

Merge pull request #9537 from bangerth/pedantic

Be pedantic in how we spell deal.II.

Use better markup when talking about header files.

Be pedantic in how we spell deal.II.

Avoid nonlocal control flow since it's so hard to read.

find other places to AssertThrow for missing dependencies

Merge pull request #9531 from bangerth/refs

Move the step-71 -> step-47 references in references.bib.

Merge pull request #9532 from tjhei/examples_no_h2

do not use <h2> tag in tutorials

Use a 64bit type in one other MGTransfer location

This is a local index (how manyth index) and as such likely under 4
billion. I found it harder to assert or document why this cast makes
sense, so I rather change the type.

Use AssertThrow when no LAPACK is installed

This bit me on a run in release mode on a cluster today, because my
deal.II didn't have a working LAPACK.

do not use <h2> tag in tutorials

I am not quite sure why, but they don't show up in the table of
contents. We have been avoiding them, but a few tutorials seem to
violate this now.

Move the step-71 -> step-47 references in references.bib.

Merge pull request #9528 from kronbichler/fix_64bit_type

Use types::global_dof_index rather than unsigned int in MGTransfer

Use types::global_dof_index rather than unsigned int in MGTransfer

Merge pull request #9510 from agrayver/add_python_wrappers

Add more python bindings

Merge pull request #9527 from GrahamBenHarper/graham_dev_fix_tables

Remove empty lines inside html tables

Remove empty lines inside html tables

Merge pull request #9511 from tamiko/fix_indent_for_old_git

Indent script: Do not use --diff-filter=d

Merge pull request #9522 from bangerth/14

Scale a graphic in the results section of step-14.

Merge pull request #9525 from kronbichler/fill_q_points

Ensure to have valid quadrature point data for all SIMD lanes

Merge pull request #9524 from kronbichler/fix_fe_eval_vector

FEEvaluation: Place exception about no block vector correctly

Merge pull request #9519 from kronbichler/fix_minmaxavg_mpi

Avoid calling into MPI functions with MinMaxAvg in serial

Merge pull request #9523 from bangerth/6

Replace eps-generated figure by vtu-generated one in step-6.

Merge pull request #9518 from rezarastak/value_semantics

Use value semantics for const parameters with trivial small types

Add python binding for TriaAccessor::centre

Add extra CylindricalManifold constructor

Ensure to have valid quadrature point data for all SIMD lanes

FEEvaluation: Place exception about no block vector correctly

Replace eps-generated figure by vtu-generated one in step-6.

Scale a graphic in the results section of step-14.

Make it the same size as the other images of the solution.

Merge pull request #9493 from bangerth/30

Convert step-30 from using eps/gnuplot to svg/vtu.

Merge pull request #9495 from bangerth/14

Convert step-14 from using eps/gnuplot to svg/vtu.

Merge pull request #9514 from peterrum/write_vtu_with_pvtu_record_comm

Remove MPI_COMM_WORLD as default argument in write_vtu_with_pvtu_record

Merge pull request #9515 from GrahamBenHarper/graham_dev_vec_warnings

Remove some unused variable warnings in vectorization.h

Merge pull request #9516 from marcfehling/bug-weights

parallel::CellWeights: Capture values, not references.

Avoid calling into MPI functions with MinMaxAvg in serial

Use value semantics for parameters with trivial small types

Add more python binds

Merge pull request #9451 from sophy1029/step-47

step-47: switch the jump and average in one term of the scheme.

parallel::CellWeights: Capture values, not references.

Remove some unused variable warnings

Remove MPI_COMM_WORLD as default arguemtn in write_vtu_with_pvtu_record

Merge pull request #9474 from GrahamBenHarper/graham_dev_svg_boundaryid

Add boundary id functionality to write_svg

Merge pull request #9506 from GrahamBenHarper/graham_dev_clean_tutorials

Update tutorial programs to fix all broken dox links

Merge pull request #9512 from kronbichler/fix_muelu_test

Fix MueLu periodicity test

Update tutorial programs to fix broken dox links

Fix MueLu periodicity test

Indent script: Do not use --diff-filter=d

This hopefully fixes some compatibility issues with ancient git versions
not supporting the --diff-filter option.

Closes #9489

Merge pull request #9507 from bangerth/6

Minor edit to step-6's results section.

Merge pull request #9508 from masterleinad/fix_section_step_45

Fix sections in step-45

Merge pull request #9473 from peterrum/minmaxave_vector

Add Utilities::MPI::min_max_avg() for vectors

Fix sections in step-45

Minor edit to step-6's results section.

Merge pull request #9501 from jihuan-tian/jihuan-tian-contrib

Correct the printed message output from ExcInvalidBoundaryFunction()

Merge pull request #9504 from GrahamBenHarper/graham_dev_step61

Fix header names in step-61

Fix header names in step-61

Merge pull request #9503 from masterleinad/create_separate_artifacts

Create separate artifacts in GitHub workflows

Create separate artifacts in GitHub workflows

Merge pull request #9500 from drwells/remove-eps-step-6

Remove eps step 6

Merge remote-tracking branch 'upstream/master' into jihuan-tian-contrib

Add a description file for the fix committed in c4b096d

Merge pull request #9237 from tjhei/trilinos_muelu_optional

make MueLu optional in Trilinos

Merge pull request #9278 from tjhei/single_level_data_out

test DataOut set_cell_selection for multilevel cells

update tests, disable muelu tests

Correct the printed message output from ExcInvalidBoundaryFunction()

make test work without mpi

Add Utilities::MPI::min_max_avg() for vectors

Clean up some whitespace in step-6 results.

Remove EPS output from step-6.

Merge pull request #9499 from peterrum/matrixfree_new

Remove most new in folder include/deal.II/matrix_free/

Merge pull request #9004 from BrettDong/icc

Add a check on whether LLD links shared object

Remove most new in folder include/deal.II/matrix_free/

Merge pull request #9160 from peterrum/ecl-loop

ECL: add loop_cell_centric

Merge pull request #9494 from peterrum/matrixfree_hold_all_faces_to_owned_cells_fix

Matrixfree hold all faces to owned cells fix

Merge pull request #9492 from peterrum/arrayview_scalar

Add new constructor to ArrayView

Merge pull request #9498 from masterleinad/fix_more_gmsh

Fix more Gmsh references

Fix more Gmsh references

Convert step-14 from using eps/gnuplot to svg/vtu.

The figures as currently used are actually quite ugly. We can do
substantially better. While there, also clean up the
function that creates output a bit.

Use jump notation to the RHS for explanation simplicity.

Correct the LHS of the scheme.

Add extra term from the symmetrization to the rhs. Use average and jump notation on rhs for simplicity.

Add one term to the rhs of the scheme.

switch the jump and average in one term of the scheme.

Merge pull request #9496 from agrayver/fix_step_49

Avoid automatic referencing

Avoid automatic referencing

Add loop_cell_centric

Convert step-30 from using eps/gnuplot to svg/vtu.

The figures as currently used are actually quite ugly. We can do
substantially better. While there, also clean up the
function that creates output a bit.

Update documentation

Initialize entry 4 and 5 of IndexStorageVariants::vector_partitioner_face_variants

Add new constructor to ArrayView