FEEval: use get_cell_ids() at more places

Merge pull request #13247 from peterrum/mf_data_in

Rename variable

Merge pull request #13248 from rschoof/typo_correction

Typo correction

Rename variable

Merge pull request #13244 from kronbichler/remove_unnecessary_include

Remove unnecessary include file

Remove unnecessary include file

Merge pull request #13235 from bangerth/pex-x

Some updates to the PEX code

Merge pull request #13241 from bangerth/26

Make reference to SUNDIALS solvers in step-26.

Merge pull request #13240 from peterrum/fe_eval_const_gather

FEEval: do not cast const away during read_dof_values()

Merge pull request #12983 from gassmoeller/initialize_fepointevaluation_with_mappingdata

Allow reusing mapping data in FEPointEvaluation

Small updates to the Serial documentation.

Small updates to the PEX documentation.

Make reference to SUNDIALS solvers in step-26.

FEEval: do not cast const away during read_dof_values()

Merge pull request #13237 from marcfehling/doc-minres

Added bibtex entry for SolverMinRes reference.

Merge pull request #13238 from marcfehling/doc-step-55

Reference book directly in step-55.

Reference book directly in step-55.

Added bibtex entry for SolverMinRes reference.

Merge pull request #13236 from tamiko/typos

fix some typos

Rename a couple of member variables to better reflect their purpose.

Rename a function.

While there, also use the correct data type for its argument.

Sort PEX member functions in the order in which they are called.

Merge pull request #13226 from peterrum/PreconditionRelaxation_refactoring_extansion2

Improve usability of PreconditionRelaxation

Merge pull request #13230 from bangerth/assertions

Add a couple of assertions.

Merge pull request #13231 from bangerth/mpi

Marginally accelerate compute_point_to_point_communication_pattern().

Merge pull request #13202 from gassmoeller/optimize_particle_sort

Faster and simpler search for lost particles

Fix lost signal

indent

Simplify code using std::adjacent_find.

Add a couple of assertions.

Marginally accelerate compute_point_to_point_communication_pattern().

Merge pull request #13227 from tamiko/fix_intel_detection

CMake: adjust tbb path glob to "lib/intel64/gcc*" layout

CMake: adjust tbb path glob to "lib/intel64/gcc*" layout

Merge pull request #13225 from marcfehling/tee-doc

Fix Y-pipe example in doc for `pipe_junction`.

Improve usability of PreconditionRelaxation

Fix examples in doc for `pipe_junction`.

Merge pull request #13179 from tamiko/add_changelog_3

OneAPI compatibility: enable oneAPI configuration in CMake, changelog

Merge pull request #13221 from drwells/fix-test-2

Merge pull request #13222 from drwells/boost-1.78-changelog

Add a changelog entry for #13165.

make define guards more robust

Add a changelog entry for #13165.

Fix a redefined variable error in a test.

052ab5dfbd combined some things into patches.h but didn't delete this one array.

Merge pull request #12265 from masterleinad/add_readability-implicit-bool-conversion

Add readability-implicit-bool-conversion

Merge pull request #13220 from marcfehling/tee-doc

disable threading in task_info.cc for oneAPI

TBB with oneAPI API has deprecated and removed the
<code>tbb::tasks</code> backend. With this it is no longer possible to
compile the following code that builds a directed acyclic graph (DAG) of
(thread parallel) tasks without a major porting effort. It turned out
that such a dynamic handling of dependencies and structures is not as
competitive as initially assumed. Consequently, this part of the matrix
free infrastructure has seen less attention than the rest over the last
years and is (presumably) rarely used.

So in case of detected oneAPI backend we simply disable threading in the
matrix free backend for now.

Fix formatting of table.

Hide template specialization from doxygen.

Fix some more

Add clang-tidy check

Merge pull request #13214 from bangerth/nbx

Merge pull request #13215 from bangerth/nbx-3

Merge pull request #13217 from kronbichler/adjust_variable_name

Fix some spurious variable names

Merge pull request #13028 from marcfehling/tee

Generator for `pipe_junction` geometries.

Generator for `pipe_junction` geometries.

Fix some spurious variable names

Merge pull request #13048 from peterrum/gc_FEEvaluationHangingNodes

Use FEEvaluationHangingNodes in MGTwoLevelTransfer

Do not reuse an MPI_Status object.

Sort the member functions of ConsensusAlgorithms::NBX.

In particular, sort them in the order in which they are called in the NBX::run() function.

Use FEEvaluationHangingNodes in MGTwoLevelTransfer

Merge pull request #13211 from drwells/fix-mass-lumping

Fix a check for zero entries in the lumped mass matrix.

Faster and simpler sort of lost particles

Fix a check for zero entries in the lumped mass matrix.

Merge pull request #13210 from marcfehling/fix-p4est-changelog

Added changelog for p4est installation script.

Added changelog for p4est installation script.

Merge pull request #13196 from bangerth/patch-4

Add to the documentation of SymmetricTensor::operator*.

Merge pull request #13201 from bangerth/patch-2

Do not output the partitioner when pretty-printing Vector objects.

Merge pull request #13207 from bangerth/patch-7

Cleanups in FETools::extrapolate()

Merge pull request #13159 from peterrum/PreconditionRelaxation_refactoring_extansion

Extend PreconditionRelaxation

CMake: remove oneAPI exclude

add a changelog entry

Merge pull request #13192 from drwells/fix-manifold-id-simplex-copy

Fix manifold copying on lines when converting hexes to tets.

Merge pull request #13206 from bangerth/fix-extrapolate

Fix a bug: Don't reuse buffers for MPI_Isend.

Avoid an unused-variable warning.

Let the CellData::pack() function return its data.

Make CellData look like our usual style.

Add some assertions.

Modernize many loops using range-based for.

Simplify the WorkPackage struct.

Fix a bug: Don't reuse buffers for MPI_Isend.

The intention of the code was clearly to cycle through the existing buffers,
but we never incremented the iterator, and so accidentally reused a send buffer over and
over. This works only because MPI_Isend is specified in the MPI standard as
'standard mode', which means that it may or may not copy the data to be sent
into an MPI-internal buffer before the function returns. Apparently it does in all
implementations we use, but we shouldn't rely on this.

Add another test that shows some vertex displacement.

Fix a bug where line manifold ids were not copied correctly.

When we convert hexes to tets, we create three types of lines:
1. lines inside the hex
2. lines on the faces of the hex
3. lines equal to the hex's lines

In the last case we need to copy the manifold and boundary data from the
preexisting lines directly, since they may not be equal to the ids assigned to
the adjacent face.

Merge pull request #13203 from bangerth/43-c

Convert manual references into bibtex ones in step-43.

Merge pull request #13197 from bangerth/patch-5

Document the meaning of jump_in/average_of_* in FEInterfaceValues.

Merge pull request #13199 from bangerth/patch-1

Minor edits to the documentation of SparsityPattern.

Merge pull request #13200 from bangerth/patch-3

Updates to step-10

Merge pull request #13204 from simonsticko/remove_tripple_slash_in_source

Remove occurances of /// in source/

Document the meaning of jump_in/average_of_* in FEInterfaceValues.

Remove occurances of /// in source/

To avoid them from showing up in the documentation.

Mention Kahan summation and discuss 'double' vs 'long double'.

Replace use of 'long double' by 'double' in step-10.

Update step-10 output to current values.

Minor edits to the documentation of SparsityPattern.

Convert manual references into bibtex ones in step-43.

reintroduce get_mapping_data()

Merge pull request #13184 from bangerth/sparsity

Fix serialization of empty SparsityPattern objects

Merge pull request #13198 from bangerth/patch-6

Be more thoughtful about parallel grain sizes in UMFPACK interfaces.

Extand PreconditionRelaxation

Merge pull request #13195 from kronbichler/step-67-movie

Add movie to step-67 tutorial program