new get_function_grads

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9544 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

The check whether something was very small needs a <= instead of a <
comparison, in case the rhs is zero itself.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9543 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

The check whether something was very small needs a <= instead of a <
comparison, in case the rhs is zero itself.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9542 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add a note.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9541 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Work around a trivial problem with the hp compiler.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9540 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add a TODO.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9539 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix path to use absolute path, rather than obscure link.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9538 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

In tria.h, we use an object of type StraightBoundary<dim> to initialize a default argument for a variable of type Boundary<dim>. Both of these types are only forward declared at this point. While most compilers seem to have no problem with this, ibm's xlC does as it tries to instantiate the default arg when seeing the explicit specialization declarations of member functions further down in the file.

While it may be that xlC is wrong, there is no need to be so contrived. We can just overload the set_boundary function and have one that has one and one with two arguments.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9537 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove a potential problem with declaring sqr() in global scope in a header file.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9536 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Merge Ralf's and my conditional ostream objects.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9535 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

CVS Server changed

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9534 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make sqr inline.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9533 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

TableIndicesBase now has operators==/!=

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9532 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Put an entry into the right place.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9531 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Comment out a variable that gives me warnings because it isn't used.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9530 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make a number of frequently used functions inline.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9529 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add Oliver.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9525 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add Oliver.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9524 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Added comment about PreconditionLU and SolverPreOnly.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9523 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Implemented a Solver class for the KSPPREONLY type of PETSc, which
just applies the preconditioner. This is useful when the complete LU
decomposition is used as preconditioner.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9522 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Added some of the probably more important parameters to
the class PreconditionLU.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9521 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add function diag_element.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9520 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Added a preconditioner class for the LU decomposition provided by PetSC.
Works only for single processor machines.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9519 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove duplicated assertions (kudos to Oliver :-)

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9518 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix a completely dysfunctional Assertion using = instead of ==.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9517 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

more specific

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9516 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Undo Guido's changes. Use a better way to disambiguate which vmult function is used by moving them to the derived classes, and providing for unambiguous names in the base class.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9515 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Don't forget to instantiate petsc block vectors.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9514 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove some calls that are no longer supported.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9513 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix all that iterator crap that didn't work for matrices with empty lines.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9512 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Use a logarithmic algorithm instead of a linear on in point_difference.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9511 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove a few TODOs by adding docs.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9510 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

New tests. Modify some tests so that they can work with the block iterators.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9509 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Assign TODO.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9508 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make instantiation scheme a little simpler.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9507 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Small modifications to accessors and iterators.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9506 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Actually check for symmetry of matrices.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9505 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Various news.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9504 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Indent comment.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9503 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add 2 TODOs for Guido.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9502 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Small clean-ups.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9501 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove functions that are only for the general template, which should never be used.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9500 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix docs.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9499 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Refine regex for TODO list.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9498 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

attempt to W1infty-norm

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9496 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

new get_function_values with indices

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9495 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

vmult for simple vector restored

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9494 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Jacobi added for simple vector

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9493 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add TODOs.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9492 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Minor doc fixes.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9491 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix more things in the docs.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9490 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix documentation.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9489 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

augment todo.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9488 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9487 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix name of output file.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9486 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add a solver test.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9485 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Use more efficient algorithms to initialize fields. Also happens to work
around a miscompilation with present gcc mainline :-)

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9484 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add entry on time-dependent example programs.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9483 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove a file that has slipped in inadvertantly during the partial merge back from the hp branch.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9482 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix step-8 web page.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9481 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix paths to images -- they aren't visible otherwise.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9480 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Reorder functions so that inline functions are declared before they are called.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9479 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Merge back the changes on the hp branch that have been made in the grid/ subdirectory.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9477 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove two controversial functions again. Untemplatify other functions.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9476 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Allow compilation.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9475 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove date and time.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9474 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Explicit instantiation of two FEValuesBase::CellIterator classes.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9473 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add missing reinit functions taking MGDoFHandler::cell_iterators.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9472 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Merge most of the changes in the fe subdirectory from the hp branch to mainline, so as to avoid further divergence of the branches.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9470 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

New right_preconditioning argument in PETScWrappers::SolverGMRES::AdditionalData.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9469 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

According to the SolverGMRES::AdditionalData class the PETScWrappers::SolverGMRES::AdditionalData class now also takes an additional flag indicating the use of left or right preconditioning.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9468 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove const from cell_iterator returned by value.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9467 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9464 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Improved: The <code class="class">SparseDirectMA27</code> class can now
       handle float as well as double input matrices and vectors.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9463 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Allow to run MA27 with float matrices as well.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9462 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

get_cell now returns a Triangulation<dim>::cell_iterator.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9461 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add a TODO

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9460 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Templatize apply_boundary_values for BlockMatrices

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9458 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

PointerComparison.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9457 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix vmult et al for different template arguments.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9456 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Instantiate a lot more functions.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9455 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add a comment.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9454 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Instantiate a few vmult-type functions for argument types that differ.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9453 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix a few things that did not work when instantiating
vmult(Vector<double>,Vector<float>) and similar functions.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9452 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add a class that allows comparing arbitrary pointers.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9451 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

New FEValuesBase::get_cell function

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9450 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

New get_cell function.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9449 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove some leftover code that wasn't meant to be left there.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9448 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Don't check for capacity(), as this is implementation defined. The check has
passed in my testing, though, so my code seems to be correct.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9447 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Include <algorithm>. <set> is not needed any more.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9446 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Improved CompressedSparsityPattern.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9445 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add some stats to the documentation.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9444 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

More changed files due to the fixed CompressedSparsityPattern::max_entries_per_row bug.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9443 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix a bug where CompressedSparsityPattern::max_entries_per_row ignored the first row of a matrix.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9442 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix CompressedSparsityPattern::max_entries_per_row

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9441 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Use a more sophisticated algorithm for the compressed sparsity pattern that uses caches and std::vector instead of std::set. std::set allocates 20 bytes each time we add a single integer, which can't be efficient both from memory and run-time viewpoints.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9440 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Avoid warning.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9439 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Check a bit more.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9438 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Don't let SparsityPattern be a friend of CompressedSparsityPattern. There are
better ways to access the data of the latter class.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9437 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@9436 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d