fix doxygen grouping tags

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32305 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

remove unused variable in quicktest

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32304 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix quick_test

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32303 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix use of freed memory: Change when to reset the vector

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32300 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix invalid memory access in gridin::read_vtk

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32299 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

improve error checks and comments for parallel::distributed::Triangulation::load/save

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32298 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Disallow calling DoFAccessor::set_active_fe_index on non-active cells.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32297 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Adjust a few tests to not call set_active_fe_index() on non-active cells.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32296 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Mention Martin's change from a couple of days ago.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32295 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

CMake: Cleanup: Remove obsolete macro, unify naming of internal macros

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32294 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Adjust test output

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32293 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix test case with 64 bits

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32292 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fixed typo in step-2 tutorial program.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32291 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

CMake: Bugfix: Clear compile variables prior to populating

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32290 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix invalid memory access caused by undefined order of construction of static members (found with ASAN)

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32289 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Some more from Winnifred.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32287 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Patch by Martin Steigemann: Handle the case of zero error indicators better when finding the threshold for mesh refinement.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32286 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

step-4: write constants as doubles

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32285 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove obsolete scripts

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32284 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

update p4est instructions, remove some outdated stuff

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32283 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Adjust test output

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32282 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Do not set active_fe_index values on non-active cells.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32281 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix broken PETScWrappers::MPI::Vector::print() in parallel

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32280 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix another place where we should use MPI_Allreduce instead of MPI_Reduce

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32279 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Test extract_row_copy, fix two bugs

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32276 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix test

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32275 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Improve error message.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32274 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Clear active_fe_index flags on non-active cells since they have no meaning.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32273 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Another test.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32272 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Leave a comment to clarify things.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32271 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix the same problem again in another location.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32270 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix a recently introduced problem with SolutionTransfer.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32269 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Patch by Mihai: Also extend the ability to deal with explicit FE spaces to set_dof_values_by_interpolation.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32268 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add extract_row_copy method to chunk sparse matrix since iterators are very slow

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32267 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Allow use of AssertDimension without 'using namespace dealii'

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32266 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Slightly extend full matrix interface.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32265 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Simplify exchange of data in Trilinos sparse matrix reinit: Can use the nonlocal_graph directly. Apparently, I would need another entry point into distribute_sparsity_pattern to fix the deal.II transfer.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32264 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Simplify exchange of data in Trilinos sparse matrix reinit: Can use the nonlocal_graph directly. Apparently, I would need another entry point into distribute_sparsity_pattern to fix the deal.II transfer.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32263 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Need to add a few more entries to non-local part of sparsity pattern for MeshWorker assembly. Now the reason for failing MG tests is a wrong prolongation matrix where some non-local rows get lost

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32260 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix failure of multigrid on some OpenMPI versions

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32259 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Try to fix some tests by adding more elements to sparsity pattern over processor boundaries

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32258 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Do not create non-local graph when there are no ghost rows specified.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32257 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix 64 bit bug

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32256 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Correct test output

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32255 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Allow constant modes for FE_RaviartThomas and FE_Nedelec.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32254 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix extract_constant_modes for FE_DGP etc.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32253 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix at least one issue with my commit: The flux sparsity pattern needs to include other-other coupling when using MeshWorker

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32251 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

New tests.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32250 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Implement more functionality for get_interpolated_dof_values.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32249 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix warning

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32247 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Use thread-safe path for Trilinos matrix assembly also when initializing with a CompressedSimpleSparsityPattern

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32246 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add test for all_zero

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32243 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix all_zero() for PETSc vectors. add documentation for Trilinos as well.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32242 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Disallow calling some functions in the hp context on non-active cells.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32240 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Disallow calling some functions in the hp context on non-active cells.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32239 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Improve error message.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32238 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix typo

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32235 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Capitalize 'stokes'.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32234 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix typo.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32233 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Improve comments

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32232 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Initialize Trilinos parallel matrices with additional relevant set in order to allow for multiple threads to write into the matrix (even though we don't use this functionality right now).

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32231 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix quadratic complexity in number of ranges in two methods. Do not directly insert into an IndexSet with MGTools::extract_inner_interface_dofs.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32224 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix typo.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32222 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

make it more clear the hyper_L works in 2d and 3d.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32221 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix tests/fe/crash_01.cc.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32220 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fully qualify a name to make MS VC++ happy.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32219 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Try not to confuse MS VC by having this:

estimate (...,
          const Function<spacedim>                   */*coefficient*/,
          ...)

where MSVC gets tripped up by the */ thinking it closes a comment.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32218 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Also import the DataOutBase::Patch name into DataOutInterface to make MS VC
happy.

Fix a couple of minor editorial warts.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32217 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fully qualify a namespace to make MS VC++ happy.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32213 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Use double instead of float in one place to avoid a MS VC++ warning.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32212 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Do not name an unused variable.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32211 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

make the test fail for real

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32207 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add failing test

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32206 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Prevent MSVC from #defining min and max as macros.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32205 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Avoid invalid cast from one to another DoFHandler type.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32204 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Match names of template arguments. This appears to confuse MSVC otherwise...

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32203 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Added interpolate instantiation for codimension one.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32201 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add two useful fields

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32199 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add remesh event

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32198 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Revert to r32190.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32196 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Revert to r32190.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32195 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

avoid deprecated functions

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32194 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix warning about ambiguous else branch

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32193 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Restore accidently deleted function.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32192 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Compute hessians for FE_Nedelec correctly.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32191 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

It does not make sense to test WorkStream with both empty worker and copier. Adjust the test case.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32190 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

remove warning (comment within comment)

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32189 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix comments left-over from the testcase from which these were generated.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32188 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

remove typename that shouldn't be there

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32187 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix another comment that was no longer accurate.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32185 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix a comment that is wrong because it was simply copy-pasted.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32184 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Mention previous changes.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32183 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix the same bug in one more place.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32182 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix more bugs...

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32181 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix more bugs.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32180 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix a testcase by Minh Do-Quang: DataOut also got with FE_Nothing elements.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32179 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix a testcase by Minh Do-Quang: FESystem got a bit confused with FE_Nothing elements.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32178 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add one.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32176 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix typo

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32175 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make compile with 64 bit integers.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32174 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d