Merge pull request #2151 from drwells/matrix-free-broken-link

Join a link that was broken over two lines.

Join a link that was broken over two lines.

This makes the link clickable.

Merge pull request #2144 from tjhei/wrapcomments

Wrapcomments

Merge pull request #2148 from tjhei/scary_mpi_fixes

fix several scary MPI bugs

fix several scary MPI bugs

I am surprised the code in question used to work at all because we are just
overwriting random memory. I detected those using clang's argument type
warnings and extensible clang type annotation within MPICH.

Merge pull request #2147 from kronbichler/master

Avoid C++11-isms in tests

Avoid C++11-isms in tests

Merge pull request #2146 from tjhei/minor_doc_update

minor rewording

minor rewording

run wrapcomments

this sadly kills some of the manual indentation of @param and other
commands

Merge pull request #2145 from tjhei/update_copyright_years

update copyright years

Merge pull request #2143 from tjhei/documentation_updates

Documentation updates

update copyright years

fix astyle

wrapcomments.py: numbered list support

update update_copyright script

-i is only valid if you process a file

fix block formulas

doxygen doesn't like numbered lists

more manual formatting

improve wrapcomments.py

manual formatting fixes for wrapcomments.py

formatting: release step 0b

various documentation fixes

Merge pull request #2142 from tjhei/msvc_bigobj_fix

fix MSVC compilation by adding /bigobj

fix MSVC compilation by adding /bigobj

this fixes "fatal error C1128: number of sections exceeded object file format limit"

Merge pull request #2100 from drwells/remove-whitespace-in-get_fe_by_name

Remove whitespace in get fe by name

Merge pull request #2140 from tjhei/fix_tests2

fix tests without cxx11

fix tests without cxx11

Merge pull request #2139 from tjhei/metis_test_output

fix metis tests

fix metis tests

On my machine with 64bit ints and 32bit metis I am getting the 32bit results
and so the tests fail. Fix this by always comparing against all possible
outputs. Also include additional output for metis_04.

Merge pull request #2138 from tjhei/metis_user_include

add metis include dir to USER_INCLUDE_DIRS

add metis include dir to USER_INCLUDE_DIRS

otherwise tests/metis/metis_01a fails with "fatal error: 'metis.h' file not found"

Merge pull request #2137 from tjhei/fix_tests

fix several tests

fix several tests

Merge pull request #2136 from tjhei/fix__parallelepiped_test

fix tests/grid/grid_parallelepiped_05

fix tests/grid/grid_parallelepiped_05

Merge pull request #2134 from tjhei/boost_blacklist2

Boost blacklist2

Add some spaces in the get_fe_by_name test.

Let FE names have spaces between words.

Previously, things like

    FESystem[FE_Q(1) - FE_Q(2)]

caused parsing errors due to the spaces around the '-'. The new behavior is to
delete space that is not surrounded by 'word' characters (things that match the
regular expression [A-Za-z0-9_]) before parsing the name.

Merge pull request #2135 from tjhei/fix_compilation_grid_gen

fix compilation errors

fix compilation errors

gcc and intel rightfully want the template parameters spelled out.

also remove Boost_DIR

use correct version variables

cleanup boost variables

Merge pull request #2132 from tjhei/boost_blacklist

blacklist boost version 1.58

move check to configure_boost

Merge pull request #1936 from tjhei/hyper_rectangle_codim_fixes

fix *_hyper_rectangle for codim and add new subdivided_parallelepiped

Merge pull request #2133 from tjhei/test_empty_results

handle empty test output

handle empty test output

If the make command to compile a test returns empty output (don't ask me
why that happened on my machine), quote it in the regex to avoid an
error like:
"string sub-command REGEX, mode MATCH needs at least 5 arguments"

changelog

fix *_hyper_rectangle for codim and add new subdivided_parallelepiped

- extend documentation what happens if dim!=spacedim
- add new subdivided_parallelepiped for codim1 and 2
- switch to Point<dim> in *_hyper_rectangle

blacklist boost version 1.58

addresses #1591

Merge pull request #1934 from Arezou-gh/local-triangulations

Add GridTools::build_triangulation_from_patch() and GridTools::get_cells_at_coarsest_common_level().

Add modified tests for build_triangulation_from_patch()

Merge pull request #2129 from kronbichler/master

Fix bug in matrix multiplication

Fix bug in matrix multiplication

Merge pull request #2127 from pesser/fix_warning

avoid warning about unused variable

avoid warning about unused variable

According to the documentation of ArpackSolver::solve the first parameter is
unused. Do not give it a name in the definition to avoid unused variable
warnings.

Merge pull request #2126 from davydden/compute_line_dof_identities_assert

remove invalid assert in compute_line_dof_identities() related to ele…

remove invalid assert in compute_line_dof_identities() related to element domination; add a unit test

Merge pull request #2125 from tjhei/msvc_fix

fix msvc compilation

fix msvc compilation

Merge pull request #2121 from sebastianGl31415/master

modified step-34 tutorial introduction

Merge pull request #2101 from drwells/continuation-line-whitespace

Skip whitespace at the start of continuing lines.

Merge pull request #2122 from bangerth/fix-64bit-output

Adjust the output of two tests for 64-bit runs.

Update intro.dox

I fixed language mistakes.

Merge pull request #2116 from kronbichler/master

Fix 2:1 balance on artificial cells over periodic boundaries.

Choose better names for tests

Use GeometryInfo to fix non-standard orientation case

Update a changelog entry.

Allow parameter files to end with a '\'.

Adjust the output of two tests for 64-bit runs.

modified step-34 tutorial introduction

Test beauty

Add changelog entry

Overload perpare_coarsening_and_refinement for the periodic case

Add additional test with hanging nodes. Fix bug in identification of periodic vertices.

Fix 2:1 balance on artificial cells over periodic boundaries.

Merge pull request #2119 from fsonner/sparsevankafix

Fix local second-order coupling in SparseVanka

Add SparseVanka fix message to changes.h

Merge pull request #2120 from tjhei/petsc_matrix_err_msg

improve PETSc sparse_matrix constructor error msg

improve PETSc sparse_matrix constructor error msg

If you construct a PETSc sparse matrix with invalid IndexSets for local
rows/columns, you only get a cryptic PETSc error code. This commit adds
a check in debug mode with a helpful error message.

Fix local second-order coupling in SparseVanka

Fixes issue #2118.

Merge pull request #2117 from tjhei/metis_small

fix METIS partitioning with too many processors

changelog

fix the case where we reduce to 1 domain

fix metis partitioning with too many processors

If you have more processors than cells to partition, METIS will behave
in a weird and undesired way:
- at some point all subdomains land on a single processor
- METIS produces an error message "***Cannot bisect a graph with 0
vertices!"

add test

Merge pull request #2113 from bangerth/further-FEValues-cleanups-40

Remove internal update_once/update_each functions

Fix copyright year range.

Slightly clarify a comment.

Remove declarations of functions that are no longer implemented.

Remove an outdated comment.

Replace it with links to places where the comments are up to date.

Remove now no longer used FE_PolyTensor::update_once/each.

Remove now no longer used FE_Poly::update_once/each.

Remove now no longer used FE_PolyFace::update_once/each.

Remove now no longer used FE_FaceQ::update_once/each.

Remove now no longer used FE_DGP_Nonparametric::update_once/each.

Merge pull request #2115 from bangerth/fix-doxygen-markup

Fix doxygen markup.

Merge pull request #2112 from bangerth/further-FEValues-cleanups-38

Initialize the last non-const field of FiniteElementData from constructor arguments